SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000155_2.0
Identity
TranscriptSECIS binding protein 2 (SBP2)
SpeciesAiluropoda melanoleuca (Panda)
Transcript IDSPT00000155
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000058_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00000155_2.0 # Transcript # SECIS binding protein 2 (SBP2) # Panda (Ailuropoda melanoleuca) # Full length # Forward
AAGAATGTCAAGCTATCAGCTGAGGTAGAGCCATTTATTCCCCAGAAGAAGAATCCGGAT
ACATTTATGATCCCGATGGCACTGCCAAATGATAATGGAAATGTTTCTGGCGTAGAACCA
ACTCCAATTCCCAGCTACCTGATTACTTGTTACCCATTTGTGCAGGAAAACCAGTCCAAT
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GTTGCTTTACTATATTATGTGAACACAGCGTCTCCTAGGGCTGAAGAAAATGAAAGATAA
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TTCTTCTCAGTACTTCTAGAAGGTAGAGTGATTTCTTAAATGCATCTATGGCTCTATCAT
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GGAGAATGTAAAGAAATACGTATTGGAAGTAAGACAGAAGTATATAACTTTCAGATGGTG
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GTTCTGTTATATAAATTGCTATTTAAGTGATGAATACTCCTGTTTTAAAAAATGAAGGAA
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ATTTACAACCTCTTATATGACATGCTCATACTTCTATCATTTATTAATTATTGAGAAAAT
ATGAAGTACAAGTAATAATTAAACATTCATTAATATTTTGTTAGTCATAGTAGTGTTAAT
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TAGTACATTGAGTAGGATTTTAAATTATCATTATTTTTTTGTGCTTAAATCAGCAGCAGC
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ATTGACTTTATAATTGTGGACTGTACCACTCTTTAAGTTTCCAGACTTTGATCCTTTCAT
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CTGAGGGCTCATTTTGGCAGAAATCACATTTGTATGTTTTTATAACTAGTTCAAAACCTT
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ATATCATTGCATTCCAGTTTGTATCTCTGATCTCAGCTTAATAGCTGTAGAGTAGATTAC
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TGGGGGTAGCTGATGATAGCTACACTTGTGGTGAGCAAAGCATAATGTATAGACTCTTAT
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GTATTCTTATTCTTTAGGTTTTTTCCCCCAAATTCTGTGGATTGCACATTCTATCAGTAT
TTTTGTTTAACTTGTTTTTAATTTCTGAGGATTACTTGGTATCAGTCACAGGTAGGATGA
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AGGCTTCCTGCTGCTGAGCAGGGAGGGAGCCCAATGCGGGGCTTGATCCCCAGGACCCTG
GGATCATGACCTGAGCCAAAGGCAGATGCTTAACAACTGAGCCACCCAGGCGCCCCAGAG
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GTTCATCATACACAGGCAGTCTAAATTCCAGTGACATTAATGAATTACAGCCACATCCAT
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GTTTTAGGAATATAAAAATCCATGAAAAAGCTATTTTAAAAAGTGAGGAAATGATAAACA
CAGAATTCCATATGGAGGTAACTTCTGGGGGAGGAAGAGGAGGCAGTGGGCATATGCAGT
GGACTTAAAAAGGATTGGTGTTGTTTTTCTTAAATGAGTAATGGTGGTTTGTTTTAATAT
TTGTATAAATATTTTATTCTCTTGTCATAATAAATACATGTCATAAACCAGCATGTCAGG
AACACCTTACCTTTTGATGATCTTCCCCCCAAATTTTTTACTTTTTCTCCATTTGCAAAG
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GAGAAATCCCGATTCTAGCACCATGAATGTATGTAACACTGCTTTGATTTCTTTATCAGT
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CAGTCACTAAGAACTGGAATACCACTTAAAGTTTGTAGAGAAATTTCCAGTTTTACATTT
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GGATGTGTTGTTATACTTATTCTTAAGTATGTGTTTGATTTGTGATGTGCAGAATCTTCT
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TTATGTTTTATCCACTCTGTTCTGTGCTCTGCTTTCATCACTTAACAATGTATCTTGGAA
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AGCTTCAGAGATAATGTGTTTTCAGGATTTGGGATTTGTGCCAGTTAGGTGAAAATGGTA
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TTTTTGACTTTGCTTATTATTATTGCCATACACCGGTTTATATTTTAAATAACTTGTAAG
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TGAAAAGTCCATCTTTTCACTGATGTGATATTAACCATCTTCATCATCTGTTAAATTCCC
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ATTAATGCATATGTAGTAAATGATTTACAACAGAACTTATTTTTGGATATAATTTTAGTG
CCTTTGGAGAGCAGGTTTGCATTTACTTTTTTGTCATAGTGACTGTCCACATGAATGAAG
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ATTATAAATTGCATGTGTTTTACCAGCTTTGTATGAGCTTCTTTTCATGAGCCAATTTTT
AAAATATTTTATGAAAATTGCTTAATAGTGAAGTTGAAGTAATTTTAAAGAGAAAATTGA
TATAGCTACCAGTTAGATGCTAGCTAACATTTTACTGAGATTTGTTTCATCGCGTATGTA
TTCCTCTGTCCGTATCTCAATCCATGTTGATGAGCGTATTTTAAAATGAGGTAAATATTT
AAAATTAAGAAACTGTTGGGTATCTGGAAAGTTATCTAGTTATAGGAAGTAGCCGAGTTG
TCACAGTGCATATTGTAAGGAAGAATTAAATTTGGTATATGATCATCTTCTCTGGCTTAT
TGTTCTGCCATGCAGCCTATCTCCCAAAAGAGTATACAAATTCTATTTCTTAAAAACAAA
AATAAAAACAACTATTTCTTATCAGCAAGTCTTTTTACACCAGTTGCTTAGTATGGGAAT
TGCTAGGTGGTTCCATGTTTTTGTGTGCATAATTTTGATTTCATCATCCAAAGCCAGTAT
ATTAGCACCTTCTGTGCTAGATCTGCTTCAAGCTCTGTTCGTTATTAGAATTTGGGGGTA
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ATGTTAGCTGCATTGAATACTTAAGAGGAGGATCTTGAAATGTCTTAAGATTCTTAAGAA
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TTGAAATTTTATTCTAAATCTCTTTTCTTGGAAATAAGAGTTTTAATTTTTAACCTTTCT
TAGGAATTGTTTTTTTTTCTTTAAATAAGACCACAGATGTTAGAAGACATAATAGTTTAA
TAAAAAGGTAGTGTGCAGTTTCTCCCAATTACAACATCTTGCAAAACTGCAGTCCAGTGT
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TCCCTCATGTTTTCCTTTTCATAGCCACATTCCTTTCCTTTCCCAGCCAGCCTCTCATTA
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TATAAATGAACTCATACAATCCTTTTAAGATTGGCTTTCTCACTTGCATGGCTCTCTAGG
TATTCATCCAGATTATTGAGTACATCAATAGCTTGTTCCATTGGGTGGCTGACTCTTGTT
CTGTAGTAGGGATGTACCACAGTAAGTTCATTCTCACAATCAAGGACGCCTGGGTTGTTT
ACAGCTTTTGGCTATTATGAGTAAAGCTGGTTAAACATTCGTGTATGAGGTGGGGCGGGG
AGGGAAATAACTTGCATTACCACATTTTTATGTTTTCCTTAAAATGATCTCATTTGTCAA
AGGTCTTTAACCTTTTATAATAAATTATGCACTTTATGAAAATTCATTGAGTTGTATACT
TTTGTATACTTTATTGTAGGTATGTTATACTTCAGTAAAATGTTCACTTAAATAATATAC
TTTTTTCTTTTGGGGCTTACTTAGGTTGGATTCAGATGCCGAGGACATAGTACTTCCTCA
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CTTAGAGGCGACTCAAATTCTGAGTCTTTATATTTTGAGGTATTTTTTCAGGCTCTGTTT
GTAAACTATTATAGCAAATGTTCCCATTAAGAAATTAATATTCTTACATTCTGATAAGTA
CTTTTTATGTCTTAACATGAGACACTGCTATTAGATCATAAATTATTTAGAAGTATTGAT
TCATTTTTGTCCTAGATATGTATAGTTAGTCTAATATTAACTTCATTAATGTCTATTTTT
ATAACTTTTATCATGAGTATTCATTTTGAAATAACATGGAGAGTTAGAACTTGGTTTTAT
GTGGGTTTCTTCTAGTATGAAACTTTCTCCCTCATTTTTGTTATTATTGTTTAGTCTGTC
AGGTTTTTTAGATCTGAACAGTTCAGTCTAGTTAATTTGTGCTGCTAGCCAGGAGAATCT
TGGAGAAGAAAAAAGCTATTTTAGGGACTCCTGGGTGGCTCAGCTGTTAGGCGTCTGTCT
TCGGCTCAGGTCATGATCCCAGGGTTCTGGGATCGAGCCCCGCATCGGGCTCCCTGCTCG
GCAGGAAGCCTGCTTCTCCCTCTCTCACTCCCCTTGCATGTGTTCGTTCCCTCTCTTCAC
TGTCTCTCTCTGAATACATAAATAAAAATCTTAAAAAAAAAAAAAGAGAAAAGCTATTTT
ATTTTCTCTAATAGGCAGAAAGTTTGTGTTCTGCTTGGAATATTTATATTGTTTATTCAT
CTAACTGACTCTTATTGGAGGCCTGTTGTATGTGTAAACTAAGGTGCTGTGAATGGTACA
TTGAGTCAGCACAGTAGCCTTAGGGAGGTTGCTGTATAGTGATGTAGATGCATATACACT
AGTACTTGCTTGGGTGTGGCTGGAGGTGAAAAGAGGGACAAGTCCCTTTGGGTCTGGACT
AGGTTAGAGATCATCTTTGTAGTAAACTTTAAAGAATGAGTAGAATTTGATAGTGCCAGG
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TATAAAATGGGTCAATAGGTGGAAATTAAAGTGGAAAATGCTTGAGGCCGGAGACCAGAG
GTGAATAATATGTTAAATGAACTTAGTTATTGACCTAAAGGGCTTGAGAGTGCATCTCTC
TTCAATTATTGAGAACATGTGGCAGATGTATTATTTGCACTTTAACCACATAATTGGTTC
CATCCTTATACTTAGTTAAAGATATTAGATATAATTTTCATTATAAAGAAGATATTGGCT
AAGAAATTACTTTGAATAGGATTTTCTTCTAAATTTTTAAACTTTTAACCTTATTGACAG
GTATGTGTAGTATTGCAGGACAGGGATAATATGATTCATATTAAGCCATCTTTTGAAAAT
ATTTTCCAAATTATCTGAAATGTGATAAAAACCCTTTTCTATTTCTTTTCAATTACCTAT
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TGAGAAACGAGATTTCCTTTTTAAGACTGACTTTAAATAGTTTAATATTAGAATTTTAAA
AATTACCTCACCATTTTTCATTATTCTTAAGCATTATAAAATGTTTTTCTTAAGACTTTA
TTGTTTTGAACTGTTTTTACTTAAACTGTGCAACTATTTCAGGATGAAGATGGATTTCAA
GAACTAAACGAGAATGGAAATGCTAAAGATGAGACTATTCAACAGAAACTTTCTTCAAAA
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ACGTTGAAAGGAAGTATTATAGGTTAGTATAAAGACATGTGGGGTACCATGGTAGAGAAG
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AGATGAGGAAGAGGAAGAAGATTATACTCATGAACCCATATCCGTAGAAGTACAGCTCAA
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