SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000158_2.0
Identity
TranscriptSelenocysteine synthase (SecS)
SpeciesAiluropoda melanoleuca (Panda)
Transcript IDSPT00000158
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000061_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000158_2.0 # Transcript # Selenocysteine synthase (SecS) # Panda (Ailuropoda melanoleuca) # Full length # Reverse
GTCGAGAAGCACATGATCTAGCTTTAAAGCCATGTCTTCAATACCCACATCTTCAGTTTT
GTCGTAATTGTCAACTCCAGATGCATTACTCTCTTTATTTTGTTCTTTTCTTACTGTCTT
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CATTTATATATTTTCAACTACTATAAAGTAACTAGATCACTAATTTAAATGCTCGGTATT
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TCTCATAAGCAGAAACAAATCTGACAGACAATACTCCTATGTAGAAAACATAGGTCCGCC
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GCCAGTGTGGTCACACTTGTAAACTAAGAGAAGCCTGACGAGTAATTAATATGTACTTAA
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CATTTCTGATACTTGAACAAATCAGTTTTAACCAGTTCTAGTAATCACTTTGTAATGCCA
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GCTGGGTGGCTCAGTGGGTTAAGCATCTGCCTTCAGCTCAGGTCATGATCCCGAGGTCCT
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TGCTGCCACTTTACCTACTTGTGATCTCTCTCTGTGTGTCAAATAAATAAAATATTTTTT
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TGCTTGTCCTTTCATAATGCCAAACAGATTTATAATTGTTTATTTAGTATCTGGATTTCC
CCGACTATAATTTCCATGATGGTAGAGACTATGTGAGTCTCATTTGTGAATTTACCTTAG
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GTGGAAGTGGAAAGGAAGAAATGAATGTTGGGAAATGTTACAAAGGACTCAAGGGTATAA
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AGGGTCCCCGCTAAGTAGGGAGCCTGATGTGGGGCTCGATCCCAGGACCCCGGGATCATG
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TCCACATGCCCACCTGTGAACCAAGCTAGCTAGATCACATGCCCACCGCTCTGAACAAAG
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TTCCCAACAATAGTGATTCTGCACAAGCAACTACCTTATATCCTTTCTAAAATATAACCG
AACTTTTTTGGCCAGGATCACTAAATTTATTCATTGTTTTTGCCTCCTTTGGATATTAGT
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CCATTTCCTATAAAAATGAGAATAATGGGAATACCTCACAAAAAAAATCTGTGAGTTCAA
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AATCATTTGAAAATCTTTGTTAGGTTTATTGAGACATAATTTACATACAGAAAAATTTCA
GAGGCCCAGTGTTTAGGGGCCCACTTCTATGAATTTGGACAAACACACACAGTTATGAAA
CTACTCCCACTATCAAGATACAGATCATTTTCCCATCCCATGAGTCCCCTCCCTCAACCC
ACAACTGTCCACCACTGATCTCTTCTCTGTCCTGATATTTTTTGCCTTTTCCAGGATGGC
ACAGAAATGAAACCATACAATATGTAGCCCTCTGAGTCTGGCTTATTTCATTTAGTATAA
TGCATGTGAGAGCCATTATTCTGTTGCTTCTATCAGTAATCTGTTCCTTTTAATTGCTGA
GTATATATATGTACCACAGTGTGTTCATACACCAGATGATGGACATTTGAGTTGTTTCCA
GGGTTTGGCAATTATGAATAAAATCACTATAAACATTCATGTATAGGTTTTTGTACAGGC
ATAAATTTTCATTTCCCTTGAGTAAATAGCTAGGAGTGAGATGGCCTAGTTTATATGGTG
AGCATACATTTAACTTTATAAAAACTGCAAAAGTGTTTTCCAAAGTTACTGTACCATTTG
TGTTCTTACCAGCAATGTCTGAGAGTCCTCTTCTTGCTTGAGATCCATGCTAGCATTTAG
TGCTGTCAGTTTTCTTTATATTAGCCCTTCTATTAGGGGTGTAGTGATATCTGCCTGGTT
TTCAGGTGCATTTCCTAAAGACTGATGTTGAGCCTCATTTCCTATACCATGTAAATCTTA
AGAGATGTCCTCATAATACAAAGTAAGCAATTACTTTCCATGGACTGAATTGGTGGGGGC
GGAGGGGTGACTACAGGAAACTAGGGAACAAAATTTTTCAACTTCTGTTACATATTCATA
AGGCTGTTGAGAGGATCTATCAGATAATACCTATAACATATCTTAAAATACATAAAGTAC
TATTATAAATCTAAGGGACTGTAATTGCTACTAAATGTTAGAAACTTACAGATACAAAAA
CTGTACCAGGAGCCTCTAGCTCTCCCAGATGGGAGATGAATAAAACATTTTAGTCTGACC
CGCCCTGCCAACACTGTCTCTGGCTACAATTCTGGAGTTGTCCTGAATTAATTAAGCCAG
TTTTTAGTGTTGGAGGCAAAGTCCGGTTTTCAAGCATAAATGTCACTTTTCTTTTCACAG
CCAACATAACCAATGAGTTCAGCATTCCAGTAATGACAAGGGATGAATTTATTATTTTAG
AATGAGAAGCTGGCCAACTTCTGACCTGGTTCTTCCTCCTGTGACTGACATATCACACCT
ATACAAGTCTTCAGACTTCCAAACACTAAAAAGAAAAAACGTCTCCATTTGTCTCTCAAG
ATCCTCTAAGTGATAAATGAACTGAATTTTACTAAATTAAATATGAATCTCTGATGTAGG
AGTTCCTAAAAAAAAAAAAAACCCACAAAAAAAACAAAAGCAAACTCCCCTGTCCACGAT
CCCTCACAATATCTGAACACACAGGAGACAATGATTAACTGAAAACCACCTGGAGTGATT
CCAGATTCAAGTAAATCCCCTAGGACCACACACTAGCTATCTATAGTCTCAAAGTGGCAA
ACCAAAAGGCAAAAACACCAATAATTTGGAATAATTTTAGTCAAGGGTATTATTTTACAA
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GATAATAAAGTAATAAGGACATCTAAAGAAGGTGAAGCTGAAGCTCTTCCTGAAACAAGA
TAAACAAGTTACATCCAGGAAGGGGGAAGAAACATCTAGAAATTAAGATTTACTATAGTA
GCCTAGGTACAAAGGGATTTTTGTTTGTTATTTTTTTCTGAAGATTTATTTACCTGGATA
CATCTTGCTGATTTCCTGAATGAAGGAATCATTAAAGCCAGCAATTATAGCGCCACCTAC
TGGAACCATAAAATTTTTGTCCAAGCTCTGAACGAAAGCATCTATTCTGCCAACCCGAGC
CCCCTAGAATGAAATAACATGTAATATTACATATTGGCTTCTAGGAAAAGAAACGACAAC
TGCTATTAAGAAAGAAATACCATTAAACAATGCATGAAAAATGAGAAATAGATCAAATAT
CTTCTTTTCTTTGTAACAGTGCCAATAAAGGATTAAGTATGAAAATGAGTTTTTAAATGC
TGCTCGTTTTATGTGAAAGAGCACTTTATTTACAACCTGATTTCACACCAAAAAAAATCA
TTAAATCCTTACAGCAACCTTGGGAAGAAGGCAGAGTTTCAGCATTAGTTCAGGTGGGAA
CTCAGCTTTTCACCTTAAAGTTGGCTAGGAGAATAGATTCCTCCCCATGCCTCTCATCTG
TGATTTTCTATTTGACAATAAATGCCAACAGTGGGTCCTGCAACTATTAAGTAATTTTAA
ACACCCTCTGTGAGTTCAAGAGTGGCCACCATAATCTAATGGACGGTAGCCACCCATGTG
GCCAATCAATCAGTTACACATTCACATAGTTCTCTTTGATGCTGGATAATCTACTACCCA
CATGACTACTTTAAGCACTAAGCTCTGTTCCCACCACCACTCAGATAACAAAAGGGAAAA
AAAATTTATTTTTAACACCAACAATGGAAGAATGGAATTTTTTTGTATACTCCTGGCAAT
GTTTCTATATACCTCATGTTTCCTAATGTTATAATCTTAGATGATCTCATTCCACTGCAA
ATGAACTTCAAGTGAAAATCTAATATTCCGGTGAAAAATTGAATACTTACTTACCAGAAA
TGTAAAAACCAAGTTCTAGTCCGCATCCAACATAGTCTGTGACCTTCTAGCTAATGTGCT
TCAATTTTCTCCTCTTAAAAATAGAGATACTATCTAAATTTCAACCAAGATCGTTTTTTT
CTTTATCTGTAGCAACAGATTTTCAATCTGTATTCACAATCTACATTCCTATTAATATTA
TAACCACATTTGACCTTCATCTTCACACTTTCCCTCCACATCCATATCTCAGGGAGAATA
GAAGAAGCAGATAGCTGGCCTAATCTGAGAGACCAGATCCCGGCAATAGGGAGAAGCACA
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CTTCCCCTGGTACTCTTCTAATTTCCCCATAAACTATGACCAAAGAAAATCTCACCATAT
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AAGTAGTAGAACGTAAAAATAAAGAGGAATTCTTAGAGTTGTCTTTTATTAACATTTAAG
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GTAGCACACTCCGTGGTAAGAAAACAAATGCAACTAAAGAATCATCGAACTTTACATCAG
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CTCCAATATATGCCTACATATGTTTTAAAAGAAAAATAAAACTTTGCAAATAAACGTGGA
AGTCAAGTATGGGGTTTTTTCCCATCTTTTAAAATGAAAACACATTTTTTGCCAGTTTTA
CTGAGATATAATTGACACATTATGTGTAAGTTTGAGGTGTATGATATGATGATTTGATAT
ATGCATATATTATAAAGTGATTGCCATAGTAAGTTTAGTTAATATCCATCAAGTTTGGCT
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TGTATTTCGCAGAAAAGTGGAAGAACAGAGAAATTATCATATTTGGGAACACTACCAATT
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ACTCAAACTGTTTCCATCTCCCTGTTGCATCTGGTTTATATGCCCATTTGAATAGGGAAG
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CAACAAAAAAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGGTTTTCTACTTCAAAAA
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CACCACAATTGCCCAGGAAATTGTTGCTATCCATGACTGCAAGTTCATGTAAAAAAAGTT
CAAGTGTACTTTCTTCCCAACCATCCTCTGGACACTTGCCCTGGGGGGGAAAAAAAAGAA
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GGGCAGGACGCGGGACTAAAGGGGTGTTGGGCGGAGCCAGAGGCTTTGGGGGGCGCGGCA
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CGAGCGGCGGGCCTCACAGCCCTGCCGCACGTAAGCCGCCGACACCAGCCGCTCGCCCGC
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