SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000159_2.0
Identity
Transcript15 kDa selenoprotein (Sel15)
SpeciesAiluropoda melanoleuca (Panda)
Transcript IDSPT00000159
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000062_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00000159_2.0 # Transcript # 15 kDa selenoprotein (Sel15) # Panda (Ailuropoda melanoleuca) # Full length # Forward
ATGGCGGCTGGGCCGGGTGGATTGCTCCGGCCGGCGTTTGCGCTGCGGTTGCTCTTGGCT
GCTGTACTTCAAGCGGTAAGTGAAGATCATGTCCGCGGAAGCCCAGAGCGAGTAGGGAAT
GTTGCGATGAGGGATACTAAACAGTCGGTCCTGTGTGGTAGCCACACTTGGAGAGTGTGG
GAGGACTGGGCTTCCTCAGCGACCGCTGCGCCCGGAATGCTACGTGGCTTCATTCCTCGT
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GGGAGTTAGGGCCTATCCCAAAGACTTCCATAAACAGCCCCTGCTTTTCTTTCCTCAAAG
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GATCCATGCACTTAATGTTAATCCCTCGCTCAGACCATCAGCATCTCTCTCATTAGCACT
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TGGCTCATATGTATTTGTTCATTGAAATCCCTCAGAGTTGGGCACCTGGGTGGCTCAGCC
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CTCATGCATGCGCACAAAAATAAATAAAATCTTTAAAAAATAAAATCCCTCAGAGGTGTG
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TGTGTAAATTGGTGATGAACCCCACTCACTCCCACAAATACAAAATGACTCCAAAAATAG
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GGGGAAGTATGGAGGATTGTTGGAAAAACACTAAAGAGAAAACTACATTTCATAGTCTGA
AGGGGGGGGGTAGTGACCAGGTGGAAGAAGTTGTTTGGCAGTGGTTTAAAAAAAAAAAAA
AAAGCCAAATCTTTGGTACCTGACAGATGAATAAAAAGGGAATGAGGGAAGAATTTCTTG
GCACCTTGAGGTTGAGCTACCAAGATGGATAGAGGACTTAGTTCCTACTTTGTTAATTTA
CCTCTGAGTCCTTACACTAGACAGGTTTTTATCACTGTGCTACTGTGTAGCCCTTATTTA
AAGTTAGTAGCAATGTATAGTTCTCAGAATTCCAATAAGGCGACAGCTGGGAGGATATAA
AGTAATTTAATCTGAAAATACATTCTGAGTATGCTTTAGCATTAGAAAAGTAATATTTTA
GTATGGCCTATGGGAGCTTTCCCTGGAGCATCCCAGAACTAAGTGGTATTCAAGGCTTCA
TTCAGCTCATACATAATATTTCTTCATTCAAAAAAGCACTATACTGGGACACCTGGGTGG
CCCAGTCAGTTAAGTGTCTGCCCAGGGTCCTAGGATCTTGTCCCTCGTCAGGCTCCTTGC
TCACCAGGGAGCCTGCTTCTCCCTCTGCCTGCTGCTCCCCCTGCTTGTGCTCACTCTCTG
ACAAATAAAATCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAAAAAAAGAGGCACTGTA
CTGAAAGCGGTATAGAATGATACTATGTATCTGAGACATAACACCTTATCCTCCTCTTCA
CAGGTTAACCTCCATCCATCTTATTACAATGGGCTGCACAATTACAATTGCTGGCATTTT
TATTATTCTAAGTAGTATGTATGATAGTGGTGCATCAAGGATTCTGTGAGATATAGTAGT
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TGTTGTCTTAGATTACCTTAATTATCCTAATTAAGCGTCTACTTCCCTCTCTGTAAAATG
GGGATAAAACCTATTTCAGAGTTGTTATGATTAAATGGAATAATGATATAAAGTGCTTAG
TGAAATATCTGGTGCTTTGTGAGAGCCTGCTGTCATGGCAGTGTTTCTGGTATTCATTTT
TCATGGGGTTCATCTGTAAACCCATCTATTTGGTTTAGTCTCAGATTTGAAATCCGTTCA
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ACAATATGGTTAATCCAGTTTCCCTGCCAACAACCCTCTCAAGTAAATCAGTGAGTAATG
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TCTTCGATTTTTAGTAATAAAGAATGAACAGGCATAACTTATAACTTTGAACTCCTATAT
TATTTAACATTTGATATTTATTAGTGATGTACTTTAAAATATGTTCTGATATCCTTAGAT
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GCTCAGGTCATGATCTCAGGGTTGTGAGATGGAGCCCCACATTGGGCTTGTGCTGGGCAC
GGAGGCTGCTTAAGTTTCTCTGGCTCCCTCTCTCTCTGCCCCCCTCTCTCTCTGCCCCTC
CCCCCCAAAAAACAAAGCCTTGAGTCTGCAAAACTAATGATAGAAGAGCTAGAAAGTAGT
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GCGTTGGCATAACAGTTTCTTATATTTGTTAAGCAGTTCATGGTTTCAAAGTGATTTCAC
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CTGTGGGTCAGCAATTCAGGCAGGTTATACAGCAGGGTGAGCTGTGTGTTCCATGGGGTC
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GTATTGACTGGCAGAAGACCAATTGGCTGATCAGCATTTTGGGCGAGTATGCCAGCACTC
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GGAAGACACCCACTCATTTATTTTTGTCTGTGCTGCTTTTGTGCTGCCATACCTGAGTTG
CGTAGTTGAAACAGAAACCATTTAGCCACCAAAGCCTAACACAGTTACTATCTGGCCCTC
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AATTCCCCCTACTTGAGGCTGTAGTTTTCACCAATTCATTTGTTCACAGATGAGAACTAG
CTTTAAACACAGAGTAATAACAGTTTAATGCTTGCCCTCAAAAGAGTTCACAGTACTACG
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GAATTGTCAAAACTTGTTAATTAATTGCTTGTAAGAATGGCAGAGAATGTAGAATCTAGG
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TTGCAATGTCAGTGGAACATATAAATGAGGTCAGTTAGGCTGTTGGCTTTGGAGGTTTGA
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GCAGCACTGAAGAAGGAGGACAAGCCCATAGAAAGAACAGCTGGAGCCAGAACAGTTTTG
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AAAATTATTGCTCTTTTATCGGTGAAGAAATTAAAGCTGAGGGAGGTTATCTTGTCCAGG
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TGGAAGCTTTCCAATATAAATATGGAATAGTGTTTTATTTCTCAATTTGTTTATTTTCAG
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CTTTCTGGCCCACTAGATCAATTGAAGCAACTAGGAAGGAACAGTGAAGGTTTATATACC
AGGACCCCATTCTACCATGGTTGTTTAGCAGAGGGGTTGCAAAATTATTATAGCGTGCTT
GGACGCTGAAGTTCTCCAGTCTTCCTAACTTCTGGCCACGTGAAGATGCTTATATTCATT
TGCAGTAAGAACTCAGCCTTACAGTGAAATTCGATACAAAAGTATAGCAGCACCTAGGGC
GCCTGGGTGGCTGAGTTGGTTAAGTGGCTGCCTTCAGCTCAGGTCATGATCCCAGGGTTC
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TGTCCTGTTGTTCAAATTAATAGTTGCCCAATTTTTAAATCTTTTCATAAAAGCCCCTAT
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TGTTTAGATCATTGTGAATGTAAATTCTTCAGAAGAGAAAATTACAGGAATGTTTTAGCA
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TCTAGGTACCATTTATAAACATTAGGATGTTGGCTTAATTGTAAAAAGCATACTAATTTT
TAGTTTGAAGAAAAAATGTAAACTAATGAAAGAAAATATTTAAATTTAAATATTTAAATC
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ATGGAAGGGAAGGGACCTCCCCCCCCCCACTACTGACTAACTTTTTCTTTGTCGTGGGAC
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GTTAGATCACTAAACAGTTGTTAGCTAAGTAGAGAATAACATAAGACCATTTGGCTGCCA
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GCTGACTTTAAAGATTTAGCTCAAGTGTCTACTGACTTGAGCTAAGGCTTCCCTAATTTC
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TCTATATACCAGGCACCAACCTAGGCATTGCTGATACAAAAATTGAAGGGCATTGGGCAC
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GCAGAGTTGGCTTGAGATCCTCACTCTGCCTCTCCCCCTCTCCCTGCTCACTCTAAATTA
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TGAGTCTCACAAGCCATGCTAGGAGGTCTGGACTTTATCTTGAGGGAGTGGGAGCCCGTG
GAAGTTTGTAGACCAGGGAGTAACTTGGTCAACTACTGGTAGACATAGAAAAGGTGATTT
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TCAATAGATGGGTTATTTTTCTCATCTTTTTTATAGTTTTTCCAGTTCTGTGAATTCGAA
CTTGATTAAGGCAGCTTGGTCCTTTTCTCCTATCTCCTCATTCATTTAAGGTTTTCATAT
TTTAATGATTTCAGCTTCTTCCGGACATAGTTATTATAGGACTTTTATATTTTTCCTTAA
CTGTATGCCCCTATTTCCTTAGCTAGCACCTGTTCTCTTTAAGATCTTGGTTCATCAAGA
TCCTTGTAGTGCCACTGCTTTCCTTTTTCTTTTGAAATATTTTTTTTTAAAGATTTTATT
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GAGGGAGAAGCAGGCTCCCAGTGGAGGAGCCTGATGTGGGGCTCGATCCCAGAACGCTGG
GATCACTCCCTGAGCCGAAGGCAGACGCTTAACGACTGTGCTAGCCAGGTGCCCCTCTTT
TGAAATATTTTTATTTAATTTAATTAAATAATTATCAATTATTTAGTTGGTTTTTAGTAC
TTCCTCTTCTTTCACATTTATACCTACCTTATCTGTGAGCTGTCATTCTGAAGATTTGGC
TAGTGATGAAACCAGAGTACCTTTGGAGAGGAAAAGAATTGACTTAGCTGAATTAGTCAA
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TGTGCCTCTCCCCCCTCACTCATATGCTTGCACTCTCTCTCTCTTTCTCTTAAATGAAGA
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TGATCACTCCATGTCTATTTCCTTATTTATGAATTGGTGATAATAATAGTTACTATCTCA
TAGGGTAGTTATGAGGATTAAACAAGCTAATATATATGTACACTACTTAGAATAGTCCCT
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TGGAACAGAATGTTCTGTTATCCACTTTCGAGCTTCTGAATTAGGTGAATCAAGAAAAAT
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TGACCATTCTGATCATTTTTAAATGCATATGAAAATTACATTTGGAGAGAAGGGATTTTA
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TGATTTCGGCTCAGGTCTTGATATTAGGGTTGTAAGATTGAGCCCCTCATTGGATTCGTG
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CCCCTGCTCAGCGTGGACTCTGCTTCTCCCTCTCCCTCTGCTTGTGCTCTCTCACACTCT
CTGTGTCAAATAAATAAAATCTTGGGGGACCTTGATAGCTCAGTCAGTTAAGTGTTTGCC
TCCAGCTCAAGTCATGAGCACAGGGTCCTGGGATCAAGCCCTGCACCGGGCTCCCTGCTC
AGCGGGGACTCTGCTTCTCCCTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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CAGATTTTTTTTTTATTTGAATTTTGGAACATCTTGGTCTCATTCACAGAATGCAAGTAG
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GTCAGGTATTTGATAAGGGGCTTTTATTTTCACTTAAAAATATACTACTCAGATAATATT
AAAAAATAAAAAATATTGATCTTTGGTAATGATTGTATTACACTAGATTTGAATAAATGG
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GAGACCATAGAGAGGAAATATGAATATATGTATAGTTTATTAGAAGTTTATCCTCTTTTC
TCTGTTTGTAAAATTTTGTGAAAGAGTTAAATTATTATCTTAGCTACTAGTTTTGTGACT
TTGAGTCAGCACATTACCCTGAAATCTTCAGTTTTGTTGTAGTAATTACACTGGTTCACC
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