SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000326_2.0
Identity
TranscriptSECIS binding protein 2 (SBP2)
SpeciesCallithrix jacchus (Marmoset)
Transcript IDSPT00000326
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000229_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00000326_2.0 # Transcript # SECIS binding protein 2 (SBP2) # Marmoset (Callithrix jacchus) # Full length # Forward
ATGGCGTCGGAGGGGCTGCGGGAGCCTGAAAGCGAGGTAAGGGCTGCCCGCGCCGACGGC
CTGCCTCCCACTGGGGGCTCGGTCGGGCCGTGACGGGGCTGGTCCGACGGGCGTGGGTCG
GAGGCTGGTAACGGCACGGCAGCGCCCTACCGGGTGGCCGCTATCTCCGCGCCCCGCCCC
GGGCCCGCCTTGGGGTGGTGGTCAGTGGCCGCAGACCCCGCCCACAGTTAGCGCCGCGTC
TACCGTGCGGTGTCACTAAGAGCAGTGACTGCCTCCCTGCCCCGCGCTCCCCGCGGTCGG
GGTGGGGGGGGGGTTCTGGCAAGCTTCCCGCGTTCTTGGGAACTGTTAGATTGTGTTAAA
GGACCTTGCGTTTTCCTAGAAGTCATTCTCCTCTGTACATACTCAGCATTGCCACGAGAT
GGAGCCCTGTTGATCGAATGCATTACTTTTAGACTCATAAAATTCTCGGTGAAAGTGAAT
CTCTTACTACGTAACTAAAAAAATTCAATAAAGAAATTTATTGAATTTAGATTTCAAAGA
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ACGAACGTCTGCAGTGTGTTTTGCGTGCTGTAGTTAAACATTCCACGTGTATATTTGACT
GTAGTAGTTGTACTGTGTGCTTTCTACAGTTTTGTTATTTCTAACTGAATCTCTTATTCC
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CAGAAGTTTTTGAACAACATTGGGAACATTTCTGGGTCTGTTAGGAACACCTCCTTGGTT
TTGCTTGTTTGTTTAGATTTGCTTAATCTCTGAATGTTTGTACCCAAAACCTAATTTTTT
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GCTGGGACTTCAGGCGCTCACCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGT
TTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGCTGAGCATGTATCTTAATAA
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TCTGTGTGGATAATTCTTTGGAAATTGTTGACTTTAGCTTTCCACAATTTTGCTTTATAT
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AAGACGGCTTACATTTTTCCTTAAATTTTCTTTTTCCTTCTCAAGATTCATTCTCTAGGT
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GGAATACCCTCTTTTCCTCCTGTCTTTCATCCATTATAAAGGGGAATTGGACATGGGTCT
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TGACAAGAACTCAAAGCCATCTGCTAGATGGTATTCCTGTTACTCAAAATAGTGGTGGAA
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TCTTTGTATGTCCCCTTCCCTCATCTTTCCTTAAAGAAGGTATAGTAATCTTACAGAATC
TGTTCCCCTCCAGTACCTTTCACAGTGCACTCAAAGATACTCATTTATTCATTTGGAATT
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ATGCAGACAAAGTAAGTTTGTTCCAAGTAATGTCCATTGTCATGTACATCCTTTGTGACA
AGTCCTGTGCCACCTGTGTATGAGGATGTAGGCCTTTTGTTTGAGAATTATTGTATACTT
TCTCTTCTTTCATGGTTACCACAATCCATGAGGTGGCAGGCAGATGTAATGTTATTTTTG
CACATGGGAAACTGAAGCTGGAAATGTTTGTTCAGACTAATTGAAATGGGTAGCACCAGA
ACCAGAATTAACGTGGTACTCTCCAGAACTGCCACCAGGTGTCCACAAGAGGCATTTGAG
CATTTTCACCATCTGTCAATATACTTTGAAAATTTTAGCACCAGTTGATGCTTTTGAGTT
ATAGCAGATCAGCTATGAGAACAATATAGCATTGTACAGCTGAGCACATGGCTCGGGTCA
GTTTGGTGGATGGAGGAGAAACTGCATCCTCTTTGGGTCCTGGCCTGACTGAAGGGACCA
TGCGCATGTTATGTTTGGGAGATAGTAGAGGAATAAGATGATAATTTTGCGGGGAAGCTG
TCAGTAGTTTGGAAGCCTGCATAGTACAGCTGAATAGTTTTAGGTTTGCTGGGTAGGCAA
TAGAAAACTTCTGGTAGTGTTTTAAATGGGCTCATTGTAATCACTCCTGAATTCTGGTTA
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GGTGGGAAAGGTATTGTAAAGATATTCAGTTGAATATGTGGAAATAATTGTAGAATCATT
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CAAAGTCCAGGCCAGGGAGCTTTTCAAGTCATGTGATGGTCAAGCCTAGACCCAACAAGT
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TTTAGGGTCATCTGGGCCACTCCTGCCATCTAGAATTTCCCAGACACGCTGTTTGAAGCC
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TGGACCCTGTCCCTGCTTTCCTTTTTTAGCTACAGTTCTTTTGTCTGTTTATTTGTCTGC
TTGTTGGACTTGGGATAGTCTTTTTCACTATTTTTTTTCCTAACAACCCATCTTCTCTTA
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ACTCTTCTCTACAAAGAGCTAGTCCTCAGTGCTGTATGTTTGGAGCAGTGCTAGGCCAGT
TGTTTTATGGGACAGACAAAGGTCAGTAAAAAGAGTTTTACTTGGTTTTTAATTAGGAAT
ATTTCATGTTAAAATTAATTACCTGAAATTAAAAGATCTTAGAAAATCTAGGTTAACATA
TCATGAAATAGTACGTAGTGAGACGAGGTAATATATGATTAAGTATTGGATAGAAGTGAA
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CTTACTTGCAGCAGATTAGTAATACGATTTCTAGTGAGCGGTACCTGTGCTCTTACCTGC
TGACAGCGTTAACAGTTTGAAGATTTTATAGGGTGTGTCACGATTAGGTTTGGATTTTTC
TGCCTTTTAGTGTACTAGTACGTTTTGGAATAGCTTTGGAAATTAACAAACATTTGCTAG
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GGTATCTTCTTTGCACTCTGGTTCTGATAGTCAGCAAAGTGCAGGATGTGGTGGTGGGCT
TGGAGCAGGGAAGGGCTGAAGAAAACCATTTGTAGGATCCCTGAGGGAGGCATTGCAGGC
TATTGGATCCCCTCTCAGCAGAGATAATGGTCTTCAGGGGCATTTTGGCCAGGGTTGCTG
GGAAAGGCTTTTCCAAATACTCGGCAGCAGTTGAGTAAAAAGCTGCTGGAGCATATTCTG
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TCTTTGCAGGGTGAGGAAGAAACACTCAGATTTTATTTGGCTTTTAATTAGGGATATTTA
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GTTTACGCTTTTTACTTAGGCAGAAAATATACACTGAAGACATGGCCTTTGGAGCTTCAA
CTTTTCCACCTCAGTATATGTCTTCTGAGATGACTTTTCATCCATATGCCTATTCTCCTT
ATACCCTTGACTCTACACAGAATGTTTACTCAGTGCCTGGCTCCCACTATCACTATAACC
AACCCAGTTGTTACCGAGGTTTTCAAACCGTGAAGCATGGAAATGAGAACATGTGCCCTC
TACAGCAAGAAATGAAAGCTCTGTTTAAGGTGAGTAATGATAGAGTTTTGTTGTGTCCTT
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GCACTGTGTATTTTTTTTTTATTTAATCTTTTAAAAATAATTTGGGCCAGGCGCGGTGGG
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ATTTTATGTTGCTTTTTAATCTTTTCCTGCAGAAAAAAACCTATGATGAGAAAAAAACAC
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ATAACCAACTATGTAGTATAAGCCAGCCTACCCCATGTCCCCAGAAACTTTCCTGCTATA
TATACAGCTGTTTCTATGGGCTTGTTCATTGTGACTACTCCAAGAATTGAGACCTGGGTC
TGACACAGCTGATGGCGTCAGACTTCCTGAGCGATTCTAGGGGTCTTTCTTCCCAGGGAT
GGGATTATAATTTGGTACCTGTTGCATTGTGGGCTCTGAAGTGCCTATAATTTGTATTAT
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ATCCAATGCATTTCAGGAGAAAGATGAGAAAGAGGCTATGCTTTATTGTTGTTGTTGTTG
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GGTATAGCCTACTACCTGGCTAGGCTGTATGATATAGTCTATTGCTCCTAACTTATAAAC
CTTTAGAACTGTACTGTATACTGTAGGTAACTGTAACAGTGGTAAGTATTTGTGTATCGA
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TCAAGAGCAGTCTGACCAACATGGAGAAGCCCATCTCTACTGAAAATACAAAATTAGCTG
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CAACCTCCTAAGTAGCTAGGATTATAGGCACATGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTAT
TTTTAGTAGAGTCGGGTTTTACCTTGTTGGCCAGGTTGGTCTCGAAAGCCTGGCTGCAAG
TGATCTGCCCGTCTTGGTCTCCCAAGGTGCTGGGATTACAAGTGTGAACCACTGTTCCCG
GCCAACTTTTTTTCTTTTGTAAGTATAGGGAGTATATACTCCAAAGATAAAAAGTATAAT
ACATAAACAAGTGACATAGTTGTTTATTATCATTATCGAGTATTATGTACTTTACATAAT
TGTATGTACTATACTTTTATACACCTGTTAGCTCATCAGTACGTTTGTTTATACCAGCAT
CACCACTAGCATGTGAGTAATGCATCACACCATGACGTTACCAGTAGGCAATAAGAATTT
TTCAGCTTCGTTACAATCTTTTGGGGATGTTGTATATGTAACCCATTGTTGACCAGACCA
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GCATGATGGCCCAACCAGAATGATTGATACTTCTGATCATTTAAACTTTATACTTTTACA
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GGGACCTGTCCACTCTGCCTCTACTGACACTTCTCTTCTAAGAGAAGTAGTAAAACCAGC
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TTCAGGAAAAGTTATTACAGCAGGTAATTTCACTTTGTTCAACATTCGATCTCAAAGTTT
TAGTCCACCATGTTGAGGTATTTCTCTCAAACAGATTGATTTGAGACTACCAAGAATAAG
TAGCATCTGATTAGTAGTCCCTAAAATGGCTTCTGATGAATTTCCACTGAAGGAGTGGTG
GGATACATGCCAGTATGAAGGCAAGCAAAAAGAAGAAAGATAAAAAAAAACAGACCTCAC
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GTGCCTGGACACTAAGGCCTTGAAGGGTCAGTGATAGTTACAGGTAATGCACACAAGATA
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AGCATAGTGCTTTGAAGTCTGGTCAACTGATGGCTGTCTAAAAACCATAGTTCCATCTGG
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ATATACTTTTGAATTATGCATGGGCTTTTAAACAATTTATTTTCCTTCTAAGACACTTTT
TCTTGATATTAGTAATGTCTATAAATGACATACACACAAAATTTGTCTGAAATTGTACAA
CCAAAATTAAAGCTTGCTTAACACATAATCTTTTTAAAATGGTCTCTTGCAGGAATTTCT
CTCAACTTGAAATTATAAATATGTGTAATGTTATGTTTGAATTTTTTAAAACTTTGTTAT
TTTTTCTATGTCATTAAGTATTCTTTTAAAACAACTGTTGCATTGGATCTCTCATACTGA
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TTGGTAAGCATAAAAGGTATGTTTACTAAAAAGACAGGCTGTGCTTTAATAATTTTATTT
TTTATTCCTGGATCGTGTTATGAATTGGCAAATGGGTAAATTTGTGAAGCATATGAATTT
TTTAAATTATTTTACATCCATTGTCTACTTAATGGATTCAGCTTCAAATTTTTTTATTTA
CTTTTGCCTCTGGTGTCGTTAGTCACTTGGAGGAGCCTTTTAATATACTTGACCCTGCGT
ACACGTAGTGTCATTATATATCTTATGTTTAATATGTGAGACAGCTTTCTGTCTTTATTA
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CCAAGGCGGGTAGATCACGAGGTCTGGCGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATAGTGAAAT
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GTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTGGAGG
TTGGGGTGAGCTAAGGTGGTGCCACTACGCTCCAGCCCTGGGTGACAGTGCAAGATTCCG
TCTCCAAAAAGAAAGGTCAGGTGGGAGGTTGCGTACGTTGCTGGCTTACATTTGTTGTTT
TTGTAGACAGACATTTTGATGGATTGTTGGACTTTGGTGTGTGGGCCTCGTGAATGATGG
CTTTCTCATTTACATGGGATCCTTGCAGCTTTAAGAATTGTGTGGTGCATCTGTGCCAAC
TTGGAAAGTTTGTCAGTGATATGTTAAAGTTTTTTAAAAGTTGCCACAACATCATGTGTG
GTATGATTCCATTATGGGAATCCATATAAAAATGGTACACAAATGTTTATGTCATAGGCA
AAGAAGTAGAAGGATACTAATGAAGCTTTAGATGTGGGTGGTGTTTTCCTCTAGGGAGTA
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AGTGATTACTTTGAATTTGAAATGGAAAATAACTGCTTTGGCTTTTTAAAAAAATAGATT
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ATATGCCCCTTGCCTGCCTGCAACACACAGCTTCCTTCATTATCAACATCTTGCTCTTGA
GTGATGCATTTTTTACTATTGATGAATGTGCATTGACATGTCCTCATCACCCAAAACCCA
TAGTTTGTTTTAGGGTTCACTGTTGCTGCTGCTGTTGTGTCTTCTAAGACTTTGGGGAAC
TGCATAATGATGTGTGTCTATCATTGTAGTATGGTACAGAGTGGTTTCACTGCCCTAAAA
ATCTTCTGTGTTCTACTTGTTTATCCCTCCCTCCCCTCAACTCCTCCTAACTACTATCTT
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GTTGCCCTCTTAGATTGGCTTCTTTCACTTAGAAATGTGCATTTAAGTTTCTTCCATGTC
TTTTCATGGCTTTGATAGTACATTCTTTTAGGGATCCATAATAGTTCATCATCTGGATAT
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CCTTTGGTTAATTACCAAGGAGTATAATGGCTAGATCATATGGTAAGAGTATGTTTAGTT
TTGTAAGGAATTGCTAAACTATTACATATCTTCCAAAGTGGCTGTGTCATTTTTCATTCT
CACCAGCAATGAATAAGGATTTCCGTTGTCAGTGTTCTGGATTTTGGTATGTAGTAGTAT
CGCCTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTATTGACATCTAATGTGTTTGCTTTTTAGGGTGAA
ATGGTGAAAAATGAATCTGTAACTGCTAATGCTGCTACCAATTCTCCTTCATGTACAAGA
GGTAAAAGTGGCTACAAAATATTAATTTTTAAAATGTCATATATTTTCTGAGTTCATTTT
TAACTTCAGTGAAATTGAAATGGTTTCTGTTGTAAAGCCTTAAGATAGCTAATGAGTTGT
GGGTAACCTAACATCAATGTTAGTTTAGAAAGTTAAAGTAAGTAAATGAGATCTCATGTC
CACACACGAGTATAAAATAAGAGACAGGAATTCTAAATGAAATATACTTCCAATTCAGAG
AGAAATTTTATGAACTGAGCAATGACTACTTCCTTTAGTATTGCCTATTCTCAAAAGTTT
TGAAACCCTTAAAGATTGAGAACCCCAAAGAGCTCCTGTTTATTTGGGTGACACCTGTCA
ATATTTGCCCTTTCAAAGTTAAAACAAATGTTTTAAATAATTGATTTGCTTAAAAATAAC
AATAATAAGTGCATTACATTTTATTTTATTTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTTGCTCTTGT
TACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCGGCTCACCACAACCTCCACCTCCTGGGTT
AAGGCAATTCTCCTGCCTTAGACTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGCGCCACCATG
CCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAATAGAGACGGAGTTTCACCATGTTGACCAGGATGGT
CTCGATCTCTTGACCTCGTGATCCATCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG
CTTGAGCCACCGCGCCCGGCCTTACATTTTAACATACCATATTTTTATGAAAACCATTTT
TCAAAATTAAAAAGCCATAGTGCGGAGAGCAGCCTTGATTTCCGCTTGTGCAGCTCTGCC
ATCTGGCTCTGTAGATCTGCCACAGCATTCACCTGTGCCTCGTGGTCCTGCCTCATACAG
CATTTGGAAGACTCCCAGGTGTTCTTGTGAGAGAGGGAGAGTATTGAAGGCAACTAACAC
GTTCGTACTCCAGGAAAAGGGTTTTGACCCCATGGACCCCTGCAAAGGTCCTGGGAGCCT
CGTGCCACACTGTGAGGACTATTCATCTGTCCTGTCCTGGCCAAGAAGTAATACATTCAG
AGAGAGTTCCATGTATCCTACTTTGAAATTTTTACAGTAGCTTGTCCTAACAGAAGACAT
TTTTGTAAAATGATTCCAAATGTATTCATAGGGTGTTTTCTTTTGTGTTCTCATGTTTGA
TGTGTATGTGGTTGAGTAATGGTCTGTATTTCACTGGCTGCTCTGAGGATGTGCAGTTCT
CTAGTGATGAGAATAGTCTGCCTTACCCTTGGGTGTAGCCACAGGCTGCTAACAGGTGTT
CACCTGCCTGGGTCCTGATCGATGTCCTTTTGTTTTGTCTGTATATAGAGTTTGATGGGC
ACCTAAAGGAGTAGTGTTTGTTGTACTTATGCCTCTGTTCTAAAAGAAATAAATTACCAG
TTATTGTGGTAGCTGAAGTCTAGTGATCTTTGACTTCTGATGTTAAAGGTACACTTCAAG
GTTAGTAGGGCCAAAATTTGAACTTTAGTTTGTTAATTCTGTGTGTTTGTCACGTGGACA
TTTATTTTGGATTGTTGTTTAACTAAAACTGTTTGTCTACCCACCTCCAAACCCCAAGTT
ATAAAACCAGTTTCCAGGAAAATTAACCTTACAAGTTAAAAGGGAAAAAATTCGGCATAC
ATGCCCCAGGAAGAAAAACAAGTTTAGTGACTACTATAGTTTCCAAAAGGACGTTGTAAA
TGATAGCCTACATTTATGTATGCTCCAAACAGTTACTTCATGTAATGTTTGAGTAACTAA
GGAATTTCTATTTTACTGTTGAGATTGTCCAACAATTTTGGTTATCTTTGAGCAGAGTTA
TCTTGGACACCAATGGGTTATGTTGTTCGACAGACATTATCTACAGAACTGTCACCAGCC
CCTAAAAATGTCACTTCTATGATAAACTTAAAGACCATTGCTTCATCAGCAGATCCTAAA
AATGTTAGTATACCATCTTCTGAAGTTTTATCTTCGGATCCTTCCTACAACAAAGAAAAA
TACATTGTTCATCCTACCAAAAAGGTACGTATCACTAGAGACAGAAAGTAAGATGGTGGT
TGCCAGGGGCTCAGTAAAGTGGGGAATGAGAAGTTATTTATTAAAGGGTACAGAGTTTCA
GTTTGACAAGAGGAAATCAGTTCTGGAGATGGATGGTGATGATGGTTGCACAATAGTGTG
AGTGTACTTAATGCCACTTTTAAAATGTGCACATAAAAATAGTTAAGATGGTACATTTTA
TGTTATATATATATAGTACTACCATAAAAAAAGATGAGGGAAAAAGAGGTAGGCATTACA
TTTTGATTATGGTGATTTTCTGTGCCACTAGATAGTCTTTGTTTTTGAGATGGAGTCTTG
CTCTGTCGCCAGGCTGGAGCACAATGGTGCATTCTCTGCTAACTGCAACTTCTACCTCCC
AGGCTCAAGCGATTCTCCTGCCTTAGCCTCATGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCGCCA
CTATGCCTGGCTAATTTTTGCATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCTAGGC
TGATCTCACTCCTGACCTCAGGTGATTCGTTTGTCTCGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTA
CAGGTGTGAGCCACCGTGCCCAGTCTTTGGTTAATGGAATTTATTTACTTGTTATAACAT
TTAGAATAGATTTTTTTCCCTTAAGTAATTTTAAGTACTTTTTTTTTCACTGTAGCTTTG
ACCTCCCTGGCTCAAGCAATCCTTCCATCTCAGGCTCCCTGGTAACTGGGACTACAGGCA
TGTACCACCACACCCAGCTAATATTTGTATTTTTTGTAGAGACAGGGTTTTGCCATGTTG
CCCAAGCTGGTCTTGTACTCCTTGGCTCAAACTATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTA
CTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCCAACTTTAAGTTACATTTTTATTGATTCCTA
GAACTGTTTCTTCAAGAGCCTTTTTTAAATTGGTCTAGATATATTCTTGATTTTCATTAT
GTATGGCTATATTATTTTAGATTGAAATGCGGTCTTGTTTAGCATAATCGTTTTCTTTTT
GCGTGGATACTTTTTTATTTCTAAGAATGTAATCAGCTCTTCCACATAAATGGTAGCTGT
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GTTTGTGCTTCAGTATGTCCAATGGGCCCAAGAATTTGTACTTCGAGCAAGTTCCCTGGT
GCTGCTACTCCTGCTCCTGCTGCTGAGGAGTGCACTGAGAACTTCTGCTGTAGGACGATG
TGGTTGGGCTGCTTCCATGTCGGAAGTGCCCCGGGTGTCTCTGTCTCCCCTAGGGCTGGT
CACATCCCCAAGGAAGACTTCTCTTTGCCTGCTGGAGGGACAGGCGAACTTCACCCTGTG
AGCTCATCTTGAGGTCACCACCGTTAGATGTGTGGTGTGTCATACCCTGCAAATGTGTGC
TCTGCCTTACCAGAGGGCTGCAGCTGAGCAACTTGCCTCTTTGCCAGTTTTCAACCAGCC
CTCCTCACCGGTGCATCACCCTATTCCTGGCCTTTGGGGAATTCTGGGGTCCAGGACTGG
CTATTCTAGGCTTTTCTCACTGTTAGCTTAGGTTGGCTAGCTCAGTTGTCCATTTGCTGA
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