SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000397_2.0
Identity
Transcript15 kDa selenoprotein (Sel15)
SpeciesCanis lupus (Dog)
Transcript IDSPT00000397
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000300_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00000397_2.0 # Transcript # 15 kDa selenoprotein (Sel15) # Dog (Canis lupus) # Full length # Forward
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TTGCGCCGGGGAAGACGAGACATTCAGTCCTGAGTTGGTAGCCACGCTTGGGGAGAGTGC
GAGGACTGGGCTTCCTTAGCGCCCGCTGCGCCCAGAAGGCGACGTGGCTTCGTTCCCGGG
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GTTTGAAGATCGTGCCTTTTTGTTTCTGCAACCCCTAAAAGGTGGATTTTTAACTTCTCT
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GTTTTTTTTTGTTTTTTTTGTTTTTTGCCAATCTTAGGTAATTTGAGTTCACCACCTTGC
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AGTTCCTCTGTTGATCTCCTCTGGCTCATTATGGAGCTGTGTTGAGCTAGTAGGTCAGCT
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TTTTACATGTCTCATATCAGGCAGTTACAAAGTCTTGTCAATCTTTCCTTCCTAAATATC
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TTCAGTGGTTCCCTGTTGCTTTTAAGGTGAAATCTGTTCTGAACCTTCCTTAACAAGGCC
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AAAAAGGTAGAGGTGAAGAATTGGAGTCATTTGTTTTAGCATATCTGACATACCATATTC
TCCCTGTCAGGCCTAAAGTAAAGTGTTTAGGTAAAATGTAAAGTTTAATTTCATACCATT
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GGGGGAGGGGAAAAGACCAGGTGGAACATGTTGGCAGTGTTTTAAAAAAAAAATCTTTGG
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TCTGAGTATGCTTTAGCATTTGAAAAGTAACATCCTACCGGAGCGATTCTCAGGAGCACC
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GGAAGCAATATGGGATAATACTCTGTATCTTTGATCTTGAGATGTAACACCTCATCCTTC
TTCACAAGTTAAATTCCTTGTTCCGATGGACCTCACAATTGTAATGGCCAGCATTTTTGT
TATTATTCATAGTGGTGTATACCATAATGATGTATCCAGGATTCTGGGAGATACAGTAGT
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AGCGGTTTGGCGCCTGCCTTTGGCCCAGGGCGCGATCCTGGAGACCCGGGATCGAATCCC
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ATAGAGCGGTTAAAATTAAATAATAGTGATGGAAAGTGTGTGGCAAAATATCTGGTGCTT
TGTGAGAACCAGCTGTAATGGTTATGTTTCTGGTATTCGTTTTCATGGGTTCTTCTGTAA
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ATTTAAATGATTATCCCAGTCAGGATTAGACTCTGTATCTTTCTTAACAAGCGTGACTGA
TTATTTTAAATTTTAATGTTTAGCCTTAATTAAGGTGCACATTTAAGTGTTACTCAGTTC
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GCCTTGAGGGGCATCTGGGTGGCTTAGTAAAGCATCCAACTTGAGTTCAGCTCAGACCAT
GATCTCAGGGTTGTGAGATGGAGCCCCACGTCGGGCTCATGCTGGATGTGGAGCCTGCTT
AAGATTGTCTTGCTCCCTCTCTCTACCCACCCCCAAAACAAAGCCTGAGTCTGCAGAACT
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GCTGGCATTTGAATCAAGATGTCATCAGACTCCAAAATACATGTTTTGCATATTTATGCC
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CTGAATGTGAAGTTCTTTATTCGTATGTCTACTAATTGATGATGGTTGTCAGCTGGGAGC
TTCAGTTGCTCTCTACATGGGACTTTCCATGTTGTCCCTCTAATTTAGGTTACCTTAGAG
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TCCCTTCTTTTATACTCTGTTCATCAGAATCAGTCACTAGCCCCTGCCCAGATTCAAGGG
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GAAAAAGGTTGGCAAACTAGCTAGTGGGCCAAAATCAGCTAGCCCTGTTCCTGTAAAGTT
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GGACGTAAGTTGAAGTTAACAAGATGAAAAGGGAGTCTTAAATGTAGGAAAAGTATGAGC
AACTGTATGAGTAGGAATTTTATTCTTCTAGGAGTTCATTATAGCTGAAAGTAGGGTGGG
ATTGGAGAAGTAAAGTTAGGACTGGCAGTGACCATGTAAGCCACTGAGGTAAAAAAATGA
TTTGAAAGCTCTTTAAGAAACAGAATTGTCAAAACTTGTTAACTAATTGCTTATGAGAAT
GGCAAAGAATGTACAAACCTAAGATGACTGACCTGGGCAACAAGGTGGTCAGGGAAAATG
GTGCCATTTTACTAAAATATCAGATAACATTGGGAGGAATAGATTTAAGCAGAAAAGAGA
AGTTTCACTGTTGGAGATTTTGAATTTGCAATGCTAATAGAATATATAAATGAGGTCGGT
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AAAATAGAAATGAGAAACAGCAGCACTTAAGGAGGACAGCCCTTGGAAGGAACAGCTGGA
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AATGAAATTTGAGATGAAAGTATAGCACCTACCACCTGGCACAGAATTGTAGGCAGTGAA
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AATTCCACCTGTCCCAAAAATAGCTTCCAAGTCTTCTGTGTTTTTCATTTTCTTGGATTC
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CGTTGCATATAAGGTCATATCTAAACAGTGTTTAAAAACTTGATTTTAAATAGATTTAAG
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CCAGATTGAGATATTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCAAATCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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GATGAATCCAGACAGGCAAGCTGGAACCAGGACATCATGAGTCTCACAAGTTATGCTAAG
AGGTCTGAATGTTTTATCTTGAGGGAATGGGAGCCATGGAAGTTTGTAAGGCCAGGAAAT
AACTTGATCAACTATGATCAACTACTGAAAAACATAAAAAAGGTGATTTAAATATATATA
TGTATATATGTTAAAAATACATGAACTTTGCAGACACTTGTGAAAGACCTTTTTCATATA
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TTTTTAATTATTCATCTAAATGTGTATCTCATTTGTAATTTATAAGGATATTGCAGGCAT
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GACTGCTAACTTTAATACTTTTTCAAACAGTATATGACTGTCAGATTAAAAGTTTCCTGG
GATTTTTCCTGGAGATAAGCATAAATCAAATATTTCTTTTTGTTAAGAATTTTTTTAACT
TCTAAGATTTATTTTTTTTAACATCTAAGATTTATAAGATTAAATGTAGTGTTTCAATAG
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CTTATTTCCTTAACCTAGTACATGTTCTCTTTAAGATCTAGATTCGAGATTCTTATAGTC
CCCCTGTTTTCCTTTTGCTTTTGAAATATTTTTCTGTAGTTATTATTTAATTAAATAATT
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TTTGCTCTTCATTCAGTCTTGATTGTATCAGGAGAGAATTGAGAGTAATTAAGAGCACAG
GCTCTGGAATCAGACTAGGTTCAGAAAGTTTTTTTTGCTATTTAGCTGACAATCTTGACA
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TCCCTGGCATGTAATAAATTCTAGGTAGATAGTTGGGGCTGGTGGTAGTTATCTGATTTG
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ATTATGTAGATTGTCTTTTAGTTTTGTTGACTGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTTTTTA
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TTATGTGGAACAAAATAAATTATGCTGGACGTAACTAGATTTCAGATTTTTGAGTCCTAC
TGATTGGCATATTTTAATAAGAAAAATATCACAAAAATGAATTTTAAAAATATGTACCAT
TCTGATCATTTTCAAATGCATATGAAAATTGCATTTGGAGAGAAAGGATTTTACTAAAAA
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CTCAGGTTATGATCTCAGGATCGTGAGATGGAGTCCTGCTTTGGGCTCGTGCTGGGCATG
GAGCGTGCTTAAGATTCTCTCTCACCCTCTCCTTCCTACTCACCCCACTCTCTACTCACA
CATGTGGGCATGCATGTGTGCTTGCTCACGTGCTTTCTCTCAAAAAAAAAATTATATATA
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CTTTGAAACCCAAAATAACATTATAACAGAAAGTAAATTAAACTCTGTTTGTAATATAAA
ATGATCACTTTGTGAAAAAAAGCAAGTTATCAGACTAATTACAATCTGTTTTCCTACTAA
CATTCCTCTGCTGCTTACCATTTTATTCTAATGGTAACAGATTTCGAAGGTTTAAGAAAA
TTTTGGAAGAAAAAACCTTAAAAGTGATTTTTTTTTTTTTTTAACTCTACAGATCTAGAA
AAGGTTTCTTTTGTTTGAATTTTGGAACATCTTAGTCTCATTCATAGAGTACAAGTAGAA
GCCAAGGCTGCAGGTCCCTAAATTATACCATAACTGGTTCTGGAAAATAGCCCAAAGTTC
AAGTTGTTTATAAAAGGCTTTTATTTTCACTTAAAAATATACTACTCTGATAATAAAAAA
TATTTATCTTTGAGAATGATTGTATTACACTATATTTAAATAAATGGACCTAAGTATTGC
ATAAAATAATTTTAAGAATATATTTAGGTCTCTTCCATTTCCCACCCCATTACCTAATTG
GAGTTAGACTAATGCTAATTGACTCACTTTCTATAGTAGCATGGCCATTTTCTATGTATA
TAATACTCTTCCTTCACATTTACATGCATTCCTAGCAAGCCAGAGACCATAGAGACGAAG
TATTAATATAAGTATAGTTTATTAGAAATTTGTCCTCTTCTCTCTGTTTATAAAAGTTTT
TGAAAGAGTTGAATTTTTATCTTAGCTACTAGTTTCGTGACTTTGAGTTAGCAAATTACT
CTGGAATCTTCAGTTTTGTTGTAGTAATTACATTGACTCACCTTTGAGTGTTTATTGTGT
CTTGGTTATATGCTACAATATCTTACCTACATTATTTAATTCTCACAAAAACTCTATAAT
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AAGGTACTTTTTGCATTTATAGTTAACACAATTCCATCACTAGTTTTTATTTTAAATTAT
TAAATTTTTATTCTTCAGTTTACCTTAGATCTTAATGACTCCCATTATTTGGTGGTTTTT
TTGAGGTTATATTAACAAATTTGGCTTATTTAAGGCCCAAACATTTTAAATAAGCCACAT
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AAAATCTGTAGCCAAATCAGAGTAATTTAGAAGTCAGCTGAAGCAGCGTTATTCAAGAAA
GTGGCATCTGTTAAGCTTTAGCCTATCTACTACTGGTAGAGATGCTACTGGCTTGTAAAA
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TTTCACAGTTGCTTAAAATAGCTTTTGTAGTGTCTCTAGCATCAATACAGGAACTGATTT
CTTCAAAGGAAACAAAAATGTAAGTCTTAACAGATTACTCTAATTATAATATTAAAACAT
TCACAAAGGAGCTTTTTTTAAAGACGTGAATAATGTTTGGCAACAGTTCTAATTCAGTGA
AAGAATCAAGACTCCTGCATAGCAACACAAATATTTACTTGATAATAGCCGCTACCATTT
GTTATTATATGAAGGCACCGTTCCAAGTCCTTTATATAAATTAATATAAAGTCTAAGGCA
TAGACTGCCTTGAGTCTAAGGCATATAGATTTTACCTAAAGTCATTCAGCTAGTAAATGG
TTATAAATATATGTATTATATTTATGTAGCAAAAATCTTAAAATATATTGTGTCATTATT
GAACTAAAAATACTTAGTTTTTTAACATTTTCTAATTATGGCATTTCCTGTATCTTTAAG
TTTAAAATGTTAAGGTTTTTTTAGGTATTTACAAAATAGAATCAAGATTCTATCTAAGCG
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GTCTATGTCCCTGCTGCCTTACAACTGATTTCCTAGACATACCAACCTCAGAGTCAAAAT
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GTATTCAGAACTATAGCTATAACCACATTTAATCATTATGGAAGTGACCAACGGAAGAAC
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TTTATACCTTTTTGTACAGTTTCTTTATTATTTCCAAATAGAATTGGTTTCTTTAAAGAA
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AAGTGCTCTGAAAGCACACAAAAGAGTCGTACAACCTTTTGACAGATGGGGTAAATACCA
CCACTTATGTAAAAGTTACTGTTGCTGCTAACTTGGAAAATAATTAGGAGAAAATCATCT
CTGGCAGAAGGAAAAGTTAATGAAAAGGCAAAGTTGTGAAAAAGATAGCCATGTGACATA
GGATGGTAGTGCCTGTGTGCCTTGATAAGAACTTTGGACCATCCTATAGGCAGGGGACAA
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