SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000406_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein O (SelO)
SpeciesCanis lupus (Dog)
Transcript IDSPT00000406
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000309_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00000406_2.0 # Transcript # Selenoprotein O (SelO) # Dog (Canis lupus) # Full length # Forward
GATATTTTGGATCTTGACTTATCTGTCTCAGAAACAGATGATTTTATCCAGCTTGTGAGT
GGTAAGAAGACTGTATTTGGATCTATTCCATTGGCTCACAGTTATGGTGGCCACCAGGTA
TGAGCAGCATCAGCATTACTTGCCTCATGTAAATATAAACAGTTGGTGGAAATGCTGTCC
TATTAGTGAAGTTATTTTGCATTAATTCCTATAATGTTAGTGTCTGGAGACTTCAACAAG
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AATTCCTTTTTCCTGAAAGCTAACTTTCAGGACTGCATCATGTTATCTGCAGGCATGTGT
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GGGACTTCTTGGTAGTTTGCTAGCAGTTAACATATAACTTTAATTGTTGGATTCTCTTAT
GTTTCAGTCTAATTGTGAGTGATGATGAGGTATGGAGAGATCAGTTCTACAATGGAAACA
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GATGTAATTGCAGCATTAGGATATTATCATAGAACATCCTTTCTTCACATCATCAGCTCT
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TGTTTTATTTATATTCATTCATTCATTTATTCAGAGTAAGCTCTACAACAATGTGGGGCT
TGCACTCACTCCCCTGACATCAAGAGTTACATGCTCTACCAACTAAGCAAGCCAGGGGCC
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CTTTCAGTAATTCCCAAGTCATATCCACAAAGTCCAATTTTCTTCTGGATTCTTTCTCAT
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TGATACACAGACACCTTAAATACCCTGTTTTCAAACATTGGCCAATTTTTTTGCCACCCC
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TCCTGTTCTTTTTTTTTTTTTTTAATTCAATTTGCAAACAGATAGTATAATACTCAGTGC
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TCTAGATGCTATAGGGATACAAAACTGAGTCTTTTGTGGTCTCTACCCTTATGGAATTAC
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GCGTTTTTGTGACTTTTGAGTTTAATGTTTAATGTCAGAAAAATTTAATAAATATAAATA
TATCTAATGAATATAAATTTATTAAGTTTAAATATGAACTTAGGGAGAGGCTATTTATTA
TAATCATCCCCATGATAAAATGCTAGTATTTTTTGTTTTAAACAGATTTTGTCCCAAACA
CATCTGATGATGAAAGAAGATATAAAATAGGAAATCAGGCCAATATTGGGATGTTTAATT
TA
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