SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000453_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein I (SelI)
SpeciesCavia porcellus (Guinea Pig)
Transcript IDSPT00000453
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000356_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00000453_2.0 # Transcript # Selenoprotein I (SelI) # Guinea Pig (Cavia porcellus) # Full length # Forward
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GACCGTGTCACCTTGTGCTGCCGCGTGGATCGGTGCGCGCCGGCGGGCTTGTCTGCGGGG
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TGTAGAGTCACAAGGCAGGACACTGGAGGGAGGAGGCACCTGGCAGAGGCCCTGGATTTT
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TTTATATTGCATTGCTTGCTCTTATCTGCTTGTTAAATGTCTTATGCAGTTTTTTGGTAC
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GCTCTGTAGTTCAAGCTGGCCTTGAAGTCTGTGTAGTCTAGGCTGGCCTTGAACTTACAG
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GGCAGGGCTTTTAAACAGGATCTGATTTGAATTTTGAAAGCTCATCCTGACAGCCAGTAG
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GGAGCTGCGTCCCTAGCCTCGCCCGAGTTCTCCAGATAGGCTGATAATGAGTGTGTATTT
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GTAGATTACTAAACCAAGCAAGTCAGGGTAGGTGTTATCTGGGTTAGTTCCCACGTTCAG
GTTTTCGAGTGTATGCCAAAATATCTTTCTAAAGCAGAATAACAGGACATTTAACAGGCA
TTAGCCAATACCACAAATCTAGTTTAATACCTTTGAAATTTATATTTTGGATTGTTCCCT
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GGTGTCTATGCCAAGGGACATGTGACCTTAGAAATGCTCAGGTGTGTGAGATGGAGCACT
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CTCAGTCTGTACACTTAAAGTTGTCTGATCCTGTCAGCTTGGGACGCCTTCATTCTGTAC
GGGTTCTGACCTAAGGAGGGAAAGTTCTGTCAGCTGTAGAGTGGAAGTTGAAAGCCTAGT
AAGAGCTGAAAGTTTCGTGGGAGCAGTGAGACTAAGTGTGCTCCTGCTCAGTCTGTCTGC
AGTTTTATATCCTCTCGCTCTGGCCAGGAGAAGCAAGCTACACTCTCCAAAATCTTCCCA
CCACCTGCCTGTCCTGGATCCTCTATCCTGGGTATCTCACTATAGTTGAAGGGGTTGGGG
TTGGAGAAACGGAGCAACTTCAGCATGGAATCTGTCAAATAATTTTTTGTTTGAGATTTT
TGCTAATGGTATTTTAATTATTTTCTTTGTGCTTACTTTTTTGTTCCATCATACTTTTAA
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GGACCTTTAAATTATGATTTAAAATATGTTAACTGTTATGGTTAGTTTCTGGATGGCCCC
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GGGTAGTGTTGTAAGTGCTTTACATATATCATTAACTTAATCCTTGTGAGTGTCCTGTGA
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GGTGTGGCCGGTGTTTGACTGTAGACTGCGTAATAACTGCGTAATCACTGAGAATATGTA
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GGATGATTAACTCTGATTTGGGCTTGACTTTTAGATTAGCCCTATGAGTGACCCATTTTT
TTTTCTTCTAGTGTTGGAGATTGATCCCAGGGCCTTCACACTGAGCTGTGTCCCCGGCCC
TTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTGTTTGTTTGTTTGCTTTT
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GCCTCAGCTTCCCAGAGTGCTGGGATTATAGTGTGTGTCCCTTTGCTGGACCGACCCTTT
CCTCTTGCCATCAGAGTAATACCTGAGTGTGCTTTACAGTCTTTGCCCTATTCATATTGT
TCTTCTAGTCTTGTTAGTTAGATGAGCACATCATACAAATAAATGTACTCTGCAGGTTAT
TTTTATACTATTATTTTCTTTTGAAAAACTGTCCAATATGCTAGTATGCAAGGATTGACT
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ATGCATCCATTTTGGAACACGATAGTGAAGGTAAGGTAATTTATAGGCATGCCTGTTCTG
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TGTGGTCCAGTCTGGCCTTGAACTTACTATGTAGCTCACGACAGCTGCCTGGCAATCCTC
CTGCTTCAGCCTTCTTCGAGCTGGGGATATAGGCATTCACCATTCCTCCTGGCTTGTCAT
ACTACACTTTCTATTTTTTTCCCCCTTAGTCACATATCTTGTTTTATCTCATTGTTGAAA
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GGATTGAACTCACGACCACGTGCTTGCAAGGCAGGTGCTTATGCCACTGAGCTAAATTCC
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TGAGTTCAAAGCTAGCCTTGGCTATGTGGTGAGTTCAAGGCCAGCCTGAACTACATAGTG
AGTCCTTGTCTAAAACAAAACAAAGCAAAACAAAGCAAACAAAACAAAAAACAATTTGTG
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TGTGTAACTCTCATATATGGTCTTTCACATTAATAGCTTTTATTACTTGAATTTGTATGT
GGTGGTGTTTCCCAAAGATTCTTTTAATTATTTTATAATTATTTTGAAAAACAGGCATTC
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