SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000539_2.0
Identity
TranscripttRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43)
SpeciesCholoepus hoffmanni (Sloth)
Transcript IDSPT00000539
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000442_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00000539_2.0 # Transcript # tRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43) # Sloth (Choloepus hoffmanni) # Full length # Forward
TCTGTTCTTGTTTTCCCGCAGCTGGAGCCCTACATGGATGAGAACTTCATCTCCAGAGCT
TTCGCCACCATGGGGGAGACCGTGATGAGTGTCAAAATTATCCGAAACCGTCTCACGGGG
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TCCCCTCAGTATAGAGGTTTGATTCTGTGAGAATTGACCTGTTGTAGCAATATACATTTA
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GTTCTTGTTCAACTCACTGTTTTTCAGTATTTGAATAAAAAATAGAATAGTGAATACCAA
AATGGCTAAATTGTATCTTTTGGGCACCTCAGAGACTCAACCTCTGACCCTGTTTCCTGA
AAGTGTGGGTACCAAATCCTTTCACCCATCTCTATTCACGGGAAAACTTGAAAGCTACAC
AGGCTTTGTGCGGTGGGTGAAGGATTTGAGGGGCAGGGACTACTTCTGTAACTCTTCTGC
TAGCAGTACTATAATGAAACAAATTAGAATCTGGTTAAGGACCTATGAAATGTGTTTTTC
CCACAGAGGGCTCAAGAGAGGTTTACCTGAATGGGCTGAAATAACTTTTCAGAGCAGAGG
TTTCAGTCTGTCTCTAAATCTTGCTGTTCTCTCCTCCCAGCCCTGAGTACTCCCTCTTTG
TGGGGGACCTGACCCCAGATGTGGATGATGGCATGCTGTATGAATTCTTCGTTAAAGTCT
ACCCCTCCTGTCGGGGAGGCAAGGTGGTTTTGGACCAGACAGGCGTGTCTAAGTAAGGCC
TTACCTGTAATTGTTGCCTGCCCTGCTAGTTGCAGCATCCTTCTCTCCTAGGTGGAGGTG
TTGCAGGTAGACCATGTCGCATGGTGGTTAAGAGCAGAGGCTCTGGAGCCAAATTGCCTG
GTTTGAATCCCAGCTCTTATACTGGCTAAGGATAATACAATAGACTAGTTACTTAAGTCT
GACCCTGTTTCCTCACTTATAACATAAAGCTGGTTAATAATATCTGCTCATAGGGTTAAT
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TCTTGCTTCTTTCATTCAGTACTTAGCATTATATCTGAGATTCATCCAGCCTGCAGCTGA
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GAGTTCTAACTGCATAGTACATTTTCTATGTACATTATCTTGTTTTCATCCTCACAGGAA
ACCTGGCAAGGCAGTGGTATCAGCCACTGTGAGAAATGAGGAAACCGAGGGAGAGGATAG
GGAACTTGTCCTAGGACACCCAGGAAGTCCTAGTTGCTGGGAACTGAATCCAAGTCTCCT
CTGGCTATAGAGCCCAGGTTTCTTTCCTTGGCCCTCTGCCCCATCCTGCTCTGGGAGCCT
CTTTCAAAACTTATCCCTGCTTCTTTTCCAGACCCCATGCCACAGCTGGATGTAACTGAG
GCCAACAAGGAGTTCATGGAGCAAAGTGAGGAGCTGTATGACGCGCTCATGGATTGTCAC
TGGCAACCCCTGGATACA
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