SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000577_2.0
Identity
TranscriptGlutathione peroxidase (GPx)
SpeciesCiona savignyi (Sea Squirt)
Transcript IDSPT00000577
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000481_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00000577_2.0 # Transcript # Glutathione peroxidase (GPx) # Sea Squirt (Ciona savignyi) # Full length # Forward
TCCTTGTACGAGCATTCCTTCAAAGCGTTGTCTGGCGAGACGGTTAATCTTGGAGAATTC
GGAGGGAATGTCACCTTGGTTATCAACGTCGCCACTTACTGAGGGGCAACTGTCCCCCAG
TACAAAGCTATGAATGCACTATCAGAGGCAAGTCAACAAAATGCGTGATTGCACATCTTT
GTTTACGTCACAAATACTTATACTAACTGAGTACTGGACTCAGACAGAGGTGAAAATATA
AACAAACCGTTGTAGGCTATAGATAGATATTAACTGATTCTTTTTTACTCAAATGTATAG
TGGGTATATGTCTGTACATTGCATGTGCATAGAAAGCTGTATACAACTGTATTATTGTAG
GGCTATTTTCACGATGTAAGCTATTTAATTTAAGAAGAAATAACAACAAAAACGGTTATT
TTTTCAAACTAAAATTAACGTTTGCGTGTTTCAGGAGTATGCACAATCTACTTTTGCGAC
TCTTGCTTTCCCCTGTGATCAATTCGGTTTGCAACAACCGGAGGCAGACGACGAAATATT
AAACGGGGTGATGTATGTCCGACCGGGTCACGGGTTCGTTCCAAATAAGAACATCTATTT
CTTCTCTAAAACTCAAGTAAACGGGGACAGTGAGGATCCTTTATTCACCTCAATCAAGGT
AAATTCGAGTGTGCTAATATTCACTTGTAAATCACGACCGTTTACAAATATTCAACTCGG
GTTTCACAGTATCTTGTATTGGTTTGCCTTTTTATTTAATAAAGTTTTTAAGCCACGTGA
CTCTTCACATGCAATCATACTTATATTCCACTGAACACGTGCATCAGATATCTTTCCTGG
TTACATAATTCAGCTGTGGCATGCTGCTGAACTGAATGATATAAAATTATGTTTAAATGT
ATACTAGAATAAAGGATGAACATACATCAGTTTGAATAGGTCGAAGGGGGTTGCGTACAG
ACTACCCATTCCCAATGATCGAATGACAGAGTTATTACAATTTAATTATATTTAATATTC
CTTGATAAAATCACCGGATCAAGAAAAATGTCTAATAAAATAAAACCGCGCGCTTAACGA
CGTATTTAAACCTTTCTTTCACAACCAAATCAAAATGTAGCTCTAAAAGATCAGAAGTTT
CCAGAAATGTTACCTTATGCTTATACCATACGCAAAATTGCAGGCCTCCTGTCCGCCCAC
CAGCAACAACATTGGAATAACCGCCGAGTTGTACTGGACTCCCATTAAAGCAAATGATAT
ATATTGGAACTGGAACAAATTTCTCCTCGATAAAAATGGGAGGATCCGGTATGCGTAATT
TTTTTTACATTGTTGTATTATTTTTATAGTTTTGTTTTAATATTATTCACGTTTGCCCCG
TGGATGGAAAAATACATGGGGTGTTATGCAGTCAATATCCGCTAAGTGTTTTGCTTAAAA
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TTGCCACTGCTTCTAGGTATAGATTCGGTAGCGCAGTGACAGCGACCCAGTTAAAACCGT
GGATCGATATGTTGCTCCACGAAAAGTAAGTGTTCAGGGAAATAATGCAGATGAACAGGT
CCGGCTTTCACATGGATAGGAACATTATTGACGTCTTCAACGAAAACTGCAATTGCGCAG
AAGTTGGGGATTGAAGACAGGGTTGCTGAC
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