SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000598_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein W (SelW)
SpeciesCiona savignyi (Sea Squirt)
Transcript IDSPT00000598
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000502_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00000598_2.0 # Transcript # Selenoprotein W (SelW) # Sea Squirt (Ciona savignyi) # Full length # Forward
GGCAGTTGAGGTTATTATGGGCGCTTCATGGATCTTAAAAACGAGCTGGAGACGAATTGT
CCGAGCGCAATGGTCTCTGGTTTTGTTGGTCGAGAAGGTAATTATTCGAGTGCCTCTAAA
TACTACAGGATCGCTTGGATCACATGGATTGCTATGGAAAGTAATTCTAACCCTGTCCCA
AACACTAATCCCTACCCCAGAACTAACTTTACCCCCCTAACATTAATATTTGTAATTACG
AAGTATAGTAAGCGATCCCAGCGCTCCAAGCAATTCAAGTGCTTTATGCGATCCTGTAGT
ATTTAGAGGTACCGAATTATTCTTTTTTTTTTAAAATATTCCGAGCATCACCATCTGTCA
GGATATCTAATTGGCTTTTCCGACTGGATAGCTCATTTGATAAGAACATCAGCAGTCTGC
TAGGCAACCGAATTGTTGTTTGAACAAAACCATCTGCTAACTAGCCAGTTATGTTCTTCG
GCAAAGCATGTAACGAACGTCAGTTGATTAATGTGATTAAATTAGTTTGTGTTTTCTGTC
AAGAACTGTTTTACGTTATTTAGACAACAACACATTGCAATACCTCCAGTAACTGCATGA
TTTTGTGTTTTTGGGCAAAGCATTTTAAAAGCGGATTAATGTGATTAAAGTAAAAATAAA
ATCTGTCTTATCATATACAACACAACACGCAATAACTGCATGGTTTCGTGTTGTTGGACA
CATTCTGCCTCAACCCAATGGATTCAAATGAATCATCCAAACGTTTTATGCTGATATAAT
GTTGTTGGATAACATGCCTATACACATGTTGTTTTTTAACAATTTTGGTAAGATCTAGTT
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AAATGTCATGAACTCATTTTTATCCAGGTTCATTCGAAGTGTCCATAAACGAAAAACAAG
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GGTGAATACCTATTCATAATGCACATTCAATTGCATTGTAGTTTCAGTATTTTAAGTAAT
AATGCTAAGATGGGTGTAACAATACCAATTATCAATCACAACTAAATCTTTATTTTTTAT
AGGATTCTAAAAACTTTGTGAAGGAAATATATAAACCTGAAATAAACTGTAAAAAAATGT
ACCATTCGTAGGTAAACTAGAGAAATAATAAAAGACTCCAAAATTAAATGAAATATTTTA
CAAAATTTAGTAAAAGGACAATTTTACTTTGTGGTGAAAACTTGTTTTAATTGTTAACTT
GTTTTGCAGCTAATTGAGGCGATACAAACTGCTGAGAATGGGGATGAGGTCTCAAGCTAT
TAACAACAGCCAATCCCCGTGTATTATTTTATAATTTTAATTTAAAGTTTTCTGTGCCAG
ACCGCTAGTAGTTGAATGCATGTATTGGTTTGTATAAGTCCTACACATTTATGACAGTTT
GAATGTAAAGTGTCCGACACCAATTCAAACTTGATGCACTGTTGTAAGACTG
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