SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000609_2.0
Identity
TranscriptGlutathione peroxidase 3 (GPx3)
SpeciesDanio rerio (Zebrafish)
Transcript IDSPT00000609
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000513_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000609_2.0 # Transcript # Glutathione peroxidase 3 (GPx3) # Zebrafish (Danio rerio) # Full length # Forward
ATGGGGACTCAGAGCAACCCCTGGACCTCTGTTGTGCTTCTGCTGGCTCTAATGCACAAG
ATAGCAGCACTGTCCAACACCCAGGTAAGAGATCTACATATTAAACACAGCTTTTAGTCT
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TGCTTAAGTCAAGATTTATGCAGGAAAATGCATTAGAATATAACTATTTCAATGATTTTC
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TTTTTTCCCGTTAGAATATATACGTATATACAGTTGAAGTCAGAATTTTTAGCCCCCCTG
TTTATTTTTTACCCCAATTTCTGTTTAATGGAGGGAATATTGTTTCAGCACATTTCTAAG
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TTTTTCTTTCCATTCGGCACGCGGTATCAAATTCAATTAAAACAACGCTTCCATCTGTTT
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TAAAAGATGAAACACCAAAAATTACATGAAAATCTGCAAGAAATGTGAATAGCCTGGTGA
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TTTTTCTCTAACGCATAAACTCTACAGGGACGTCCATCATGGCTTCCTAACCATCCCCAT
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CTGGCGCAAAATGGCTGCCGTCACGTCATCCAGGTGGATGCTGCACACTGGTGGTGGATG
AGGAGATTCGCCCCCATTGTGTAAAGCGCTTTGAGTGCCCAGATAAGCGCTATATAAATG
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ACAAGTGTGTCCATGACTATACATAAAAACTAGAAAGACAATAAGAAAATATGGGTTTGC
AACATCGAGCAGCAGAACGAGCTGTTTTTAACGTCTAAAGATCAACGCAAGTGAATGAGA
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AGGTTGATATTTGGACACAAAAGCAGTCAGATGTATTGTATTGTATTGTAATGTCGTCTG
CTTTCAGAACGCATGTCCGCCTGTAGGAGAGAGTTTTGGGGCCACCAGCAACAGGCTGTT
TTGGGAACCGCTGAAAGTCAATGACATCAAGTGGAACTTTGAGAAGTTTCTGCTGGATCC
AGATGGCAGGCCTGTGATGCGCTGGTTCCCCAGAGTCAACGTGTCTGAAGTCAGAGCAGA
CATCCTCAAATACTTCCATCAGCTTCTGCAGACTGCACAGTAACTGGGAAACACTGCTTT
CTGCTCAAAATCTCCCTCTCTCCAATATAGACCAGTCAACACAGGGTTTCTGCAGGTTTT
ATCAAGGTCAATTTGACATTTCTAACATCAATATGTGACACTGGACCACAAAACAAGTTC
ATTTATTTGTGTGTTTAAAAGATGTCTAATAGAAGTCTAATAGATGTCTGAATATAGATG
CTACATTTGGGCTGTCAGTGAACATCTAATAGACATCTAAGAATAATCCAAATCTAGACT
AGTCATAAAATAGAGATAAAATAATGACTATGTGATATCCCAGCAAGCATATTGTTAGTG
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GAATTAATACCTATGTGAAATCCCAGCCAGCAATTTTTGTGTTTGAAAGAGGTCTAAAAA
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GGTGTTAAAAAGATGTTTAGTAGATGTCTAATAGATGTTTAAATATTGATGCTAAATTTT
GGCTGTCAGTAAACATCTAATAGACATCTTAGAATAGCCTAAAACTAGACTAGTCATCAA
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AAGTCTAATAGACGTCTAATAGATGTCTGAATATAGATGCTAAATTTGGGCTGTCAGTGA
ACATCTTATAGACATCTTAGAATAATCCAAAACTAGACTAGTCATCAAATAGACAGAAAT
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CTTAGAATAACCCAAATCTAGACTAGTCATAAAATAGAGATAAAATAATGACTATGTGAT
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TTGTGTTTGAAAGAGGTCTAAAAAATGTCTAAATGTAGATGCTAAATTTGAGCTATCAGT
TAACATCTAATAGGCATCTTAGAATAGCCAAAAACTAGACTACAGTTATCAAAGAGGCAT
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