SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000615_2.0
Identity
TranscriptGlutathione peroxidase (GPx)
SpeciesDanio rerio (Zebrafish)
Transcript IDSPT00000615
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000519_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00000615_2.0 # Transcript # Glutathione peroxidase (GPx) # Zebrafish (Danio rerio) # Full length # Forward
ATGGCTGCAAATTCAGTGTATGATTTCACTGTGGAGACCCTGGAGGAAAAAAGCGTCTCG
CTCGACATCTTCAGAGGAAAAGTTCTGCTCATCATGAACGTGGCCACCTTCTGAGGGTCC
ACCATTGAAGAGGTGAGCTTGAGTAATGGGCTGCTTTTAATATGCACTTGAATGAATCAC
AATGTTCACTGAATCACTGTTTGTGAACTTTAAATTTAATTAAATTTTTCAGTATATTTT
TTCCACACATTAACTGGATATATGCTGGATATTTTTCAAGATGCTAGTATTCAGCTTAAA
GTGACATTTAAAGGCTTAACTAGGTTAATTAGGCAAGTTGGGGTAATTAGGCAAGTCATT
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AAGTGTGTATTAGTGTTTCCCAGCACTGGGTTGCAGCTGGAAAGGCATCCGCTGCATAAA
ACATGCTGGAATAGTTGGCGGTTCATTCCACTGTTGCGACTCCTGATAAAAAAGGGACTA
AGCTGAAGGAAAATTAATGAATGAATAATCTTTGAGAAGAATACTCGAAGTAGTAAAGCA
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AGTTGCACCAGGAGGTTAAAACAAACTAACTAACTTTATTTTCATTAACCAACGATAACT
AACATGAGCAAATACTGTATTAAACATATTGTTCATTGTTTGTTCATGTTAATAAATGCA
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GTTTACAGTACGTGAATAATGACAATAATCAACCCAAGCTCATTCTGAAAACGTAGTCCC
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TTTCAAGCGAACACTGCGGGGCGGTGTGACGCTGTTACCTTTCGCGCTTGCCTTACTTCC
TTGTGGAGGTCTTCCCCGCTCAACCCGTTTGTCCACTCAGCTCACCGTGTACATCGGCAG
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TTTTTTGGAAACACTTTTGTAAACTGTTGCTCGGGTTTAGGGAAGCGAGCAGGCAGGCGG
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ATGTAAATGCTGTGTTCAGTATCACAGGATGAATGCACTCATGGACATGTATGGAGGACA
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GTGCACTGAACAGACAACACACTCCATATACAGTACAACCTATCCTTATTTTAATCTGAA
TAAGGGGTAGTTGCATATCTGTACAATGGTGCTGTAAATCCAATTCAAAGACCTGAATAA
TGATCTCCACTATAAAAGAATCCTGAAATAAAATATGTATTATTGATTTGTACACTTGGT
ACACGCTTGAATAGTCATAGCTCAGGTAGCAAAGAATTCTGGCCCAGATTTGGCATAAAG
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ATCAAATGTAGTATTTGGCCCAGATGTTAAAAATGTATGCGGGCCACGTAAGTTTGGCCT
ATCTTGACCCACTTTTAAAATACATTGAAATTATTTTTGAGTGCAGAAAAAGATTTATTA
ATCAGGTCGCTTCAAGAAAAAGCACAGCCATAAAGCGAAATGCTTCACAGGTTTATAAAA
AAAAAATTGCAGTCATGACACCTGTCAGGATTACCAGAGATCGTATTCCACTAGATCGCT
GGTTCTCACTCACAACAGACCATGGACTACACTTCCGCCTTTTCCTGGACTACATATTCA
GACATGCACTTCGCCTACACCCATGCTCACTCATCTAGATTGATTACACTCGCAACACCT
GTGTACTATCAGAGACTGATTGCATTCACTACATAAGCCACTCATTCTTCCTTTCAGTTT
GCCGAGTCTTGTTCACTGTAGAAATGACACTCACAACAGAAGGTAGGATCCAAAAATGCA
GGTTTAATCGTCGTCAGGCAAGCAAAGGTCAACAGGTATAAACAGATATGTTCAGGCAGT
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CAAAAACACAGGAAAACAAGACAGGATTAACGCGTTGTAATGTCATCTATACATAGAACA
AGACTCGGCAAACTGAAAGGGTGAATGAGTGGCTTATGTAGTGAATGCAATCAGTCTCTG
ATAGGCCACAGGTGTTGCGAGTGTAATCAATCTAGATGAGTGAGCATGGGTGTAGGCGAA
GTGCATGTCTGAATATGTAGTCCAGGAAAAGGCGGAAGTGTAGTCCATGGTCTGTTGTGA
GTGAGAACCAGCGATCTAGTGGAATACGATCGCTGGTGATCGTGACAACACCAACATGTC
AGTTCAGGCCCAGTTATGGGTTATTATCTTGGCCCAGATATGGTCCATGTTTGCCTCTTG
TCTGGAAGCCAGATTTGGTCCAGTCATGTACCGTAATTCACTGCGGCATGTGGGCCAAAA
ACAATTGCTGATGGTGTGGGCCAGAATTAGGCCGGAGAACATTAGTTATGGGGGAGGTTA
TTATCTGAGTGCTGTAATAATGCTCTCTCTGTTTTTCCTCAGAGGAGAACCATGAAACCC
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GCAGGATTGAGGTGAACGGCTCTGATGAAGATCCTCTGTACGCTTACCTGAAGGTACTGC
GTTTACTGTAGCTCACTCAGACATATACTCCATTTATACTGGATATATTAGTTTGCATGA
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TTTGGTCAAATATGGACAAAATCAACATTAGGTTACTTTTATTTTTTTGGGTGAACTATA
TCTTTAAAGGGCACCTAGGTTACCCCTTTTTTTCAGATTTAATATAAGTCTTTTGCGTCT
CTAGAATGTGTATATAAAGTTTCAGATCAAAATACCCATCAGATTTTTCATTATACCTTT
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GACAACAGACAGACTTAAAAGAAGAAGGTCTCACGTAGCGTTTGTGAGAAATACTACAGT
AAGAACTAACCTTTACTAATCAGTATTGTGAAGTTGCATTGATGAGTCACACAAAATATT
GTTACAAAGTTAACGCACGCGCACACACACACACACACCACAGATGACACACACACACAC
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TATCTGTTATGCTAATGTACAAAATAAACCTGATTTAACTTCCACAAACTGGGATTGAAA
CGTCTTCCTTTATAATTGTTCTGACACGCGACTGTGCTGATGAAGTAAAGCTGAAGTAAA
ACGCTGTAATTAATTAAACACATACTCTGTTTTAAAACATTTTAAACATGTGAAACTCAC
TCTTGATCACATTTGATGATGACTGCTGATCCTAGCGAACAGAACAGACCTTTTATTCCC
GGTTGCTTTGCGTATGTCTGTCTGGTCTTGTTGACATATACACGTGACTACCGGAACATG
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TGCGATCGATTTGAAAACAGCTCCAATTAGCCGACCCTTTTTTTTGTAGTTAAATTGAAA
AAAAAGGACTGGGTGTGTTCATATCACCCCAGTATGACGGTCTATACACTATACCAACAC
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TTTTTTAAAAGTGGTCTGGAAGCAGTTGCAATCTGAGCTGCACGCAATGCTTTTTAATGC
GCACACCTAAGCCCACCTCTCACACTGACGTCTCTTTGGCTCTCGGTGAGGAGTTTGGGT
TCGGGGGAACCCAACTGTCCTGCGGGGATGTTCGCAGCTGGAGTGATGATGGAAAGGTGG
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CTATTCAGAACTTTGATTACAGGGTTTCTGCTGATGGGCTTAGGCGGGGTAAAAGCGATT
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GGTAAGCAGTGTTGTTGGTACTCAGACTGTGGCCTTAGACTGCAAATTGGAAAACATCGG
GGAGAAACTAGAGGTGTTGCAATGGGATTTAGTCAGACCTGGAGACCAGTGACGGACATT
AGGTATCTGCTAAAATTTGCAGAAATTGACCCAAGTTTGAAAACCTTTTCTTCTGTTTTG
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AAGAAAAAGAGATGCTCAAAATTCCTGCTCCCTGTTCCAAGGACACCTGTGAGACTCTAC
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CCCACGCCTTCATGTGCTTCACTTACCGGTGTGGTTAGGCAGGTCTGTGACCAGCACCCC
TTGGTTGCAGGATAGGATGGCTGCCGCCTTTATCAGATTATGTCCACATCCCCTGTTTCC
ATCCCCTGTTGCGATGTCTATGTGTTTATGTGCTTGTGCTGGGGCTTTTTTTCCCTCTGA
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TTGAGAAGTTTCTCATCACCGCAGACGGACGTCCTTACAAACGGTACTATTGTGAAACTG
ACATGCAACATAAAACAAACATCGAACTATATTTGACCCTGCACACTCAGAATTAAAGGT
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TTAATATGTACGTTTAAGCCAGGCAGCACAGTGCCTCAGTGGTTGGCAATGTTGCCTCAG
AGCAAGAAGGTCGCTGGTTTGAGTCCCGAGTTTGCATGTTCTCCCCGTGTTGGCGTCGGT
TTCCTCCGGCTGCTCCGGTTTCCCCCTCAGTGCTATGGGGGAATCAACTAAATTGTCTGT
AGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTTTG
TGTGTGTGAATGTGTGTGTATGGGTGTTTCCCAATACTGGGTTGTGGCTGACAGGGCAAA
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TGAACGTACTGAACATTTAAGGTACAACATGAACCCTTTAGATGTTTTAGAATTTTTTTT
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ACAATACAGTAGCCTCACAGTTGATGATTTCTGTACTTATTTGTAAATACATGCTATTTA
TTTTTAGTTAAATTAGTCAACAATGACCATATTGCTCAAATTATCTATATATAATTTTGA
TGTAATTAAACAATCCACTTATTATCCACTAATTTAAACGTCCTTGTGTCCTCTTGTGAT
GATATGTATGCACCTTGACCTACTATAAACCACAAATTATTCCTTATAAATAAATCTCAT
TCTGATTCTGATTTAAGACATGCTAATAATATAATTTTAAGGTACCAATACCAAAAAGTA
GGCCTTTGAGTACAAATGTGTCATGTACTTTTTTAAAGGCTACTTTGCCAGTGACAGCTT
TTGTATCTTCATTTCTGAGAGTGTGGATTACAAAACTTAAGTAAAATAAGTTGCCAACTC
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CCGCCAACTTATCATACAGCGGATGCACTTCCAGCTGCAACACATCACCCAACACCAGGG
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TGTGGCCCCAGAGACATTATCAAGGGTCTGTGCCAATCCACCAGCCCCCCACCCCCCGCT
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TATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATT
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TTCATTTTATTTTACACAATCAAGCATATGTTTTACATATTTTAGATCCATTCAGACCCA
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TGGCATAAAAGCAACAAGTTAACCTTACTTAAAGGGAGTAAACTTGTAATGTGAGACTAT
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GCTTAGTGCCTTTATTCATCAGGAGTCGCCACAGCGGAATGAACCATAGCATATGTTTCA
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TTTTTAAAGTCAGCTAAACACTTTTCCCAGTTCTCTCACAAATACAATCGGTTAAAAATA
ATTGAGATATGAACATATAATTTGATTTATATATATATATATATATATATATATATATAT
ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAATTTAT
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AAAAAGCAGACACTAAAGCTCTAAGGTTTAAAAGATGCTTGCTCAACTGTTTAACTCTCA
GCTTATGATTTGAATCCGGAAGAAAGTAGTTCCTCATACAACAGGGTTTTTGAGACTCTC
CATGTTTGATTTTGTTTTTATATACACAATTATGCCGTCAAACTGTTGTATAAACTCAAT
ATCACACTCGTAGCAGTGCGATGTGGCTGTATATCGGCACTGGTGGGTGCACTAAGGCAC
ACGGCCTGCGGCCAATGATATACAGCCATATCGCACTGCTACGAGTGTGATATTGCTCAT
ATATTTGCCCCTTTTCTTTTAATTTTTAAATACTTTTTTTTAATGAACACAATTCATTAT
AAGCTTCTCATATTCACAATTGTTTTATGTTGTGTTTGACACTCACTCATCTGATGTGTG
TGTGTGTGTGTGGGTGTGTGTTTCTCGATGTGGCGACGCAGTGACGATCCCTCAGGAAAC
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Chart Advanced