SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000629_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein L (SelL)
SpeciesDanio rerio (Zebrafish)
Transcript IDSPT00000629
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000533_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00000629_2.0 # Transcript # Selenoprotein L (SelL) # Zebrafish (Danio rerio) # Full length # Forward
ATGGCTGAAGTAGACGAAAGCACACTCGTAGGCGCTCTAAAAGAACTCACTATATTTGGT
AGAACATCGCTGGAATATGTGGAGAAAGACACTGCGAATGGTATCTTAAAACATTTTAGC
TTCTTTCCTGTTAGTTACTGTAAGCATGTTTGTACGTTAGCTACTGCGCGCACCTGTGTT
TACAGTCAGTGAGAGAGTAAAGTAATACTTACTAGATATTTTTCAAGACACTTCTATACA
GCTTAAAGTGTCATTTGAAGGCCTAAAGTTATGTTAATAAGGTTAACTAGGCTGGTTAGG
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TAAAGGGGCTAATAATTTTGACCTTAAAACGGTGTTAAATTAAAACTGCTTTTATTCTCT
AGACGAAGTAAAACCAATAAGAGTTTCTCCAGAAGAAAAAATAATATGAGACATACTGTG
ACAATTTCCTTGCTCTATTAAACATCATTTAGGAAATATATATATATATATATATATATA
TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAAACAAAAGGG
GGGCTAACAATTCTGACTTAAACTGTACATATATAATTCACTTTTACCATGACAAATTGT
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CGAAATCGATCGAAATTTATGCTCAATTTCGATTATCACAAGTCACGCAGAAAAAGTGAT
TGACAGGTGGTAATTATGTGTGTATCGTGCCTTTATTCATTTACTGTATGATTTGTTTAT
GGGTAAAACAAAGACCATGCAGGTCAGGTAGTTTAAACGGTAGGCTACAAATAATGAATT
GGTCATTAATTAATTAATTAATTATTCATAATCGAAAATCGAATCGAATCGTGCCTTTAG
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TTCCTTTCCAATTGTCTTATTGTCTTGTGTGCATTGTAGTATATCTGATTTTGGCTCTTT
TTCAATTGAACAGAAATACAGAGGTCCGAGAAAGTGTTGAAGGTTTACTGCAGTTGGAAG
TGAGTAATGTTATTTTTTTAATTGTTTATTATGACTGATACAGAGATATGAGGATGTCTT
TTTTAATTAAGTAAGAGTCTCAAAATGCCAGCAGGCGTCTTTAGCTCTGCTCACGCTCCG
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TAACGTTTGGCCACGCCTACTGGTAGCTTCTTTTGGGTTCTTCAGAAACCTATGGGTGAC
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TTGTGTTTTTTGTTGTTATTATTATGTGATTGAGAAAACGAGATGGTACATCTCAAAGGG
TTTAGCCTAAACTATTTTTTTCTTTAGAAAATACACACTCACCGGCCAAAAATATACAGT
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TTTAGAGAAACTATAAGAAATAAGGCTGTGTTTTTTGTTTTGTAGGTAATACTGTGAAAA
TTTCCTTGGTTTGTTAAAGATTACTTTAAAGACATTATTGAGCAATTCCAGCATTATGGA
TGTGACGTTTGCAGTAAAATCTCAGCATAAATTGACAGAGGAAGTATATGCTGACATTAT
ATTGAAACATCTGTTTATATTTATCAAAACTACTAGCCACAGAGTTGTGGGAGCAGAAAT
ATATACATCTGTAAACATTTTTTATATTTTCAATGTGGAAAATAAACATGCGTTATGGAT
GTGACCAAAAAAGTCTGCAAGTTTACAGTATACAGCATACTTTGCGAAAATTCTGTTAAT
TAAATTGCACAACCCAAAAGAAATGATACTAATCAAAAGGATAAAAGTCGGCTCTGTATA
GAGCAGCGGTGCCCAAACTCGGTCCTGGAGGGCCGGTGTCCTGGAGAGTTTAGCTCCAAC
CCTAATCAAACACACCTGAAGCAGCTAATCAAACTCCTACTAGATCAGGGGTGGCCAACC
CTGTTCCCGGAGAGCCGCCTTCCTGCAGATTTCAGTAGCAACCTATATCAAACACACCTG
CCTGTAATTATCACGTGGTGTTTAGGTCCTAATTAATTGGTTCAGGTGTGTTTGATATGG
GTAGATAAATGGGTAATAAATAAATCTAGAACCTAAAGTTCATTGATAAACTTTGATGTT
GGCTTGAGAAAGCCAACGTGACTACGCTAGGACTGGGAATGGCAGTTGGCAGGAAGCACG
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AGTAGGCATTTCTAGCATATGTTATTGCATTTAGATAATCATTCATAGCATGTAGCTAAT
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TTTGCTAGCATGAGTCAAACAAGCCAATGCCCAGGTCCCTACGATGTTCTGATGTAGAGA
TATTGCTATTTTTAAATGGTTGCTATGTATTCCTGGTCTTGGGGTGCGGCTGGAAAGGCA
TTCGTTGTGTAAAACAAATGCTGGATAAGTTGGCGGTTCATTCCGTTGTGGCGACCCCTG
ATTAATAAAGGGACTAAGGGAATGAACATTATGTAAAAATGGCTTGCCGTATTTTTTTGA
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AATTATTTATTGAAAAACTATAAGTCTGATAAACCTTAAAGATATAGCAACAAAATCTAA
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GTTATAAAAATTTAATATTAAACATTTTTTATTAAAAAAACGATAAGTCTTATAGGCATG
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GGCATGAACGGCCTAGGAGGAGATACGTTTGTTTTCAAGGACAGAGTAGTATAACAGTAT
GTTGGCTTTCTCAAGCCAACATAATGAAGTGAGGCACAACCTGTGATGAAATAATATAAT
TCACTGATGTTGACCAATGTTTAATCCATTATTAGAAATAACATAATAACATGCTGGGAT
TTTTGTACTTTGCCACACCCAGCGAGTGTAAGGTGTAGGCCAGATCTGGGCCAGAATAAA
AGCAAACTGTGGCCCAGAATAGGGTCAGTTCTGGTTCATTTGGTTAAATTCTAGCTGATA
TGTGATATTGGTATGGCTTAATTGTGGCCCAGATCTGGCAAACAGGAGTGGACCGCCGTA
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GGCCAGAATAAAAGCAAACTGTGGCCCAGAATAGGGTCAGTTCTGGTTCATTTAGTTAAA
TTCTGGCTGATATGTGATGTTGGTATGGCTTAATTGTGGCCCAGATCTGGCAAACAGAAG
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GGGCCGAATTTGAGCCACATGAAATTTGCTAGCTGGGTTATCACACTTTTTATTGTGCCC
TTTTAATTTGCTCTTGATTCTGCTGTCACTATTTGTGGATTTTAAATCTTTGCTTAAAAG
TTGAAAAGTTTTGCACCCAAGAAAAAATAACTAAAATAAGACATTTTAAGAAGGTCCTCT
AAATCATGCAAAACTCCAAATTCATTTCAACCTCTTGTGTGTTTTTGCTTTTACACTCGT
TTCCTGAAATGACAAGCTAACCATAATGATTGTTGTGATTGTGTTGTCCTGTTGCAGGAA
TGTGTCTCTGGGTCAGTATTTAGGGAAAGGGGAGAATCTCCTGCTTGTGCTGCTCAGGCA
TTTCGGATGATTGCCATGACGGGACCACCTGACTGAGCTGAAGAACAGCAAGGTAAGATC
AGCTGCCAGTAAAGGGGAAACACTGCAGAGCTCAGCCCTTTCTGCAGGCGGACACTTGAT
TGGAAAGCAGCTTTCCAACGATTGTTGATCCAGCTGTGGACTTTGCAAGGGAAAATAGTG
TGCTGCGCTTGTATAGTGCAAGCCAGCATTAGGAGTATAGTTTATTCAAAAATGAAAATT
TCCCGTTTAGTCACACTTTTATGAGTTTCTTTCATCCGTTGGCCATAAAACAAGATGTTC
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AATATAAAAATACTATGGAAGTCAATGGCTGCTGCTTTGCAGCATTCTTCAAACTATCGC
TTTTTCGTGTGTGTTCAACATAAGAAAGCACATTTTATGCAGGAATGTAACTGATATGCT
TAATGGCCCGTTTAAATACGAGATCAATGTAGCGAATTTTGACGCTAAGCTGAAAGCAAA
CAGCGTTGTCGCCAAGGCGACCTTTGATGTTCTCGCTGCCTTCGGTGTGAACGCACAGTT
AGGCTCTCTGCCTCGCTCCATTCCCACAGCTCTCGGCCTCGTCCCACTCGCTACACTTGC
ATTATGCCATGAACATATTTACAAGCACCTAACATTAAACCCAATCTCAATCCATTTGTC
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GTAAATATTTCCAAGTAAGTTATTTCTGGAAGGAATTGATGCTTACATCAGCTTCGGTTG
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TCATTTAGCGATAGCAGGGTCATTTTTATCGATTGAAACTTCATAATTTTCTCGGTCATA
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CACTTTTATATGGTTGTTTATGCAATAAACACCCGTGACTTCTCTTATTTGCCTGCTGCT
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ATTATTCGTTCATTTTCTTGTCGGCTTAGTCCTTTTATTAATCCGGGGTCGCCAAAGCGG
AATGAACCGCCAACTTATCCAGCAAGTTTTTACGCAGCGGATGCCCTTCCAGCCACAACC
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GCTAACGCAGGGAGAACATGCAAACTCCACACAGAAACGTCATATGAGCCGAGGCTCGAA
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TCTGTTAATTAATTAATTTAAAAAAAAATTTCAGGATGAAGTATGGGTTGCATAATACGA
TGCGTTGCATAATGCAAACCACCAAAAGCATTGGAGGACCCTGCTTGCCGTAAAACGATG
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CTTTGAATTTGACATGTTGCTGGATACAGAGAGAACGGTGAGAACTTTCAAGAGTGCAAA
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GAATTTAAATGACTTTTCTAATTACTTTGTCTGAAAAGTACTTTAATTACTTGACTCAGT
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TTTTTGTAACAAAGCATGTAATGACTCCATATTTCATACATCATAACTTTCAAACTCAAT
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TAAATAATAAAATAGCTGAAAAAATAATATACATCAGTATTCACAGCCTTTGCTCAATAT
TTCGTTGATGCTCCTTTGGCAGCGATTACAGCCTCAAGTCTTTTTGAATGTGACGCCACA
AGCTCGGTACATCTGTCTTTGGGAATTTCTTTTTGCAGTACCTCTCAAGCTCTATCAGGT
TGGATCTAGTGACAAAGTCCCTAAGTTGGCAACACTGTAATGTATACTGTATCTATAGTT
GAAGTCAAAATTATTAGCCCTCCTGTGATTTTATAATTATTATTTTTTTATATTTCCCAA
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AGAAAGTGTTATTTGTTTTATTTCAGCAAGAATTTAATTTAAAAAACACTTTAAACCATA
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TTAAATGTCACTTTGAGCTGAATACTAGTGTCTTGAAAAATATCTAGTCAAATATTATGT
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AGCAAGAAGGTCACTGGGTCGCTGGTTCGAACCTCGGCTCAGCTGGCGTTTCTGTGTGGA
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TGATGTTCCACTACTCTGAGATTATGGCCATGAACCGGACGTTACCCGAAATGCCGCCTC
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TGAAATTGTAAAAACGTCTATTTCCCGCTAACGTTTAAGCGCTGTTGAGTGCATTTTTAA
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TTAAAGTCTTTAGTAATTTACAAACAGCTTGTTCATGATCTATTACCAATTTATTAGGTA
TAGTTATAAATCATTAAAGTATTTATAAAAGTCATTTTTAACTTAACTAACAGCTTGTAA
GTTATCTATTGGCTTTCTATAAGGCACAGTTAGAAATAATTAACAAACTATTAACTACTA
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TGCTGGATAAGTTGGCGGTTCATTCCATTGTGGCGACCCCGGATTAATAAAGGTACTAAC
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GAAATTCCAAACTCAGCATGAAATAAAACCGCTGATGCATTATTCTGTTGGACATTAAAA
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CTCTCTCAGATGGGTGGCGATTTTGTGCTGGAGCAGGATGGTAAAGTGATATTTTCCTAC
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TGCTTGCCATTAAGATAAGAAGGTCCATTTCCTGAAAACTTATATTCATTCGTGTTTTCT
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GTTACAGTCCACGGATCCTTAAAGTCTTGAATCCACATTTCAGAGGTCTTAAAAATGCAA
TTGAACCAAATGATTTTTACATTTCCCAAAAGATGTTTAACAGAGCAAGGAAATTTTCAC
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GTATAGAAGTGTCCTGAAAAATATTATTTACTGTCATCATGGCAATGATACAATAAATCA
GTTATTAGAAATTTGTTATTAAAACTATTATGTGTAGAAATCTCTTGAAGCTCCAAGAAC
ACTTTTGTATGCAGAAAAAATAGTTAATATGACTTTTGCGTTCTTTTCTGCATCAGGTCA
GGGTGCACCCTTTAACAAGAAATTAGAGCTATGAAATGAGACTGTCACTGATGTTAGGAG
TTAAATGTGTGCTATACTGTAAGTTGGCTCCACAGATAAACAGCTCCCCCTGAGGTTGCA
TGGATGAAGATTTGACTCGAATTCTTATATTTACGAAGAGTCTTTTCTGATGGGAATTTA
CACCCTCAGG
Chart Advanced