SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000632_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein O (SelO)
SpeciesDanio rerio (Zebrafish)
Transcript IDSPT00000632
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000536_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000632_2.0 # Transcript # Selenoprotein O (SelO) # Zebrafish (Danio rerio) # Full length # Reverse
GCTTAACTTCTGTCTTTCCGACTGAGACCTGTCATGCAAAGACTGCTGGTCAAAGTCATC
ATTAAAAACCAGTCACATTTCACTTACACCTTACCCATTTTTGAACTGGTAGACAGGAGT
TTAATACCTCATTTAATACCTCCGCTGACGCCTAACCAGCTTCTGCAGGATTATTCTGCT
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TGTTTGAGAAATGCATTATCTGTTATGCAAATGTGAATAGTGTTGTAAGAAATGCATTAA
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TCATTTGTTAACATAATTTCATTTTCATTCAAGTCAGTCAGTCACAGACAGACAGACAGA
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CTTATTTTAAAATATTAAATAATAATAATAGTTGAAGAACTAAACTAAAAATAAAGGTAC
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TCTTTTCAGCTTAGTCTCTTTATTAATCAGGTGTCGCCACAGCAGAATCAACCGCCAACC
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GAGTGGCTCTTGACATTGGTGTGGACACGTGCTTTTAATAAATAAATAAATAAATAAAGG
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TTGGATTTGTTTACCGAGGACCTTTACCTTCTGTTTCAAGTTAACTTTAAGGAGGGGAAA
TATTAATTTTGTTGAACTTTTTTTGTTATGTTTCATGCAAGATGTAAGAAAAGTAAAATA
CAGCATTTCATGAAACATGTAATCTCAGCATTGCAGCTAAACGAGTGTGAACACTTAAAA
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CATTAGTATGTAATACAGTAATACAAATGTCAATCAAAGTGGAGACATTGGTATTGCTGT
ATTTTGTACATTGTTCTGTTTTTTTATGTGATGAAATATTTTTTTTTTGTTTTCTTATTT
TTTCTTTTTAAATTGGACTTTGAGTCTGTAATAAAGTTTGATATGATTATGAACCTACCT
GGAGTACGGAGTCAGTCCAGCACCCTTCACCTGGATCTCCCAGCGTCCAGTCGGGTTCTC
CCGCAGTAACTCCGGGCTCTGACCCGCCGGTGCTTTCACTTCTCCTAGATAACACGCAGC
TCCATCTCCGAGCTGTCCGGCAAATTGTCCAAACTGGTGTCCGCAGTAGCAGTGGGCAGC
GGGCTCTGACCCAGGCATCACTTTAGAGCCGCTCAGATACTCCGGGCCCAGCGGATCCTT
CAACACCTCCTCGGCATCCAGACCCAGAAGCGCAAGAGCTGGAGCAGAGACCGCCACAAA
CTCCGGGTTCTTCAGAGGGGTCGGCTGGACTCTGGAGAAGCAGGAACCTCGGACCTGCCG
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Chart Advanced