SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000641_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein T (SelT)
SpeciesDanio rerio (Zebrafish)
Transcript IDSPT00000641
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000545_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000641_2.0 # Transcript # Selenoprotein T (SelT) # Zebrafish (Danio rerio) # Full length # Forward
ATGGGGAAGATGCGCTGGCTGCCGTTCTCGGCTCTACTATTATGGGCCTTATGTCTTCAC
AGCGCTTCTGCCGATAACAATGGCGTGAAGAAAATGAAGATGCAGTTTGCCACGGGTCCA
CTTCTCAAATTCCAGATTTGGTGAGTGAGGAGTTGAAGTCGTTCTGTTCCCAAGCGAGGC
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GCCGCAAGTCGGCCGCTGTCGGCGGCGCCCAGTCACGACTCAGGACGCAGTTCAAATTTC
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TCTGGTGTGCGATAGTTTAAACTGTCATGTGCGCGCCGTGGCGCTTCTGGTGTGCGACCT
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AAATTGTAAAACCTTATTATAATCTCCAATATAATTTTTTCTCGCTATGAATATGGGCAT
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TTTCTTATAAATATGTTTTTTGTGTGCTCAAAAAAAGAAAGAAGGGCAAATAAATGATGA
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TTTTTCCACTGTTTTTATTTCAGAAAATGATGTTTGCTTGTGTGTGTTTTTCTCTTTAAA
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GATATACATTTAATTAAGAATTAATCTGAATATATTTTTTAAGCACTTCATGTAGTGTTT
TTCTTCCCTCCAGGCACATTGCTTCCTTTCTGTCAATGTTTAAGCTGTTGTTAATCGGAG
TGATCATCTTGGGCAAGGATCCTTTTGCTTTATGTGGCATGCAGGCTCCAGGGATCTGGG
TTTGGAGTCAGGAGAATAAGGCAAGATCTTAAACCTTTTATTTTTTTTTTTTGATAGACT
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TTTTTGCATTTTAATATATTTTTTAAATAATTGTTTTTGTTTAATTTATGCCATGACTGT
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TACTTGGTACACCTGTCCAACAGCTTAACAAATTTCTAATCGGCCAATCACATGGAAGCA
ATTCAGGCATGTAGACATGGTCAAGACAGTCTGCTGCAGTTCAAACCAAGCATAAGAATA
GGAAAGAAAGATAATTTAAGTGACTTGGAACGTAGCATGGTTATTGGTACCAGGGGTCAG
AGGAGAATGGCCAGCCTGGTTGGAGCTGATAGAAAGACAACAGTAACTCAAATAACCACC
CGTTACAACCGAGGTATACAGAAGAGCATCTCTAAACGCACAACACATCAAATCTTGAGG
CGGATGGGCTACAGCAGCAGAAGACCACACCGGGTGCCACTCCTATCAGCCAAGAACCGG
AAACTGAGGCTACAATGAGCACAGGCTCACCAAAATTGGACAAAAGAAGATTGAAAAAAT
GTTGCCTGGTCTGCCGATTCTTGATTTCATTGGATGGTAGGGTCAGAATTTGGCATCAAC
AACATGAAAGCATGGATCCATCCTGCCTTGTATCAACGGTTCAGGCTGGTGGTGGTGGTG
TAATGGTGGGGGGATATTTTCTCTGCACACTTTGTGTCCATTTGTACTAATTGAGCATTG
TGTCAACGCAACAGCCTACCTGAGTACTGTTGCTGACCATGTCAAACTTAAAACAGTAAA
AGCCGTAACTGTAAAACTTATCAAGGGATGTTTTTTATTTATTTTAAATTTTTCTCCCTG
TTTTAAATGAATAATTTTGTCCCTTGTTTCAGATTTCTGGTGGCGCTCTCCTACGGTTGT
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CTGCGCTCTCCTCAT
Chart Advanced