SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000641_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein T (SelT)
SpeciesDanio rerio (Zebrafish)
Transcript IDSPT00000641
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000545_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000641_2.0 # Transcript # Selenoprotein T (SelT) # Zebrafish (Danio rerio) # Full length # Reverse
ATGAGGAGAGCGCAGAACATCCGGTGTGTGCTAGTAGTTGCTACTTTCAGCACAAACCTT
CATAAATGCCATCTCACAACCGTAGGAGAGCGCCACCAGAAATCTGAAACAAGGGACAAA
ATTATTCATTTAAAACAGGGAGAAAAATTTAAAATAAATAAAAAACATCCCTTGATAAGT
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GAGGCAAGGTTATGACTGATGGGGTGGAAGTGTGTCCATGTGCATGCTCATCTTCATCTC
ATTCTCCAGGATTTGGACTAGCTGCTGCATTGAAGGCAGGTGTCCTGACTCCAGCTTGGA
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TTTTTTTTTTTACAGTTATACCTTTGTTGATAAAAGCGTCTGCTAAATGACTAAATGTAA
ATTTTATACACAGTACTGAATCTATATTTTCAGTAAATCAGATACACCGAAAATATATTA
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AAATATGTTTCATAAACACATGAAAGCTACTAAACGTAGTGTTGCTGAGATGACAGATAG
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AGACCATTTAACGCTTGTCTGTTTATAATATCGCGATTCATAATATCAAACATCTCTTCA
ATGTGCTCCACTAAAGGCAGTTCTCCTGTGTTACTATAAACACCCTCAATGTCATCATCT
CACACACACTCGTCGGCCTCGCTTGGGAACAGAACGACTTCAACTCCTCACTCACCAAAT
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ATCGGCAGAAGCGCTGTGAAGACATAAGGCCCATAATAGTAGAGCCGAGAACGGCAGCCA
GCGCATCTTCCCCAT
Chart Advanced