SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000645_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein U (SelU)
SpeciesDanio rerio (Zebrafish)
Transcript IDSPT00000645
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000549_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000645_2.0 # Transcript # Selenoprotein U (SelU) # Zebrafish (Danio rerio) # Full length # Forward
GTGTGGTCTGTGCTGTTGTGTGTTTTTGTGGTTTATGTACTGGTGGCCAACACAGATCTG
TTTCTGACCAAACCGGAGCGAACGTCTCTGGATGTACTGGCTGATGCAGACCTCAGACCC
ACCACTGAAGGTCAAATACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACA
CAACGTTCATGATGTCAATGTCAAATAAAGGGAATTTATAACTTCTATAATACACTATAC
AAACTATTGTGATTTGTAGTAAATACTGCAGTGTTTTTGAATTATATTGTAGTAAAGTAC
CAGAATTTATCTGTTGTGATTCTACAGTCGCTATGGTAACACAATAACTATGGTAATTGA
TCTGTTGTGGTGATTCTGCAGTTGCAATGGTAACACAACAACTATATAATTAATCTGTTC
TGGTGATTCTACAGTTGCTATAGTAACACAACAACTATAGTATTTGATCTGTTGTGGTGA
TTCTACAGTTACTATGGTAACACAAAAATCGATCTATTGTGGTGATTCTACAGTTGCTAT
GGGAACACAACATCTTAAGTTATTGATCTGATGTAGTGATTCTGCAGTTGCTATGGTAAC
ACAACAGCTATAGTAATTGATCTGTTGTGGTGATTTTACAGTTGCTATGGTAACATAATT
ACTACAGTAATGGATCTGATGTGGTTATTCTAGAGTTGCTATGGCAACACGACAACTATA
GTAATTGATCTGTTGTGGTGATTCTACAGTTGCTATGGTAACACAAAAACTACAGTAATT
GATCTGTTGTGATTATTCTACGGTTGCTATGGTAACACAACGACTATAGTAATTGATCTG
TTGTGGTGATTCTACAGTTGCTATGGTAACACAACAACTATACTAATTGATCTGTTGTGA
TGATTCTACGGTTCCTATGGTAACACAACAACCACAGTAATTGATCTGTTGTGGTGATTC
TACGGTTGCTATGGTAACACAACCATAGTAATTGATCTGATGTGGTGATTCTACGGTTGC
TATGGTAACACAACAACCATTGTAATTGATCTGTTGTGATGATTCTATGGTTGCTATGAT
AACACAAAAACAATAGTAATTGATCTGATGTGGTGATTTCACAGTTGCCATGGTAACACA
ACAACAACATTTATGTAAACAAATTAGGCAATGCTGTAATTTTCTACATCTATTTGGTAT
ATTATACTACAGTACACTAACATGTACTATAGTAAAAACTAAAGTATGCTACAGTATGTA
TTACAATAATTAGTAAGTAAATATTTTGAAAGACTTCACATGTATAATACGTAATTAAAT
TATTGCATGTATGTAGTTTTAATTAAAAAGATAATATTGCACTGCAGTGCTTCACATGAT
TCTTTGTCAGTTTGTGTAAACAATACTCTCTGTTGTTTTGCATTTGCAAACAGGAAATTN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTCGATGCATTTGTGCCC
ATCTCTGAGTTTGCAGTTGATCATGCTGGTTCACACTAATAGAGAATCACTGACAGTCAT
TCAGTGTTGCAGCCATTTCCGATATTTATATAATTTATACTGTATTTGTTTATTTGTTGT
ATGATTATTGAGTAATTTAGATGAATAATATTATGCTGTATTATTCTGTCAAGCATCGAG
TGGTTTGGTGATATGGATTAGCTCCACTCACATTTCACGTCAGCTCACCTGCTTGCTTAA
GGGACAAAGGTGATGGGTGATGAGCTGGCAGGAGTAGCAGGGAAACCTTGACCGTGTGTG
TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTTTTTGTGTGTGTTGTGTTTTCAG
AAGATGCAGGGAGTTTTAAAGCAGTCTCTCTGTGGAAGTGAACCGGAGCTGTTATTATGG
CTGTCAGACGGCCAGGATGATCTCTGTGCAGAGAGGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG
TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTCATATGATCATGTGACTAATCTTTC
AGTACTTACAGGAATTTGTGTTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG
TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTTTCATATGATCATGTGACTAATCTTTCAGTA
TTTACAGGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTTTCATATGATCATGTGACTAATC
TTTCAGTACTTACAGGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTT
TGTGTGTTTCATATGATCATGTGACTAATCTTTCAGTACTTACAAGAATGTGTGTGTGTG
TGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTCTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG
TTTGTGTGTTTCATATGATCATGTGACTAATCTTTCAGTACTTACAAGAATGTGTGTGTG
TGTGTGTGTGTGTGTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC
TACACGTACTCATGCGTGACTTTAAAGAAGACCTGTTGTGCACTTTTGCCACATCTATAA
TCCCCTTAGTCTATGCTGACATTATCTTCAGCAGCTCACACACTCTAATGGCGAATGGAC
AGACGGCTGCTTCTCACTCAGGGCTGCTGTTTATGCTAATGAGGGAGAATAGTGGGTGTG
GCTTTCCCCCCTCTGATGACACGTACAAAAGGAGAATGTCAATCAAAGTGTTTCATTCAT
CAAGTCTGATTATAAACGAATGCAATTAATTCATGTTGACCATTAGAGGCTGGAGGTATT
CTCACACAACTGTGCTTAATCTATTAAAGGGATGATAGGTCTTCATTAAAATGCAAATGT
ATAAACAGCTTTACAGTCTCCGTGTCATGTGTGTGTTGTGTTTTGTTGCAGGGGATTCTT
CTGGAGCATCATGAGAAAGAGTTTGGAGATAAAGCTGATCTCTCTGCAGTCCGCAAGGCT
GTCAGCATGATTAACAATACAGAAAAGAAGAAAATATGATCATGAGCATGAGTGTGTGTG
TGTGTGTATCATGTGTGTCTTCTGACGGTGTGTATGTGACAGACTGATCCCAAACTCTGA
TGAGAGGACAGTCCTGATGATTAACGCTTCAGACC
Chart Advanced