SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000649_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein W (SelW)
SpeciesDanio rerio (Zebrafish)
Transcript IDSPT00000649
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000553_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000649_2.0 # Transcript # Selenoprotein W (SelW) # Zebrafish (Danio rerio) # Full length # Forward
ATGGGTGTACAAATAAAAGTTGAATATTGGTGAGTGATTTCACAACAAATGCATTAGTAA
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TGTTCCGATGGTGGGGGGGTATTTTTCTGTACTTGAACGAGTATGGATCATTGCTAGTCA
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GTTCCGGTAATGTTACAGGAGTTTGTTCTGTCTGAAAGAGGCTTTGATGATAATAAGTGC
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GCCAAAACAAAAGTATTACCCATGGGCTGCTGATGGCACATTTATTGATCAGATCATCAA
GGACCAAGGTTTCTGTTTAAAATCTTTACTGACAAATCTCTTTGATGACCTGGGATGACT
AAGTTAACAGCAAGTTTTATATTTTTGGTTGCACTATTCATTTAAGATTTCAAACAATTC
AGTCTGCATAACTTTATAAGGGAAGAAGTATAAACATCTAGAGATCCTTGAATGTCACCT
GCTTCACTCTGCCTGTCTGGATGCTGGACGTAAATGATTACCGTAACTCTAAAATAAGCA
GTTATGGTATGAGAACTAAAGTCCACGTATCCATT
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