SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000653_2.0
Identity
TranscriptThioredoxin reductase 3 (TR3)
SpeciesDanio rerio (Zebrafish)
Transcript IDSPT00000653
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000557_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00000653_2.0 # Transcript # Thioredoxin reductase 3 (TR3) # Zebrafish (Danio rerio) # Full length # Forward
ATGCCGCCCATAGAGAATGACGCGGGTCGAGAGCAGATCCGATCGAAAATCAAAGAACTG
ATCGATTCCAGTGCAGTTGTGGTGTTTAGCAAAAGCTTCTGTCCGTTTTGTGTCAAGGTG
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ATCAGTCTTCTCTTATCTCGATGTACATGCACAGCTGCTCTTCTCATGTTAGGAGCACGA
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TTTTTTTTTTTTATCTCCTGTGTGCCTGGAGCTAAACATTAGTTTCAGAAGCAGCCCTGC
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AAGCATTAACTTAAATGAACGTCACCTAAGATTAATTAATGCTTTTGTAGTTTTCATTGC
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GGAGCCGCACAAGATCAAGGCAAGTGTGCTCTGACCCAGCAAACCAGTTATACTGGATAT
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TTGAGTGCAGGTTTTTAAAATCTATTATTATTATACCGCCTGAAATTATTATAGTGTGAG
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GTTTTAAGTGTTGGCTTTTGTATACACCACAAAGATTTTTTTATTTTTTTATTTTTTTTT
TATGTTTTAAGCTTTTCGACGCAACTTCCATTTTAAACAACATTTGAAATCAGTCATAAT
TACATGCATCTCCAGTCACAATATGCTTAAAGCTGCTGTTACTTATTATTAATTTGCTCT
TCTCAACAGGCCACAAACAAGCGTGGCAAAGAGACGTTCTACACCGCGGCTCAGTTTGTC
CTGGCGACTGGAGAAAGGCCTCGTTACCTGGGCATCCCGGGAGACAAAGAGTTCTGCATC
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TTAAAGCTGATTCATTCTCACTCGCCAAGGGAACGAAAGCTTCCCCTGATCAGGGTTCGT
ACAGGTGCTGGAGATGCTTCAGCTTTAACTTTGTGTTTTCAAGATTGGGGAAGTGCTCAG
TTTGTTGATAAAGTGCTTGGAAAATGTTATTGTGCTTTCATAATAATTGGTTACTATTGG
TATTGCAGGGCTCGAAATTAACTTTCTTACTTGGTAGCACCGGTGCTCCCAACCTGAAAA
ATTTAAGAGCACCCTCCAAAGATGAATGATATATTTGACAAGTTGTATATTAAGGGATTT
ATTGTATTTGAAAACAACATCAATTGGGACTAACAAAACCCAGAAACAACTCTCTAACTA
ATGCTGTGATGACTTAATATTTGTGCAACAATTCCAAAATGAATGTTGAATAATTATAAA
ATATTCATGATGACGATGATGACAATAATACTCATAATGAATTATATTTCTCATCATCAT
GCTGCCTTGAATGTGCTTTAATGTAAGTAATCTGCTATATAATGTCCTGCTGTTGCTTTA
TGAAAAATAAATTGATGGTTTGCATCAAACACAAATGAAGCATTGTAGTAAGAAATATTT
ATTTTGTTCTGCTGTTTTTATATGCACGTCAATTTAATAAATAATAGCCTATTTCTGCTA
CAAAACAAACGAAATAATATAATAAATCATTCAATTCAATGCTGAAAGCTGCAAAGCAGT
CATCAGTAATTAAATAGAAGAATAATCTACACCTCAAGAAAGAACGGACAGGTAAGGAAG
AAAAGTCTCACTTATAAAAGTTTTGGTTTCGGTTTGTGTGGTTTTAATGCTCAGCCTCGT
TACGCGCTGAATTACATCTTTCTGTGTTTGCGGAAAAGCATGCGAGTCAGCCGGCCCAAT
ATATGAGGGGGGCAGAGCAGGATTCTCCCGATGACCACCGGCGCAATACTGTTCTCTGTT
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GACATTTGCGCTGTTGCAGCCTGATCTCACGAGGAAACGTATGAAAAAGTTACGAATTGC
CGTGAGATTGTTTTGGCTGAACACGGTGCATGCAGCGCATCGAGAGTCAGTGTACTTTTC
ACTCTTTAGCCGTTTGCATTCCCCGCGGTCACAAAAGCTCCCTCCCTCATCTGACAGCGG
AAAGTCTTGAGTGATTGACAGCTAATATGAACCAATATAGCGGTTTTACCACGTTTTTAG
AAAAAAACCAAAACAGGTCGCACTACAACCATTATATGCAGTCGCACGAATGCTCCCAAT
ATATATTATGAGGTTGCATAGCTTAAATTTCGGGCGCATATAATTTCGAGCCCTGTATTG
GTATTATCTATTATATAGGGATTATAGTTGTTTTTCTTTGCCAGCTCTTTTGATATTTAA
AAAGACTTTCACACATGTACTTATTTACTTAACCTCAAGTGTTTCCAAACCTTTAAGTTT
CTTCTCTTGAACACCTAAAGAAGGCTTTTTAATAAAGCTTGTAATCGTTGACTTCCTTAG
TATTCGTTGTCCTTATTATGCAAGTAAATAATGACTATTTTAATTGTGAACTGTCTCTTT
AACTGCTTCAGAATGTTTGCTACATTTGAGGAATGCATAATCCATCTCTGCTGTGTTTCT
GTTGGTTTTCCCTACAGTGATGATCTGTTCTCTTTGCCCTACTGTCCTGGGAAGACTCTT
GTGGTGGGAGCCTCTTATGTGGCTCTGGAGTGTGGTGGCTTTCTGGCTGGTTTGGGGCTG
GATGTGACCATCATGGTTCGCTCTATTCTGCTGCGAGGCTTTGATCAGGACATGGCTGAC
CGTGCAGGAGAATACATGGAGACACACGGGGTCAAATTCCTCAGGAAGTTTGTTCCCACT
AAGGTTGGTTCGTGTGTGTGTGTGTGTGCTGTTAAACATTACTGAAATCTGAAATGATGT
CTTATCTGTCGCTGCTGTGGTTATGAAATGCTCCTGAGGAAGAGTATTATAATCATGGCC
TCTTTACACATGCAGTTGATAAAGCATCAGTGATTTCAGGGTGTATTTTTCCACAGATCG
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AGGAAGTCTTCGAAGGAGAATACAACACTGTAAGTGTGATGCCAAAGAGACGCAACATAA
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GCAAATATTTGAAAATGGTTACTTATATTTAGGTATAAATTATAATTTTGAATATCTATG
CAACAAAGTTCAGTATAGTTGTCTGTAGCTATGTTTCTATCCACCTATTTTTATGTGCAT
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ATGTGCATAAACTACGATGGAAACACTTTTACCACACAAATTTCAGCATGCGCATTAAAA
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AAGAAGTGGCGATTTTGTTCGCTTTGACTTGTTAGATGGAAACGCTGCTTTATTCGCATG
TCTTTTATGCGATAATCCAGCTTTGCACACAGTTCGTTTGCATTTATCGATGGAAACATA
ACTTGTCTCTTATTTTATTTATTTATATATATATATATATATATATATATATATATATAT
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