SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000654_2.0
Identity
TranscriptEukaryotic elongation factor (eEFsec)
SpeciesDanio rerio (Zebrafish)
Transcript IDSPT00000654
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000558_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000654_2.0 # Transcript # Eukaryotic elongation factor (eEFsec) # Zebrafish (Danio rerio) # Full length # Forward
ATGACAGATTTTCCCAAAACACTGAACTTTAACGTCGGTGTCCTCGGCCATGTGGACAGC
GGGAAAACATCTCTCGCCCGGGCGCTGAGCAGCACCGCATCCACTGCAGCCTTCGACAAG
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GGGCTTTTCGTCTGATATTTTGGTAGGCTGCATTTTTAAGGGTGTCTCTGTCTTTGTTTT
TAGTTACTAAAGGCCCAGTCGTTCCTTCCTCATAGAGATCCGTCAGGCTCTCTTTTGATG
GCTGTAGATCACTGCTTCTCCATCCGTGGCCAGGGAACGGTCATTACTGGCACAATCCTG
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CACATCACCGTTGGACATGAAACTGTTATGGCGCGCATCTCCTTTTTCAATCGAGTGCTT
CCAGCCAATGAAAACGGAGACTCTAAGCCCACATCTCAAGAGCAAAGTGCAAACTCTTTC
TCATTTGACTGGGAGTTTCATCACCTGGATGAACATTTGACTAGTCAGGCAGAAGGTGGG
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CTTTGCTTAGTGATTGGGTCACGACTGGACTCAGATATTCATGGTAACACTTGCAGGCTC
GCTTTTCACGGAAAGCTTCTGGAAGGCTTTGAGGACAAAAACTACACGGAGACAGCACTG
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GGCTCAGTGGTTTGCACTGTCGCATCACAACAAGAAGGTCATTGGTTTGACTCCTGGCTG
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CCAGAGCTCAGAGGAGAATGGCCAGACTGGTTCCAGGTGATAGAAAGGCAGCAGTAACTC
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TACAATTCGCACAGGCTCACCAAAATTGGACAACATAAGATTGGAAAAACTTTGCCTGGT
CTGATGAGTCTCAATTTCTGCTGCAATGTTTATATGGTTGGGTCTGAATTTGGCATCAAC
AACATGAAAGCATGGATCCATCCTGCATTGTATCAACAGTTTAGGCTGCTGGTAGGGGTG
GTGATGTAATTGTGCGGGGGATATTTTCTTGGCACACTTTGGGCCCATTAGTACCAATTG
AGCATTATGTCAACACCACAGCCTACCTGAGAATTGTTGCTGACCATGTCCATCCCTTTA
TGACCACAGTGTACCCATCTTCTGATAGCTACTTCCAGCTGTCATGTCATAAAGCGCAAA
TCATCTCAGGCTGGTTTCTTGAACATGACAATGAGTTCACTGTACTCAAATGGCCTCCAC
AGTCACCAGAACATAATCCAATAGAGCACCTTTGGGATGTGGTGGAACAGGAGATTCACA
TCATGGATGTGCAGCTTACAAATCTGCAGCAGCTGCATGGTGCTATCATGTCAATATGGG
CCAAAACCAGTAAGAAGATTTCCAGTACCTTGTTGAATGCATGCCATGAAGGATTTAGGC
AGTTATGAAGGCAAGAGGGGGTGCAACTCGATACTATTGAGGTGTACCTAATAAAGTGGC
CATTGAGTGAATGCAGCAGCATACACCTCTTCATGGCCATTGAATATGAGTATTTTGCAT
GGTTTTCTGTAAATAAAAAAGGCTGAAAAAAGCTGACAAAAATATACAAGTCAATCTAAA
TTATAATATTTTTCCACAATTGTTGATTTGCTTTACCAAAACATGAGGCATTCTGTCTAG
TAACCTTGTATGTTGCGTGTTCATAAATGGTTGTTCTTTCTGTCTCTTCTGTTAGAGGGA
CTGAAAGAAGAAACCAAGCAGCTTCTCTCCTCTTCCTCTAAGAAGAAGGGAAAGGGTGGG
TCAAAAAATGAATCCCCCAAATTGGAGGAAGCCAAGCCAGATGCTCAGCCAGTCACCATA
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