SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000709_2.0
Identity
TranscriptGlutathione peroxidase 2 (GPx2)
SpeciesDipodomys ordii (Kangaroo rat)
Transcript IDSPT00000709
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000613_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000709_2.0 # Transcript # Glutathione peroxidase 2 (GPx2) # Kangaroo rat (Dipodomys ordii) # Full length # Forward
ATGGCCTACATCGCCAAGTCCTTCTATGATCTTAGTGCTATCAGCCTGGATGGGGAGAAA
GTAGATTTCAACACGTTCCGAGGCAGGGCAGTGCTGATCGAGAATGTGGCATCGCTCTGA
GGCACAACCACCCGGGACTTCACCCAGCTCAATGAGCTGCAGTGCCGCTTTCCCAGGCGC
CTGGTGGTTCTCGGTTTCCCTTGCAACCAATTCGGACATCAGGTGAGGGGTCTTTTGGGT
GTGGCTCTTGCAGGACAAGGAAAGAGGATGAATGATTGTGTTGGAGTGTCTGGAATTGAG
GGGCATACTTCCTCATGCAGAGTGTTTGGGTGCAAGTGCAATACCATAGGGAAGTGTAAG
GTTAAACATGGAGGATGTGTGTTTTCATTGTTCTATGGTCTTCTCCACTGTAATATATGA
GGGCTTCTACCCATTGTGTCTTTTTTCTCCACTGAGTCTTCAGAGCCTAGGATACCAAAT
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAGTAATGTGTTGCCTACCTATTT
GCCTTTCCTTCTATAGATTCCTCCTTCATTGATGACTCCTATTTGCATTTTAGGTTTAGG
ATAAGGTAGAATGAAAAGCCAGAAACTCTAATCCATTCTCCTGGGCTTCACTTTCACCTC
TGAGAAGACAGAGAAAGCAGGGAGAGGGAGAAGGACAGAGAGGAAGGAAGGGAAGAGAGA
AAAAGGAGGGGAGGCGAAAGAGGGAGAGTGTATGCATTTGTACTGATACATAGATGATCG
TAGGTAAGATGGGTTAGAATGGCTGGTGCCTCCTTTCTTTTGCTTCTTCTGCCCCCAAAT
CAAGGTTCCCTAGAGTTTCAAATAAATACTTTATGAACCTTTCAGGGTCAATTATGTTCA
GAAGCAACAGTTCATATGTTCAGTCTGAAGTATAAGAGCAGCAAAACTAGCAACTACAAG
AACTTTCAGAAATGGCCTAGCACACTATCAAACAATATCATGGAGAGGAAAAAAAAACCC
CACAACGAATACTCAGATAAAATGGAGGAGAAACACACACATTACATAGATAGAAAAGAA
TGATCCTGGCAAGGGAGTTTTGGAGAAAAGATTTCCATTAATGGACCCCTGGCTTCCTTT
TGCCTTTCCCATGTTCCTTGTCTTTTTTTCTCCCCTAGGAGAACTGTCAGAATGAGGAGA
TCCTGAACAGTCTCAAGTATGTCCGCCCTGGGGGTGGATACCAGCCCACCTTCACTCTTG
TCCAAAAGTGTGAGGTCAATGGGCAGAATGAGCATCCGGTCTTCGCCTACCTGAAGGACA
AGCTCCCTTATCCTTATGATGACCCATTTTCTCTCATGACCGATCCTAAGCTCATCATGT
GGAGTCCGGTGCGCCGCTCAGATGTGTCCTGGAACTTTGAGAAGTTCCTTATAGGGCCGG
AGGGGGAGCCCTTCCGCCGCTACAGCCGTACCTTCCAAACCATCAACATCGAGCCTGACA
TCAAGCGCCTCCTCAAAGTTGCCATATAGATGTGAGCTGCTCAGCATGCTGATCTCCCAG
TCCTCCCAGACCCTAAGCATCCTTCCTTAGGATTCAGCGTGCCCTCCGTGGGCAGTGCTG
GATCTAAGCTCTCTCTGTACCTCACTCCCCTTCATTGGAGAGCTTTGCTTTTCCATCCAC
CTGTTTTCTTTTTCTCTCTCAACCCTCCTGGTGTTTTAACTTGGGGCTCTAAGACTCAAG
TAGGCTTTGGGGCCTTCACAGAATGATGGCATCTTCCTAAATCCTATTGGAAGATGTCTG
AAAAGCGTGAAGGGC
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