SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000727_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein N (SelN)
SpeciesDipodomys ordii (Kangaroo rat)
Transcript IDSPT00000727
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000631_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000727_2.0 # Transcript # Selenoprotein N (SelN) # Kangaroo rat (Dipodomys ordii) # Full length # Reverse
CGCAGCTGCGAAGACATCAAGCTGGACCTGCGCAGGATTTCAGACCCAGCCGTCATGAGG
CTACTGCGGGGGAGGCCGCGCCCCCTGCTTTCTCTCCAGCACATAGGTTGTAAAAAAATA
TCTATAGTTCACATAAAACACTTCTCTGCATGTGTAGAAAAGACTGGCCCTGGTCAGTGG
CTCAGGGTGTGGACAAGGTCCCAGGCGCGGCCGCCAAGCTGGCCTGGGTGCCGGGAGGCT
GCTGTGTCTATGGAGATCTGCGGGCAGGGCACCAGCACCTGTCCTGCCAGGACCCTGTGT
TAGGGTGGCTGGGCCCTGGCGGGGGGAGGGGGGGCTTAGAGATTCGCCTGTTTTACAGCC
CCACCCCAGTGTCCTGTCATCTGGCCTGGCCTGCTCAGTGCTCTGGGAGCCCCCAGCCCC
CCCCCACTTCCGCTGGCTGCAGGCCTCCGCACAGGCTGTCTCCAGCTGAGAGTGACCCGC
TGGGGACAGGAGGCCGCTGGGCGGGGTGTGGGGGCTCCACACACAGAGTGCTGTGGCAGC
CTGGCGCCCTGGGCCGGCGCTTGCTCGTGTCCTCTGGGACGGGTGAGGGGCAGCCAGGAG
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GGCCAGGGAGGTGACCCCGGGACTTGTGTTGAGGGGAGCCCGGTGGTTAGGTAGGGCTGC
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TGCGCGCTCCCCTGCGCGCTCCCCTGCGCGCTCCCCTGCGCGCTCCCCTGCGCGCTCCCC
TGCGCGCTCCCCTGCGCACCCTCCGCTCCCCTGCGCGCTCCCCTCCGCTCCCCTGCGCGC
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TCCCCTCCGCTCCCCTGCGCGCTCCCCTCCGCTCCCCTGCGCGCTCCCCTCCGCTCCCCT
GCGCGCCCTCCGCTCCCCTCCGCTCCCCTGCGCACCCTCCGCTCCCCTGCGCACCCTCCG
CTCCCCTGCGCGCTCCCCTCCGCTCCCCTGCGCGCTCCCCTCCGCTCCCCTGCGCGCTCC
CCTCCGCTCCCCTGCGCGCCCTCCGCTCCCCTGCGCGCCCTCTGCTCCCCTGCGCGCTCC
CCTGCGCGCCCTCCGCTCCCCTGCGCGCTCCCCTCCGCTCCCCTGCGCACCCTCCGCTCC
CTGCGCGCTCCCCTCCGCTCCCCTGCGCGCTCCCCTCCGCTCCCCTGCGCACCCTCCGCT
CCCCTGCGCGCTCCCCTCTGCGCACCCTCCGCTCCCCTGCGCACCCTCCGCTCCCCTGCG
CGCTCCCCTGCGCACCCTCGGCTCCCCTACGCGCTCCCCTGCGGCGCACACACCGGCGGA
GCCTAGCTCAGTCCTAGCTCAGTGCGCCCCGGCCGCACCCCGCGCCCACGGTGCCTACCA
CGGTGCCATTGGGCAGGCAGATCATCATCTCCACGGGGAAGCTGTACTTCTCCAGGTGCA
GGCCAGCCAGCTGCCTGTGGGTCGGGCTCTCCTGGTTGTTCTGTGGGGACAGCGCGGTGG
CTACACCCCTGCCCCCCCTCCCCCGCACTGCCCCGGGGCCCACCCGCCCTGCTCACCTGC
AGGTCCTCCAGCTCCTTCACCAGGGACCAGGTGCTGATGAAGCTCTCATTGAGGAGGGCA
AGGATGGGCGGACTTTCCAGGACGGTCTCCCGGAGAGTCCGCCCGGAACCTGTAAGGGGG
AGCCCAGCCCGAAGGGTGAGGGGCTGTGTGCCTTCCGGGGGGTTCCAATCAGTATTTTTG
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GCTCTACCACAACACCAGTCCTTTCTGCTTTAGTTATTCTTCAGATAAGGTCTTGCTTTT
GCCTGGGCTGAGGTCAGACTGTAATCCTCCCATCTCTGCTTCCTGAGTAGTTGGGATTAT
AGGCATGAGCCACAGCACCTGATTTATCCTCACCTTCCTCTCTTCCCCTCCCTCTTCCTT
TTTCTTTCTCTCTCTTCTCTTTGGTAGTGTTATGGTTTGAAGCCTACGACGTAAGCCGAG
CCTCCAGTCTCGGCTTTCCCTTTGACATAGGGTCTGGCTAACCTTTGAGTTGAGGCTAGC
CCTATATCCCATCCTCCCATCTCTACCTATCAAGTAGCTGGGATTGTAGGAGTGTGACAC
AGACCTGTGGATGACTGAACTGGGCCAGGGACACTGTTCGACTCAACTTTGTGCCTACCA
CTGGACACCCAAAGAACTTTGCATCCAGCTGGGTTTTCTGAGTCAGGAACATGGCAGAGC
CTGCGGCCCTGCTTCCTCTCATTTGTGGAAATGGCCTTAGAGTCCAGCTCACTTTCACAC
TCATTTTCACAACCTCAGGAAAATACACTGCTCCCTCTCACTGTGGAGAAAACAGGTTCA
GGGAGGGGAACGCTAAGCAGCAAAGTAGCAAAGTGCTTGACCCACATGGCGGGGCCTTTC
TTCTGGCACTTTCCTCTGGACTCAGCACAGAAGCCCCCGAGCCTCGCTCATGTTCCCAGC
CCGTGTGGCCCGAGTCCCTCATGGCTGTGATGAGTCCTGGCAGTCTCCACTCAGTACATG
TTTCCCCTCACCTCAGCACGACTGGTCGTCCAGGGCCCCCCACAGCAGGATCGAGTGAAC
CAGCGTGTTCTTGGCCTTGGCTCGGTCGAAGGCCTCAGTGAACGGCAGGTAGGTGACCTA
CAGCCAAGTCAGGATGGAGTAAAGTTACTGTGTGCGGCCAAGGCTCTGTCCAGGGTCTAT
GTGTAGTGCATATTTATACACGTGAAACTGTGTATAGGTGCAAGCGTGTCTGTGTGTGTG
TGTGTGTGTGAGTGTGCGTGTGTGTGAGAGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGAGTGTG
TGTGTATGTGTGTGTGTGTGAGTGTCTGTGTGTGTGTGTGAGTGTGCATGTGCGTGTGTG
TGAGTATGGCAGAGCCTCCTCCAGGCTTGGGTGCAGAGACGAGTTAGCCATGGGGCAGGC
TGGCCCTGTGTGGGTCCAGCACCCAGCCTCAGCCCCTCAGAGCCTGACCCTCCGCCCCTG
CCCAGGCTTGCCTTCTTGAAGGGGTACATGGCCACCTCCAGGCGCCGGGCAGCCTCCTCC
CAGCTCAGCTCCTGCTGCCACTTGATCTCCTCAAACACAAACTGCAGTGGCTCCCCGGAG
GGCGGGCGGCTGTCCATCCTCTTCCCATCTTCGTCCAGGATCACAGAGGGCACCGAGGGG
CCTGTGGCCTCCAGCTCCATCTGGGCGGGAATCAGCCCTGAGGGGTGTCTCGGAGATGGC
CTGGGGGGCCTTGAAGGAGACCCCACTCTAGGGAGGCAGGGAGCCTGAAGAGCCTGAGGC
CCCACGGGGGCTGGCAGTCGAACTGCCCGTGCTCACCTGGGGAATGTACCCGATGTCCAC
CTCCATGCTGCTGCTCTCACTGGCCCCATACAGCCACTCCATGTCCACATTCAGGGATCT
GGGGGCCGTCGGGGCAGAGCAATGTCAACAGCAAAGCCCACTGGCCATGTGTCAGATTCC
ATCTAACTTTGCCCCAGCAACCATCCCAAGACTTCAGATGGCAGTACAGAAAAGCCACTG
GGCCAGTCTTGGGGTTCCAAGGGCTCTCAAGGCTTGGCTTGTGTCCTTCCCATAACCCTT
CCCTTTCAAGGCCGAGAGATGGTCAATGCATCAGACAGTTCCTGGTGTGAGGCAGAACAG
GGCGGTGGGAGGAAAACAGTCTGGCCTGGTCAGTGTAATATGAAGATCTGCCACAGGGGG
GCGCCCCAGGACCGACTGCTCAGATGTAGGGCAGGTGTCTATGGAGTGTGACACCTCTGC
ATCAACCCTGCGTTGGAGCAGGTATGCCGCTGTGGGGGTCAGCCTCCTTCCTGGGGTGGG
CTCAGCCCATGGGAGCAGGTGCTCCTTGCTGGGGAGGTGGGGCAAAGCTATGCATCCTCC
TCAGCCTTCCTGTAGCTATGTCTCTGCCCTAGGACTCCAAGGAGGAGAGAAGCCACTCCC
ACTGCTAGAGACAGTGTTATCTTCCAGGCCGCCCCAGCCATCACTCTACTCCTGCCCAGG
ATGAGGAAACTGGCCACACTACCCATTACTGCCAGGGCCAGGACTCACTAGGGCCTCTGA
GCTCCCAGCCCAAGTCTCATCCCTACACACACCGCTCAGGCCTCCGGAGTGTCCACTGCT
GTCAAGAAGGGATCTTTTGAAGCCAGGCCTCCTGGGTCCCCATGCTGCCCCAACAGGTGG
CTCACCCTGAACAAGTGTGCAAGCAAGTGGCTAGCACAGTGCCGGAAACCCCGCCCGCGC
TCAGTGGCGCAGGAAGTCTGCCCTCGGGCCCTGGCGTGCACCGCTCCCTCACCTCCCTGG
GTTTCTGCTTGGTGTCATTTCCTCTAGGAGGCTTTCCTGGACACTAGCAGGGCCTCCCGT
CAGTGGCAGGAGCCGCTGTGGTTTGGGTCTGCCTGTTATGGGAAGGCCGGAGGCTAGCCT
GAGGGAGGGCCTCGTGGCTTCCGTGTTGCGTCCCAAGCGGGAGGACAAGCCTAGTGAGTG
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CCCTGGTCGGCAGGGGCTGCTTCTGAGCCCTCGAAGTTTGGATAGAACCCGATGCACCTG
TGATTTGGCACGAAGAGTCGGAAGTCGCGGACATGGGTGGCGTCTTTGGAGAGGATGATG
TGGCCGGTGAACTGGCCTGGCGAGAACCAGAAGGGGAAATCGGGAGGCTCGCTGAGCTGG
AACTCGGCATGGATCCTGGGGAACAGAGTCAGCTAAGCTGGAGCTCCCTTCCTCTCCCCC
AAAGCCTGGAGCTTTGGCCAGACTGACTTCTGGGGGGGGAGCAGGGGAAGGAAGAGTAGG
GTAAGAGAAAAGGTGGGGGCAGGGAGAGCACATGAGCCCCTCTGGATGCCGCCACCCTTC
AAGGACGGTCTGTGTGCTGTCGTTTTGGGAAGCCTCACCCTGAGCTCCCCACTTCTGCTG
TGTGTGACCAGTGTCCTCTGTGGGCATGGGCGCCAGCCCCAGGCCAAGCGAGCTCCAGAG
TTCTCACTGTTCTGGGAGGAGGTCATCTCCACCCAGATCCACCGGTGGGGAAACTGAGGT
TCAGAGCCTGAGTTCACGGGGTGGGAGGGGCGGGGCTGAGGCCTGGGCTGGGCACTCACC
GGAACACCACGGTGTAGTAGGAGTCGCTGGTGGCTGTCAGGCAGGCCACAGCGCCCTGCG
GGGCGAAGCGGGTCTTCACGAAGGGCCTGGGGTGGAACATGCTCAGGAGCCGGTGGATGA
TGACCTGGATCAGGGACAGCAGTGGAGACTCAGTCAGGTTTCCCGGCAGTGGGGGGGTCA
GGTGAGCTGGTGCGGCAGGCCTGGCACGGGGTGCAGGTGGGCAGGGGCCTGGCACTGGGA
CAGGGCTCTGGGTCTGGGGCCTTACCTCCTTGCCCTTGGGGGGCGGCGGGTAGAAGCGAT
TGTTGGACAAGTAGCCGGTGAAGACGCTCAGCTCGCTGGGGATGATCCACCAGGGCTCGC
CCAGCTCCTGGCCTTGCGGGGGAAGGAAGGGCCGGAAGTGGCGGGCGGCAAACACTGCAC
TTGGCAAGGCTGCTGTGGTCCAGTTGCGGAGGCCGGACAGGGCAAAGCGGGAGACCTGGG
GCAGGGAAGACCGAGGCTCTGGGCACTGGGGCCTCCGCTGCAGGGTCTTGTCCTTTGTGG
GGTCTCCTCACAGCCCTAGCTGGATCCTAGGCAGAGGGAGCCCAGAGAGGCGCCTGTCCC
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GAGGCCCAGCGGCCTGCCAGCAAGGCCTGGCCAGGCTCAGGGCAGGGAGGGAGCTGGAGG
GGCCACCCGGGACTGGAACGGGTGTGGAGCCTGGGGCTCACACAGGGGCCTCTGCCAGGT
CCCAGGCAGCCTCATCCTCCATCAGCCTCGCTTTCCACGCCCTGCGCCCCCAACCCTCCT
AACCAGATCAGCGTGGGTCTGGGGCTAGGCTGACAAGGAGGAGCAGCCATCTCTGGGGTG
AGATGTGTACCGTCACAGTGGGGGGGCCTGACAGGAAGGGGAAGGAAGGCCGCTTCAGAG
GGTCCTGCCCTTCTTGCCATTCATCTGGACAAAGGCTTTCCCTAGCCTTCCACTGCCTGA
GCTCCCGGGCAGGAGAGAGCAGGGTCAGAAGCTGCAGGATCGGGCTTGCATCTGGGGTGA
AGAGCCCCAGCACCCAGCTGTCCTTACAGGGCGCACACGGGGGCTGCCAGGACGGCTGGC
CCTGTCCCCTCAGGTTGCTCAGACCCCACGGGGCACAGGCCCCTCTCCCTCCACCCTGTT
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TGTCCACCCCCTCTGCTCACAGGCTGCCCACTCCGCAGAGCTCCAGGGTATGCAGGGCTG
TGACAGGCGCCTGGCCGCCCTCCTGAGGGCCTCCAGCTCCCCTCCNNNNNNNNNNNNNNN
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CCTGGCCTGCTCCCCTGCAGCAGCTGCTCCCTGCCCCTTCTCTCCCAGCATCCTCTGGGC
TGCCTCCTCCCACCCTAGAGACTGGCCTGTTGTCCCCATCTCCCCCTGTGCTGCCCCGGC
CCCCCGCTGCCAGTGGAGACACACTAATGACAGAAGCTCATTTCACAGCCCGCCATGGTG
TCTTGCTGCTGCCAAGGCAAAGCCGGGTGGTGGTCAGGATGGCCTAGAGCAAGCAGGAGA
GAGGGCAGACCGTGGGCAGGCTGGGACCGGTTCAGACTGTCCACAGGCCCTCATCACCAC
CCCCCCATGGGGGAGGCGCTGTTCCCTCCTTCTTGGGGACTCTACCCTGCGCCTCAGGTC
CAGCTTACTGCGGCTCACCAGAGCATCTGTCAGGCAGCTGGCACGTGCTAGAGGCTTGGA
GACATGGCGGGCAGGAGAGGTAACCACTGCAAGTGGGCACGGCAGTGCCAACCCGCCCCA
CACTTGCTCTTTCCTCCAACCCCGTGAGTAGGATCTGCTGGGTGTCCCTTCTTGCAGGAA
GCACTCCCCCCCTCCTGGCCTGCCCCCCTCCAGACTCCCCATCTTGGGGAGGGGCTTGTG
CGTCTCTCCTGCTCTCCCATTAGCCTGGGAATCCGCCCAGCAGGTCCGAATCACACTCTT
GGCACAGTCTGCACCCCAAGGAAGGAAAGCGGAAGAGGCCACACATACGGGTTCCTAGGG
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CTCTGGGAGCAGAGGCTGGAA
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