SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000854_2.0
Identity
TranscriptSECIS binding protein 2 (SBP2)
SpeciesEquus caballus (Horse)
Transcript IDSPT00000854
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000758_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00000854_2.0 # Transcript # SECIS binding protein 2 (SBP2) # Horse (Equus caballus) # Full length # Forward
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CTTGCCTTGTAGATTTCCCATCAGACATCGCTAACAAGTCTCTTTCTGAGAGCTCTGCCA
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GTAGGCTATTGCATCTAGGTTTGTGTAAGTACAGTCTATGATGTTCGCACAGTGACGAAA
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TTTACCACCCGTGTATGAGCTTCTTTTCATGAGCCAATTTTAAAAATGTTTTATTATGAG
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CTGGTCTATAGTTCTGCCATACAGCCTGCCTCCCAGAAGAGTATAAAAATTCTATTTCTT
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TGTCTTCTAAGTATCCTGGTTAAGACGAGACATTCCTTGTTAGCTGCATTGGCTACTTAA
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TCTATGACAATTGGACATTTTGCAAATTGTTAATACAATAGCAATAATTTATGTGATTGA
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ATGAACTCATATAGTCCTTTTACGATTGGCCTTTTTCACTTGCATGATTCTCTGGAGGTT
TGTCCAGATTGTTGGGTATATCACTAGTTCGTTTTTGTGCTGACTCCTGTTCCATAGTAT
GGATGTACCAGTTAGTTTAACTGTTCTCCTAACGGAGGACGTCTGGGCTGTTTCCAGTTT
TAGGCTATTATGAGTAAAGCTGATATAAATCTTCATGTACAGGGGAAAAAAAATAAAGTA
GTGTGCATTAATTATCATATTTTCCTTATAATTATTTGTCAAAAGTTTTAACCTTTTATA
ATAAGTTACGCACTTTATGAAAATGAGTTGCACACTTTGTGTACTTTTCTGTAAGTATGT
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GATACATTAAGGTGAATAAACTACCCTTTGGGAGGCTGCTGTGTAGTGAGGAATATAGCC
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GGTTTGGGGCAGGGGTAAGGATAACGTTTTGAATCGATTTTAAAGATTGAGTAAAATTTG
GTTGTGTCAAGATAGTGAACACCATCCCAGGTAACACATTTGAGTAACTCATTTTTGTTG
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TTGAGAGTGTATCTTAATTCTTCTATCAAGAACAATACATGTGGCAGATTTAGTATTGGC
GCTTAAGCATATGGTTGGTTCCATACTTACATTTAGTTAAAGATATTAGATAAAATTTTC
TATGTTAGAAAAGAAATTACTTTGAATACGAAGTTTCTTTAAATTTTTATTTTTTAACTT
TTGACCTTATTGACAGGTGGGTGTAGTAATGCAGGACAGGGAATATATTAATGAAATTCA
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GAGTTTCTTTTTGATTACCTACCCATCTTAAGGGTAGAATTATTAATAAGAATGGAATAG
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ATTAGCTGTTTTAGCATATGAGAAGTGAGATTGTCTTTTTAAGACCGACTTTAAATAGTT
CAGTAGTAGAATTAAAAAAAAGAAGTTCTTCCTCTTTTTTCATTACTCTTAATTAAGCAT
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TATTTCAGGATGAAGATGGATTTCGAGAACTAAATGAGAATGGAAATGCTAAGGACGAGA
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CGTGTGAGGCAGCGTCATTTAGAAGAAACAGTGTATTTGGTTCTTACCTTTAGTATTTCT
TTTCAGCATAGCCAGAACAAAGATACTTTCCTATGAAATCCGCAGTTCCATTACAGACCA
TTAATGCCATTAATTAAATATCATAAACATACAGTCCATACTGAGATTTACCCAGTTGTA
AAACTTAACTTTGGAGTTATTTTATTTCGCTTTCAGTCCAGGATCCAGACAAAGGTCACC
TGTTGCACTAAGCTGTTTTGTCTCTTTATTATTTCCCAGTTTAGAATGGTCCCACCATCT
CACTCTGCTCTTTATGATGTTGAATCCTTTGAAGGGTCTAGTCCACTTACCACCTTCTTG
ATTGTCTTTCGTTGTGATTAGAATTTTATGGGATCACTAACAAATGTTTTTCTCTGGTTA
TCATAGTTGGATGATTTACCTGAGAACTCACCAATCAATATAGTTCAGACTCCAATTCCC
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CTTGCCACAGCTCAAGAATATTCAGAAATAAGTATGGAGCAAAAAAAATTACAGGTACAT
TTTATGTACAAGTAACTTTATTTTTTTTGGTTTGGGAGGATGAATAGATGGAATGACAAA
TCTAATCATGTTGCCACATTTTTGTGCTATAACGGAAAGTAAATGTTTCATGTTTACTTG
AATCCACTTATCAAGCAGCTGGAAAAAGAATAAACCCTGTGCAGCTGAATTGGAGGATAT
GTTAGCAGCTCTGGAAAACACACAAGCGATGAAAGCGCGGCAGATTACTAATACGAGACC
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CTCCCACTACCCATGAAGTTGTCTTTGTACCCACCTGCTCTGAGTATATAATTAAGACTT
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TTATTGTGAGCCTTTTTAGGAAATTGTGGGTCAAGGATAAGTGGTACTGGCTTTAGAGGC
AGACATGTTTCTTTGACTGGAGTGATACTAGTTGAAAATAAAGAAGATAAAGAGAAAGTG
CCACCTTTGTAAATGAGATCAGTTCTCTGTATATAGTGAAATGCTAGATCTCAAAGGCAA
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GCATAAAAAGAAAAGTTATGAAAAGAACCTCTCAGAGATTTAGGAGATGTTTTCAAAAGG
TACTAGGTTTAAAGAGTTCAAAGATTGAAGCCTTGGCTTTTACACTCTCTCTGGGGGATT
TCAGCATAATTGATTAATCTTTGGGCCTCATATTTCTTGTTAGTAAAATGAGGAGGGTTC
ATCTATGTCATCTGTAAGGTTCCATTCAAATCTAAAATTCTGTGGTCTAATGGTTGCATC
CTAAGGAAGGATTTAGATAGAACCTTAAAGACTCTGACCTGATGAGCTGATTATCAGATG
CCAACAAAATGTGTGGAAATAATCGTAAATGAAATTGAGAGTAAAGCATGAAGTTATTCT
GTCCATATCAGATGCATTCATCAGTAAACATAAAACCCACTAATGTGGCCTAAGATATTA
GGTTATTTAATGATTTCACAGCGTCGTCATGGTCCCTAGCTCTTTCCTTCCATTCTCAGT
GGCTTCTTATTCTTGTGCTTATCATCTCATGTTCATAAATGGTTCTGTGGCTCTGAGCAT
AGCAACAGTCAAAAGCAGGAGGTTCAGGCAATGTGCTCCTTTTATCAGTGAAGGAAACAA
TTTTCAGAAGACTCCTCTTTTATTTGGCGAGAGCCAATCACATGACTTTTCTTAGCTGCA
AGGGAAACTTGGGCAAGAGAATATTTGCCAGAGGGGAGTGGGATGGCCACAATAGGCTAA
GAACTGTTTAATTCATCTCCTGGGACTGGGTTCAAGTCCATCTCAAGTTTGGGGCTTCTG
ATAGCCAGGAAGAAAAGGAGGAAAGATTGTTGGGTAAACAACAGACAGTGTCTTTCATGC
CATCCTGGCACAAGATTTCTGAAATGTTTTCTTTTGATTTCCATGGTTTAAAGAAAAAAC
AAAGCTGAGAAAGGGATGCTAATCATTGATAGAATAGAAAGGCTCCTGTGATAGTCTAGT
CTTATTGTCCCTTGTGTACACCTCTTGATGGCTAATTGCAGAGTCCCTTGTCTCTGTTTC
TAAGGTGATATTTCCCTTTTCTTTCGGAAGGTCGCATCTGGCTTTCAGCTCCCCTACTGA
GTAGATGACTGCCAAGACTGGACCTGGAGAGAGGTCAGCCTGGCTCAGTCTACTGACCTC
CTTCCTTTTCCGTGTTCCTTTGACTCATTGTCAAGGGAAAGCTGGGACTTTTTCCAAGAC
CCCAAGTGAATTCTTGTAGTTCTTTTGAAGGAGGAAAAAAAACGTTGGAAGGAAATATAA
ATATGCATCTAAAATTTTAAAAAATTTTATACCTTAAAGTTATTCTTTTGTTTAATTAAA
TATATGTTTGAAAATTTTTGTTTAATAAGCATTTTTCCCCCTAGCGTTTACTATATGCCA
ACCATAGGGACATAGAGATGAGCAGGAGTAGGAGTGAGGAGGGAGGGGGTGGAACAGCAA
ACACAAAATAAGTGTTTTTGAACTGTAGATGCAGAAAGTGCTGTGGGGGTTCAGGTTAGT
GGCTGTCTCAGGAAAGTCTTCATTTTTACACTAAAAATAGAACTACTATATGATGTCATA
GTTCCACTTTTGAATATTTAATCTGAAGAAAATGAAAACACTAACTTGAAAAGATACATG
CATCCCCATGTTCATTGCAGCATTTTGTAAATAGCCAAGATATGGAAACAACCTGAGTGT
GTCTATTGATAGATGAATGGATAAAGATATGGTGTATGTATGTATATGCAATGGAGTATT
ACTCAGCCATAAAAAAAGAATGAAATCTGCCATTTGTAACATAAATGGATGGACCTTGAG
GGCATTATGCTAAATGAAGTAAGTTAGACAGAGAAAGACAAATATCATGTGATCTCACTT
GTATGTGGAATCTAAAGAAAAAAAAAAGAACACCAAGCTCACAGATACGTAGAACAAACA
GATTGGTGGTTGCCAGAGGCAGGAGGTGTGGGGTAGGTGAAAGGGGTAAAGGGAATCAAG
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ACTATAGTTAATCATGCTGTATTGTATATTTGAAAGTTGGTAAGAGAGTAAATCTTAAAA
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GAAAGTAAGAGAGCTGTCCTTCATCTCCTGGTTCCTAGTACATTTTTTGCTCTGAACTGA
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TGAGGGAAGAACAAACAAATTCCTAGTTTGTTCTTCCCTCTTTTAAGAGTTACATGATTC
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