SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000880_2.0
Identity
TranscriptThioredoxin reductase 3 (TR3)
SpeciesEquus caballus (Horse)
Transcript IDSPT00000880
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000784_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000880_2.0 # Transcript # Thioredoxin reductase 3 (TR3) # Horse (Equus caballus) # Full length # Forward
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GTTGGTAAGTACAATGGTTAGTACACACTCTTGTTTGTAGTAAGTGTCAGCATGATTGAC
TTCTGTCCATTTGCTTTGTTCAGTTCAGCTCACTTTTGTCTCTTGGGTTAGATGAGCTCT
TTTCGTTTACATTCCCCTATGCAGAAAATGAACCTCTACGTGACAAAGGATTTGGTGTAG
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GCTTCACCAACTCCTTTTAGCCAAGTTGCTTTAATAAGTGAAATGTTCTCGCGTCTTTGA
GACTTTTCTAAAGAATATACCAAATAGGGTAGTCTTAAGTAGTCATTGCCTGGTTTTATT
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GGAGGATTCTTATTTATTGTCTCGGTATAGTCATTGAATTGTAAGTCAAAATCTAATTTA
GAAGAGTTTATTTTAAAAGGAATCAGTAGATTGGTCTTTATTCTTTGAAAATCTGGGTGT
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TGGAAGTGCTACTCTTGCCAATCCTAACCTGGAAAGTGATGTCAGAGGATGAATCTGGAG
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AGGATTGTTTTCGAAATGAAGCCTAGCTCAGGTGAACAAGATAAAGAGGATCTTGAAAAA
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TGACCTCGTCTGACGTAGATGTAAAGCCGTGAGCTCTGGGTCATTTGACGCATCCCTACC
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AGACTTTGTGCTGCCGTCCCCGCAGGGCACGTCCTGGGGTAAGCTGTTTTCTTCGTTGTT
GCGATTGTTGTTACCCTCTGCTCTTTACATGCTTCTTTGGCTTTGCTGAGTCTCATTTAA
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TTATGCTTCAAGTCCGTTCTCCTTGCCTCTACCCTGCTTTATGCCCCAGAGGCTGATGAA
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AACAGAAGGAGGGAGGAGAGTAGCGGTAGGGTCTTCATCCCTTAGCTCCCGCTGCTGGTC
GCCGCAGGCTGGGTCCCTCTCCTTGTGGAAGGCCACAGCCCTTGTCACGGCGGTCCGCCT
TTGGGCTGTGGCACTCACTCAGTATGCTTGCCCCTTCACGTGGGGTTGGTGCTGGCCCCA
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CTGGGTGGTCTTCACTTTTAAGAATCCTTTTCCTGACTCTTTGATCTTGTGTAGATGTTC
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GAATTATGTACCTTTTGGATTGGTAGTTAGGTAGTTAAGGAGTTTCTCTTTAAAATTAAA
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GGGAGGGCACAGTGGGCTATATGCTTGCCCCGCTCTGCCGCACCTGGGGGACCAGGTGAC
GTTCTTGAACTCTTCTGAGTGCTTAATATTTCTAAATACTTTTTAATTTCTTTCAGTGGG
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GCATGACACTGTAATTTAAAACAAATAAATTTTAAAAAACAGGAAATAAGATGCAGACAC
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GGGGTTTGCAGGTTTGGACCCCAGGTGCAGACCTACATACTGCGAATCAAGCCATGCTGT
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GGTGTGAGGTGGTCGGTTGAAAGCTGCCCTGTGAAACCCTCCGTGGGCCGATTTGAATTA
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GTATGCCCAGCACGGTTGGTTCCTGGCCACACGTGCCTCTTCTGAGTTTCCGCATTTGCT
GACGGCAGTGTCTCCTCAGTCACTCTGGCTGGAACTCTCTGGTTCCTCCCCCTTCAGCCC
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TGGCCTCTTGCTGTCCCCAGACACCAGCTGCTTTCAGGCCTGTGTGTCTCTATGTGTCCT
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TGTCACCTTCTTGGTAGCCGTCCCTGGCTGCCTCCCTGATCCCCTGCTCCACCCGCAGTG
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GTCCAGGGTGCCTGATACGCTGTATGTTTGCTGAAAAAGTGAAATTTACTTTTCTCTTTT
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GGTGCAGTGACCTTCAAACGTTTTTGACCAGATGCTCAGTAAGAAATACATTTTTCATTG
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GTATTTTTTCTTATCACATATAATGGAGTCAATATTTTATATTCTATTTTATTTTTAAAA
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CTGTAGACACTGTCACAACCTCCAGCAGCCCGTTTGTTTTAGTGTTTCTTCGAGCACTAG
ATAGCCATTCAGCCAACAAAAGCCCGTTACACGTGGAAACCTAAGTAACACATTCCGTTT
TCATTACCTAGGCATTCTTTCCTTTATTTTTATCTTTCAGTGATGACCTTTTTTCTCTGC
CTTATTGCCCTGGCAAAACGTTAGTAGTGGGTGCATCTTACGTTGCTCTGGAATGTGCAG
GGTTTCTGGCGGGCCTCGGCTTGGATGTCACGGTTATGGTGCGCTCAATCCTTCTTCGTG
GCTTTGATCAAGAGATGGCAGAGAAAGTGGGTTCCTACATGGAACAACATGGTGTTAAGT
TCTTAAGAAAATTCGTGCCTGTGATGGTAAGTCTGGGCGACATTTGGAATTCCTTTTATT
TTCTCTTTACTCCCTCTTTAGCTTTTTCTTTTATCCCTCCTTCATTTCATTAAATAAGTT
AGTCTGTACTTAATAGGAAACTTTAAAGATAGTGTTCCCACCCCAAATCTATGAAACTGA
CCCCACTTGTCCCTCTCTCCTCTGATATGGAGAAGGTGTCCTTGTTCCTCTCAGGCCGAG
TTCTCTCTTCTCTCACTGTCCTGTCACCTTTTCAGGGACGTCCCATAGTCGTCTTCTTTC
CCCCTTTCTCACTCCCTTCTGGGTCTCTCATCTTTAAACAAATAAGTTCTCCCTTCCCCC
TCTGCCTGTCTGGCTGGGTCCCCATTTTTCTTCTCCACTTTACAAGAAAACTTCCGTACG
TGCTACTAATTTCTTGCCTCCATTTTACACTTCAGCTTCAGCGACTTCCATCCCTGCCAC
TCCTTTGAAACTGCTTGTCGGGGTCTGTAGCAAACTCCGTGTTGTCAAAGCCGATGATGA
CATCTCTGTCCTTATCTTCCCTGGGCATCTGGGCCCCATTAGGTGAAACTGACCTTCCTT
CCCTTTGAAACGCTCTCCTTTCTCGGCTTCTGTGGCCCTGCAGCCTGTGGTTACAAATCT
ACTCAACTTGTAAATATCGGAGTACTTGGTCCTCTTCACTGCTTGCACTTTTCACCTGGG
CAGAGTGCTTTTAGGGCCATGCTTCATCATCTCAGTGCTCACGGCTCTCAGATTTATACA
TCCTCTTCACGCATCTCTCCTGAACTCCACACCCATTTCTACTGCTGCTTATTGGATATC
TCCACTTGAATTCCCCAAGAGCATTTCAAATTTAACAAGACAAAAATGAGACTCTTGGTG
TTCTACCTAAGTGTGCTCCCCAGCTAGCCTTTCTAGCCTGTCCCAGTACTCAGTAAACGG
CACTACAGTCGCACAGTTTATCAAGCCAATGCCCGGAAAGCATCCCTTCGTTCCTCCTTT
TATGCTACCTCCAGCTAATCCATCAACTTCTTTCTACCTCCTAATTATACTGTGACGTCC
TCTTTTCTCACTCTCGACTTAGTTCACAAACCTGAATCCACACACACACGGATACACTCA
TGCACATGTACACCCCGTGATCCATTTATTTTCTGTCACCCTTAGATAGAATCATTACAT
TGTTTATCCTTACCAGATTCAGCAGTTGGAGAAAGGTTCCCCTGGAAAGCTGAGAGTAGT
GGCTGAATCCACTGAAGGGCCAGGCGCTGTTGAAGGAGTATACAACACAGTAAGTTTCTA
TTTTGTAAGTGGTAAGTGGTTGAACACACTCATAAATTGGCACAAATAAAGCTTATGGGA
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CTAGGCTGTCAACATTTGATGATTTTCAGTGGTGTGTGAAGAATACTGTGGGAAAATAGG
TTTGCATGTGTAACTGTGCAGAGAACAAACTCTGGCAGCAGACCCATCCAGCTGATATTG
GTGCTTATTTCTGGGGAACTAGACATCTTATACATTTCTGCATTGGAATATTTTTTCAGT
AAACATTAAATATATCTTATAATCAAAAACAATAATAAAGCTATTTTCATTTTCAAAAAC
AAACAATATAAAATTTCCAAATAACATGACTAGTCCGTGGACCGTTCCGGTTGGCAGCAG
ATCTAACATAAACCAATGGGGTTTGGATGCCAAGGTTTCTTTTGTAAACTATAGTTTATA
CTTTTAACATAAACCGTACGTTTATATTTGAGATACTCATATACCTGATTTTTCTTTAAT
TAAAAGAAGTAAACAGTGTAGAGAGGATTAACAAAGCCAGAAAATATACAACAAAGCCAA
AAGGCAGAAATCACCCCCTGTTGCGATTTTGATTAGGATTGCATTGGATTTATAAATCAA
CTGGAAACACTTGACTTCTTTGCAATATTCAGTCTTAACCCATGACCATGTTCTGTCTCT
GTCCGTTGCTTAAGCCATCTTCAGCGATTTCCGGCAAAGTTAATACATTTCTCTGTGGAG
ACCAAGATCTTCTGTTAGATTTATTCCTAGGTACTTCTGTATTTTTATGTAGTTATAAAT
GGCAACTTTTTGAAAAATATCATTGTCTTTACCTGTTTGTTGCTACTGTGTAGAAATGCT
GCTGATTTGTGTATTTCGATTTAGTATTCAGTAATCTCTGCTAAACTCTTATTGAATAAT
TTATCCTTAGATTATTTTGGATTTTCCTTACACATTCACCTCGTATGTAAATAGCAGCAC
TCCCGCTCCCTCCTTTGCACTCTTTTCCTCTTTCTTTTTCTTGCGTACGTGCACTAGCTG
AGACTTCTGGTGCGGTGTTGACAAGATATGGCAGTGGCAGGCATTCTTGGCTTGTTCTCA
GCAAACGGAAATTTTCAGAGTTTCATCATTAAAGAGTAACGTTTTCTGTACAGTTTTGGT
AGATATTCTTAATCAACATAAATTCTTTTCTCTTTCTTTTTTGCTAAGTAATTTTTGGTT
GTTTTTTGTTGTTTTTAAAAAGTCATGAGTGGATGTTCAGTTGTAGCAATGTTTCTTTTG
TAGCTGTTTATCAAAAAAATTTTTTTTCCTTAATCTGTTAATATGTTGAATTACATTGAT
TTTCTAATGTTCAATCAACTTTGTGTTCCTGGTATAAATGCAACTTGATTATGGTACTTT
TTATATATTGTTGGATTTGGTTATTTAGAATTTTTACAACTATATTTACGAATCATATTG
GTTTATAATTTTCCTTTCACATATTGAATTTACCAGATTTTGGTATCAAGGTTATTCTAC
CTTGTGAAAGAAGTTTGAAGTATGTTCTGTTTTTCTATTTTTTGGAAACATTTATTTGAT
ATTAGAAGGAGTTCTTTGTATGTTTGATAAAATTCAGTAATGTAACCATCTGGGCCTAAA
ATTTTCTGTGGATATACATATTTGACCACTGATTCAATGTCTTTAACAGGCAAAGGACTT
TTAAGGCCCTCTGTTTTTTTCTTGAGTTACTTTTGATTAGTTCTATTTTTCTAGGGATTA
GTCCATTTCATCTAAGTTGTCAAATATATTGGTATAAAGTTGGTCACAGTATCTAAATTT
GTAAATTGTCTACTTTTGTAGTGAGGTATAATTTCCATGCAGTGAATGCACAGATCTTAG
ATGTACAGTTCAACAAGTTTGACAAATACACATGTTCATGTAATCCACACTCCTTTGAAG
GTAACAGAAAATTTCTGTGAGTTCACAAAGCTCTCTTATGTCCCTTCCCACACCCTGGCC
CCAGGGAACCCTATTCTGATTCTGTCACCATAGACTAGTTTTGCCTACTCTAGATGTCAC
AGAAATGGAGCCATACAACGTCCAGTCCTCAGTATCTGCCTTAGGATACATCCATGTTGT
TGTGTGGCAGTAGTTAGTTCTTTTTATTGTATGAATTGTATGAATATACCACAGTTTATT
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TGTTGTCACCATCAGTAGTCAGTTCACCAGGAAGTCCTATCACGTTTACCCTCAGAATAT
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