SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000912_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein U (SelU)
SpeciesErinaceus europaeus (Hedgehog)
Transcript IDSPT00000912
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000816_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000912_2.0 # Transcript # Selenoprotein U (SelU) # Hedgehog (Erinaceus europaeus) # Full length # Reverse
TCACACGTGGATAACTGAAGATCTGTTAGTAAAGTCTATATGCTGTATTCCTACAAGCTG
TAAAACGGAGTTGATGGGTTTGTGATCCAACCTATTCCTATCACGGTGTATAAAATGGAT
GTTGTTACCTAAAAGAATAAGAATGAAAAACAGCAGTGGGCATATAGTATTAATCAGTAT
GTTACTCACTAGAATAAAGGAGGTTTTTCAACTTTTAATTAGGCCAAAAGGAAAAGTTAA
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TTTTTAATGAGATATACTATTCCAACCAGAAAAAAAAAATCCCAATACTTGGTCAAAATC
CTCCTTTAAAAATTTTTTTTTAAATATTTATTCCCTTTTGTTGCCCTTGTTTTATTATTG
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ACCTGCTTCACCGCCTGTGAAGCGATCCCCCTGCAGGTGGGGAGCGGGGGCTCGAACCAG
GATCCTTATGCCAGTCCTTGTGCTTTGCACCACGTGCGCTTAACCGCTGTGCTACCGCCC
AGCTCCCTAAGTAGGCTGAATCTTCTACTGTCAAAAAAAAAAAAAGTTTGATGATTCTCT
ATTTTGGAAACATTCATCTCTATTAAGTTTCTTCTTGAGTACTATTGCCATATTCTTCTA
TTCACCAAACCACAACTAACTTTCTCTATCCCAAATACCTAGAGTCAGGCAATGAATGGA
GTCATTACATCCAATAAGCAAATTTCAAAGTGTTTTAAGTATATGAAAATAAAAGATACC
CTTATGGAGTAACTATTGAATTAGAGCTTTCATGCTTACCTGGACCTAAAATGAGGGTTC
CGCCTTGCTGAGCTGGATCTCCTTGAAAGTCAAAGAGAGGGCCAGTCACTGCCCGCCACA
GGCTCCGAATGCTTCCTGACAGTATATTTGATTTTATATGGGGGCTTTTCCC
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