SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000917_2.0
Identity
TranscriptThioredoxin reductase (TR)
SpeciesErinaceus europaeus (Hedgehog)
Transcript IDSPT00000917
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000821_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000917_2.0 # Transcript # Thioredoxin reductase (TR) # Hedgehog (Erinaceus europaeus) # Full length # Forward
CAGGCACACCACAGCGGCCTGCTACAGCAGCTCCTCCAGGAAGGGTCGGGCTTTGATGGC
TTTGATTACGACCTCATTGTGCTCGGTGGTGGTTCCGGTGGCCTCTCGTGTGCTCAGGTA
TGGAACCAAAGGGGACTCAAAGGTACTCTTCCTGCTCACGCCTGTGCTCCTCCTGCTCTT
CAGCAAGGGCCATTGTAAAGCTGCACTGCAAGCTTCTTCTTGGAATGGTTGGCTTCAGGA
AGAAGAAAAGACCGTATAAAGACGCGGCACAGTCTTCTCTGCTGGGGGTGTGTCAGAGAG
CTGACGGTCTTTATATATAGCCTCTTTTGTAGGAAGCTGCCATTCTGGGGAAGAAAGTGA
TGGTCCTGGATTTTGTGGTCCCCTCACCTCTGGGCACGTCCTGGGGTAAGCCGCTACTGT
CTTTGTCTTGACGCTTCTCTGCTCGCCGCCTGTCATGCTGGCTTTGTCTCATCCCCTTTA
ACTCTCACGACAATCTCAAGAGGTGTCACCAGTTTAATAGGTGAGGAAACAGTCTCTGAA
CTAGTCCAAGCCCCTCATAGCCAGCGAGCTGCGATTTGGGAAGATACTAGGAAATAATGA
AAGAAAGGCTGCGAAGAAGAGCTCACAAGTAAGGCATCTGACTCGCTGTGCTCGTAGCCT
CGGCTTTGAGTCCCAGCATCACACTGGGAGCTGCCAAGGCAGTGGGGGAAGCACTGCTGC
TGCGTTCTCTTGCTCTGTCTCTAGCTAAAGGATATAGTGTAGTGGCCTAGAGCAGTGAAA
GCACATTTACACAAGGCCCTGACATCACACACTCACACACACACACACACACACACACAC
ACACACACAGCTCTAGCAGAGAGAGCGAGAGAGAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNAGGTGACTCAGCAGGATTGCTCCTGCTTGGGTTCTGGATGCATTCCTTAGTACC
TCATTAACATAAAGTTTAGGCTAACTGTTTATGTATTTGTGGTGTGTGTGTGTGTGTTCA
TCCCCTAACCATTCAAGGTTGCCGTTGCTACACGTCTTTTTTAATACTTATTTTTGATAG
GATAGAGAAATTGGAAGGGAAAGGGAGATGGAGACACCTATAGTGTTACTGCACTGTGCA
TGAAGCTTCCCCTGCAGGTGGGAACCAGGGATTTGAACCTGGGTCCTCATGCATGGTACT
GTATCCGCTCTACCGAGCGCACCACAACCCAGCCCTTACAGCATCATTCTGCACTTAAAC
CCTCACAGACAGAAAACCAGAATGACTCTTGTTCCTTCTCTCAGGTCTTGGTGGCACCTG
TGTCAATGTCGGCTGCGTCCCCAAGAAACTGATGCATCAGGCAGCCCTGCTGGGACAGGC
GCTGGCCGACTCAAGGAAGTTCGGCTGGGAGTACAGTCAGCAAGGT
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