SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000981_2.0
Identity
TranscriptSECIS binding protein 2 (SBP2)
SpeciesGadus morhua (Cod)
Transcript IDSPT00000981
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000885_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00000981_2.0 # Transcript # SECIS binding protein 2 (SBP2) # Cod (Gadus morhua) # Full length # Forward
CTCCAGAAAACTGAGAAGGCCTCTGGGAAGAAGAGCAAGGTTCCTCTGCAGCTGGACATC
GGCACCATGCTGGAGGTGCTGGAGAGGAAGCAGCAATCCCAGAAGTCCAAACACGATGCC
AAGCCTCTCTACCTGTCAGGTAACCACACCCCAAAGCTGTCCCCGTGACCTGACTCGGTA
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AGGGAGGTGCCCAAGGCCAAGAAACCCACCCAGCTGAAGAGGGTGAGCCCCAGCCTCACC
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GATGACTGACTGACTGACTGACTGACTGACTGACTGACTGACTGACTGACTGACTGACTG
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CATTTATCAGAAGAAAGAGAAACAACAATGTATCTCTGTGGGTACAGTAAGGATGTTCAA
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CAGCTGGGGTAAGACGCTACATAATGATAAGGACTATTTCTAAGTGCCAGGCCGTACAAC
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TGCACAAGTGAGTCTTCAGTCTTTTGCGTTAGCCGGTGAGCGTCTCTGCGGTCCTGACAT
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AAAGTTGAGCTTAGCCCTTAGCTGAATGTGTGTCTGTGTGTGTGTGTGACTTCGATTTGC
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GTTTATACGTACATTTTTCGGTGTGATCTCTTATCAGCTTATCATGTAGGTCTTGTAAAG
GCATGTAAGCTTCGAACCTGTTACAGGTTAACCCAGTCCCTGTAGACAACAAGACAGCTA
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GTGTGTGTGTGTGTGCAGCTACTGCAGCCAGGTCCTGAGTAAGGAGGTGGATGAGTGTGT
GAGTGCACTGCTACGCGAGCTGGTGCGTTTCCAGGACCGGCTCTACCAGAAGGACCCCAT
GAAGGCGCGCATGAAGAAGCGTCTGGTCATGGGTCTGCGCGAGGTCCTCAAGCACCTGCG
GCTCGGCAAGGTCAAGTGTGTCGTCATCTCGCCCAACTGTGAGAGGAGCCAGTCCAAAGG
TACGCCCCCCCCTGTTCTGCTCTGGTCTACCATTAACCTGGGGTGGGTTGCAGCTCAGTT
GCAGCAGCCAAAATACGAGTGTTTCCCAAAAAATCTCCAGCTAACACAGCCATACGTGGN
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CCCCTCTAACCCGTGGCTCCTCCTCTAACAGTTGGCTCCTCCTCTAACTCGTGGCTCCTC
CTCTAACCCGTGGCTCCTCCTCCCCTAACGTGTGGCTCCTCCTCCCCTAACCCCTCGCTC
CTCCTCTAACCCCTCGCTCCTCCTCTAACCCATGGCTCCTCCTCTCCTAACCCTTGGCTC
CTCCTCTAACGCGTGGCTCCTCCTCCCCTAACGGCTGGCTCCTCCCCGTCCAGGTGGTCT
GGACGAGGCGCTCCACACCATCATAGAGACGTGCCGGCAGCGGGCCGTGCCCTTCGTGTT
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