SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000982_2.0
Identity
TranscriptSECIS binding protein 2 (SBP2)
SpeciesGadus morhua (Cod)
Transcript IDSPT00000982
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000886_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000982_2.0 # Transcript # SECIS binding protein 2 (SBP2) # Cod (Gadus morhua) # Full length # Reverse
GCCTTCAGCCCGCTCATCCGGGAGGTCGGCCGACTCGATCTCCTCCTCGCTCTGTCCCGC
CGTCTCCTCCTCGTCCTCGTCCTCGTCGTCCGTGCTGTCCTGGTCCTTTCCCAGCTGCAG
GTTCTCCAGGGTCTTGGAGACCCAGGACTCGATGCGGCTGCTCAGCGGCGGCACCTCCAC
CGAGATGGGCTCCGGCGTGTAGTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCGTCCTCCTCCTCCAG
CATGCCCGGCACCAGGGTGGAGGTGGTGGAGGTGATGGACGAGTGCAGCTGCTCCCGGCA
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GTTGCGGGAGTGGCCCATGTGGTGGGGGACCTTCTTGACGTTCTTCAGGGCCTCCTCAGC
CTGCTCCTGCTCCAGGGCCGACACCATGTCCTTGTAGGCCTTGCGGGCCTCCTCGGTGAG
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CTGGCCATGGCGATCACGTTGTACAGAGCTTCATCCAGCCCACCTGAAACCCACACACAG
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CAGACCGTCTAAGATATGGGCGACACCCACTTTCACTTCATATTTATTTTCGACCAATCG
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GTGTGATTGTTAGTTAGTATGCGATTTTTCTTGTTAAAGTTCCTTACGTACACTGGAAGC
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TGCTGGTCAGCTAAAGAGTGCCTGAATCTATCAAGGATGGCCACACATGTCTGCTGCCAA
GGGCAGAATCAATTTTCCAGTCATTTTCTAGTCCTTGGGGTTTTCATAGAACATGTTTTT
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TGCGTGTTCGTTTGCATGACTACTAGTGTTCCGCGTGCGTGTTTACGTGCAATTGTGTGA
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GTGTGAGTGCATACATGTGTCGTATGTGTGTGAGTGACCGCGTTTATTTGTGGAAATGTG
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TGTGCATATGCGTGTGTGTGTATGTGACTGCGTTTGTTGGTTTTAATGCGTGCGTGCGCG
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GTGAACGGACCAAGCCGATTGGAGGTGGACGTGGTTGTCTGACCCCCCCCCAACCAGCAC
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TCGTCCGGGTTCTGCTCCTCGGGGCCCGAGGTCCCTGGCTCCACGCTGGGCTTCCCCTTC
TTCCCCTCGCGCTCCTTCAGGATGATCTGGACGGGAGCAGAACACCATCCCCGTCAATCA
AACCCCTCACTCGTCATGCTCACCTCGTACACACTGATGGGAGGCACTGAGACCAGGCAG
TCTCGTTTACAGCTATTATTATTAGATTTTATTCTCTTACACTTTTTATGTTGCATTGTT
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TGCTCTTCTTGCCCGCCGCCTTGGTCAGCGCCTCCTGCAGGCCCGCAAGGGAACGACACC
CTGGGGTTAAACCTCTGCACTGCCCGGGTGACCACAATGCCTGCTTTAACCGTGGCCATG
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CCCGCTTGGGCACCGAGGTGGTGATGGGGATGGGCGTCTGCACGATGTTCATGGGGGAGT
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GGGTCCGCACGGACGTAACGGGTCCGTGAACCCCCTTGCGTTGCGTCAACGTGGAACCAT
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CTTCTGGGCTGCCTGGGGGGCTACATTCACCCAGCTCCCTGCTGAACACACACACACACA
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GACGTCCACCTCTCCCCCGCCGCCCCCCTGCTCGCTGTAGCCCTCCGCCCCCCCGTTGGA
CCCCTGCCTCCTCTTGGGCCGGCTCTTCCACAACAGGGGGCTGCCGTGCTCCGCGCCCGC
TCGCATGGCCACCTCCCCGGGGAAGTCTGGGGGGGGGAGGAGGAGGAGGAGGAGAGAGTT
CGTCTTTATCTAACTATTGAATTGTACAAGAAAATGAATAGGAATCTTACTGATCTCCAG
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TATCAGCCTTTTCTACAACATCGCGATGTCGGTTTGAATACGATCAATCGATCAGCCCTA
CAGAAGGACAGTGGTGACACCAGAAAGAAGAAAGAAAGAAAACAAGCCTGAAGGACGCGC
CGTCTCCAGTGCAAGACGTCACGCTGATGGCTGTTTTACCGTCTTTAATAAAGGCTGGAA
TTAGCTTCTTCTATCTAACAAGTCAGAACTAACTGGAAGATTATGGATTATTGACTTTTT
CCATATAGTCGTAAAGCAAAATGCAAATTAATATACATTTAGGATTTTGTTATATATCAT
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GGAACACACTTCTCCAACTGGTAGACCGGCATTCTTCCTGTGGTTTCCACAGGTGATGTA
GCATGGCTGTCACCTCATGCATGCCAGCCTGGTTTCTACGAGGTTTACCGTCATTGTTTA
CAGCCTTGTTTATTGTCGCCTGACTAGCGTGAAAGCATTTTTTTATGTCGTGTGACTCAA
CCTCATTGCTGCCACATTCCCTTTGCGTCATTGGAAATTTTACAATAGGGGAAAATTATA
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GAGTTGCTCTTGTTGTGCTTGTGACAGCTCCGTGGCATCAGGTCAAGACTCTCTCAGACG
CTGCGATTCATCCAGGATGCCGGCAGATACAGTGGGGCCATATTAGACGCGTCATGAGGG
GAGCTACGGTGGGTTGAAACCATACGTTGGCATGATACTTCTGCCAAGGAAATCAGTACC
AGTTTGAAACCATTTCTAAGCCTTCTCTTTTTTTAATAGACTAGTCGCTGACACTAAACG
CTCAGTTAGCCGTCAGGGAGGTCCCTCGTTAACAGTGACATCATGCGAGGTATTAAGAAG
TGGAGTAATTACTGCTGTGGTACGGCATACCGGTCTGCTGCGCTGCGTCCACCAGCAGGA
CCGTCCTGGCTCTAGCGTTGGGCCCCGGGGCCCCGCACACCTCCTTCTGCACCGCTACAC
TCCTGGTGGGGGGGCGCCGGCCCCGGAGAGGGTGGCACGCCCCCAGCTGCTGCTGCTGCT
GCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGGAAACAAGTGCAAAGAGAAAGGGTTTAAAAAGACACGT
CGACAGGAGAGGGCCCCACACTGTTTCTAGTGCCTGCTCCATGTAAGACCTCTGGCCGTA
AAGGGCTGATTATGGTTCTGGCCCGCGGAAACAGTCGGGAAGCTGCAGTGGTCCCTCGTT
GGGTTTTAGCGAGAGGACCAATCACAGCCTTCTGCTGCTCGACGCAAGGTTAACCTTTTT
TTACCGTAGTCAGCCCTTAAGAACGACTACAGTCGGGGTTACCTTGGGCAGCAGAGGGGG
CCGGATCAGAGCCCGTCCTCTCTGATTGGTCAGTCCAAAGGCTTGTCCGAAATGTGGTCT
CTCGCCGACGTCAGCCGCGGAGACGGGGTTCACCACCCCGGCCTGCACGGACCCGGGGTA
GGGTCCGGGGAAGGACTGATAGAAGCCCATGACGGGCGGACACGGTGCGGGCATGATCTG
GTAGTAGGCGTAGTCGTTGGAGACCGGCGGCTGAGGGGAGGGCATGATGGGGTAGGCCAG
GTACGGCCCACCGGGGCTGGGGTTGGGCTGCTGCCAGCGCAGCTCTCCTCCGTTGTACAT
CGCCGTGTGCTGCCTGTGAGGGGGAAAACCAAGGCAGGATGTGGTGTAAGTCCATGTTAT
TCTCTTGGGTTAATGGGGTGCGATGGAGACACGACACTGCCTTGATAATGATGCAACTAG
ATTCCGGTGAGTTGTAGCATTCTGTTATTCGTGTTGTGATCATGCACTGGAGTCTAATTT
GCTGACAGGGGGACCAAGAGTAATTAATCACTGGGCACAGAGCCCATAAAGATTGCTGAT
TGGCTCTTGAATCAGAGCAATAACAAAATACCTTGGCGCTTTTGATTACATTCCATTACA
ATCGTAAATAAAAAATATATAAAAGAAAAATAGTTTTTTGGAAAGTCCCTGTGGGATTTC
CCACAAATGTTATGCAACACAACGCCCCCAACTCTGGCCCTCCCACTGGCCTAGATGTAA
ATGTCTTCACCTTCAAAGTGATTTACATACATTTGGATGGGGATGGAAATGGTTTGGGGA
CAGTAGAAATGACTCAATGAGTAACCGAAGCACCGTGCTTCGGTCTGCCATGCGACTCGT
TTTTGCAAGGATCAAAACGGCGTACTGCCAGCCAGCGTTCTATAAGTGGCCACTTCCTTG
TATTCAATAAGGTAGAGGAAGGAAACAAAGGGGCCGGATGTGCACAGGATACAACAGATC
TCCTCAGACAAAGAGAGACTCGCTGCCGAGAGGCAGATAGCGGCTGCGTGTGAACTGTGG
AACAGGCCGTGTCCGTTCAGAGTATAAGTGACCTGGGGAGCCAATGGCTGGACAGCAATA
TGGAGGTGGCGTGAGCGTCGCTGATCTATATCGCTAAGGGGCGGAGTCAGAGCCTCCCTG
CTCATTATGAGAGGCAACAGAAAATACAGTGAATGGTAGGAGGCGTTTTATGGGGACGAT
ATTGGAATGATTTGTGAGTTTTAGAACTAACGGGACTGCTCTCAAACATGACCAACCTCA
TTTCCATATAAAGCCAAGCGATTTAAAGCCCCACTTTAGGTTGCAAATTGTAGAACGCGA
GAGAAAGTACACCCACCCCCGATCTACAAGCCCCAGACTTTTGTTGAGGTTTCACCAATT
TGGTTAAAATATGCGGTCTCGCCGTAGAGATGAAGCGGAACACCAACAGTACCTGTTGGG
CTGGTTCTCCTGGACGAAGGGGTAACAGGTGATGAGGTAGCTGGGGATGGGGGTTGTCTC
GACTCCTCCTCCTCCTCCGCCTCCGCCTCCACCACCACCGCCGTTGTTGTTGTTGCTGCT
GCTGATGTTGTTGTTGTTGTTGCCCCCAGACTCTCCAGGGAGACTCATTCTGACCAAGTG
CCCTTCCACACCTTTCCTCTGTGGGATGAACGGTTCCACTTCTGCCGATAGTTTTACATC
CTGCATGGAGAG
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