SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000985_2.0
Identity
TranscriptSelenocysteine synthase (SecS)
SpeciesGadus morhua (Cod)
Transcript IDSPT00000985
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000889_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000985_2.0 # Transcript # Selenocysteine synthase (SecS) # Cod (Gadus morhua) # Full length # Reverse
CCGCCCGAGGCCCAGCAGGGTGATGAGGACATCGAGGCTGGGCGAGGCTGAGGCGCGACC
TGCACACAGAGGTACAATCCCTCACGTCAGGTCACCCATGATCCCGTCACAGCCCGCCTG
GCGTCACGGTGAGGTGACCCCCCCCCCGTCCTGTCCTGCCCTGCCCTGTCCTGGGTGAAT
ACAGGTCCTTATGCCCCGCCCCCTGCCCTACGGACACGGCCTGCAGGCTCCAGGTCAGCA
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GCAGTGAGCTCACCTGGGTACATCTGGCTGATCTCCTGGATGAAGGCCTCGTCGAATCCG
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TGAATTACTAAAGCTCTTACATTAATCATACGTTTGTTTTGAAGAACAATTGCATCCGTA
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GGGCGGTCAGAGTGGGGGTGTGTGTGTGGGGAGGGGGGGGGTACCTGTCGGGGACGCGGG
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TCTGTCTCTCCACGGCCGCCACGTCGGTCCGTAGCTCGTCGCCTTCCAGAACGTTCTCCA
CCACCACCGGCTCATAGCCTGGTCACAAGGGGCGGAGCCAGGTCAACAACAACACTGAGC
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TCAAAGGGGCGGAGCCACGTCAACAACAACACTGACCCAGGTGGACGGCACCAAGGCTTC
TGATTGGCTGAACCACCAGAGGGCCCACCGGGCGTGCGAGGAGGCGTGCGAGGAGGCGGT
CTCACCTGCGGTGACCATGGCCTTGAAGCAGGACTTCTGGTCGATGCGGGGCCAGACGAT
GTAGCGCGCCCGGGGCCGCCGGTGCCGCAGCGTCAGGAAGCACAGGCTCAGGCTCATCCC
CGTCGCCATGGGGACCACGAAGCAGCTGGCCGCGCCCCGTACCCCTGAGCGGGGATAACC
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCCTCAGGACGTCCAGCACCACCG
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CCCCCGACCGGCCGATCCCGTGGATCAGTCTGGACGGCAACACACAGAGGACAATGTTAG
ACGATCACAAGAGAGCGGACATCTTGGTTCAATAAGCTGCTATTATATTCCCCTCAACGG
TATGGAATGTTTATATTAATTATTGCTTTTATATTGCAATTACCGATAGTGAAAATATGA
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CGGTCTCCCCTCGTTAGTAACTCATCTCCCCGATACGACTCCACTTCTACCAACGACTCT
CCTCTCCTTCTCCAAGCACGGGTTCGATGTCAGATCAAAGAAGACCCTTTTCAAGATGAA
CTCAGCGTAAAGACTCGTCCCCGTTCAGCGAGCGTCTGACCTGTAGTGGCGCCGGGCCAC
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GCATTTCGATTAACAATACTACATTTACATTTAGGGCATTTAGCAGGCGCTTTTATCCAA
AGCGACTGACAATAAGTACATTTGTCAGAAAATAGAGAAACAACAATATATCGCTGTCGG
TACAGTAGAGATGTTCATAGAAACAAGTGCCAAGCACTAACAATTGTTAGGTTAACCAAT
TCCCTGTACGCAACAAATCTTACTAGTGTCTAAAGATGAAAATATATCTTTAGCTATATA
GGCAAGTTATTTTATTTGCTCCTAGTCCTGTATTTTCGGCCGTGCCACCTGAAGTTCTCA
TACAATAAACGACCATCTCCTTTTCCATCACAGTGCCCGACTGCTCCGGTTCTAACTGGC
TGGGTCCGGTCGGTCGTGGCCTCACCTGCTCCAGGAGCTGTCTGATGAGCTGCTCGTGTC
CGCGGCGCGCCTGGGAGCCCTGGCGAACGTAGGACGGCGAAACGATCCTCTCACTCAGGG
AGAAGTTCTCCGGGTTCAT
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