SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001012_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein U3 (SelU3)
SpeciesGadus morhua (Cod)
Transcript IDSPT00001012
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000916_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00001012_2.0 # Transcript # Selenoprotein U3 (SelU3) # Cod (Gadus morhua) # Full length # Reverse
TCATCGCGTACAAACTTCGTCATTGCACTGCAGGGAGTTCAAAATAAATAAAGAAGAGAT
CAAATTCAGACCAAACCAGTAGAAAAAATCTATTAAATATACAGATATAAGTATAGATTG
ATAGATCAGCAGTATCAATCACTGGACTGGAATGCCAATGACCTGAATGGTACATGTTGT
CCAGGGATAATAGTTCAGACTGGAAGCAAAAACAAATACGAAAGCGGCAAATCAAGTGGC
CTACACAGATGTTTCCATACATTAAGGGTTTATGAGCCACATGATAAAGATCTTTCTCCT
AGCGTGGTGAATAGCGAGTTAATTCGAGACACTGTGCAGACACTGTAAGTAATCTCACTT
TCTGATTCCCCTGGGGCCGAATTCAGTGAGTTGAGGCAGTTTGGGGAAAGAGGAACAAGG
AACATTGACTGCTATATATGTACAGTTTTAAAGAGCCACATTAGGTTCTAAATTTGAACC
TCCATAATGTTTGTTAAAAAAACAACAGTTAAGTCCACACAGACTTAACTGTCTGTCTGG
AACATATGTATATACCATCCCTTATTTTTTCTTTCTAAAATATAGCAGGGAAAACATGCA
CACACCCACACATTATATTTTTACATAAATTATGTCAGCTCAAAAAAATTTTTTTGAAAG
GCCCATACAGCCATACCCATAGGACATAGGAGATTCAGATTCTGCTAATGGGAACCAGAC
TATGTATTTTGCCATGAAGCTCCAACTGCGTCCCTCAGTCCACCTCAAAGGTGCTCGTAT
TGCACTTCCCAAATCAACTCGGATTTTAAGCCAGACCTGTGATTCAAAAAGCCAATATTA
AATATTGTATCAATAAAAGGATATATGCCCCTGTTGCTCTGCTTCCAGCCTTTGCTATTT
TGCTATAAGCACAACAAAATGATAAGTGGGGAACATATGTCTCGGTATGCTGTTTGACAA
ATGGAATTAGAAGTTCCTGTAAAGTCCTTTACGGGTGAATGGTTAAAGTACCGTCCATGA
ACTTCGGTGAAATACACAATGCAGTGATAATTCACATTTGGGAAAGACCTGGGCAAACAT
ACGTTAGTCTATGAAGAACCACCTTCCCTTGATGATGGCTAAATTCAAGGAATTGACCAT
GGGTCTGCCTGTGTGTGTGTATGGGGGCTGATTTGGAGGGACACAGCTTTCTTCCAGAGA
AATATCAACACCATCGTCCTACGATGGTTAAATTATAATCGTCACTACATCATGCGTTCA
TGTGTTTTGATTACATGTCTAAGCCATGAGGATGCTTGGGATCAAGCTGTATTCCTTAGG
CTTGAGGCCTCGCCTTGATGACGATCAAATACGATTGAAGCACGTTGGGGAAAGTTTCAA
GCCGGTAACGCATCTTGTCATGCTTGCCGTCAAGCCTTGTGACAGCAACACCGGGGTGAG
ACAATGTTGTTCTTGTTTCCTGAATACTTGAATGACAACCGTCTGTCGTCAGACGCGTCA
CAGGGATTTCTGAAAGGGACACAACCTTGTGCCATGGCCGCAAGCCTACTCTCGTACGCA
GGCCTTTTTAAGAGACCCTGACTGGTCACAAGATCTCCCCAGTATCCACAGGCGACGTGC
GTTGGGTCATAGGACCTAGGATGCTATTCCTCTCAACATTGAGCATGAACTGTTTTCTCT
TAAATTCTTTGTTTTATAATTTTCCTTAAGCCCCAAGTCGAATGGTCGGAATTGCCATGC
ATTAAACAGACCTTTGTGTCACATTAGACCCTTTTGACGTGGTTAGGAGATGGTAAAGCC
CGTCAAATTAGGTATAAGTGGCAGCTTCTGCGGTCATACCCATGGTCAAGGCATGACAGC
AGATAAACCCTCAACAGTTGAACCAGGGGACTTACCCCTGATCACTGGTTATGCCAACTG
ATCAGAACTGGAAACCTTCAAGTAAGGATTGCAACCACTGAGGTTCAATCCTAGCCAAGA
TATGTTTTTTACATATCTTATTGTTCTTGGGTCTCACCGACGGCATCTGTCCCTCCTGTG
CGTTGGTGGACACACCCAGTGCCTTGGAGATGTCTTCTAAAGGCACAAAGTCTCCTGGGT
TGTCCTGGACAAAGTGGAGCAGCACCTTCTCTCCACCTTTACAATGTGAAAGAAAATAAT
GCAGCAATGGAAATGTCAACAGATACAGATCATGTATGTATGTGTACTTTACATATTTTG
ATGGTCAACTTCTGGTCATCGTTATTTTTCTAGCCCCCATTCCCATTTTGTTATACTACA
CTGCCCTCTAGTGGGAGAGGAGTAACTACCAAGACAAGTGTTAATGAATAACCCTCAAAA
TGCCAAAAGGTGGGCACGTGGAGGAAAGCACTAGTCTCGAGGTGCTCCCCCCTGCAAAAT
GTTTTGTATTATTATTTTTTTTATAAAAACCAAAGCCCTATTGGCAAGATGGTAAATCTC
ATTAGTTTATGAGCTTATCATTTCATTATATTTCAAACCAAACTCAGATTATACCCAATC
ATTTTCGAATTGCAGGCTTTATTGAATTAATTGAAAATTATTAGTTTTCCTTTATCACCA
CCCTCTTGATTTTATTGGTTGAATGGCCTTTTTTTCTCAGATGCCGATTTCCAATTAAAA
CAACCTGTCCCCGTAAGTGAGAGTGGTCTGTCTTTTATTGCGCCGAATTGACGGTGCTTG
TGGACGCGCCACTGAGCTGCAGGGGCAAGGGTCGCCAGTGGTTCTTGTGCTGCCTGCTTA
ATGGAGATTGTTACTAGGTGCTTTGATAAGGATACATTCATTATCTTAGAGGATGACGGA
GTGAGAAAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACA
GACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGGTAATTAGTAAGTTACCATGAAC
TCTATCTCTTACACAGCTAAAACAACTGTTTAGAATTAAGGAAGACAATTTATTTTGTTG
TGCCATTTAACGCTTTTTGATTGGCTGAATGAATGAAAACTTTACGTTTATAAGTATTTT
ATAGTTTGGGGACAAGAGAAAGGGCTTTTTGCACGAGGCTAGGATATGACGGCTTTAAAT
CCGGCATGCAAGCTATTCACTGTGTCTTTGCTCCATTTTATTGTCCTTAGGATCTGTTAA
GGCCGTTTGAAATTTGCCCCTGCCAGTGCCGTCGTTTGGCCCGCTCAAAATATAAAATGA
ACAACCTAAATTCACACTTGCAGAATCCAATTATTATTATTATAAACTATTCATTTCAGC
AGTTTTCTTCTAATTATACCTGTGAAGAAAAGAGAGGCGAACGACACATCTCTTGTTTCG
CGCTGGTCCTTATCTCAGTATGTAAGTTGAGCTTTGTTATCTCCTCAATGTCACAGCCTA
CCTTTTGCAACAATCAGCATTCCTCCACTCTGTAATAAATCCCCTGAGAAGTTCCCCTGG
ATGCCTTGAGCACTGGCCTGGAAAACAACAGACATGGCAGCTGGTCAGAAGGCCGTACAT
TCTGTTACATGTTCAGGTTTTAGACAAAACAGGGCACCGGTCTGATGGTAGAAGATCACA
AGTAGAGGTTTTGAAGAACAGGTGTCTACACAGCTAGATTTTTTGCTCTCAATTCACTTG
GGTTTACTTTGGGTTTAACTTAGTATATGTTCTTTCTTAACTAAAAAGCTTTTAAATGTA
GGTAATAAAACCCCTTCCTCTGTGCATATTAGCTGACGCACAGATGTTAGGGATAGAAAG
TCATTAATGTGCTCTTGCTAAATCTACTATTCTACTAATTTGTTCTGGTTTCACCCATTT
AATATTTCCAGTCAAACAATTGTTTAAGGCTTACAAACAGTACTGCCCAACACAAACTGT
GCAAACAAAGGATGAATCCAATTGACCCCATAGTATCCATAGGAACAACAAGTCCAAAGA
TTGAAGAACCATATTATATTTGGGGGTGTGGCCTAGACAGGTGACGAACAACGTATGGCT
GGTTAGAGGAGCAGAGATAACACAGAGACTGTTTGATATTGTGTGTGTTCTCCCTTGCAG
CGAGGCTGTGAGCTGGACTAAAGTGAGTCACTGCCTGAATAACTCAAGAAACATGGTGCA
TAAGCAGCTTCTACGAGCCTGTTGTGTCATTAGCTACAATTAACTTTTTTTCTTTTTTTT
AAGACCTCATCAATCTTATACTTAAATACACTACGCAGCGATGTCATCAAGGCAATACAC
CTTACCTAGCCTCACAAAAATCCACATTGGTCAGATATAAGCACCTTTCTGTCTAGAAGT
CTGAAGAGTTCAATCACTTCGGAACCCTGGCTGAACGCTTCGCTGACTGCTTGACAGAAA
GTTGCTCATACCTGACAAACCAGATTTATGTGAAAATGATGTCAAAGAGGATGACCTAAG
CTGTCCCTAGATGTCCGATATTGGTGACCTTACCACTATACAAGCAGATAGGACTTACGT
TTTAATTAATAGGGCTCTCCATGGAGTGAATTGCAACTAAGAGGCTGCAGTAATGTCAAC
ATCCTCTAGCTTGCTACATCTTACCTTTGCAGCCACAGCTCTCACTTTTTTCCCTAAGCC
GGCAGGAACGACACTCAAGGCTGTGTACCTGTGCAGGAAAACAATCAATGAATCCTTGGC
ATTTTGAAACAGTTTGCAGAATGAGTCTTGAACATACATTTAAGCTACGCTCACCTTTTG
AAGCCTAAATCCTTGTAGGTCTTCTTCTTTTCATCAAGATAAAGGGCTTCAGGAGAAATA
ATTGATAGACAGGCATTAGCTTTGACACTTGTCCTTGGGCCATGCCCACTCTCATGTAAG
TTATGTAAAGTTGAATTGTGCAATTCTCATAGAGACCACAGGGGGGAGACAGTGTTGGGA
CACGTCTTATATTCATCGCATAATAATATGCTGAATGAAAATATCCCACCTCCTTTAAAG
AACCCTAGTTCCCTGAAGTCGTGCAGGCCCGTCTCCTCTGGACCGATGCCCACCAGGGCG
ATGTTGTTAGCTCTCAGGTCGGGCTCCAGTTTGCTTATTTCAGCCGCTGTCCACCGACAC
ACCTGACATCCAAACCGGCGTAGGAAGAACAAGACCACCGTCTGTCCCTTCCATAGAGAC
TGGATCTCTATATCCTTAAAACAGATATAAACCTTGTAAATTCCACAACAATGAAGATAA
ATTGGTACTTTATTAATCCCAGAGATTAAATATGGTTTTCACAGCAGAAAGTATACAGGA
AAGTAGTTGATACACACTATTTATAACCCACGTTAATTACCAAATAGGCCTGCAAAATAT
AATTACAGAAGATATATTCATATAAACACAATGAGAGTATTAGCAATGTAAATATAAAAA
GTGTATGTCAACAGTTGGAGGTGGATGGTATAAGTGCCCAGTATATGATACATTGAATCC
ATCGATTAATAACAAAATAGACTTGTCAGGTAACATACCTTGTTAAACAGATCTTATTTG
AAGTCATACATCAACACTGTTCTGTAACAGGGTCACATTAGTGTCACTTTATGCATCTGC
CTATATGCATTCATAAGCCATTATGGCACCAGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCATTCAC
GACCAATTAAGCTTACAGTAATGCCTTTATTATGCAATTATGTCATTATGGGTGCCCCAC
ATTAGGACAGCCAACAGCTTGAGCTAACTTGTTATGTAGTCATTACGATTAGGCGGATAG
GATAGATACCAATGATATAGCTAATGAGACAATAACACAACGTACCTCGCCAGAGTCTGT
CTTTTTCAACAGGTTTTTTCCAATTTGAGTTAGATCAATCTTTGCCAT
Chart Advanced