SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001015_2.0
Identity
TranscriptThioredoxin reductase (TR)
SpeciesGadus morhua (Cod)
Transcript IDSPT00001015
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000919_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00001015_2.0 # Transcript # Thioredoxin reductase (TR) # Cod (Gadus morhua) # Full length # Forward
ACCAATCAGGTGACAGACACCGATGGAAGGAAGTCCCGCCTCTCTGTGGGGACGCTGGTC
ATCGACCCCGGGGAGCGACCTCGCTACCCTGGGGTACCGGGAGACAGGGAGCACTGTGTC
ACCAGGTGGGGACCCAGGTTGTCCACCAGGACTCACCTGTCTCCTAGCAACAGACCCTTC
CACCTGGCGGCCATGTTGGTCCGCTGGGTGGGAACCTTCTAGAATATTTAAATTTAGAAT
GCATGTCCATTCAATTGTCATGGTTCCCCTCATGATTCTAGAAGGTTTCCCTACCCGACC
AACCAATATGGCCGTCAGGTGAACTACATGTTAATGAAACAACCTTTGTCTTTCCTTATA
GGCCCTATTGCAAAGAACATGATTTACAACAGTGTCACTTTGTCACCCCTGCTATCACAA
AGAGGTCAAAGGTCGAGTTAGCTTAAGTTCACCCCCTCTATAATGTGTTTGAGCAACTTA
TGTTGCTAAAGAGTACTTTGGGAGAGAGTTAAGGCTCGATATTGTCATTACAAAATCTAA
ATCGGCATGTACACATAGGTTGTTAAACGGTGGTCTGACACAGTGACGTCGTCACGGTAC
CACCGACTTACTGGCTTTGTTGACCAATAACAGGCATCGTTGGACTGGTGGGCGTGGTCA
CAGTCACACTATCTGGGTGGAGTACCCCACATGTGCCGCGGCAATGTCAACCCAGTGCAG
TGCTCTGATTGGTCAGAAACCTTGCGTTTTGTCCATGCGAACAGGACACTTTCGCCGCTG
TTGTGCAGTGGATCCGGGTGTGGCTCGTCTCTCTCTGAGGACGTCTCTGGTGTCTATGCG
AGGCCGACAGCGCCTGTGGTGTATTCTCTCCCCCCCCGCGCGGGAGCTGCGTGGGAACTT
TGAAACAAAGCGGGACACACTCAATTACTCTTTAATGAAACTGTCACCGTCCATACTGGT
GGCTGTCGACACAGCGGGGATGAATGTGCCCCGGGGTAGTGTTATGCAAACACATCTCTT
CCTCCCGTGGGACCGCTGGCTAATGTGAGGAGGAGGCCGCGTGAGGTCAGCGTCTGGGGC
TCCGAGGACGGACCGGCCTGGGTGATGGGACAGTCACGGACTAGTGTCTCACTCTGTCGC
CATGGTTAGCTGTCTCTCTGACGCTCTCTTCCTGTCTCTCTGTCTTGCTGTCTCTTCTGC
TGTCTCCATCTTCATCTGTCTCTCTGTCCCTCCGTCTCACTCTCTTCTCTCTCTCTCTTT
TTCTCGCTCTCTATCTGTATCTCTCTCGCTCTCTCTCTCTGTCTCTCGCCTCTCTCTCTC
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CTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTGTCTCTCTCTCCAGTAACGAGCTGTTCTCCAGGCCT
TGCCCGCCCGGCCGCACCCTGGTGGTGGGCGGGTCTCCGGAGGGGGTGGAGTGTGCTGGC
TTCCTGGCCGGCCTGGGTCACGAGGTCACTCTCATGCTGCCGACCTCTGACCTCCTGCCA
GGCTTCGACCTCAAGATGTCCCAGAAGATCGAGAACCACATGCTGGTGCACGGAGTCCAC
TTCCTGTACGAGCACACACTCAGCAAGGTAAGCAAACACATTCACACACACACACACACA
CACACACACACACACACAAACACACACACAAACGTAAACACACACTCAGCAAGTGTGTGT
TTCTGTTTTTTGTCTCTTAGGTGGAGCAGATAGGTGCTCAGGATGGGGGCGTTTCTGCAG
GTACATCAGCTTGTATAACTTCAACCCTCAGCACAGAAATATAAGACAACCATAAGACCC
CGATAGCCGTGCTACATCATGATAACCATGCTACGACATGCTAACCATGCTACAACATGC
TAACACGCAGCAAACATGTGATACATCCGTTCATGTCTCCAAACCTACCTATTCCTGCCA
ACATAAAAACACAGAGGATAGACAGACAGACGCTCACACACTGTGGCAACCCGGCACGGT
CAGCGAACCACCTCCTCCCAAACAGGACACCATTTCACGGGGAAAAGCCAAAAAGGCATG
TTTAATCCAAAACATAACACAAAGTCTCTCCCAACACAAAAGAACGTAAGACCTGGGAGG
AATCAACGGTCCCATCCGTCGTGGGTGGAATCCCGTCACCCACGACGGCCGGTCTCTCCG
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GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCCAGGTTCTGACCAGTCTCACG
GTGACCCAGCGCGAGTCTGAAGCCATGATGGTCCGGGGAAACTGCTGAGGTTAAGCCCGC
CCCTGCTGTCAATCACCGTTGTTCCCGGCGACCGGTGAGGGCTGCAGGGAGCTGATTGGC
CCGTGGCGTGACCAGCGGCAGACTGGCAGCCAGCCAGCCAATGAAGTCCTTGCGTTAAAC
CTTATCGAAAGGTGGGCGGGGCCTGATAACCTGCCGCTGA
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