SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001110_2.0
Identity
TranscriptThioredoxin reductase 3 (TR3)
SpeciesGasterosteus aculeatus (Stickleback)
Transcript IDSPT00001110
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001014_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00001110_2.0 # Transcript # Thioredoxin reductase 3 (TR3) # Stickleback (Gasterosteus aculeatus) # Full length # Reverse
CTCCTGCTGAGGGACATCGATCCTCGCCCCCCTCAGTGATGAGGTTACGGGCCAGGACGT
CACAAACAGCCCAAACACACACAGATGTGCGTTTGGTGCTCCTCAACAAGAACACAGTGG
TGGAGCCCAAAAAGGGGAAAATAAATAAATAACAAAATAATAATATCAGCAGAGTAACCC
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TGTGGACTTGGATGTAACCTTCAGCCTGCCGGGAGTTCCTGCTTCCAGCTCTTCTACCTG
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CCCCGATCACCAGGGTCTTTCCCGGGCAGTGGGGCAGCGAGAAGAGGTCGTCGCTGATCG
GGGTGAACCGCAGACACACACACACACACACGCTCTACGTCAAAGGCTAGAGGATAAGAT
CGCCGACGGCAAACACCACCATGCAAGCTGGAAAAAAAACACAGGCCGGATTACAGCCTG
CCGCTGCGCTCCCACCTGGTGATGCAGTACTCCTTGTCTCCAGGGATGCCGAGGTAGCGC
GGCCGCTCGCCCGTAGCCAGGATGAACTTAGCGGCTGTGTGAAACGTCTCCTTCCCTCGT
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TGCCCACTTTGTGGGTTACATTTTTAGCAAAGCTTGTTAAAAACAAACTAAATAGAGGGC
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CATTTACCTTGATTTTGTGCGGTTCAATGAACTCTGCGTAGGCGTTGACATAGTTGACGT
TCTTGTCCCTCAGCGCCACCCTGTAGCCCCAATTTAGGGAGCCGATGTAGTTGTTCACTG
CAGTCTTCATTGTGTCCCAGTTGTGCGTCACTGAAGGCGGACAAGACGGCCGTTAGCAGA
GTCGATGCAGCGCTGGCGAGACACCATTGACCGGGCATGCCTCTTGATTTACCGCGGCAA
ACCGGCGCGGTGTCCCCCCTCCGTGACCTCCGGGGGCGGCGCTCTGAGCCCTCACCTGTC
TCGCTGAACTCCCAGCCGAACTTGCGGGAGTCCTGCAGGGTGGTGCCCAGCACGGCCGTC
TGGTGCATCAGCTTCTTGGGAATGCAGCCCACGTTAACGCAGGTTCCGCCAAGACCTGAT
GGGCAGTTCACGCATTAACAACGGACTCAAACGCGTCTGAGGCATCACAAGCGTCTCGCA
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GTTGCGATAAGCTACCAAACTAGTTTCAAATACATGGTGATACAGATGTATAAACGGGCT
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AGCTACTCTTAATATGAGCAGCAGTGTGAATATGCAAATAAAACAGGGAGGGTGGACACG
GTGCAAAGCGTTTGATCCTTTCCCGTATCTGCAACCACAGAAGGGATTTCTGCACTCACT
ATGAGGCTGCACTCAAGGGGTCACCTGCTTTTCAGAAGGTCACATGTCACTTTCTAGGCC
AGTCAGAGACGACCAACCGCACTGTTGCTGTAGTCGCCCTCCGTCTAACACGGCCACTAA
ACGAGACTGGTCGAGGTGATCGTATCGCAACACATCGACAGCTGAATCTGTAACATTATT
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AGGGTCGAGGGTCAGCGTACAGAGGTGAGGGTTGACTAGATAGCGAGGCCAAGGGCGTCT
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ATCACCGAGGATTTCACACAACGTTAGTGGAAGACAAACTCAACCACGCCGACGCAGTTG
CATATCAAATGGAGAAAAAAAACTCAAAACATTTTAAAAAAGACATCCGTGAGCAATAGT
TTAACTTCTCCTAAAAAAAGTGTACAAAATTGAAACGTGTGGCGAGCAGACATTTCAAAA
AAGCTTTTTTTTTTTAATGTATAATAATAAATAAGTAATATCTTACCGATGAGATCCAGC
TCCACTACGTTACAATCCACTTTCAACTCTTTGAACAGGTCTTTCACCTACAAACACACG
AACAAACAATTATTAACGGTTTCCTCATCACACGCCAAACCTCCCATTAGCAAGTCACAG
CTTTATGAAATGAAGTCTATAAACCACTCTGTGTTAATCGAATAGCCCGCTTGGTTAACT
CGGGTTAGCGCTGCTTTGGGCCTCCGTGCTGTTGATAGAATAGCCCGCTTGGTTAACTCG
GGTTAGCGCTGCTTTGGGCCTCCGTGCTGTTGATAGAATAGCCCGCTTGGTTAACTCGGG
TTAGCGCTGCTTTGCGGCAGTTCAAGTTACGTTAGCGGGTGAACTTCAAAATTATGTAAC
CAACTCTTTGAAGAAGTGCGACCACGAGCAGATAACTACTAACGTTAAGCTGCCGACCGG
ACGTTATCTCGAATACCGAAGCAATGTCGGTTCTGTTAAGTTAATGGTTTTATGTGGTGT
GGTTAATTTGTAATGAATAGCGCTTGAAACCGGCTTCAGGCGCAGAGTAGTCGCTGGCAG
CTCTGACTTGAAATGGGGAAACCGGCAATTAGACGGAGCCCGCGTGCGCTTCGTGGAGGA
AGATGGAAGTTTCCAACCGGCGTAAGCGAGGAGTCCTTCGCCGTCAAACGAAACGTAGCT
GCCTTACCGTGACGCAGTACGGACAGTAGCTTTTGCTGAAGACCATCACTTGGTGGGAGT
CGATAAGCTGCTGTATCCGAGACTTCAGTTCTTTCTTCCCGGGGTCATTGTCAATGGGAG
GCAT
Chart Advanced