SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001170_2.0
Identity
TranscriptIodothyronine deiodinase 2 (DI2)
SpeciesIctidomys tridecemlineatus (Squirrel)
Transcript IDSPT00001170
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001074_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00001170_2.0 # Transcript # Iodothyronine deiodinase 2 (DI2) # Squirrel (Ictidomys tridecemlineatus) # Full length # Reverse
ACTAATGTGACCACATCCAACCACTAACTGAGTCAAGGACTCTTTCGTCAGTAGTTATCA
TTCGCACACTGGTCAACTCTGCACATCTCTGTCTCCCTCTTCGGGTGCCCGATCGATTGG
GCGAGGGAGTCCAGTGATAATGTGATGCAAAACTAAACAGAACTGGCCAACATTCCCTAC
CCAATATCTTGTAATTGCTTTGGTTATAAAGTACTGGATACTCATGTCTCCACATCCCCC
AATCCTAACACATAAAAACCACACTGACCAGCAACATGGGCTGGACAAGTCTTGAGAGAA
TTTTATTTATTTCCCATCCCTCTCTGTGGGCTTCTTTCATTTATATGTTTACCTGTTTGC
TTTTTTTCCCCCCCCGCCCCCGAGGTGGAGGGGGGAGGGCAGTTCGAGCCAAAATAGTGA
CTTCATTAAACATCTGCTGGGTCTCCGAAGTCTCCAGTAAATATTAAATAAACTCCCTGG
AGCTCTGGTGCTGCTGCCCAAGACGGGCAGGCGGCCCTGACTGGCATGAGAAGTCTTGTT
TGGATACCTGTGCGCTCGCTCTCTGCGGTTCAGACTCCGCTTGGAACAGAGCTGGGTCTG
TCCAGCCTGAGACCTTGTTTCTGGTGCAATCTGGAACACAGGGCTTTAGGAAGTAGCCCA
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TTTCTTTTCAAATCTTTCCTCCTCAGCAGACCAAACCCTCAGAGGCTGGTTCTTATCCAG
TGCACAACTTTCCTCCCTTACCCAGCTCAGTTCCTTCTTTTCAAGGAGGGCTTCAGGACA
GGACTAAGATAGCACCATTAGCAAACAGCAGTTGATGTTTTGCAAGTTCACATGAACAAT
GGGTTTGGCTCCTAGGTTGAAGGCAAAGGAGGAAGTTGGGATATAATTAAATATACTTGT
AAGTTCTGATTTTTGACAGCATCATTTCTTGAAAAGCTCCTAGAATTAAAAGACTTATTG
TTTGATCTCCACTTCTCAGAGACATGACATTGCACATGTTGTGAAAACCTCTGAATGTTA
GGTTTCCATTAATCCTCAGATGGAGCAGACGTAGTGTCTACATGTTCCTCTTTGCAATAG
CCAGGGGATTCTAATTAAACGTATTTTCCAAACCTTCAGTCAGAAGTCAGATGGAACAAA
TGTCCAGGTTCATTCTCTTATGATATTCAGAATTGGAAGTCCTAAAAATCAGCAAATTCC
TCTTGCTGTGGGAATAGGCTTTAGGGCATGCCAAGGGCACCTTGTATCCACCTGAGAATT
TTCCCAAAGCCATTAATGTTGTCTTTAACCTGCCACTCTGGTATTTTAGGCAGCAAGGCA
GCCCCTACACATAACCTCGCTATGTTTCATAGTTGTTATTCAAAAGCCCTAGCAGTGAAA
TATACTCAGTCAAAATGAAAGACAATAGGTTTTTCTTCCCTCCCTGATCATAGAATAAAC
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GGACACATTCTATGAATGAGACATAGGATTAAAGACACGGGATTAAAGATCCAAAATGTG
AAGACAGAAGTCACTTAGGTTAAATGGCTGCCACTACACAAAGCAAGAACGTGACTAGTT
TGCCTCTAAGAAGGTCAGTCACACTTTCATAGCTGTAGAAAATACTTTTAGATTATTGTG
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AAGCAACAAAGTCAGTTTTGGATAGTCCAAACAGTAAATGTTTGAGTAAATCCAGATGTT
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TCTTCTTAATTTTACAAAAGATACATCATAGGATATCACAAAAGTTTATGTTGAGATAAA
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TAGGATTCCTGAGCTTTGTCAATCCACTTTCTCCATTGGCCCTTCAACTGCCTTTCTTCC
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GTATGTTTACTTCCTCTGCTTCATTTCTCCTTCAGAGTTCCCTCTGGGAGAAGAATTGTC
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GGTGATTTTTCCAACATCCTTTTCCCCAGATGACTAGCACTGTGTTAGCCAAATCTCATC
CCCCCACCAGCTTCTCTGACATCCTGTTCCATTATCCGCACACTTAGAACAAAGGGGAAG
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ACATAAATCTCAACACCATTTTGAAGACAAAAATCAATGGGGGCTACCGATAAGGTTGAC
TGTAGAATTTAACAATGGCGGAATCTGAAACCATCGAGCCTCAGTATGATTTTACAGCAA
TTTATGAGATAACATCACATTTTCAAATTTTGCTTTGTTTGCTTGTGGGTCTTTGTTGGT
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CTTTAATATCTAAACAATATACCAGCTTGATTTGATAGGACTGATTTCTTGCTCCAGTTT
TTCTTTAAATACTTTAGGTTCCTGCACACCCAGTTTCCCACTTTTTTTCTCATTTCAGGC
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GATACAGCTATTAAAGAAATGGACATAAGAACGTTAGTGTCTTTAAACTATATACTGTGG
TTTGATAATATACTCAAATTTTTTAAAATAAAAAAAATATGGTACAAAATTGTTGTCTAT
TTTTTGGGGAAGTTACAATCTTTAGATATTACTTATGTATAAAACTATACTGTTTTTAAT
CTTAAAGGGAAACAAGATATATATATATATATATAATTACAAGTATGTGCTCTTGGGAAA
TTAGATTACTGAACCTCAGCTATGGACTAAAGGACAAACTGAAATTCAAATGTCAATAGA
AAACCCATTTTATCCAATTCCCTGATACCAAGGGTAGCTGTATGAGTGATTCCAAAATTA
CTGATAGGAATTAAACTTTCTCCAATTTTGCAACTGAAGAAAGAATGATCGTTTGCACCT
TTAATTCACTGAAGTTCACCTACTTTGGGAGGAAAACACAACACGGCTGTAGCTGAATGG
CCAGGGTACTGCCCCCAATGCCTTCAGCTCGGCCATCCTCTGTAGACTGAGACTAGCAAT
GAGTAGGGCCACGTTATAAGTGCAGGAACTGGGAATAACAGCCCAGTACCATCAGACCCA
CTGGGGTTTCCCTGGACAGGTATCATGAAGTATAATTCACCCACTGAAACATATACACCA
TATGCATGTTTCATAAAGTAATTATTATACAAAAAAAGTCCTCAATAGCACACTTATTTA
AGCATGTGGGGTTTTTTTTCCTTTCAATCCCCTTTTCACCCTCAACATAGAAATATATGA
TAAATATCTTGTTTTCACATGTTTTCTCTATGCTATTTTTAGATAAATTTTTTCCTTTTC
TGTCTTTATATAAAGTTTCTATGTTTTGGGGGCTAACAAGTTAGTCTCCCTTTGTAAGTT
TCAAGGTGAAACTCTGTGAAGTCTTCTAATCTTTCTGCCTCCTCTCTTTCCTAGCTGGTA
CTTTGATATTCTTCCAGTTGTCTCCATCTGCCTAGAAAGTAACCCTCAAATTTCATATGG
TCATTCTAAACGTGCAGATTGAGGAATCACCCCCGGTATCTACAAATACACCTGGCAGGA
AACGCTTTGGCTAGCACCTACTCTAACACATGAAACACCAAGGCCTTGACCACGTGGCCC
GAGTTCAAGGATGCATTATAAGTCAGTATTTGGGAACTTTCCAGTTGAGCTCTACCCATG
CTCTCTAAAGCCTAGGTGACAGACTTTACCTTTACATGGATAATAGCTTCCCTAACACAG
TAATTATTCAGGTAACCCTTGGGTTCTACTTGCATAAGCAATACCACTTCTTTCTCAAGG
AAGAATGAACACCCACTGAAATCAGAATTTCTTCCTTCCCCACTTGGATTTTTTCACTCA
GGGGTTCTCCCCAAGAAGAGAGGTAACAGGGCTACTATTTAGCCCAATGACATTTGAGTA
GTTAAAGAAGTACTGGGATGTTAGAGGTTTATGCTCTTCTGACAGGTAAACGCCTGTCCT
GTCTTTCGGTGAGGCAATGTGCCTCAGTTGAAATCGTGGATTCAGTTCTTGGTTTCCTCT
CCTTTATATAATATCTTTTTTAAAAAATAATAAGCTCCATTACAATCATACCTTTAACCA
GCTAATCTAGAATTCATCTCTTGCTGAAATTCTTCTCCAGCCAATGCCGGACTTCTTGAA
GGTTGTAGCAGAAGGGGCCCTTTCCTCCTAGATAAGCAATCTTCTGTCTCTGCACAATGC
ACACACGTTCAAAGGCTACCCCGTAAGCTACATTGGCATTGTTGTCCATGCGGTCAGCCA
CAACCCGGCACTGGGGCGGCAAGGAGAAACGCTCCAGAAGCTGCTGAGCCGCTGCACATC
GCTCTTCCTGATTCCGGTGCTTCTTCACCTCAAAAGACAAAGAGGAGTCCCCAGGCACCG
CCCAACCATCTGAAGGATGAGCCTCATCAATGTAGACCAGCAGGAAGTCCGCCACTGATG
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CTGAGCCAAAGTTGACCACCAGTGGGCGCTCGGGACTGGCAAAGTCAAGAAGGTGGCATT
CTGCTCCATCCGAGGTCTTCTCCTGGGCGCCACTTCCACCATGGTTACCGCCTTCAGGAC
TGGACACATGCACCACACTGGAATTGGGGGCGTCTTCACCCAACTTCACCTAGTAGTGAG
GGCATAAGAGAAAGAAAGAATTCCATATTAAACACATTGCTGCTTCAATTCACTCTAATA
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AGAATAAGGATCTTTCTCATCTGCACAGTAATTCTTTTCATCTTGGAAGACACTGCAGTT
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TTCAAGACACATTATCAGGGTCTTGGGATATACTGCCTCTTTTTGAATTATAAAATACTC
AAGCATCACCTAAGTTTTCACCTATGGTACTAAGCTTTTTAATCTCAACCAATATACGAT
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AAGGACTACTGACTCAAACTCTGCCGCAATTTCCCATCTATAGAACTGAGATAATAACGC
CTGTCTTCCTCATACAGGTATTAGAGGATAATATAAGGAAAAGAGCACTTGAAAGCTCTG
CGTGAGTGAATATTGCATTATCAGCTACCCTACTGCATTATCAGTGTACCCTCTGAAAGA
GAATAACACTTTTCTTGGGAAGTCTTGTGTTTAAAATGAATAAATAAATAAATAATCCTG
AGAAGAGATTGGGGCTCTTCCCCAGCATGATACCTCCCTAGAGTTTTTCACTGTTACTGC
TTCGGTATGGTTCTTATGACTAGAACCTTCTAATTTTCACTAAAAACAAAAACATAATCC
TACTGTTGGTTAATTTCTCATTTTACATGTGTTTTTTGTTTATTTATTTGTTTCCCCCCA
CTTCACCTAGGAAGTCACGAACCATACATTTTTCTATAATATAATTTATCAACAAGCTCC
TCTGAATGATAGAATTTCCAGGTGAAAGAAGTGTCGTCAGATATCGTGCCATGTTAAAGC
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TTATGGCAGTAAAATTGATTCTTACACACTATCTTTAATATTACAAAACACTTCCAACTG
GATCGACTTATTTCCCCTCATATAAATACAGCCACACATAACGCTGCTGCTGACTGAAGT
CACTTAGAAGTGAATTGTTTAAGATGTAACAATCCAAACTGATTAAAAAACACCCAGGCT
TTTATTCAGCGGCTTCTATCCAATGTTAATGCATAACTCATTTTAACACTAGAGAAAGAA
AAGAAGTTCTTTCTCTCCCTTCTCAAAAATCCTATCAGGGCAGGTTTGAAACAGGTACTA
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TTTTCTTGGCTAATCCGCAAATGACTCTAGATGGGGGAATCTGAGAAGCCACCTTTAACT
GGATTATTTCAGGTGAACTATGCTAGTCTTTGGTGTACTAAAATATACTTCACACTTAAA
GATACATATTTTAAAGATTTTAAACCCTTTTTAATCTGTGGGTTCTATGGGTTATTTATT
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GTGCTCCTCAACATACTGTGATAAGACAACCTAAATGCATTCATATCACTATAGAGATGT
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GTTTGGGGGAGAGTGAAAACATCCCCCTGCATTTTGGAGTCACTGGTGAGACCTACAAAC
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CTCTCTTAAAGGAGCCATTTTCCATTGTAGGAACTTGTGTCAAAAGGCTGGAGGTGAATG
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ACGCCCAAAGACAGTAGCACAGATGGCAACAGCATTCCGTGAAGTAACTCAACCTGTTTG
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GTAGGTAGAGACAAAGAATGACAGAAGAGGAAGATGCCAACCACATGCCAAAGGAATAAG
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GAACACTGTACATTAGTTAAAATATAAATAATCAAATTTATTATGGAAGCATTTGTTTAC
TTTCCCATTTCTATCTCACTAAGCTGCTTAGTAGGGGGGAAACTTGGTAAGGGTGATTAA
CATTATAGCTCCTAGAGTTGATATAATGAAGAGATGACATTTATATTAGACATATATGCA
CATAAGTGAAATTCTCTCAAGAAGTTATTTTTTTTCTTTTATAAGCAAAAGTTGATTGTA
TTTCCAAAAAGCAAGACTTTAATATAAGGAGATCAAGACTCTGACATTTCCATGTTATCA
GCTAAGACATGCAAAATACAGAGGCAGATGAGGGAACTTCCTAATTAATAATATTTCATA
TGCCTGTGTACTCATCCTCCTCCAAATTCCCTGCCTTTATTTAGAGCAGAAGATAAAAGT
TTCACATTCAATATGTACATTTGTATCTGATCATTTCAGCACCTACTTGCCCACATTTTT
CATCTGCCTCCACATACATAATATAAATGAAATTTTACTATTAGGACTTTGAGCATCCAT
TCCTATTTGCATCAAGGAATTGACATTTACTAATAAGAGTTCTTACTATTCACCTGTCTT
TAGGGCAATAAATGCAAACCCTCTGCAGGTGACCTCAATAACAAAAGACATGTGTTACAG
TGAAAATTCCCTAATTCACAACAGATATTCTTCTCTTGTACATTTGAGTTTTCAGTGGAA
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TAGTGATTATTTACAGAAGATTCATTCCCTTTCCCCTCTATTATTGCTGTCTCTGTTTCT
GAGGTTCTGTCTGCTTTACATGTGCCACTGCGTTGAACACCTGGCTTCAATATTCCTCGC
AGACTCCTGATCCTGATGTCTTCTACAACATCCCCCAATACTGTTGGGGAAAACTAGGAG
AGTCTCCTCTGGTAACAATGTTTTGCCAAATGAATTATCTCTTCCTAAACCCAGAGGGTC
TTCAGGAGCCATCCTTGCTGAGCGTAAGTAGGGGATGGGAGCAAACTGACAAAGGCCAGG
TGACCAAGCATTCCTCTTTGCCCCTTAAGATCTCAGTTGAAAATGTTCCACCAATATCTC
CAAGCAGATACGCACACCAGAATTCAGCTCTGGTTTTTCAAAAGTAGCTGGAGACAACAC
TCTCAGAGATAAGGCAGGCTACTAAAGCTCTAAAGCTCAAGGCAGAAGAAGGTATACTCA
AGCAGATCCATCAGCTCTGACCACACTATGTTTTTACTTGGAGAAACAAAGTAAATTTGG
TTTCCCTTACAAAGTCTGGATTCCTGACAGGCACTTTGCAGATCTCTCTTTTACAAACTG
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CCTGCTTTTATAACAGCCTAACAAACGCAGCATCTCCCCTCCCCCAACATTTTCTGACTT
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TGGAGCGGCTCAACAGCAACACCACGTGCTTGAGCAGAATGACCGAGTCATAGAGCGCCA
GGAAGAGGCAGTTGGAGAAAAAAACTGGCAGAATTTGCAGTGTGATCAGCAAGTCTACGC
TGAGGATACCCAT
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