SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001183_2.0
Identity
TranscriptSECIS binding protein 2 (SBP2)
SpeciesIctidomys tridecemlineatus (Squirrel)
Transcript IDSPT00001183
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001087_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00001183_2.0 # Transcript # SECIS binding protein 2 (SBP2) # Squirrel (Ictidomys tridecemlineatus) # Full length # Reverse
TTGTTCTTTGTTCATAGAGCTGCAGTTACTGGACTTCTGTTGCTCAGGATTGGCTTGTTG
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CTCTTCTCCACCTAGTTCTACATTGTCTTCCTCAGAACCATTAAGGGTTTTTCCAAGCTG
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CAGGTCATCTGGCTTCACTTCCTCTTTATCCCCTGCTGTAGATTTCCCAGGATCTGTAGC
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TGGAAGTTTAATAGGTTTTTCAGAAGTGCTGTGCTTACAGGAAACCTCTTTTTCATTTTC
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GAGATAGGTTCAGAAATAACACTGCAGAAAGAAATGGCACTTGCTGCAGAGGGGTTCCGA
GAATGCCCCATGTGGTGTGGTACCTTTTTCACATTTTTTAAGGCTTCTTCAGCTTGCTCT
TGCTCCATTGCTGCAACCATATCTTTATATGCTTTCCTGGCTTCCTCAGTGAGTTCTACT
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TGCTTTTGAGGAACTTTCTGTGTGGCTATAAAAAGACAAAAGACAGCTATAATTCCAGGC
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CGTTTCTGTATATTGTGGCAAAACTGTTAATGTCTTAATAGCAGCTCTTTGGTTTAAGGT
TGTATATCATTTGTATTGAGATCTGTTCACATTGTTCTTCCCCTTAAAGGAGAGATATTG
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TCTTTGAAAAAGCAAATAAAATTGATAAACCCTTAGCCATGCTAATGAAGAGAAGGAGAG
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TGAAAAGTCTTAAATGTGAGAATAAGGAAAGTTTAATTCAAAGGTTTTATCAGATAATAA
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TGTAGGCAAAGGAAAAGAAACTGAATGGAGGGGGAATGGGAGGTATACAAACACAGTGAA
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TGCCTACCACTGCTACTGGGACAGATCTGTCTACTCCAATCCACCTAAAGCAGCTTTTCT
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ATTTAGCTTCATATGTTTGGTGACTTCCCTTAGACCCATAACCAGCCGTCTTCGTGCTTT
TGCTCTTACAGGATCCTTTTGGTAGATGCGTTCCTGAAAACTGACAAGTTCTTGGAGAAG
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GAGTTTGAATAAGTCTCTGGGCATTTCTCAAACACAAAAATGAGTCAGATGAGATGACCT
TCATGGCCCAGTTAGCTCCGAAAACCAACAGCTATTGAGGATAAACTCAATAGTTGAACT
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TGATGTCACTATAGTACTTAATTTCTAGGATAAGAAAATCATCTAGACATATTTTTTATA
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TCAAAGTTATATAGTAGGAAAATCCAGGGCTGTAGTGTAAAAAGGAAAAAGAAAGAAAGA
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AAGGAATGCATTTAAAGAATAGAATATTGAAAATAAATTTTCTTCATTCTTTTTTCTTTC
AAGCTGTTATTTCATACATATGTAACATTTCCTAAATGGTTCTTTTGCTCCACATCTGTT
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ACATGTATCTCAATGGTAGAGCGCTTACCCACTATGCACAAGACCCAAGGTTCAATTTCT
AGCACTTTGAAAAAAGAAAAAATTAGCTTTATGTAATAGATTAATTTCACAAAATAGGGT
TTTCAGAACTTTATTACATGTTATTGATTGATGAGAGAAATTTTTGAAGGATTAATTACA
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TATGCAAAAGCACTTGGAGGGGAAAAACTCATAGCACAAAATTATATATGTAAGATGTAA
GAGGCTAATAGTCCAGGGTAGAAACACTAGATGATATCAACAGAATATATTTAGTGTCAC
ATCACTCTCTATGGACACTGACAAAAGGGAATGCTTCAAATAGAGCAAAACCAGCTGTTA
AACAAAATTTGAAAAAAATATTTTTGGTGTTTGGCATGTTCAACTCATGAAGTAACAATG
ACAATACTAGATTTGGAACCACAATAAAGATCCTAAACTATTAAACCTCAATAAAGAGAC
AAAAACTTACTCTCTAAATCTTTTGCTATGGATTTTGGTTATTGTTGATGATGCCATTGG
ACTGCCTATCCCAGAACTGGCAGGAGAGCCTTGTGACACAGGTGTCATGCAGTATGGAGA
ATTCTGACTTGCTGGAGAGAGTGAAGTATCACTCGGTACGCTCAGTCCAGTATCTGTGGA
GATGTGAAATGAGGGGAAAGAATTTAGAAACCTCAAATGCTGAAAAGCTCTACACTGATC
TATATAATCTAGAACGGCAGTTGTCTTTTGGGCTACTTCCTAATTCTCTGCAAGCTAATG
AGTTAGGCATTGTTCCTTTCACACTCACAAAAAAAATTCTCTACAAAACTACAAAAATTA
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ACAAACGAGATGAGAAAAGGCCAAATTATCAGAAACACGTATTCTCAGGGGATTTAAATT
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TAAGGAGCCGCATTTTTAAGATGCCATCCCTTGACTCTACCATTTCCTTTGTTCAATTAC
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