SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001188_2.0
Identity
Transcript15 kDa selenoprotein (Sel15)
SpeciesIctidomys tridecemlineatus (Squirrel)
Transcript IDSPT00001188
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001092_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00001188_2.0 # Transcript # 15 kDa selenoprotein (Sel15) # Squirrel (Ictidomys tridecemlineatus) # Full length # Forward
ATGGCGGCTGGGCGAGGTGGATGGCTTGGGCCAGCTTTTGGGCTGCGGTTCCTGTTGGCT
ACTGTGCTTCAAGTGGTGAGTGTAGGTCACCTCCGCGACCGCCTTAGGGCGAGTAGGAGG
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TGGAAGTTTTATAATGTAAATGTAGAATTGTGATTTATTCCTCATTTGTATTTTCAGGTG
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TCCCAACTACAACGAAATCTGAGGCAAGAGGATCATAAGTTCAAGTCCATCCTGGGCAAC
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GAGCATTCCAGAGTTCAATCCTCAGTACTGCAAAAAAGACATGCCAACGAGTTTTTAAAA
TGTAAGTATTCAGTCCATCCAAGAGTTAACAAGTGACTTCTCAGTTTCTCAGTATCATAA
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ATTTAGATTTCCATATGTGTAAATTACTCTTTATTGCATATAAATAAAATATAAATAACA
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ATATGGACAGATTATTTCTTGTGCCCGTATATAGACCCAGTAAACAGAGTTAGGATAGTA
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GGCGCTATTATATGCAGTCCCAACTAAAGAAGACACACTGCCAACAGTTTATGTAAGGGG
GCACATATTGACAAGTTAACTTTTATGACCTTGAGTATATAGGCTGAATCAGTGGGGTTT
GGGCCTTGACTAACCCTAACAGCCAGTTCCTAGCCCTGACTACACATAATAGCCTGCTGG
AAGCTTCAGCAAAGGGAGCCTAAAACTATAGCCATTTGGGGCCTGACCCAACATTACTGA
AAGAAACTTTTTGAGTTATCATCTCTTCCTTGTTCTATGGACCATACTACTCAGTGATTA
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AATTACACTTGATTTAATATGTGTAGTACTTCTCTCAATTATTGACACTTGATCATAGGT
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AGCTTTAATCCAGTCAGTGAATTAATACCTTGATGATATTAACTGAGTGATAACTGAAGG
CCCATTAGGTTGTGACTGGAGGAGGTAGATCATTAGGGGCATGCCTTTGGAGTATATATT
AGGTATATGGCAAGTGGAGTCTCTTTCTGCTTTCTGATCATCATTCGAGGTGCTTCCTTC
CACTCTGCCCTGATGTTTAGCCTTACCTTTAGCCCTGAGGAATGGAGTTGGTTCTCTATG
GACAGACCTAAAACCGTGAGCTCCCAAATAAACTTTTCCTTTTCTAAAATTGTTCTTTTC
AGGTCTTTTAATCACAAAAGTGAAAAAGCTGACAAAGCAGTATTTACTAAGTCTCATGAC
TTAAGATTTCTATGAAGAATCTGAAGATGGAAGGGAAGGCATCAAAAAGATACCCAATCC
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TGCCTGGTTTAGAGAAAGAAGTGAATGTTTTGACACATGAATTCCACAGTTGAACAACAA
CACTAGAGGAGGAGACAGCTAGAAATCAGAAACAGACTGTATCTTGCAGTCTCTCTCTTA
GCTTTTGCTTTTACACATTCTTTACTTGACTATTGCCTGGCTTTTTCCCTGAGGTAAGAA
AAGAAGCTGCATCATACTTCTTCCTCTGGAAAAGGACTAATTCTTCCTTGTTTACATTTT
TAAAATATTTTCTGCAAGGACCAGTTATTGCCTGAGTTATTTGTTAGATTATGGAATAAT
GAAAGAAGCTATTAACTTCTCCAATAGTTGAATGAATGGATTGGTGCACTAGGAAACAAT
AGATGAAGCAGTTCTCAGTTATCAAAGTATTACAGGAGTAGATACTATGTAAACAATCCC
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CTCTTTGAAGTCTAAGACTGTTTTATGATGTGTTTCTGAATTCCCAGCCTTTAGCACACA
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TGATTTTTAAACTTATATTAAAATATGCTAGAATTTTGTAATTGCTTCATAAATACCTTT
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TGTCTCCATATTGGCAGTTATCCATTGGAAACATGCTTTGGTTATACAAATAGAGCCTTC
ATTTCTACATTTTATTTAAAAGGCTATCATAAACACCCTCGATCTACCTAAAAAGTCATA
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TCTTGAAGATTTTGGCTTCTTTCAGACATTGTTATGTAGAAATTTTGCATTTCTCCTTAT
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TCTTGTACAAATTCTCTGCTACTCTCTTAAGTGGTATTCTTGTACAAATTAATTGATCAC
TGTGTTTGTTTCCTTAAACATTTTTTTCAAGGCTATTGCTAAAGAAGAGCTTTATTTTCC
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TTAATTTTTCCACTGCTAGTCCTCTGCTATTTATTTATATTGTTAATCTACTATCTGATA
ACAGATTTCAAAGGTTCAAGGTAATTTTGGTGGAGAAAAATTTGGAAAGTGACTTTTTTT
CTTCTTCATAACGCAAATCCTACAGATGGAGAAGAGATTTCTTTTGTTTGAGTCTTGGAA
TATCATGATCTCATTAACAGTACCAATCAAAGTCTAAGCTATTATCATACCACTACTTGC
TAACTTACCAACTTAATATAGTAGCATTATCATTTTCAGTGTGTACTATACTATGCCTTG
ATACTTAAATGTACTCTGAGCCAGAGACAATACAAAGGTAATATTAACGTGTGTATAGTT
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CTGCTCCATTGCTTATTGACTTGGTGACTTTGAGCTAGCAAATACTCCAGAATCCTCAGT
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CTTTGTTGGTATGTGGTGCTGAGGATCGAACCCGGGCCGCACGCATGCCATGCGAGCGCG
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CTTTTTTTTTTTTGTATTGGCAATTGGACCCAGGAGTGCTTAACCACTGAGCCACATCTC
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TTTTACGTTTCTGTTTCCAGATGCATTGTTTCTTTAAAAGAATTCAATGAGATATGTGCT
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TTTCTTAAAGATGATAATTGCAGGGCTAGGGTTGTGGCTCAGTAGTAGAGCGCTCACCTT
GCATGTGTGAAGCCCTGGGTTCGATCCTCAGCACCACATAAAAATAAATAAATAAAGGTA
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GTTTTTGAAGCTAGTAAAAATGCTGGGCCATATTTTCACTGGATCTCAATTTCTCAAATT
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CTATATAGAAAATAGTTCAGCATTTTCTAAAGTATTTTAATCTATTACCTATGATATTCA
AGGTTGGAGTTATTTTTACCAATTCTTTGAAGATTTGAACCTCAAGAAATGTAGCAATTG
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GAGGGCGTAGATTTGGTCGTGATGGTATGGGTACATCAGTATTATATTGATTTCCAAGTG
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TCTAGTAGGCAGTGAAGTTGAGAGTATTTTCATTTTCCTTTTGTTTTGTTTTTATACATT
TTCATTGAGCTTTTTAGTGGGATATTGATTTTATCTTTGTAGAACAAGTCCCCTAGTTTA
TTCTTACCTTCTTTAGAATCTAACTTAAAGTAAATGTTACTGTTACGTTTTGGATTTGCA
GTATCCCCTTGAAACACTGTGTTGGGTGATACAGTAGTGTTTAGAGGTGAAAAGACTGGA
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CCTTCCTGCCTCTCTGTTTGTGCTTCCCAGCTGCCCTGATATGAGCAGCTTTCCTCCACC
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GAAACAATGATAGAAAAATAATTAGCATTTTAATAGTGTCAGAGCTGGGCACATTGGCAT
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TGAGACCTGTCTCTAAATAAAATATCAAAAGGGCTGGGGATGTGGTTTAGTGGTAAAGCA
CCTCTGGGTTCAATCCCTGGTGCCCAAAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
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ATATGGTTTGCCCTATACATGGTAAAAAAAAAAAAAAAAATCTGCTTTGTGACTTAAACT
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TCCATGTGTAAAATTATAGCTTATTCATAGCATCAGACATTTTAAAAATATCAGAAAATA
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CAGGAAGATCACAAATTCAAGGCCAGCCCCAGCAACTTAGTGAGGCCCTAAGCAACTTGG
CCAGATGATTTCTGAAAATAAAAAAGGACGAAGCTTCCTTCTTTTGCTCCATATATAATT
TCCACTTTCCACATGTGTCATAATACAAAAAATTTGATAAATAATGGTTTAGGAAAATGC
CATTATATAACATAGTGGAATCTCCACCAAGAATTTCCAGGATATCAGAAGTCAAAAATA
AAATCTAATAGCTAAATTTTAATATGACCTGCATTTTTTAAATTGTGGTAAAATATATAA
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CCAGAGTCTCTCCATAACCCATTAAACATTAAATACCCCTTCTTTCCTTCCTTGGCTTGA
TAACCCCCATTTTACTTTCTGTATCTGAATTTGACTACTCTGGTTGCCTCCTTAAAGTAA
GTGATTATATAGTGTTTGATCTTTTGGCTGACTTACTAAAATATCTTAGAGGCTCTCATC
TTGAGCAACTTTGTTGCCCTTCAGGTTCATTCATGTTGTAACATGTATTAGAATTTGTTT
TAAAACTGAAAAACATTCCACTATGTGCCACATTTTTTTAATGTTTTAACCTTTCAATTG
GTTTGCCCTATGACTATTTTGAATAAGGCAGCTATGCATGACATACAAATATCCATTTGA
GTTTGCATGTATTTTCTTTGCTCTGAGTCACCATAGATTCCAAGTCACATCTGTGGTGAG
AGGAAACTATTCCCCAGGCATTAGTAACTCTTATCACCGCCTGACCAGTCCTGAGATAAT
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ATTATCTACATAATTTGGAAGCGCATGTTAGTACCCTGAGGACAAGGCTAAAATGCTTTA
TCTCACTTTTCCTTCTAATTATGACCATATTTATTGTACTTCTTTCCCTGCTTTTCATCA
TTCCTTTTTTGTTTGCTGTTTGGGGCCTGTGGCATGATGTGTTAGTAAATCCCAGAATAG
GACCTCCTGACCTAGGACTCCTAACACCTTTCTTTTGATTATATATCCAGAAGTAGATTT
AAAACAAAGAATGGCTGTAGTATGAAGAAAGCTGAGCATTATATTATCTTGATGTTCCAA
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CATTGTTATTTCTTAAAATAAACTTATTCCTTCCATACAGTGGAAAAATATATCATGTGG
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ACCTAGTTACAGAAATGTAAATCAAACTACTCTTAAGATTTTTATCTCACTCCAGTCAGA
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ACACTCATACATTGCTGATGGGACTGCAGATTGATGCAACCACTCTGGAAAGCAGTATGG
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GCTTAACTCAAAATAGGTAAACTATGGACCAACCTTCTGATACACAGATGCTAATTCATA
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GGGGAGGGGGTATGGGGGTAGGAAAAAATAGAATGAATCAGATATTGTTACCCTAGGTGC
ATATATGACTACACAACCAGTGTGATTCTATATCATGTACAACCAGAAGGATGAGAAGTT
ACACTCTATTTATGTATAATGTGTCAAAATGCATTCTACTGTCTTGTATAACTAATTAGA
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GAATCCATTTCTTCTGAATTCATCACAATAAAACATTTGCATTTGAGTTCTTTATTATAA
AGAGAATGTATGGGTTCTGTAATTAGAAAAACAATGTTTACTAATGTATCTATTTCAACT
GAATTTTATTAAAGGAAAGTATTTGCATGAGTCCTTTGTAATGAGATTGTATTGATGTTC
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TTAATTTAATTTTAGGTCATTCATCACATAAGATTAAAAGCAACCTGAAAGAATTCTCTA
AATTAAATATTTATTTCACATAGATGGATATATATACCTGTGTATATTTATTAGTCTAAA
AAACTTTAGGAAATCTTTAAGATTTCATAAAGACCTTCCCAGGCCATCTAAATTATTAAA
GTTTATTGTCAAATCTCCTTTGTCTTTTAAGCTTTTTGGCTAGGTATAAGAATACTCCAA
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ACAGTTGTAGCAATGTGCAGGCCTACCTGAATTGCCAACATCATTACTCTTGGAACCATT
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TTGACAACTACTAAGTGTCTACTGGGCATGTACCATATATGGCCTGGATACACTAATATG
GACCAAGGAATGATTTCATGCTCCAGGCAGGATGAAGTGAAATTTCATCACACTGCTCAG
AAAACTGCATAATTTAAAACATAAGAATTACCTGGTTGCAGTAGCACACACCTATAAACC
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ACATGGCAAAACTTTGTCTCAAAAAAATAGATAGATAGATAGATAAGAAGGACTGGGGTT
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AGTTATTTCTGAATTTTTCCATTTAATATTTCATACCACAGTTGGCCTTGGGTAACTGAA
AATATAGATAAAGGAGTGCTTCTGTTGTAGCTGGGTCTTCATTTCTTCTCCTATTAGACT
GGAACTATATGGTCTTATTGAAGTCTTACATTATTTTGGTCTATATATCTGCTGAACTAT
AATGTTCCTCTTGTAAACTTTTTCTTTTTTGTTGTTGTTTTGGTTTGTTTGTTTAGTGCT
GGAGGTGAAACTTAAGGCCTCATACATGTTGGGCAAGCATAATGTATCATTGTTATACCC
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CGCGCTCGCTCGCCTGGCATGCGTGCAGCCCAGGTTCGATCCTCAGCACCACATACAAAC
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TCAGCTCACAGTTTTGGAGATTTCAGTCTATGACTGACTGACTGGCCCTGTTGCTTTGGG
TCTGTGACAACACATTATGGCATGAGCACACAGCAGAACAAAACCATTTACCTCATGACT
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CCAGTAAATGGAAAAACTTCCACCAGACTCCATCTCTTAAAGGTTCTATCACCTCTCAGT
AGTGCCAAGCCGTGGACTCAGGATTTAATGCATGAGCCTTTGGGGATATTTAAGATACAA
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ATGCCTAATGTTTTGAGGAACCTCCATAATGATTCCCATAATGTTTGTAATAATTTACAA
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TTAAAAATATATATATATATGAAGCATAGTTGCTGAAAAAGAGTCTTAAGAGCTCCCTTA
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CCTCTAATTATTTTGAATTTACTTGCCTCTACCATTAAATATTAGCTCATTTGAGTTTAA
GAGTCCTGTATGCAAGAAACATTTGTTTCATTTAATAATAATAAAACTCCCTAGCATGAT
GGCACACACCTGAAATCTCAGTAACTCAGTAGACTGAGATAGGAGTATCACTAGTTCAAG
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TCTCATTTTCTGTGAAATTATATTTAATTCTTTTTAAAGACGTCTTTAAGATCTGTTGAT
TGTGATGTTATTTCTAAAAGCTTTTTTTAATTGCTATTTTAATTAAGCTGCTTTGATCAT
GGTTGAAGCTTAGAAGGCTCTTTTTAAGGAGAAAATAATGATAATGTTCCTCTGTTTTGT
AGTATGTTCGTGGTTCAGACCCTGTACTAAAGCTTTTGGACGACAATGGGAACATTGCTG
AAGAACTAAGCATCCTCAAATGGAACACAGACAGTGTAGAAGAATTCTTGAGTGAAAAAT
TGGAACGCATATAAATGTTGCTTTAATTTTGTCCTATTTTGTTACCTTGTCAAATGAAAT
ATTACAGCACCTAGAAAATAGTTGAGTCTCTTACAGTGAGGCATTAAACATCTAATTAGA
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TTTTTGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTAAATAAATTTCTGTCCTCCTGCATTTGTTATAC
CACTAACAAAATGCTTTGTAATAGGCTTCTGGTTAATTATGCAAATGATAGTTTGTGATA
ATTGGTCTGGTTTATGTACAACCCATTTTTAAATTAAGAGAGGTTAATAAGAGATGATTG
CTGTGCCTCATGTGCTGTGTGCTATTTTGAAAGTAATGACAGAAAACTACAAAGCAAATA
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TTTTCTTTTTAATGGAAAAGTTATAGTTTGTAATGAATGTACTGCTTAAAAACTTGGTAG
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