SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001198_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein O (SelO)
SpeciesIctidomys tridecemlineatus (Squirrel)
Transcript IDSPT00001198
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001102_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00001198_2.0 # Transcript # Selenoprotein O (SelO) # Squirrel (Ictidomys tridecemlineatus) # Full length # Reverse
ACACATATGTAAATCATACATACCTGGATTATAGGCCTCCATAAAACCAAATGGACCATA
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GCCTCAGAAATGAATGGGTTGGTGATATAAGGATACAGGAAAGGCTACTCTATTCTGATA
CTGCAATGCTGAAATTATATCTTGAAGAACCATGGGTTGTTTTTAAGGTGACCACAAAGA
TGTCCAATAACTGTTGATCTTAAAGAAGTTAGTTCAGTTTTCTGTAAGTATTCTAAAAAC
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AAAGAATTTCATTTTTAATTAAGACAACATAATTCTTACTTAGATGTCTAAACGTATTAT
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CACCCTGTCTTCAAAAAAAATTTACATATTAGAAGATTTAGGTTCAAATATAATAAATAA
GCTATTATATAAGAAAAAATGTGGTACCTGTTCGTATAAGTTCCAATAAGGTGAGCTCTT
CCATCTCCAAGCTGATCTGCCCACATCCCAAA
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