SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001236_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein K (SelK)
SpeciesLatimeria chalumnae (Coelacanth)
Transcript IDSPT00001236
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001140_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00001236_2.0 # Transcript # Selenoprotein K (SelK) # Coelacanth (Latimeria chalumnae) # Full length # Forward
ATGGTTTACGTGTCGAACGGTGAGCGGCGCTTTGTTTGATTCTTATTTTATATACTCCTG
GTTATAGTTGGTTTTCCTTCCACTTTCTATGTTTTATGGTGTTTGTCTTTCTGGGAAAGT
GAAATTGCTGATGTTTTCAGCAAAGACACGTTTAGATTAGAATGGAGATGTGATATTTGG
TTCAGATGAACAGTAACAGCTCCTAGTTTAAGGAGACGAGTCGTTTAAAGCGGGCTCTCT
TATTCCAGGGGTTAAAAGTTCATATCGAGGGGAAAGTGTTTGACCGTAATGCGGGGAATA
GTGTACAGTATATTCAGATGTGATTCATCATTGTTCTCATAAACTCAACAGTAAGAGTGG
AAAATATATGTACATACACACAGTATCTTTCCCAGTCACTACCTTAGTACATTTTCTTGT
TATTAACTACATCATGGTTGCTTAAAAAAAAAAGTATTTAAGGATGAGGAGTAGTCTAGC
CTTTGAAGAGAAAAATGTCCCTGTGGGAAATGCTCTGTATTGGTATAAAGAAAATGTCAC
CTGACTACCTTTTTTTTCTGTTCTGATTTTAAATGTGGAGATTGGGAAAGGCTGGGTTGT
GACCAGGACTAAATGGAAAATCTCTTTTAGAGGCTTACAAAACTTCCCTAGTACCTAGCA
CTGTTGTGAACCAAATAACTTACCCAAAGCTTATGTGCCACCATAACTTCTAGAAGATCT
TTGATTTCAGGATATGTCAAGTATTAGTCTTTTAAAGTATTTTTTAAACTTTACATTCAG
ATTTGTTTGTAGACATAGATTTATCTGCCTCTCCAAAACCACTTTGTAGCTCAGGCTACT
GGTTTTAAAAAATATATTTAAACAGAAACCAATCAAAGTTGCTAGAAGTCTTCCTTAGCA
TCAACATTGGAAAGAACAAAGATGGAATTGTTGTGCTATTTATTACACTCAGTGAATGTA
ACAGTAGAGTTGACCAGCTGTGCAGTTACCATCAGCTTCTCAAGTTATCAGCCTGGGCAG
CTCACTGCCATTGCATTAGTTGCATGTTGACTTGTAATCTGTGATGCCATCAAACCTAGA
ACAAAGGGACTTTAGTTTTTGTTGTGTTTTTTTAATGCATGTTTTGAATTTTTTTAAAAG
TATCTCAGCAACCATGTAAATGATCTGCTGACTGTTCCTGAAATAACTTGATGCCTGCCA
TTATTAAGAGAGAACTCTCTCTGTCTGTTCAGTTTAGTGTCTTTCTTTCATTACAGCCAA
TCTATACCTGGAAATCTTTAAAGGGATGCCATCTGCTTTCTTGATTATATTGGTGGTTCT
GTGATTTTTTTTTTCTCCCCCCAAGACACTGCAGTAGCTCTTCTGGTGTCTGTTGGCATT
CACCCAGATGCTGAATGCTGACATACTTGCAAGTGAGCTCTGATTAGCTTACTCATGGCA
GCATGAATGCCAGTGGAATTCATTGTAATACACAGTAGACTGCTGTGGATTACTTGTGTT
TTAAAAATTTTTAAATAAAGAAGCAACAGGGAACCCCCAGTGGAAGCAATGAAAAGTAGC
CAAACAGGATAGAAAACAACTTGGCTGTTTCATTACTAAAAACTCATTTCCAAATAGTAT
TTCTCTTAGTCTGTTTTGCTTAATGCATTTTTTTTAATGCAACCTAAAATTCTTAAAACA
TTTTAAACAACCATTTATCTCACCAGTTTTTATTTAATTTCCACCCTTCCTAAGGAAAAT
TGGTACATTACAGTAGCTTTTTAAATGCAAAACTGGAAAGAAGATTATCTTGAATGTTAA
TCTTGGCAAGGGCATGCAAAAGAGAGAAAAATTACCCATTTTTCATGACCAAAAACATGA
AGTTACAGATTTACAGTGTTCATTCCAGTAAATTTGACATGGATGGTATCCAACTTAGTG
CAAAGAAATAAGGATTAAAAATGGAAATTAAAGGAGCATGTTAAGAAAAAATTACAAGTG
TGGATCAGTGACTTCCAATCCAATCTATATAGGGTCACAAAACAAATTGTTGGCCCAGTA
TGAACCCTGTATTCATAACTGTCAGGGAGGGATTAGTAATTTTTGGAGGCTTAAAATCCA
TTATTTTCCATAGAAACAGATGCCCCCAGTGCAGGCTTCCCCATTAAGGCATTTTATCCT
TGACCTAGAGGGATTGTATTGCGTTGAGAAGCAAGGTTTCCTCAATCTCCAGACTCATGA
ATTCAAGAGATTTTTTTAAGCCAAATGTGGGATGGTTTTGTGATTAGCAGCCACTTTGCA
CCAAGGCCACCAATTTCATCTTGAGGTAATTATAGCTATTTAATCAAATCACTTGTTGGG
GCTAAATTTAAACCCAAGCCCCAGATATGACAGTGGCAGATCCTCAACGAGGAAGAGATA
CTATTAAGCTATGATGGTATGCTTTCAAAATAGTTATTGAAAAAAATGAATTGTTTTATA
GAGCACCCTTTGGTTCATTTCATTTTCCTTTTATTCACTCATTTTCCTGTTTGCTCTAGT
AAGGAAAAAATGTATTATAGCATTTGTATTATCTTTATCATTTTTTTTTCCAGAAGTATG
TATTATTGCAGGACAGCTGGATGTCAATCTGGCAGAAATTTATAGTGTCAGTCACAGTTC
TTCCAGATAATACCATGGTGTACACAAAGTTGATGACCCAATTGGTTATTAAAAGGGGCA
ACAGATATTTACAGATAATTTTCACAAAATCTGTTGAAGCTTCTGGGGACCGAAGTCTTA
GTTCAGAATTTTTCCAACCATTATAACTGTTATTCCTACCATAACCATGTATATAACAAC
CATATCGGCAGGAATTTTACAGAGCCTTGGCTCTGTTCTTTTCGGATGCTTTACCAAGGA
CCTTCATGAATCGAGCTAAATGGTTACAGCACTGATATATGCCTCATGTATTACTGCAGC
TCCACCACCTCCATGATCCTAAGTCCCAGTCTCACTTAAGAGTACCTGAAGGTTCAGTTA
GTAAAATAATGCATTTCCAGCCTACTGTGTTGTTAGGAAATCATAACGCAGCATAAATGC
TTTCAGAGCAACAATTTTTCTTTGGTAAATAATTTAGTTTAGAGAGAGCATCAATTTTAT
TAACATTTTGGTACTTACTTTTTAAACAATTTGTGTTTGAATTGGTTTTGTGTGTATCTG
TTGCCAGGATTCCCCCTTGTAAACAAGGTTTTGTTTCAATACAGTTATTTTCTTCATTTT
TGACAATAATAAAGAGGAATAATATTTTAAAGTACTTATAGTTTTACCATTGCCCAGCCC
ACATATTGACTTGTAGCACAGATATAACTTTTTTTGTTTTAAATACATCCAGGAGTATTG
TGTGATAATGTAAAGCTATCCCAACATGGAAAAGAAAATACAAGGAGTAAATCTTTGGCA
AAAAGTAGTAACTATATATTCTTTTGTTCTGTAGTGTTAGGATGCACCTTATGTTATTTA
AAAAAAAAAATGTTTTTGTATTTCTTTTAATGTCACAGGGCAAGTGTTGGATAGTCGAAC
CCAGTCCCCTTGGAGGCTGTCTTTTATTACTGACCTTTTTTGGGGGATAGTGGACTTTGT
GGGTTTATTGTAAGTTTGTTTATTAGCATCTGCTTTACATATTTTGAATAGAAAGAATGC
ATTGCCTCATAAATAACTCAACTGCAACATTGTGATCATCATATAAATCGGCAATAATTA
CCTACATGATCTCCAAGTAAATTCATTGTCTCCTTACAACCCTCTGAGCATATATTTTTT
TAAAAATGTTCTATAAAGGGCCGCTCCAGTGGCCTAGTGGATGGAACGCTCGCTCTATTC
CCCCAGAAGCCTGGGTTCAATCCTGATGGGGGGCCCTTGGATCCCTGGNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCCAATCCAGGGGAGA
GCTGAGAAGAGGCCAGACAATGATGTGATGGGGTTGGCCAGCTCCACCCTGGAGAGAGAG
AGAGGGCCCACAAAAGAGAAAAGTTCTATAAAGTGGCAAGAGAATATATTGAATGTAGTT
ATTTATTGTGTGTTACAACTAACAATCAACTGGTGACCACTCCACTTATTGAAGAAAAAT
CATATCAGAAACTTCTTGTGATCATATAGTCTGGATGGATTTGCTGAATATTTACAGTAG
ATACCTGACACAGTGGCTTATTTCCAGTACCATACAAAACTTTTAAAATAAGTATTTAAT
ATTCTAGTACCTTTTTATTAGCCAAGTAATAAAGCAGTTTATTTAATTAGTTCTGTAACT
AGCTTTTTACCATAGATTATCTGGCCACTACCCATGTACATTTTTATCTGCTGCTATAAA
AATTATATGTAATATCCTAATCACTACTTCACATAACTTTTTTTAAAAAAATTTTTTTTA
TTAATACTAACCTGACTTTAATTCCTCCCACATTTTAATGTTTAGCTTTCAGACACTATT
TCAGCCGGACATGACAAGGAGAGCAGGTGGATCTTCGTCTTACACAAGATATGATGATGG
AAGAGGGTATTGGCTTCTTATCTGACTATTTTTTTTAAAAATTTTTGTTTAGTAGTGAAC
ATTTTGTGCAGTATCCTGTCACTTTCATTGTAAGTAAATTAAGCTTCTTGAAGTATAGGC
AAGGATGCACAAAGTACACAATTAATAGCAGTGTTTTACATGCACTTTTTGCAAAGGTAA
TAACTTAACCAGTATGAAGGTACAGTAAGGATCCTGCTTATGATCTAGAAATTAGTTCAT
TTGAGGTGTGTTTAAAAATGGGTTACACAGTAGTTGATTGATCCTGTTTTGTATGCTTTT
CTAACTAAACCTTCTACTCATTACAAAAGCATTACCAAGAAACTTGCATTTTGAGTCTTA
CAGTGACAAGACATTATAAAGGTGGGCTCAGATATAGTACCTAGGGAGTGAGCAGGAAAA
AAAACTGTAATTTGAATAGTGAAGGAATTCTAGAGATGGTTTCTGAAAATTTGAGAGTAA
TAAAAGTGTCTTTTTAAGGAAGCTTAAAACAGAAAATCAACCTTATTGGGTAATTTAAAA
ATATATACACATACTCTAACTAAAAGTTGGGTGCTAATTTTTTTTTCCTGCAGACCTCCT
CCATACCCACGGCGCCGATTGGGTCGAATAAATCATGGTGCAGGCCCCAGTCCTCCTCCA
ATGGGCGGTGGTGGATGAGGAAGGTAAAATATAACTCATGTTGCATTACATATTATACCT
ATGTTTTATTAAGGCATTGTTGCCATTAATTGATTTAGATTCATAGGCCATATTTATGAA
GTTTTCATTTTTTTTTTTTAATAAGTGATTCATTCGGTCTTTAAAAGCCTCATGGACTAA
ATGATGTGGTATTTATAATCACTAAAATTGGAATAAAAAGTGTGTTAAGATACATGAAAG
CATTGATTTTATCTACCTCCAAACTTTTGTAACATTTGTGGTACATGTAATGTTTCTGAA
GTATTAACGCTTGTATTTCTTTGCAGGCCAGGTACCATGCACGTGGCCTTAGTGTGTGCT
TTCATACTCTGTTCTGCTAGTATTTTTCAACACAAACCTGCAGGAAGTGCCCTTTAGAAA
GGTTACATCCAGGGTTTCATTTTGGAAAAAAAAAAAAAAAAAGCAAACTACTGATCTTTC
CATTTGTATGATGGTTTTGTGATGGAGACTGTAGTGTATCTGTTATAAAGGTGAGACCAG
CAGAGCCAATGTATATGGAGCTTTTTACAGTCCTCACTGCTGAAATTGAACCCAAGGTCC
TGAGGTGAAAGCTTTATGACTGATACTTGGTAAATCCCTTCCATTGATGCACTAAACTTC
TTAATTATAAATAGAGTCTTTAAAAATTACTAGAATATTGCACAGACTAGTATGTGAAAA
GGCTTTTATGTACCAGTATAAAAAGGGTGCTATGATAGCCCCCAAACACTTTAAAATTGA
TATGAATTGTAAACTTACATCAGCACCAACCAGTTGGAATTTTTTTGAGTAGGTCATTCA
CCCATAATTTGCAGGAAATAAGTTATTTAACTTTAGCCTAATTAAAGCTGATTACTTTAC
TGATTACTAATTAAGAAGTTTTTCACAGTTCTGTTTGCCTTAAAGTAAACTTGTTAATAA
ATGGCTCCCATTGCTATGCTACATAATCTCCTTCACTTGCAGCCCCAATGATATACATCT
CATATACTCAAAAGAAAAACAAAATTGTTGTTTAAACAGAGAATGTTAATTTAGTTAAAT
TTTAGTTGGAAATAGTTGTACTTGTAGCATACTATTACTACTTAACACTAAACAACCATG
TTTTTATTACAGGTAAATACCTGCTTTCAAAAGCAGGCAATGGACTAACACATTCATAGC
ACGGCGGGAAGAAAAATAGTCTAGTTGTCAAGCTTGAAAGGGAATGTGTGTGTCCACTTG
GAAAGTTGCTCTGTATCCATACAGATTCATGAAGTTGTGCTGGGAATGCCTGTTTCAAGG
AGCTGGTGCAATGGAAAGCAACACCGGATACCAA
Chart Advanced