SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001280_2.0
Identity
TranscriptSelenocysteine synthase (SecS)
SpeciesLoxodonta africana (Elephant)
Transcript IDSPT00001280
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001184_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00001280_2.0 # Transcript # Selenocysteine synthase (SecS) # Elephant (Loxodonta africana) # Full length # Reverse
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GTCATAATTGTCAACTCGAGATACATCACTCTCTTTATTTTGTTCTTTTCTTACTATCTT
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GCTCCTTGGAAATCCTATGGGGCAGTTCTACTCTGTCCTATAGGGTTGCTATGAGTCAGA
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TCCTTTACATATTAATTGCTGATTTTTCTTCATCTATATTATTCCCAAAGTCAGCCTGCA
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TGTTACGGCTAAATCTATAACTGACATTTATTATAAAATACTTCTGTAAAGGGAGAAATT
TATAAGCACCCCAAGCAAATGTATATAGAGAGATCTTACTTAGAAGGAATGAAATACTAT
TGATTTTCTATGTCCTTTGTGCTGTATTTAACTTGATTTTAAAAGACTTTTCACTAGAGA
TAAGCTGAACTGTATACTTGAATGCTAATGTCAGCTGTATTTCTAGAATAAAAATACAAA
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TCCCCCGAACACCCCGGAGATGCACATTCACTAAATTTTAAACAAAAAGGTCTTATTTAA
TCATGTCTTTTGAAACATAACTGTTTCACATTACAGGATAAGCTGGAACTGGAGCTTCAC
ATACTGTTAGGGTATGTCTCCTAAGGCAGGTAGTAAACCACAAGTGAAACATTACCAAGC
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GTTCAAATCCACTGGCCGCTCTTTGGAAATTCTGTGGGGCAGTTCTACTCTGTTTTACAG
GGTCTTTATGAATCACAATCAACTCAACGGCAATGGGTTTTAACAAGTAGTCTAATATTT
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CTGCAAGCTCATCTACTGGCGAGGCCCCATGCCCTGCCTGAACTGAAGCTTTTGTTCAGA
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GTTCCACTCTCTCAGAGCCTTTCACCCTTCTAAAAAGAAGGCTTGAGAAGGAATGGCTTC
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CCAGATGCAATAACCCCTAAAAATATCATTGTGGTGAATAAGGGCACAGAATTAAAAAAA
AAAAAAAAATCTAAGTTTTCTTCTAACACTCCTTTTATAGTACGCAGTCACACCAATAAT
ATAAAAAGGAGCTGTCAGTGATGGTGTATAAATAGCCCTGGCTAGGGCATAATAGCTTTG
CCTCAGCCTCTCCAGAGCTAAACCAATAAACTATCACAATTCAATTTTCACAGCTCAAAA
GTAAGTCCATTTAAACAAAAGAGGCCCTTACTTCTACAACGAATCTAATAAAAAACAGTA
TTTATGCTATGTATATACAATTATGGCTTATGGAAAACATCCACATTTTTCATCAAAAAC
ACTTGCCTGTTGAATGAAGTTGTTAAAGACCAAACTTTTATTCAACTTACAACACAGAGT
TCTCAAGTAAGCATTTTCATAATTACTACTATGGACATTTCCTAGTCTAAGTAAATTCTA
TGGAGAGAATTTTAAATAAAATCAATTCATATAATAAAGCCTTTGGGGTTTTACACCCCT
CCAGAAGACAGAATGGTGGGCATGAGACAAGCATTTCCTGGCTCAAATGCCAAGCACAGA
GCAGGTGATCCCCCCATCGGTGACAGACGAGTGTCTGGAGCAGTGAGAAGAAAATGGTAA
GACAGAAAGCTCAGAGGCTTTAGCTTCGTATAGCCCTAGGTCTCAACAGCAGTTTTGTCA
CTTATATGTGGGCCTCGGGCAGGTACGTAACTTCTCTGAGCCTCAATTTCACCTATAAAA
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TCAGGCAGTCCGAATCTACCAGCCACTCCTTGAAAACGCTATGGGGCAGTTCTACTACTG
CCTTATAGGGTTGCTGAGTCAGAATCGACTCGACAGCACACTACAACAACAACAGCACAG
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GTTTATAGCTTATTGCTGTTCTTCCCCATATGCAATGGAAGCTCCTACAGAGCAGATATC
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GTTCAATAAATATTTAGTAAATTGAACTGAATTGAATTAAACTTATCCCATACTCAACTT
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GTAACAGAAATGTCTTCATGCTATGAAACTAAAACTAAATCTTATGGTTTCATAAAATGA
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