SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001281_2.0
Identity
Transcript15 kDa selenoprotein (Sel15)
SpeciesLoxodonta africana (Elephant)
Transcript IDSPT00001281
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001185_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00001281_2.0 # Transcript # 15 kDa selenoprotein (Sel15) # Elephant (Loxodonta africana) # Full length # Forward
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GATTGCACCTAGGAAGACAGAAGATTTGGCCCCGTTTGGGAGCCACACTTACTTAGGGAT
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TTTTTTTACTCCTAGGCAAAGGTAAAAAGGAATGACATTTCAGGCTGCCTTCTGATTTCC
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CTGTGGTGCACTGCCTAAGCACTCGGCTGCGAACCGAAAGGTTGACAGTTCAAACCCACC
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CCCTATGGGACATTTCTACTTTGACCTGTAGGGTCGCTATGAGTCAGAATCCCCTTGATG
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CTGCGTAGGAGCAGCTTCCCAGCTTTCCAGCTTCCCATCCTCTCCCCTGCTCACAACAGA
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AACCATATAGGGCAGTTCTACTCTGTTCTATAGGATCACTATGAGTCAGAATTGACTTGA
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TGCTTGTCATTATCAACTATATATTCCAGTTAGCTTCAGTGGTCCCAACTGGAGGTGTAT
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CTTATACCAAACCAAATCTGTTGCTGTAGAATCGATGTCGACTCATAGCAAGTCTGTAGA
GAGTAGAACTTCCACATAGGGTATCCAGGGAGCACCTGGTGGATTCGAACTGCTGACCTT
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TCTTTCTTTTCTTTTGGTCTTTTCCTAACCCATTCTCCTGTCCTGAGAGAAGGAGCTACA
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GCCTGTCAGCATCCTGCTCCCCCTGGAGTGTGAAACCCTGCTGCTACTAGAATCTGGTGC
ACACAACTATCACCACTACTCCTCTAGGTGGATAGGTGACAGTCTGCACCACACACTTGA
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TGAGCAAATAAAGAATAAATCACTACAATATCTTTGAGATGGCTCAGAGACAGCAGTCGA
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AACATAGTGGAAAAATTAATAAGCTGCAAGAATCCATAGAGAGACAGCATTCAGAAATCC
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GTAGTGCAAATGCATGATTGTTCATTTGACATCCTTATTTTATAAAACACACTTAATTAA
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GACTGACCTGGGCAGCAACTAGGTAATGAGGAAAAATGGTGCCATTTTACACAGATACTG
AATGCATGAGAAAGTACAGATTTAAATTGAGAAGATAAGTTTCACTGTTGGAGGTTGTAA
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GATGAGGTCATCCATAGAAAGTATGTAGAGCAAATAGAGGGCTGAAAACAACTCTAGGGC
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TGACTTTGGCAAATTCAGTGGAGTGGTAGGTTCAGAAACAGGCTAGAGTTCAACTCAGAA
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GAAGGAAGAGAACTAATATTTTTTGAAAGCTTGTTTTACCAGTCAGTTTGATTCATTATT
TTATATAAGTCTTCCCATTTAATCTTTACAACAATTTGTCTTACGTAGAATGCATTGCTC
CCTGCTTTACCAGTGAAGAAATTAAGGCTTAGGGAAGTTAGCTTGTCTAGGGTCACACAT
CTTGTAAGTGGTGGAGCTAGCACCTGAACCCAAGTTTTGTTTTGCTGTGCTCCTGCCTTC
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GGTGTTGTAGAGACCTAGAAGTTCATACTACTCTGTAGACCCATATGAACAGGTGCTAAG
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TGTTAGATGTTGACAGCCCCAGCTTGCACTTTTTTGGAGCTTTATAATGCAAACGTAGAA
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TGGACAGTTCAGCCTGCTTCAGCTGGATCATGATTGCAGAGGATGCTGTCAGGAAGAAGC
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ATGGGGCAGCTCTACTCTGTCCTATAGGGTCGCTATGAGTCAGAATTGACTCAGTGGCAG
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TGTTAGATAAACAAATCAAACCCATTGCCATCAATTCGATTCTGACTCATAGCCATCCTA
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GTTAAGCATTCAGCTGCTAACCAAAAGGTTAGCAGTTTGAATCCACCAGCCACTCTTTGG
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TTAAATAGTTTGATACCAACAGGTGTTTTTCTCTTTAGAAGTACAGTGCGTGGTTTTTTT
TTTTTTTAATTTGCAAAAATCCCTTTAAACTTTTTCTTAAAAGACTTCCTTTAAGACACA
TTGATTTCTGATATTATATTTGAAAGTGTTTTTTATTACTATTAAATTTAATGAAGCTGG
ATTAAATTGTTTTGGACCTTGTTTGAAGCTGAGAAGGTTTTTTATGAACAGAAAATAACA
ATGGCATTTCTCTTTTTTGTAGTATGTTCGCGGTTCAGACCCTGTACTGAAGCTTTTGGA
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TTTGTTATCAAATGAAATATTACAGTCCCTAGAAAATAATTTAGTTTTTGCTTCCTTCTA
TTGATCAATCTTTGACTGTGAGGCATTGAACATCTAATTAGAAGTTGAAGTAGCAGCACA
GCCCATGATACCTAATGAGTTGGCATGCTTATTAGAAAAACCCATTTTTTATAAATTTCC
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ATGCAAATGGTAGTTTGTGATAATTGGTCCAGTTTTACAAACAACAGATTTTTAAATTAG
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GACAGAAAGCTACAGAGCAAGTGAGATATACTGAGCCTCAGCGGATTGTCTGCTACTCAG
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TCAGGATCTATAGTAAGAGTGAAACATTCACAAAGATTTGCATTAATGAAGACTGCACAG
AAAACCTTTGTAAGGATTTGTGTGGATCTGATATTTGGCAAGTTTTTG
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