SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001307_2.0
Identity
TranscripttRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43)
SpeciesLoxodonta africana (Elephant)
Transcript IDSPT00001307
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001211_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00001307_2.0 # Transcript # tRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43) # Elephant (Loxodonta africana) # Full length # Forward
ATTCCAGCTGGCTACTGCTTTGTAGAATTTGCAGATTTGGCTACAGCTGAGAAGTGTTTG
CATAAAATTAATGGGAAACCCCTTCCAGGAGCCACACCTGTAAGGACATTTAGATAATGA
TGATGTTGCCATTTTTATTGTCTTTAGTAACTGCCATCTGTTGAATACCTGCTGTATACT
TATATCATTTGATGTGATCTTACAACAACCCTGTACAGTAGGCATTGTTATCTTTATTTG
ACAGACCAGGAAACTGAAGCTCAGGGAAGTGAAATAACTTGCCCAAGGCCACACAGGTAG
TAAGTGGCAGAGCCAGAATTCAAACTGAAGATTGTTTGCCTCCAAAGTCCATGCCCTTTC
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GAGAAACTAGAACAGGCTGGCAGCAGTGAGGACACGTTTCAAGAGAGTTACATTCTGCTC
TTCCCACAGTTACTTAGCTTACCGCTGCACCAGGCTGGCACACCGGGCTCATAGAATCAT
GGAGCTGGCAGTGCCCTTAGCGGTCATCCGTGCAACCCCCTCATTTTAAACAGGAGAAAA
AGCTGAGGCTTAGAGAGGGGGAGATGTTTTGGCCAAGGTAATTTATTTCAGTTTTTTTCA
AATATTGTTTGACTCTTGAAACACTTTTCTCTGTTTTAGTTTGTTTGTTTTTAAATTTCC
AGGCAAAACGTTTTAAACTGAACTATGCCACTTATGGGAAACAACCAGATAATAGGTAAG
TGCAAAGTAGCCTCAGGGAAGCTTCAGGCCTCAGGAGATGAGTAGGCAGAAGACAAGATG
TATCACTGTGCCTGTCTCTGCCAGAGAGGAGGATGGGATGCTCAGTTTGGCTCTATCTTG
TGTCCCTCCTTGGAGCCCTGGTGGTGCAGTTGTTAAGCATTTGGCTGCTAACCAAAAGGT
CAGCAGTTCGAATCTACCAGCTGCTCCTTGGAAACCCTATAGGGCAGTTCTACTGTGTCC
TGTAGGGTCGCTATGAGTCGGAATTGACTTGATGGCAGCGTGTTTTGCCTCCCTCCTAAA
GGCATACACTCTCCCACATCCAATGGATAGACTTTCCTGGCCCACTTCCACGTCAAGGCC
CTGTCTTCTCTTTTTTGGTCCTGCCCCAACCTTCTACCCTGTCACTTCCTGCAGTACAGA
GGTTTTCTCCAGTAGCATTGACTTGCTGTAACGATAAAAATTGATTCAGCATTGCAGGGA
GCTGTTTGGCACTATGTGTCAAAAGCTTTAAAAAGGTTTGCGCTCATTGACCCTCTAATT
CTGCTTCTCAGAATTGATTCCTGAATGTGTACAAAGATTAACCGCAAAGAAGTGTTCAAT
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TGGTAACTATTTTTCTTTGTGCTTTTTGGTATTCTGGTTTTATTTAAAGTATATGTATCA
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ACAGAGATTGGCAAACTATAGCCTGATTTGTATCATCCACAAGCTACAAGTGGTTTTTAC
TTTTTAAAAGGTTTAAAAACAAACACACAAAGAATATGCAGCAGAGACCATATGTACCTC
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CCTAAAATGGACTGAAAGAGCTCTTTACAGCAGAGGTTTGGGTCTTTGTCTCTGAATAGT
ATTGTTCTTTCCTCTCAGCCCTGAATACTCCCTCTTTGTGGGGGACCTGACCCCAGATGT
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GGTGGTTTTGGACCAGACAGGCGTGTCTAAGTAAGGCCTTACCTGTTATTGTTGCCTAGC
TTGTTAGTCTCAGCATCCTTCTCTCATTGATGGAGGTGTTGTGGAGGGGCCACGGTGGTT
AAGAGCACAGGCTCAGGATCCAGACTGTTTGGTTTGAATCCCAGCTCCAATACTGGCTAG
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TATAGAACAGGACTATAAAAATGTTGTGGTTGCAGACCTCATCTAACTTCATGGGTGGGG
AGGAGAATCAAGATCAACATCAGCTCAAAGCTGATTCTTATGAGGTTGAGGTCAGACATA
CTTCCACTCTCCAACCTATTTACCAATTCTTACCACAGCCATCCCTCCCACAGCACTCTC
TACTTCTCTGCTGGGTTTGATAATTCATTGTAGTAGCCACACAACTCACACACCATACTC
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AAGCAACAGGAACAACTCAGGATACAGTTCTTCAGTCAGAACAGCTTCTTCTCGGCCATG
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GTATGATAAAGCCCTTTAGCTCCTCCCATAAGTGCCTGGAGGCACCTAACTCTACTAGGA
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AGTCTCCTGGTTCTGCTCCTGACCTTTCTCTGCCGCTGGACTCTGACGTGCTTGTCACCA
CTTCTCGCTGTCTTGCACCATCTTTGGTGTTACAGCTCTCTCTGTCTTCTGGGTCTAAGA
GGTTCTCAGCGCAGGGACCCCAGGTCCAGAGGATGTGCTCTGCTCCCGGCTCTTCTTCTT
GATGGTAGTGAGGCTCTCCCTACCCCACAACATCTGGGATTGGCTCTCTTTAAGCCTAGT
GGGATGGCAAAACTGACCAGTCTCCTACAAGTGTTCCACTCACCTTATTTACATTAGCAA
AACTGCCCGATTCCTTTGGTGGACCACAAGAACCCCATTTGCATAGTACCATCCAGTCAT
TTTGTGGGAGTTACAAGACCATGACCAGAAGTGCCACATTAATGCAATTCACTGCATCAC
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AGTAAAAAAGCACATAAAAAATGCTTTGTAGGTACTCGCTATTTTAATTGTCATTATTGA
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TCTTGATCAGATAGTAATTATATTATAAGTTCAGACTTTGACAGTCTGGCAGACCTGGAT
TTGAATCCTGCTTCAACCATTGACTTTGGGCGCATTATTGAACCTCTCTGAACTTTGGTT
CCCTGTTTAGTAAAAAGCAGATACCACCTTCATTGAATGGTTAGACAGTTCAATGAGACC
ACCCTGGTAAAATGCTCAGCATGGTGCCAGGGATATAAGTGCCCATTAAATGTTGGCTAT
CATTCATTTGGAAACCCTGGTGGTTAAGAGCTACAGCTGCTAACCAAAAGATCGGCAGTT
CAGATCCACCAGGCAGTCTTTGGAAACCGTATGGGGCAGTTCTACTCTGTCTGTGGGGTC
GCTATGAGTCAGAATTGACTCGACGGCAGCGGGTTTGTTTTTTGGTTTATTATTATTCAT
TTATCCCCCAACTAGAAAATGAGTTCAGGAGAGAAGAGCCTTGTCTGTCTTGTGACTGCT
GGATCCCAGTGCCTAGTATAGTACCTGGCATTCAGGGCAGGCTCTGTAAATATTTGCTGA
ATGAACTTCTATAACTGTTACTGTTATTACTTTATAAAGATAGTAATAATAGTTATTCTT
TAAGTAGGTTGGAGAGGAAGCTATTTGGGAAGAGATAAGAGCCCATCAGTGAAGCTGTTG
AAGAGAATGGTGAACCTAAGTGGGAATACCTGTAGATCTCATGGTCTCAAATGCTTAAAT
CCCATCGCTGCTCAGTGGCTCACCCCCACTGAAGGGGCTTATCTCTTCCCAAGTAGTTTG
ATGTTCTCTCTCTCTTCCTTCTCAGTACCTTCTCCTCTCAGCATTCCTGCCCTTAATGCA
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ATTCACAGATGAACTGGAACAGAAGCGAGCCCTGACAGAGTGCCAAGGAGCAGTGGGTCT
GGGATCTAAACCAGTGCGGCTGAGCGTGGCAATCCCCAAAGCGTGAGTCCTGGGCCAGCA
GGGAAAGCAGAAGGCCTCTGGACTGGCCCCACCCAGATATTCCTCATCTGTTTGCTCATC
ATTAGGGCATCCACTTAGAGAAGACTGGGTAGGAGCTGCTGGGAGATTCAGTTCAAGTCA
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TCATGACCCCGTCCCTCTGGAAGCTTATAGCTAGAGAGAGAGCTGTGATTGGCAGAAGTG
GCTGCACTCAGACATTGCTGTAACACTGAAAAGTAATTACTCTCTTGGGAAAGCAGTTCA
GCAATACATGCCAAATGTTCCTCCTCCTTGCCTGGTAGTGTCACTGTTGAGAACTCATCC
ATAAAATGAATAAGAATTGAACAGAAGGAAAGAATTATATCCAATCTCAGCATTTTTTTA
TACCAGTGAAACCTACAAACCTTTTGAATGTCTTGCTGTGGAGATGGAATGTAAGTCATT
ATTACCTCTGTTGTGCTAGTCAGACAGCCCTTCTTCCCTTATGACTCCAAGCAGGTTTCT
CACTCAGATTTCTCTGTATAGTAGTGGTTCTGCAAGAGTACTTCTCAAGTGGGGGCAGTT
TTGCCCCCCAGAGGACATTTGGCAATGTCTGGAGACATTTTTGCTGTCACGACTGTCATC
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CAAAGAATTATCTGACCTTCCCAAAATATCAGCAGCGCTAGGACTGAGAAACTCTGTGCC
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CAAAAGATCTGGGGGGTCTTTGTGGTTTAACTGTATTTAATACATAGATTAGGCTGAGTA
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TGCAAAAGAAAGAAATTTCCTCATCATTTCATCACCCTAACGCATGATTTCTGGTTTATA
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ATGTATCTATTACATACGGATCAGTTCACATGTAGAGGATTTCTTTACTCATTTTTAATT
AACAAAGCCGTGCTCATTCTTTTCTACTCCCTCCAGTTAACTCAGGGTGAGCACTTTCCC
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TGTGTGCTGCCTCTCCATTCCTCCAGAGTTGCCCGTTTTAGTTGTCCCTGATTTGTTACT
GGTCATTCAGAAAGCAAGCCTCTACAACAATGCAGGCCCTGACCATCTGTGGAGATGCAG
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ATCAGAGCCAGTGGGCCTCCTGTTAGGAGGTGAATGCATCTGGCTGGCTGAGGCTATCGA
ACGTTGTCCATCTAATACTCTGGCCGAGGCCTGCTCACAGGCAAATATTTAACTTGCAAG
GAACTTCACCTAGGGAGAGCTCCTTCAGACTTTGAGCATTGGTAGTTCCTGTGACAAGGA
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TGGTCTGAGCTTGGGTTATGTTCTTTTGATTCCTCTCAGCTAGGCTTTCTTGTCATACCC
CAGGCCTGTTTTATAAGCCTATTCATATATGGCTTTTATGCTTTTGAAAGCAATGGATTC
TTCGCGGACTTGACATTCTGCCTTCAGTTAGCAGCAGATGGAGTAGCCATGCATTCAGGA
GAAGAAACCTTCCCACTGACCCTGGGCCTCAGTCCTGATTGGTGAATGCGGGTGTAAGAG
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TGATCATGAGGCTTGGAGTGCTGTCTGGCTCTAGTCCTAGCTCTGTGACTTGGTAGCTAT
GTGGTCTTGGGCAATTCACTTAACCTTTTAGAGGCTCAGTTTTCTCGTCTGTGTAAAGGG
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TAAAATTAGAAGTGCCTATCTTAAAAGCATAGAGCCAGGCTACCTGGATTTGAATCTCTT
ATTAGCTGTGTGACTTTGGACAAATTACTTAACCTCTCTGTAAGTAGGAATAGTGGTGTA
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ATGTAATTACAAGGGGCAGTGGTGGTTCAGTGGCAGAATTCTTGCTTTCCATGCAGGAGA
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TCATCCATGTTATATAGCATGTGTCAGTACTTGACTCCTTTTTATGGTTGAATAGTATTC
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GAACATGTTTTTATTTCTCTTGGGTGGAATTGTTGCATCTTATATGAGTAATTGCCAAAC
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TTTAATTGGATTATTTGTCTTATTACTGAGTTATAAGAGTTCTTTATATATTCTGGATAC
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CATTTTCTTGATAGTGTGCAAGAAGTTTTTAGTTTTAATGAAGTCCTGTTTACCTTATCT
ATTTTTTCTTTTAAAGTTTGTGCTTCTGGTGTCATATCTTAGAAACCGTTGCCTGTTTAT
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GTTCTGTTGTATATGATGTGAGGTAAGGATCCAACTTCATTCTTTCACGTGGCTATCCCG
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TGTCAAAAATCAATTTACTTACGTCAAAATCTTCAAAATATATTGCTTTTTGACTCAGCA
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AATTTACTCTAAATGTAAGGATTTATTTCTGGTTCTCAGTCCTGTTCATCTATATATTGA
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GCATTTCCATATAAATTTTAGGATCAGCTTGTCAATTTCTGCCCCCCCAAAAAACTCCAG
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TACAGAAAAGTACCATAAACAACGTACAGTTCAATATGTCATTATAAAGCAGTTGCCCAA
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TCCACCAGTAACAACCCCCGACCCAAGGAAAACCCTGGCGTTGATTTTTATAATAATCAT
GTTCTTCCTTGTCTTTATAGTTGTAAAACCATCAACAGTATGGTTTTGTTTTGCCTGTTT
TTCAACTTCACATACTGGAACCACACTGTGTGTACTTTATTCTTCCATTCAGCGCTCACT
CAGCATCGTGTTTGTGAGGGTCATCCAAGTTGCATGCACCTGCTGTTCATTTTCAGTGCA
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TCTGTTTTCTGTATTTGTTGTGATTTCTGAAGAAGTAGTACTACTTTGAAAATTTAAAAA
AGAAATGATTAGCTCAATACAGGGCTCAAACATAGTTCTTTTTCTTAGTGTTAGTTCTTG
GAATGGTGCTTTGACTTAGTAGTTGTGACTGGATTTTCCAAACTCAAACTAGAAATAAGG
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TTATCCTTTTCACAGGAACCCTGCAGTGGTATTGGCCCTGTGATAAATGAGGGAACTTGA
CAGAGGATAGGGAACTTGACTGAGGGACACACATAAGTCCTAGGAGCTGGGAGTTGATCC
CAAGTAGCTCTCCATGCATCTTCCCCTGGTCCTCCCTGCCGCATCCTGTGGGGGTCTCCT
GAACCTGTCCCTGCTTCTCTTTCAGACCCCATGCCGCAGCTGGATGTGACTGAGGCCAAC
AAGGAGTTCATGGAACAGAGCGAGGAGCTGTACGATGCACTAATGGACTGTCACTGGCAG
CCCCTGGATACCGTGTCTTCAGAGATCCCTGCCATGATG
Chart Advanced