SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001521_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein T (SelT)
SpeciesMonodelphis domestica (Opossum)
Transcript IDSPT00001521
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001425_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00001521_2.0 # Transcript # Selenoprotein T (SelT) # Opossum (Monodelphis domestica) # Full length # Reverse
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AAGATGATTTCAGAAAAGCCGTCCCCTGAATCAGATATGAAGCAAAATGAGGAATATGGC
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GGGGGGGGCGGGTTGGGGTCTGTCTGATGACCCTCATTCTTCGTATTGACCCAAGAAACC
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CCTAATTTGATTCCAGGCTCAGCTCAGTCTCTAGCACCTTGCCAGCACCCTGCTAATAGA
CCAGCTTTATGGGCTTTATGGGCTCTCTATCCAACTGCATATCGTCATTCATTTGGTCTA
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TCAGCCCAAGGTTATCCACAAACTAAAACATCTAAAGGATTTCTTTAGAGGGAATTCTGT
TCCCATGTGGACTCTGCTCTAAACAGCCTCCAAGTACTAACCAACACTTTTAGTGAGCAC
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ATTCTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC
ACACACACACAACTGACTTACCCTATTGTCAGACAGCCTCAAAGGCTGTATTTCCTTATA
CTGAACCAATATTTTTTTATAGCCAACAAACAACAATGGAACAAACATAATGGAATCATA
TTCTTCTCTTCACCTTTCAGTTAACTATACAACTGTAAAAATGTAGAATATTTTTGTCAA
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CCTTTGTTTCCTTCCGTTTTTTTTAAATTACCTCTTACCTTCTGTCTTCTAAGGCATAAG
GGCAGTAAAGGCTAGGCAAATGGGCTTAAGTGACTTGTTCAGAGCCACAAAGCTAGGAAG
TGTCTGAAGCCAGATTTCAGGCCAGGTCCTCCTGACTCCAGGCCTAGCACTCTATCCCTT
GTGGTACCTAGCTGTCCCTTACCAATATTTCCTAGATCACCTTTTCTGTAATAGTAAAAT
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CTTTAATATCTTTAATATTGGGTCTCTTACCACAGATAGTTTTTTTGTATAAACTTTGCT
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TGCTCTTCTTTACTTACCTACAATTTAGTAAGTTAAAAATTCTATTTTTCTTGAAAAAAA
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GGTTATTCATCTGCCAAGAGTATAAATTATTTCTTTTTGCTAAGACAAGAAAACAGTCCA
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GGCTTAAAAATCTACAAAGAACTCAACAATATCCTCTAATCAGGGTGACAGTGCCCTTAA
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AGGAAAAAAGTTTTGTATTATCATGCCTGAAGAGTAAGATAATGAATATGAATAAATATG
AAAAATATTTAGAACCTACCATTTAGAGTTATCTCAAATGCACCTGTTGACATACACTGG
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AGATTAAATATTGCTATTATATTTCAGAGAATGTGATTTTTAAGAGGAAAAAACTTAATA
CATGATGTGTTAAATTCCCAACATTCTCTATCTGAAACAAATATTTCATCTGATAAGTTC
TGTTCTTCTTCCTTAGCACATTTCTATAGTTTACACACAAGCTCTATTCCCAATGTCCAA
TGTTAGCAAGAAAAAAATTAAAAAATGTCAGTACTAATTCAGTTCTAAGAATCCTTATTT
GTGGTTTGGAGAAAATATATCTAAAAGAAGGATCTCAATGGCCCAAATAATTCTAATAAA
AGAACAACTATACAAGTGGTGTGGTTCATTTGAACAGCTTTTAAAATTATTCACAAAGGA
AGTGATGCAATATTCAGCAACTTCACAAAGAGGCCTATTATGTAGGGTTTTTAAATTGTT
ATTATAAAACTAAACATAAGCAGGCTTACATTTCTAGCAAACTATCATAAGCTTATATGA
GAAAAATAACAACAACTGGCATTCTGCCACTCTGTGAATGCCAATCTCCCCTTCTTCCCA
GAGTTCCTTCTCAGTTCCTGCTGAAACAGCTTTAACTCCCAAATTCTAAAAATTCAAGGA
GGGCCAAGGAGATCTACAAGAAACAAAATACTTCTCTGCTGTCCAGGAGAGATCAGCTAA
TTCCATCCTAGTAAGAAGTTAAGAAAATACACAAAACTGGTTTTTAAAGGCATAGACAGC
AGGAAATCTGGTGTTTCAGGAGAAATAATACTTAATAGGACAGATGAAGAGAAAAAAAAG
AATGATGGATAATTTCACAGTGCTTTAAGATTCACAAAGCACATTCCCCACAACAGTCCC
ATGAGGTAGGCAGTACAAGTATTATTAACTCCCTTTTCCACAAAGGAATCTAAGCCTCAG
AGATCTTATACAAATTGTCACATAGTGCTGGGTACAGGATTGAAAACCAAATTTCCTGCT
TCCAACTTAAGAACACCCAACCTATCATCCGTAATGTAGCAAAAGAAATCATTAAATTCC
CCAAACTAAAACAAAACAAAAGCCATCACTGCCACTACCAACAGCTCACAGCTAAGTACC
AAGCTCTTCCAATAACAATATTATCCCACATTTTCACTTTCAACTTGAAATGAAGATCAA
ATACATACCTTATTTTCTTGGCCCCACTGCCAGATGCTAGGAGCCTGCATGCCAAAGAAA
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TTGTGGTTTATATGAAATATGTATGTGTAAAGAACTTTAACAAAATTAACAAAATTGTCC
TATTTCCATGCCCTGTCCTGAATTTTTCTTTTTTCTTACATATTATTCCAGATTTTGCCA
TCATCATTGCTATTTACAAGCCAACATATGATGAAACAAATTCCTATGAAATGCTTCTTT
CTTGTTTAATTACATTAATTCAAAAGTATAAAAATATTTCTGAAAGGCATATGTAAAACT
GCACAGTAAACTAAAATAGCTACTAAAATTTATTTTTCAGTTTAAAAAACAAACAAACTT
TTAAACAATGCCATGAATCATTGTTGTAAGCCATAAACTCATCAAGGACAGATACTATTT
TAAAATTTTTGTTATTGTCTCCCAAATACCCACCATAAAAAAGGTGCTTAAGTGTTTAAC
TTAAATAACTATATTACCTCAATTTAAAAGTATAGCACTTAAAACTTTAAATCATTGTAT
AAAAGTTTTTGAGTTCTTGATATTTTTCCTCCATAAATAATATACTAAATTTTTTTTAAA
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GAAGCAGCAGGAAAAAAATCTTTGAAAATTTCTCTGATAATGGTCTCATTTATAAGATAT
ATGAGGAACTTGTTCAAATTTATAATAATAAGAGCCATCTCCCAATTGAAAAATGGTCAA
AGGATAAGAAAGAGTTTTCAAAGGAAAAAAATATATACCATAAATAACTATGTGGAAAAA
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CTGGAAGAGCTGACAGGAAAAGAAAATGATAAATGTCAAAGGAGCTACAGGTAAATTCAT
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GCAATTCTTTTTGTGGTAGTAAAGAACTGAAACTAAGGGAGTGATGATTAATTGGGGGGA
ATGGCCACACAAATTATGGCATGTAATGTAATGAAATACTATTGTTCTAGAAGATGTTAT
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GCAGAACCAGGAGAATAATTTATATAATAATATTACACTATCAAGGCAAAAAATGTGGAA
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TTTTCTTCAATTAATGAAGCAGGAGAAGAAAGTGGGAGAGAAACGAAATGCTTACTAAAT
GAAAAAGTGAAAAGTAAATTTTCTAAATTTAATTTTAGCTAAATGTTTTTTAAAAATTCC
ATTCTGAAGATAATTTTTAAAAAATTTTAAAAATTAAAAAACTTCTACTTGTATAAACAT
GGTTATGGTACTTATAAAGAAATGCCATTACAGCAATGAGGGGCAAAATAAATGAAAATA
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ATACCCACCTATATATTGGTTGAGGGAGGTAATTCTCTCCTTCTATGCGGATGTCTGGGT
ACCGCTGGCTAATAACCCGCATGTACTCCTCAAACACCCGCCTATAGCCTCAGGAAACAC
TATAAGAAAAAAAATGCATTAAATGATTTAGAACTATTTACCCAAGATTTATTTAGGCAC
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GTTCTAGTTAAAATATATTAAACAATAGTCTGAAGCCAATCCAGGCAATGGATTCCTACT
CATCTTTTCACCCCAAAAGATACATTTTTTAGGTTTTTTTTTTAAGTATCTTAGAAAATA
AAGATTTTGCACAAATTATAGTCTTTTTGAGCAATAATTATTTTCATAAAGCATACAACA
TGTGAGAAGTGCTATGCTAGTTCACTGTATTCTTCTGAAATTTGAGCTTGGAAGTGATGA
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TTTTAACCTTTCCCATTTCCTAAAAGCATATTGTTCTGTGTAGAAAAGAATTCTGTAATT
GAAAACTGATTTTCAGCAAAAAGAAAGTGCTGTAAGTTTTTTATTTAATCTATTGTGCCC
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GACTAATTCCAGGTCACGTGAGCAACAAAACAGAGGCATAACGTTTTCTGTAATCCCCAT
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GCAGTGAGGTTGTACTAGCAGATCCAAGGATCTGAAATATGGGCTCACAAAACAATCCAT
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TATACCTAGGGAAGTCTTTGATAAGAAGAAAATCTCTACAGCACTTTTTGTGATAACTAA
AAATTGGAAACAAAAGTAGATGCCCATCCACTAGAGAATGGCTAAACAAACTGTGATACT
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AGAGCTCCCTGAAGCAGAGCCAAGAAAACAATCTATACAGAAATTACAATGTAAACAGAA
AGAATACACAAAAGTATAAGCGAACATAACAAAATCATAAAGATTTTCAAATAGGACTAC
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AAAACTTATTCACAAAAAAAGAACAAAATGAAGTGGATAGCATGGAAGTAACATTGTTAA
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TCCCTGCACTTAGCACAGTACCTGACATAGAGTAGATATTTGATAAATACGCGTTGATTT
GACTGACTTTTAAGAAAGTAAGAAAACTGCTGATACAAGAAAACAAGATTAGGAAAACTA
GCTTCCCCCTTACCTTGGCCAATGCTTATATCATAACTTTGGGCAGATCATTATTCTCTT
ATAGGAAGAAGTCATCTCCAAAAACCCAGGTTCACAAGCGTACCAGAATAAGACATTTGG
GATAAAGTAGTAATCCTCAAAACAATCTGTTACTGGCTAAGATGGATAGAAGGATGGATC
AATGGAATAGATTAGGGGTATATGACCTTGGCAATCTAGTGTTTGATAAACCCAAAGTTC
CCATCTTTTTGGATAAGAACTCACTATTTGACAAAAACTGCTGGGAAAATTGGAAAACAG
TATGGCAAAAATTAGGTTTAGATCAATATCTCTCACAATATAACAAAATAAGGTCAAAAT
GGATATATGACTTAAGACACAAAGGGTGATATTATAAATAAAGAAAACAGAATAGTTTAC
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AATGCTTTTTGAGCATTAAAAATTAAAAAAGTTTTGTACAAACAAAACCAATGCAACCAA
GATTAGAAAGAAAGCAACAAAATGGGAAAAAAAATTTTACGATAAATTTTTCTGATAAGC
CTCATTTCTCAAATATAAAAAACTACATCAAATTTATAATACCATTCCCCAACTGATAAA
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GACTTTGCTACTAATAGGAATATAATGATCCAGAACAATTCTGAGGGACTTATGAAAAAG
AAGGCTATCTACTTCCAAAGAACTGTGGGAGTGGGAATGCAGATGAAAGCATATGATTTA
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TAAGTCTCCTGGGAAGAGACACCACAGACACAAAGTAAATTGATACAAAATGTCTATTCA
ACAGTTTAAAGGAAATTGCTGGGAAGGGACAGAAACATTTAATTCTGGGGGGAATTAGGA
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ATGCCCTATATGGGAAAGAGAGAACAGGCCAGCATTGGAATGCAGAATAAGGAAGAATAA
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AATGCCAATTAGGACTATTGTGCTCAAAGGAATAATAAAGTGGAGGAGTTCCATGGAGAC
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ATGTCCCTGAACAATCTGCAGGGATCTAAAAAACACTATCCACAAGCAGAGGATAAACTG
TGGGAGTAAAAACACCGAGGAAAAGCAACTGCTTGATTACAGGGGTGGAGGGGATATGAC
TGAGGAGAGATTCTGAACACTAATGCAAATACCAACAACATGGAAATGGGTTCGAACCAA
GAACACATGTGATACCCAGTGGAATCGTGTGTCAGCTATGGGAGAGGTGGGGGGGGAAGG
GGGGAGGAAAAGAAAATGATCTTTGTTTCCAATGAATAATGCTTGGAAATGAACAAATAA
AATAATGTTTAAAGTGCAAAAAAAAATATATATATATATATATGCGCCAGGCAATATAGA
ATAGAAGAGTTCTATTGGGAGAGAGGTAAATAAGCTCAAACAAAAAAGAGTCCCAGAGTC
TCTAATGTAACAAGCTTCAAATAAATAAGATCAAGGTTCTAAAAAAAAAAATTTACCATC
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ACAGTGATAATGCTGTTTTCAGTACTGAGAATCGTTTTAAGTTTTGCAATTCTTGAACAT
CCCTTTTATCACCCTCAAAAGTCACTTTCTCCTTGTTCTAGTTCTAGTCTTTTGATAATT
TGTCACAACATTCTTATGAGGTGACAGGAATATTATCAGTCAAAGAAATACAGCCAGGTT
CATTATTCTTAGGCAAGAGCTTGGGGGTTGTTCTTAGTTGACTTTTTGAGAGAGGGGAGT
TGGTTATTTGTTCACTGCTCTTGCCAGGTTTTAGAGGATACAAAGAATTATCAGTGTACA
GAAGCAGAATCTGAACTTCCCAGAGGTCCTCAGTGGTTTAAGAATGATAAATGAAACTGG
AGGTAATAATAAAATCATCAATTATTTGATACTCAACCAGTGTGATGATAGTCTTACAAT
ACACTGATACTTCTTTCATTGTTTTTAGGTCTCTTTTCCTCCTTTAATACTGAGGAAAGC
CTACTTCTATACTTTGGATCATCTTCTACTCTATTTTGTGTGCCTGTAAAGAATCTGGGC
CTTATGCAATGATCAGCCAAGTTAGCTTTCCAGGAACACTTCTTTCAGAACCAATCCAGG
GGGATCTTTCTACTAATTTCTCAACTGCATTACTCACAACACTCCAGATTGGGGGCAGCT
CCTACCCCTAGCCTTTTTGCTCTTAAGACTGCTTAGTTTCCTCTGGTCAGTGAGCAGAAC
CAATTTGTCAATAATCTTTCTTTTTTCTTTCAATTGCTACCATTGTGGCTGGAACCTTCC
CTTCTTATCCTTATCATACTATGCTTAGACTACTAAAGTTTTGTGTTCTACTGTTTATTC
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GGAACTATTGAGAATAGGCTAACTATTGGTTCATATCAGTAATGGCAAACCCATGGCACA
GGTGTCAAAGATGGCACATAGTGCTCTCTCTTTGGGCACTCGACCACCCTCCCCCCCCAA
GCCCCCAGAATTTATTACTAGAAATTACTAGAGGGACTCAGGCAGAGCTGTTCCCCTTCC
CCTATCCACTGTGCCTAAGAAAATTTTTTCACCTGCCCCTCTGTCCAGCAGCCCAATGGG
AGCACACAGGGGGAAGGTGGACAGCTCACAGGTGGCAGAGTTGAAGGACAAAAGAGTGCT
TGGGCCACTCCTCTCCCCCTCTCTATACTGAGGACATTTCTCACATCACCCATCCCTCTT
GTCTAGCAGCTCAATGGGAGCACTTTTTCCCTTCCCCTGTAAGGGGTAAGGGGGGGAGGC
ACAGCATGCAGTCGGAGCAGGGGGAGAGGGGAGGGGAGCGTGCGGCACTTGGTCTGGAGG
GTAAGGTAAGGTTGGGGCCTGGCACTCCATCTATAAAAGGTTTGCCATCACTGGTCTATA
TTTTCCTCAGGAAAGTAAGAAGCAAGAGACTTGATCATTAGCTAAAGAAAGAAGATGCTC
TAGGTTTGAAGAGAGGAAAAGATTTGAAATAATTGCTCTGGAGAGTCATAGAAAAATCAG
AGAAGAACAAAGGCTTGTCATGCAACAGCAAGAACCCAATTGAGATTAGATAACAAATTT
GTATTCAACTCAGTTGGCATAGTTACATGCCTTTCAAGGGCTCAGCAGCACATGAGTATT
AATGGAAAAAGAAGATCACAATGGGGTAACCTAGATTTGGGGCTTGGGAAGGGACAATGG
CATTTTAAAACTGCAGGTGATTCAAAATGCAAATAAAATGCAGAATGAATATAATATACA
CTGTCAATACTGACCAGTTACAATAAAGGGTGTAAAAGATTTCATAAAGCTATGTATCAC
TGAAAAGGGGGGCAGGCCAGTCATAGAATAATCAGTATGCTAATTTCCCTGGAAAATGTA
AGCGAGCAGAGCCTTTCTCATATTGTATGAATCTGTTTGTGAAAGATATATACAAAAAAT
ACACAGTATGGGTTACCAATGTCATTTTCTAANAGTCACTACCAGGGAGAGAGGCACTTG
GAGCGAGGCCTCACTGGCCTAGGCACGAGTTTCTTACTCGGTATTTTCTTTAATGCCTTA
TACCGTAGACATAGACCAACGTGAAACATGATATTCCTTGCAGAGTCCGACCAATATCTA
CCTAGGCACAGGGCCCGCTCCTTCTGATACTACTTTACAGGAATGGCTAGGCAGCGTTGC
TGCAGAGTGTGATTGAGAGAAGCTCTTATCATGCGTGTTGAGTGGGTAGGCTGATTCCTT
TTACCTTTACCTCCTAAAGGAAACTATCCTCTGAGGAGACCCCTCATCTTGGAGGAGGCC
TTGTGGAAGCCAAGCTAGATTGAGAAGGCCCCTTGGCCTAGGCCTCTGAACTCCTATATG
GCTTTCCAGAGCAGTCCAATTTCCTTTTCCTCCCTCTCTTCTTCTTAATTTCTTCCTTCT
ATTGTAATTAAAATCACCATAAAAATCCCAAACTGACTCGAGTAATTTATTGGGATTGAA
TTCATCCCTGGCAACTACTAGTATAATATATATTCAGTCAATGACCCCTAATTTTACCCT
TTACAGTCTCTGTGTGACTCTGGGAAAATCACTTAACTCCAACTGCCTAGCCTTTACTGT
TCTCCAGCCTTAGAACCAGTACTTAGTGTTGATCGTAAGAAAGAAGATAAGGGTTCTTAA
TTCAAAGAAAAGATTTGTAGAATCCTATGATCACAATACTGAATGAACATAAATAATGGG
AAATAGATGTTTATTGTTAAAAAACTTGACTATTCAACCATGACCAGAGGGAAGACAAAT
TATCTAAAATAAGGGTTAACCTGGGGTCTGTGTACTTATTCTAAAAAATATTTTTGATAA
TTATATTTTGCTATAATTGGCTTCATTGGTATCCTTATGCAGTTTTTTAAACCCTTACTT
TCTGTATTAGAATCAATACTGTGTATTGGTTCCAAGGCAGAAGAGTGGTAAGGGCTAGGC
AATGGGGGTTAAGTGACTTGCCCAGGGTCACACAGCTGGGAAATGTCTGAGGCCAGATTT
GAACCTAGGACCTCCGTCTCTAGGCCTGGCTCTCAATCCACTGAGCTACCCAGCTGTCCT
CTCCTTATTCATTTTTAAGCATTATCTGATCTAACCAATCCATTGATGGCAAAGGAATGT
CTGACAATTTCAGATTTTATAAGAAAATGCACATACACACACCCCCACAAGACACCTAAA
TGGCAATTTAAGGTTTTCACAGGTATTTACATAACATAGGTATTCTTATTCCAATTTTAA
AGATGAGAAAAATAATGCTGTTCAGAGGCAAAGTCATACCACTAATGTCAGAAAGGGAAT
GCTAAACCAGATCTCTTCCAACTCCTATCTAGCATCCTATCATTATATCACACTGCCAGC
AGGGAGAAGGTATAACAAATGATAAGGATAAATGAGCATAGTGTCTCACAAAACTAAAAA
CAATCTGATTTCATCTTTTCCAGCAAGAAAAAATTATGCAAAAAACTGGAGAAAGTCTAT
ATGCCACACTAGTAAAATAAAGAGCAAATAAAGAACAAATGATAGTCTAGAATACCTAGG
TAAAGAGAAAATTCTTAGTAGTTAAAATGAAAACAAACCACCCTGTAAGAACATAGAATT
TAATGCTGGAAAGGATCTTAGAGAATATCTAGATCAATACTCTGACGTGTTTAAATTTTT
TTCATGGTCTCTTTCTTCTAGATCTCGGTCTAGAAGAAGCAGAACAAGCTTAGAGAAAGT
CAGCTGACTACAAATAGAAAATGCACAAAAATGTAAAAAGTAGCATAAAACTGTTTCTAC
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TGAAGCAAGCTGACAAATATCTTCTTTCTAAAAACTGAGATTCAAAGACACTAGTTCCAA
AGTCACACACTAGTTAAAAGTAAAGGAGGGACTCTGGCCAGGCTTTTTTTTTTTTTACAC
CCGTACCTTCCATTTTAGAATCAATACTATGTATTGGTTCCAAGGCAGAAGAGCAGTAAG
GGCTAGGCAATGGGGGTTAAGTGACTTAAGTGATTTGCATAGGGTCACACAGCTAGAGGT
GAGATTTGAACCTATAGGCCTGACTCTCAGTCCACTGAGCTATCCAACTACCCTCTGGCC
AGTCTTTCTGACATCCAGTGCACTGTCCTTTCCCTATCACACAAGTCTCTACTGTACACT
CCAAAGGAAGGAGAGAACTGCCCCATGTAGGGTGACACACATCTGTGATTTCTACAGCTG
AGAAAGCTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTCTTAAGGAACTTAAACGAAAACCGCCCCCCTA
AGGGTATTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCCAAAAAAAAAACCGGGGGGAACCTTTAAAAAA
AACCCCGGGAGGGGCCCCTGGACAATCCGCCCCGGGATGGGGGAAGAAAAACCCTTTCAA
AAACAAAGGACTTATACTAGGTGAGAATTTCATGGGGTTTCTATCATTTAACAGCATCTT
CCTCTCATTCCCAAATTCAATAACTGTGCTTTGCCTAAAATTATGTGAATCTTCTTTGTT
CTTTCTACTATTAAAACTGAACGGGAACACATGTATCTGTGGATTTAACCAGGAAGGCAC
AGTCCAACAGAAACACCTGACCTGGAGTTAAAGTAATTTCAAACTTTGTTCTCTGCTTGT
TTCCTGTGTGAATCTCAGCATGCTATTTAGAAGCTGTCATCATCTTTAAAGGAGGGGGTT
GCACTAGGTGACTCCTAAGCACCACTTCAGCTGTGAACACTCTGAAGTCAGATCTGCTCA
CTGGAGTACAAAATGGATACGCTGACAAGCAGAGGGAGATTTACCTGACCTTGAGAGTTC
TACAGCAACAAACCCAAGTCAATGGCAATAAGTAGCTCCATGTCAGTAACACAACCCCTT
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