SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001608_2.0
Identity
TranscriptSelenocysteine synthase (SecS)
SpeciesMyotis lucifugus (Microbat)
Transcript IDSPT00001608
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001513_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00001608_2.0 # Transcript # Selenocysteine synthase (SecS) # Microbat (Myotis lucifugus) # Full length # Forward
ATGAACCCGGAGAGTTTCGCGGCCGGTGAGAGGCTGGTGTCGCCCGCCTACGTGCGGCAG
GGCTGTGAGGCCCGCCGCACGCACGAGCACCTCATCCGGCTGCTTCTGGAGCAGGTACCG
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CTCGGCGTCATTACAGGTATTTTTTTTCAAATAGCCTGTGAAAACATTGCTTTCCTTGCC
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GTCCCTCAACCTGGCCTGCATCCTCTCCAATCTGGGACCCCTTGGGGGATGTCCAACTGC
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GCTCCTAACCATTTGCCTGCCTGCCTGCTTGATTTCTCATAACCGCGTCTGCCTGCCAAC
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CCACAACTGCCCTCCCCTGCTAGCCTGTTCACCCCCAACTCCCCTACCCCTGCCAGCGTG
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CCCGGTGGCCCCCAACTGCCCTCCCCTGTCAGCCTGTTCACCCCAACTCCCCTCCTCTGC
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TGCCAGCCTGATCACCCACAACTGCTCTCTCCTGCCTGCCTGATCGCCCACAACTGCCCG
CCCCTGCCCGCCTGATCCCCCACAACTGCCCTCCCCTGCTGGCCCGGTGGCCCCCAACTG
CCCTCCCCTGCCAGCCTGTTCATCCCCAACTCCCCTCCTCTGCCAGCCTGATCACCCACA
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GTTCACCCACAACTGCGCTCCCATGCTGGCCTGATTGCCCACAACTGCCCTTCCCTGCCG
GCATGATCGCCCACAACTGCCCTGCCCTGCCATGACCCATCTCCTCCTCCAGGCCCCACC
TCTGCTGTGTGCATGGCCATCTTGTGACGGCCATCTTGTGAAGACGTGAGGGCGTGATGT
GTGAGGGAGTGACGCCACCTAGGCTATTACTAGTACAGATTATATGTGTCAGTTAAAAGA
AAAACCTTATTGCAGTTAAAACTAACGATAACTAATGTATAACTTGGGTGAAAAATTCAT
GTTAAAAATGGGCTGATAACAGTTATCTGTAAAAAATGCTTTGTACATGAGGTTTTAGTG
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GGTAAACTGGGCTCAGCAGGGTGATGATTACTTTGGGTTTCTCATGTGGTTGCAGTCAGA
TGGTGGCTGAGCGTTTAGTCACCTGAAGGTTCAACTGGGCAGTTTATCCAAGTTGGCACA
CTTGGGTTGCTGGGAGCCCAGTTGCCCTCTCAATGTGGCTTTGGCTTCTCCCAGGAGGGC
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TTAAGGCTTCTTATGCTCTAACTCAGAAGTTCCAGATATCACTTCTGCTACTTTCTTTCT
GGCCCAGCAAGTCTCTAAGGCTTGACCAGATTCAAGTGGAGGGAATTAGACTCCATCTCT
TGGTGTGGCAGTACCATATGGGCATAGGGAGAAAAGGAATTAATGGTGGCCAGCTTTGGA
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TTTTTTTTTTTGGTTATTGCATTGTATACTTATACAGTGGATTACTTAGAACATTGAATA
TTTTTGTCCAGTTGTTGGCCCATTTTTTGCTTAGGTTCATTCATGGAATTGGACGATCGG
GTGATATTTCTGCTGTGCAACCAAAAGCTGCAGGTTCTAGCCTTTTGAACAAAATTGCCA
ATTCTTTGGTCCTGGACATCATAAAGATGGCTGGTATGTACTGTGTTAATCATAATACTT
TTGGCTGACCAGCCACACAAACTTTGCCTACTTTCTTTTATTAATGTCTCTTTCAAAAAG
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GCTGCTGAGCTGTGGTGACTTGGCAGCAGCAGTTCTCGGGTGATGCACCCCGGAGCCAGA
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TGTTGGGGCACTGTTGGCCCTGAATCTGGTTTACTGCCGAGCTGTGGTGACTTGGCAGTG
GAGGTTCTTGGGTGACACACCCCGGAACCAGAGAGGAGGGGGCCATGTGATTTCACCTTT
GGCCGTGGGTTATGTTGTTGCTGGGGCACTGTTGGCCCTGAATCTGGCTTACTGCACACT
TGTGTTTGTGTTGCACACCCTGTATGACAGCAACTTTGCCGAGTGCCCTCTCGCACTCTG
GGGCCCCTTGGGGATGTCGGAGATCCAGTTTCGGCCTATCCCGAAGGCCAGGCTGAGGGA
CCCCACCTGCCAGAGGGTCCCTGCTCACTCCGCAGACGCCCTTCGAGCCATGGCGCCGCC
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GCACTAAATCTACAACTCTTATTATTTGCTAGAAGTATATAATTCCTTCAAGAAGAAAGC
TGGTTTTTCAATGGAATAACTAATTTCTGTTTTACTTCTTATTCCTAGGTGTCCATACAG
TGACCAATTGCTTTGTAGTGCCTATGGCAACTGGTATGAGTCTAACTCTGTGTTTCTTGA
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CCTGCTTTAAATCCATGATCACTGCAGGTAAAAGAAGAGACATGTTGTATACTAGTATAA
TGTATTCAGTATCAGTTAGACATTTCAAACTTTTTATGTAAAGATATATAAATGAAAAGA
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ACAGTTCCATGATAGTAAGTACATTCACATTGTTGTGCAACTATAATCACCATTCATTTC
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CACTGCTCCCAGTCCCTAGCAATCATCATTCTCCTTTCTGTCTCTATGAATTTGACTACT
CTAGAGTGTTTTCCCTTTGTGACTGGCTTATTTTACTTATGCCTTTAAGCTTTAATCCAT
GGTATACTACGTGTCAGAATTTTCTTTTTAAAGACTGACTGACATTCCATTCTGTGTGTG
TGTGTGCTTGTACATGCGCGTGCATGTGTGTGTCAAGTCGAATTTGAGAATTTAACATTA
TTTTTGAATGACTTCAGTGTGTTGTATGAAATGAACAGTATTGGGCTGTAATTGAACTCC
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TGATAGACTTCAAAAAATACATTGATTTATTTTAAATGGTGTAAAGTTATCAAGTCTGTT
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CCTTATTGAAAAACTGAAAACTATTTTCCAAAAGATGTTGGCCTATGATTTACAGTTTAT
TCTTTTTCAGGATAGCCTCTATTCTTAGGAAGCAAGATTATTGTATTTGTAAAAAAAAAA
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AAAAACAGTAAAATTAGCTGTCTTCAGGAAACTTATTAAAGTTTGTATATTTGTTTTAAT
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ATTCTAAAACTCAAAAGAAAACTACTTGCTCTTAACTTTGCTCTAACTTGCTGTGTGACC
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TTTTATTCATATCTGAAATGAAGTGAACTTTAAAATAAAACTTAAGCATTGCCAGAGAAT
GTGTAGATTTATTTTTCTGTGGAGTAGTGATCATTTTTGTCATCAGTGGCTGTTACTACT
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TCAAAGTGCTAAATAGATTTGTGGTCCTAATTGTAGTCTAGTGGTCCTTCACGTTATTTT
GACCTGCCTTTGACTCATTCCAGTGTTGAGCCAGGTCTTTATTGCTAGAGGAGGGTTCTT
CGACCAAAATAAGTATTTAGAGTTCTTGTGTAGAATAGCGCTACTTCCCAGAGTTTCAGG
GTCTTCTCTTATTTAGTTTACACTAATATTTTGATTTCTAATTTGGTTGGTTAGGTTTTG
AGCCCGTGGTGATAGAGAACGTTTTAGAAGGCGATGAGCTGCGCACAGACCTGAAAGCAG
TAGAAGCTAAAATCCAGGAACTTGGGTCTGATAACGTGCTTTGTGTTCATTCTACTACAT
CGTGTTTTGCTCCAAGGGTACCTGACAGGTAAATGATTTGTGAATATTGTCCTTTAGGTA
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GCCTTTGCATTCTGAGAAAAATGCAAATGTTTAAGAAAATAAAAGTAAAGGGGAAAAAAG
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AATAAAATACTAGTAATTTGTTAAAATTATATTGACTTTGTTTACTATTTTTGTAGCACC
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CGCCCCCCCCGTGCACAAATTTTTGTGCACCAGGCCTCTAGTAATTAATAATATAAGAAT
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TCTTTTTCATTGATGGTTTTGCTATCTAGAAAAATTTTAATGTGATAGAAATAAATCACA
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GTTTCTGTCCCATCTTGACTAGCTCTTTTTGGATGTTTACTGTATGCCTGGTGCAGTATT
AAGTATTTTACATGTATGAAGTTTTTTATCAGTAAAATTCTCATATACCACTTTTCAGTG
GTATTATATGGTGAGTATTTCTTACAAGAGTGAACTTTAGGAAAGTGGTGCTGCATCGTT
ATTAGTATGTCTGAATTTCTGGTTTTATTACAGTTAAAAATTTTGATGTCTTTAAATTAA
GCTTAATTCTTTTGTAGTCTTAATTTGGATGGGCAGATATTATCTTTATTAGTTCATTAA
TTGGACAGAGAGCATTGTGGGGCCAGGCCCCGGGCTGGGATGGGGAACCGGGGGTGGGTG
GTGGAGGACTCAGCCCCTTTCCCAGGGGGGCTGAGGGCCGGCTCCTTCCTCGGGGCTGGC
AGCCAACCTCCTGTGCCCTGTCCCTCCCCGCTGCCGGCAGGCCCCGATTGGCCTGGCCCC
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GGGCCTCTAGTTATATGCTAAAATACTGCTGTAGAAATTCCAGTTTTGTCATCTTTTCCT
CATGTACATTAATAACTATTATATTAGTTTTCACACTGTAATTTATAAAGCATAATATGG
ATTGGTCTTTATATTGAATATATTTATGTTTGTAGATTAGAAGAACTGGCTGTGATTTGT
GCTTCTTATGGTGTTCCACATATAGTCAACAATGCTTATGGATTGCAGTCTTCAAAGTGT
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ATCTTAGACTGGAAATGACTTCATTTATAAACATCCTAAAATATAAAAAGCCAGGGGCCG
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GCAGGGGGGTTAGTGAGGGACGACCAAATGACTGAACAGTAGGCTGCATGGGGCGACCAG
GCCGGCAGGGGGAGCAGTTGGGGGCGACCAGGCCAGCAGGGGGGGCAGTAAGGGGCGACA
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ATCCCAGGGGTCCCAGATTGGAGAGGGTGCAGGCTGGGCTGAGGGGAATTTCATGCACCG
GGCCTCTAGTTCTATTATGTAACTATGGAGTAAGAAAGTTTAAAACATTTTTGACTTATT
TTATTTTTATAAGCATCAACTAGATCCCAATCATCTTATTTTGGGATTCTTATTTTGAAA
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TTGTATTCAGGCCTCTGCAGCTCCTCTGCTTTCATTTCCTACTGCTCTCCTCTTACCCAT
GGTCTCACTGCACATGCCTCCTTTCCGTTCCTCTGTCACATTACATGTGCGCACACCGCC
AGGCTTTTGCTCTTGCTCATCCCTCTCACTGGATTGCTCTTCTAGAGAGTCGCGTGGCTT
CTTACTTCACCTTTTTTTTTAGGTCAGTGAGACCTCCTCAGACACCTTATCTAAAATAAC
CCCTCCCTCTCCCTTGCCAGAATTTCTACCCCCCTTTTCCTGTTTTACCATTTTCATTGA
TTTTAAGGTGCACATTTTTTCACTTTATAACATCTCTGAAATAGGGATGTTTTACAATCA
TTGGCATCTTATAATGTTAATTGGCAGTTTTGTTCTTACCTAGTGGTATGTACTAGTAAA
ATAATGTTGCTTCTTAAAATTGATGGCCTCTTGCTCTTTTTCTCCATAGCACTTATTACC
ATTTAATAGGTTATTTTCTTATTGTCAAGTTATTAAGTTTCTGTTAGGGCAAGGTCTTTG
TTTTATTTACTGTTATGTCCTTAACTAGAGGCCCGATGCATGAAATTCATGCAAGAGTAG
GCCTTCCTTCCCCCGGCTGCTGGCACCGGTTTCCCTCCGGCCGCTGCCAGGCACCCGGGA
CCTGGGCTTCCCTTGCAGACCCAGCTTTATCCAGAAGGTCGTCCAAAAGGACATCCAGTC
TAATTAGCATATTATGCTTTTATTATTATAGATAATTAGGATGGTACCTGGTACATAATT
GACACTCAATAATTAGTTACTGAAAAAAGGGAATGAATAAATGAAGCATTATATTTACTT
ATAGTGATTAATTATTCATACTGTATTAGGGTAGGGATAGATATTACCCCTATATGGTAT
GAGTTATATAATTTGTGTGCATAATGATGTTAATCACATTTAGTTTTGAAATACATATGA
TTTAATGTCATGTGGACACAGATTATTCACAGATTATCTGTGGTCTTCTCCAATGTGATG
GTGAATGCTCCTTAGCCCAGTAAATCTTATCTGGTAAATTTTTTGTTTTTTATTATTTGT
GTATACTAGTATCATCTCTAATATACATGTGGTTTATATGATAGTAGTAGCCAATTTACT
AATTTCTTTACTCAAAGGTTGTACCAGTTAGGATATAATTGGCTGAAAGTAACAGAAATT
CCCACTCAAATTAGCTTAACCAGTAAGGAAATAGATTTGTTTACATAAGTCCAGGGGTGG
AGTACTCTGTAGGCACTGTATGTCAGTGTTTTGTAAGAGCTACCATTTCCTTGGAATCCT
TTCCTATTATTCCTTAACTTTTTTTTTTTTAATCCTCATCCAAGGATATGTTTTAATTGA
TTTGAGAGTGAGAGAGAAACACTGATCCATTGCCTCCTGTTCTCACCTTGACCGGGAATC
GAATCCACAACCCTGGTATGTGCCCTGACCAGGAATCAAACCTGCAACCCTGAGCCACAT
GGCCAGTGTTTATTCTTTAACTTTTTAAAAAATAATTCATTTTTTAAAATATATTTTTAT
TGATTTCAGAGAGGAAGGAAGAGGGAGAGAGAGATAGAAACATCAATGATGAGAAAGAGT
CATTGATCGGCTGCCTCCTGCACGCCCCCGACTGGGGATTGAGCCCACAACCTGGGCATG
TGCCCTTGACCTCGAACCTGGTACCCTTCAGTTTGCAGGCTGACGCTCTATCCACCGAGC
CAAACTGGTTAGGGCTTCTTTAACTTTTTAAGGCTTCATCACAATTCTAAACTAGATTGT
ATCTACTTTGAGTGGTAGCAGAAGAAGGTTTTATAATTCTCGATGCTGGAAATCTTAAAA
ATAATTTAATTTCAGTGATTTATTTTTATTCCAACTCCCTCATTCTCCCTTCTCTCCCCT
TTTCCTTAAATTTTAGCAGCTTCAATTCTTTTAAAAGTCAAATATATCAGCATTACTAAA
AGTTTAGAAAAGTGAGAAAGTAGAAGCTTATTTATAACCCTGTTACCTTAACAAATAATC
ATAGTAATCTATATATCTACTTTTTTCTTATTTTATATACGTTTATTGCTCTTTATATAG
TTACAGTAATTGTGTACATTTAGAATTAACTTTTAAAAACAGTGAAAATATATTTAATTT
TAAACTTAAACATAAACTTAAATTATCTCTACATGCCTATAAAGTTTTATAATGATAATT
TTAATGGCTCATTTACATTTACTGCAATGTTGTTTACTAACCTGGAAGTACTCTTTTGGT
GCTCACACATATTTTTGAATACTAGAAATCTGGTGGCATATTCAAAGAGATTAAGACTAA
AAGAAAATGAGCTTCAGGATATAATATAAAAGTTTCCCTTGTAGTTGTGAATCAGGAATA
CTGTACTCTGTCACCACTTCTCTTCATGAGATGGTTTTACTAAAATTTTAATGAGATAAT
AACACTATAAGATAGGTGAATAAATTTTTAAAAATGTAGCTATTTTTAAAACTTGTTGGA
GTTACTGTGTTAACTTCTAAAATTATCATTTATTCACAATAAAATAAAGCAGTACATAAA
CATTCCATTTTCCCCAAAGTTCCCCTCACAAATAGAGGTGGTGGCACAGTTCCTTTGTTT
ATTTATTTATTTTTATTTATTTATTTTTAATATATTTTTTTATTGATTTCAGAGAGAAAG
GGAGAGGGAGGGAGAGAGAGATAGAAACATCAATGATGAGAGAGAATCATTGATTGGCTG
CCTCGACACCTACTAGGACTCGAGCCTGCAACCTGGGCATGTGCTCTTGACCAGAATTGA
ATCCAGGACCCTTCAGGGCTGACGCTCTATCCACTGAGCCAAACCAGCAAGGGCGGCACA
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TTCTAAAAAAAATTAGTTAGCTTTAATTCTCCCTAATAAATTTTTATTAATAATATATAC
TATTTACTCATTACCCACCATGTGCCAAGCATCCTGTTAGACTTTTCAAGTTTGTTAACT
TAACCCAGTGGTCGGCAAACTGCGACTCGCGAGCCACATGCAGCTCTTTGGCCCCTTGAG
TGTGGCTCTTCCACAAAATACCGACTTCTGCACATAGGCCACGAAGTTTCAATCGCGCTG
TACGTGCGCGCCCGCAAGTGGTATTTTATGGAAGAGTCACAATCAAGGGGCCAAAGAGCC
GCATGTGGCTCGTGAGCCACAGTTTGCCGACCAGGGGCTTAACCTAACAATTTAAGGTGT
ACTTCTTATTGTTTTCATTCTACAAATGAAGAAGCAAACTCAGCTGGATTTAGTGACTTG
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TCTTGGGAAGCATGTATTACAATAATGAGGCAACCAGTGAAGCAAGAGCTATAACTAAAA
TGTGTCAGGATTCTCTTTTTTTAAGGGGCAGTGCCTCCAAACGACTTAACGCTGAGCATA
CAGAACATCCTATATGCACATGTAGTCCCCAGGAAGTTAGCTTTGCAGAACCCATACTTA
CGATTATATACTGAACTGACTAATTTAGGAGACTCATGGAATACGGATGTTAAGACAGCT
TAATAGAGGGTAGGGGATATAGTAGAATTACAAAAATACATATAATTAATTCAGACATTT
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