SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001782_2.0
Identity
TranscriptThioredoxin reductase (TR)
SpeciesOchotona princeps (Pika)
Transcript IDSPT00001782
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001687_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00001782_2.0 # Transcript # Thioredoxin reductase (TR) # Pika (Ochotona princeps) # Full length # Forward
GTAGGTCGGGTTCCAGAAACCAGGGGCCTGAACCTGGAGAGTGCAGGGGTGAAAACCAAT
CCTGAAAATCAAAAGATCCTGGTGGACGCCCACGATGCTACCTCCGTCCCGCACATCTAC
GCCATTGGGGATGTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNCTTCCCTGCCCTAGGGAGCCCTTCGCAGAAATAGCAGGGCCCCT
GGCCTGGTAGTGTGCCTTTTCCCAGCCCTGCCAGAAAGCTCCTGGGCAGGTATACTGGCC
CTTAACTCCCATGCCCATAGACCTGATGGCTCAGAACAGCTGAGGTAGCGTTTGTGGCCA
CACCCAGAGAAGGTCCTTTGCTGCCACCCCAGCTCCCAGTAGCCATGGTGATCTCATCCC
CTCCTCCCACTGCTCCCCATGCATGCCCCAGGCACATCTGGGTGCCCTGAGCCCTGAGCA
CCCACCCCAGCATGTGAAGATACACTTGGTCATCAGCTAGTGACTGAGCCCCGACTATAT
CCCAGGGTACTTTTCCTGGGCTTGAGGGGCACTGTGGGAATGGACAGAGCTTCTGTGGCA
TCCTGGTCAGGAGGTCCAAGTGACAGGTGTCAGAGGACTTGCAGGACACAGCAAGCTCAG
CGAGGGCACCTGTGCAAGTACCACCCTACCCACCCACTCCGAAGCCCACTCTGAGGGTGA
GGCTGGGGGAGTGGGAGTGTGAATGTGAGGTCTGTGGGACTTGGTGTGAGGCGACATGGA
CTTAATGCTGAAGGACTGTCCCTTCCTTATCGCCCCCTGCTGCTTCCAGGCCACACCCAG
GCCCGCTAAGGGGTTGGAGAGAGTTTGGCATCCACATGCAAACAGGGCAGGGAGACTGGG
CCTGCTCATCTTGTCCAGCAAGTAACCATTCTAGCAGACTTCAGGCACCCTGCCAACCCT
CCTACTGGGTCCCCACTCAACTCCTGGAGCCCCACTCCCTGCCCAGGATCCCAGGAGGCC
CCTCACCCAGCTGTGACCACCACTAATGGATACCAGGCACCAGCTGCCACTCCAGCACCA
TCAGGCTCAGGAAATGCCATGCGTAGCAGCAGTTCTAAGGCAGGCCTAAGTGGGTCCAGC
TCCCTGGGGCTTGCGGCTGGTTCCAGGCTGAGCCCCTTTCTAGGGAAGTGCCAAACCCCA
GCCCCGCTTAGCTGGGCAGTTGCCAGGTACTGTCCACCGGGACTTCTGCCCGTACTCTTG
GCAGGAGCAGGCCACACACATCTCTGTACAACAGGAAGCCTCCCTCCCAGCTCTCCCCCA
GGGGCTGCAGAGCCCATAGCAGGGCCCCCCTGGGGTGGAGGAAGGCTGCTGTCCTGGAGC
TCCCACTGTAAGTGCAGGAACCTTGTGCATACACAGCAATCTATTAGAAAGGCACCCCTG
CCTGCAGTTGTACAGCTCACTGGGACTGGGAAACCCCTGAGGGACAGGCCATGAGCTGTT
GTGTGCCACCACCGGGGGTTGGGGAGGAGCTGGGGGAGCATGGATGTTTCCGCCATCAGC
CAGGCCTTCCCTCCACCCCACACCGTGGAATGCATGGTGCCCGAGTTTATCTCTGTGGAT
CTCAGCTCATTCCTGGAATGTTGAACAGCAGCTGCACTTCCTGCTAGCACAAGTGATTGG
CAGTCAGGCCCAGGCCGCCACCCCGCCCCCATCCCCGAGGCAGGCACATCCTGGGACGAT
GGACAGGTCTCCGGCAGAATGATATTCTGCTGTGGGGTTTGACACTGGCTGGGCCATGCA
CCTCCAGCTTGTGGAGCACTACCCCTCCCCCAGGAGCTGGGATCTCCTGCTCACACAGCT
AGGGTGTCTTCTGAGCTTCATCACTACTGGGGCACCCTACAGAGGTGAAGGAGGGGGTTC
AGAGGGGAACAACAGGGCTGGCCTCCTTTCCTCCTCTGGGAAGGGGTTGGAGCCACGGGC
ATCCCTGGCAGAGACAAGAAGCAAACCCAGAGGCTGCCTGCTGAGAAGATGGCAGGCATG
GTGCTGAAATAACCCTGAGTTCCTTCCACCAGGGGCGGCCCGAGCTGACCCCTACAGCCA
TCATGGCGGGGAAGCTCCTGGCGCAGCGGCTGTTTGGGCAGTCTGCAGACCTGATGGATT
ATAGCAACGTGAGTCCTCCCCTAGGGCCATGTCCAGCCAGGAGAAGACCCAGGCTCCTTC
TCCTGGGGTGAGGGGGGCCTGTGCGTGCATGTGCATGTATGTGTAGGAACATGTGAGTGC
ACTATATACTTGCATGCAGGAATGTGTGTGACTACACACATGTGTGGTGTGTGTACACAT
ATGGCACGTGATGGCACATGTGTATGTATTTGTATGTAGAAACATGGACATATGTATTCT
GTGCACACATGCTCAAGGCACTCATGCACATGTCTTCACGTGCATATATGTGTGTACAAT
GAGGTCTCGTGTGTATGCATGTGCAGAGGTGTGTGAGCTCATGTATGTGTATGGGGACCT
GTGCATATTACAGATGCATTTGTGTTAACTCATATTTCAGAGGATTGTGCATGTGTGGCG
AGGTATGGGAAGATGCTGTGCAAACAGCCATGCACATGTCTGTACGTGTCTTCCTGTATA
CATATGTGAGCATACATGTGGTTTAGCACCAAGAGTGTGGCCCAGAACAATGAGTAAGAC
CTGAGCCCATGGTGCCCATGGCATGTCAAGGGCCCAGGCCGCCATCACTGCTCTCAGTGT
CGTGCTGTGCGGACTTTCAGTTCTGGGGGCCACGGGGCAGACCTGACTCCAGGTGGGCTT
TGCAGGTCCCCACGACTGTCTTCACTCCCCTGGAGTACGGCTGCGTGGGGCTGTCTGAGG
AAGAGGCGGTGGCTCGCCACGGACAGGGAACAGATTGAGGTAGGAACTGCTGCTGGGCCC
CTGTGAGCTGGGGTCAGGGAGATGTTGTGTGCCTGGAGGGACGGGGCTTTGGGGGCTCAG
TTGAGAAGGGGTTCATGGGAAAGGCAGTTACAACACCAAAGGAAAAAGNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTGCCGGAGTCCCAG
CCCCTCTATCAGTGGGACTGCCCGTCAGGCCGACCTGCCCCCCGGCACTCTATTTGCTAT
TTTTGTTGAATCCGTCTTAAGTGCTCCAGGACACATGTTCCTGGCGCTTTTAGAACGTTG
TTTTAAGTTTCTACATGTTGAATGGCCAAATACTCCATTCTGTTTGTTGTCTTTGCAGCC
CCGTCTTGGCCGGAACAATGTTCTCCGAGGCTGCATTAATTAGCAGTGGCTGTGCCGCAC
ATGTGGGGGTCCCCACCCTGCCCCCCAGCACGCCGCCTCTGGCCTTCATGGTGCTGAAAG
CTCTTGTCCCACAGCTCTGGTGTGGCCGTGGCTTACCCTGGCCCTCGGCTGCCTGGCGCC
TGCCTCCTCCTCTTCCTGTTGCTGCTTGCTCGAAAGAAGGGGGGCCCAGGGGCGCAAGGG
AGCCCTAGGGAGGCTGGGGGACCTGCCCCCACCCAGCAGGCCACACCTCCTCAGTATCCA
CTGCCCACGGTGTCCCTACCCAGTCTGCTGTGCCCACACTTGTGCATGTCTCAAGGTGTG
AGATTGCTAAGACCTGAGCCTAGGCACTCATGCCAGAGGAAGAGGGTTTTATGGGGGACA
AAACTGATGTTTGGAGGTCCCTGCTCTGCTGTGAAACCTACCAGGCCATGTAGCTAGGAC
TGGCTGGTGGCACTTGGGCAGCCTGGCACCTGTTCTGTTGCTGATGGAAACTCACAGGTC
TCCATGGCCACGTAGTGATGCAGTTCCCAGTCGCCTCCTGGACCCCTCCCGCGGCGCTCC
TGCCCACCTTGTTCCCCTCCCACTGCTATGCCCCATCCCTACACAATGTCCCACCTACCA
CACTGTGCTGCCTCCCTGTGCAGTGGCCCCATGATACCCCTTGTGCAATGCACCACTCCC
TGCCACACCCCTCGCCCCATCAATGTCACATCCCCCATGCAATGGCCTCCATGACATGAC
TCTTTGCCCGCTATGCCATGTTCAGCCTCCGATGCAAATATCCTGCTCCCCATGCAATGC
CCCTCCCACCACCATATCCCGCTCCTGCCTAAACAGCCAGCCTGTGACAGGGCATCCTGT
TACCTGCCCCTACCCTCCCCACCCCGCACCTGTTTGACTGTGATTGCAGAGGGGCCTGTT
GTCATTCAGGTTTATCATGCATATTACAAACCTCTCGAGTTCACGGTGGCCGAGCGAGAT
GCGTCCCAGTGTTACATAAAGGTAGGTGTTCCTGTGGGGCTTGGGGTGGGGTTAGGCTAG
GACAGGAAGGAGGAGCCAGATGTGGGGTCCACGTGGGAGTGGTGAGACTTTGGAACGGGG
CGAGTGGGTACCCAAGGCTGAGCCACAACACCCCGGCTTTCAGATGGTGTGCCTGCGACA
GCCCCCACAGCCCGTGCTGGGCCTGCACTTCCTGGGCCCTAACGCGGGTGAAGTCACTCA
GGGATTCGCGCTGGGCATCAAGTAAGTCCCCAGGGTGGCACTCCCTGCTCCCCCACCCCA
TGGGTACCTTGTGCATGCTCATAGAGGGCACTCCTAGGACAGGTTCATTTGGGGGAGAGG
CACTTCCTGTCCTGCCAGGCATAGGGTGTCTGGAAGCGCATGTTCTCCTGGGTCAGAGCA
AAAAGTGGCAGCACCTATGAAGGGTCGTGAACATGACCAGGGTTCTGATGGCCGTATGGC
TTGGAACTCGGAAAGCTCAGACTCTGGGAACTCTCGGCGGCTGTGGCGGTGACTCTGAAT
GGAGCAGGATGTGAGGCACAGGCTGAGAGAAAACAATAGCCGGGCATGGGGTCCCAGAAG
TCGGGGGCCAGGAGGGAAGAGGGCCCATACAGGCGGGTTGGATCCTGGAACAGGGTCAGG
ATCTCCCAGGCTAAGTTCTCTGAGAGGGAATCAGGGAGTACTGGGCCATGGTCATGGAAC
CTGTGTCCTCCCAGCTGTGTAACTGAGCCATCTCTTTGGGTCTTGGTCTAGAGTGACCAT
TGGAAGGTGCCAGGAGCTGGCACAGCCCATGTGGCTGGGGTACACCCAGGGAGCAAGGGG
AGAGACTGCAGGTGAGTCCAGGCCCAGCGTGGGAGGAGCAGCAGGCTATTCCCTCCATGG
ACACTAGCTCTGGTCCAGGAGACACTCACTCTGGGGTGGAGGACTGGCAGGGGACAGGGA
AAGGCCTGGGGCCAGAAAAAGCCCCAGGGACGAGGGGCTACTCTCCTTAATATGGGAAAT
GCTCTGAGAAATCACTAATAACAGTGAAGGACAGAGCAGGGTGCCTGGTTGGAAAATGCA
GGACACAGATAGTCTACACACAGAGAAAGAAAGTAAAGGATAGAGAAAAAGTGCCGTGCC
CTGGGAACCCAAGGTTTAGAACTTGGGCTGCCAACAGCTAGCTCAGCTTCTGAGGACTAA
AAGGGTTGGTACCTGGGGAGTCCCTGGGCACTGTGCCCCCCCCCCCCCGAGGGCTGGCTG
CTGCAGGCTAAAGAAAAACATGGAAGTGGGGGTTTGGGAAGACCACACAATGCCCAAGGC
CTCCCCAGGGGCAGCCTGGCATGGACGCTGACACCCTTACCCCCCGCCCACGTGCAGGTG
CGGGGCATCCTACGCACAGGTGATGCGGACTGTGGGCATCCACCCCACCTGCTCCGAGGA
GGTGGTCAAGCTGCGCATCTCCAAGCGCTCAGGCCTGGACCCCACCGTGACGGGCTGCTG
AGGCTAAGCGGCCATCCCTGCCAGGCTGAGGGCACACGGCTCGCTGCCCCTTGGCTCCTC
AAAGGGCCCAAGACCAGGTACACAGGAGGGGAAGGTGCTGTGAGGACAGAGCGTGGCTGG
GGGAGGGCTGTGACAGTTCCCAGTAGGTGTGTGGACAGCAAGGCTGCACCTGCCAAGCCA
CGTCTCTCATGCCAACACATGAGCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGCCTAACCACCCCCCTCACTCTCCCACCAACACCA
GCACAGTCCAATGCAGGACTTGGTTGGGGGAGTGCAAGCCGGGCCCGCCTTGCCCCTCCT
CCAAAGAGCATGGACCAGCCCAGATGCCCACATGCCCTGCAGGGATGGCTTCAGGGGATC
TGCAGCCCCTTCTCCTGCACCCTGCCACCCCCTCGCCGCCAGCTGATGACGCCCTGAGCA
GAAACCCACCCCTGTGGGCCGCCCAGGTCCGAACTCCTTGGCGTCT
Chart Advanced