SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001819_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein I (SelI)
SpeciesOreochromis niloticus (Tilapia)
Transcript IDSPT00001819
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001724_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00001819_2.0 # Transcript # Selenoprotein I (SelI) # Tilapia (Oreochromis niloticus) # Full length # Reverse
CTGTGCGACGACTTGTTCCCTCAGAGTGAGCCCGCTCCGTTAGCGGTTTTTGGACCCACT
CTTCATTCAAGTGCTACGCAACTTTACCACACACCATTGCCATGGCAACAGTTGAATCAA
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TGTTGCAATGGTGATTGGTCCCTTATATTTCACACACATACATCCAGGATGTCATGTATA
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ACTTTGATCGCACTGTCACTCCTAGATACATGGAAGAAGGGTGGGATCTTCACTTTTAGG
GTTAACTATTGTTTTGTTTTTTTAAATACACTGTTCTTACAAAAGCTGGGCTCCCCAGTG
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GACTCTTGCTTTTGCTGCTGTGTGAAGCAGTAAAAACAAGAGGTATTAGGAATGAGCCTG
AATACCCACACTAGGGTTTTAAAGGAAGAAGAAACTTGACTGAAATAATGCAAAATATAT
AGAAAAAGTTGTAATGTTATAGCACATGTTAACAAAATGAAGATATTCAAAGATCAACTT
ACTACTTGAAATACTCCATGACTTCCATGCCCTTACAGATGAGCGCATTTGTAATAGTCC
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TAATTGTATTTAGACGTTTTTAATGTGTGTCTTTGTTTCTCATATCCTACTGGATCCAAT
TGAATGGTTTCCTCTCCACGCTACCATTACAGCTGTTCGTTAGCAGTTTATTTCATTACA
GTGGCTGAAATAATAAAAAGAAATTAACAGCTGGAGTCCAATAAAAAAGGAAATAGATAA
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AGGAGTCGCTAGCTGTTAGCGCATAAGCACCAAATGTAAAGTAAAACACAGAAAATAAGG
ACACTTCCGAGCAAAATTTTCAAAACAAAAAACGTACCATTGGTGAATATGAGATAAGCT
ACGTTACGGCTTTTATTTTCAACAGGAACAATGGGAAACATCCGGTATCGTTCCGTAAAC
TCCGAGTACCTTTACATATTTTTCAGGGGAAGCACCCTGCAGATCGTGACAACTAGCTGC
TAAACGCACAGAACCTGTCCGCTCAGCGGCTAGCTGCTAGCATGCCATTGTAACCTATAA
ATCATACCTTATATTTGTCGAAGCCCGCAAGCTGCTCCTGAGTGACATATTCGTA
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