SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001847_2.0
Identity
TranscriptThioredoxin reductase 3 (TR3)
SpeciesOreochromis niloticus (Tilapia)
Transcript IDSPT00001847
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001752_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00001847_2.0 # Transcript # Thioredoxin reductase 3 (TR3) # Tilapia (Oreochromis niloticus) # Full length # Forward
ATGCCTCCCGTCGAAAATGACAGCGGGAAGAAGGAACTCAAATCTCAGATACAAGAGCTT
ATCGACTCCAATCAAGTGATTGTGTTCAGCAAAAGCTACTGCCCATTTTGTGTGAAGGTA
AGGCGTTTGGTTTGTCGTAGACGGTAGACGCTCCGCGCCGGTCAGAAACTTCCACCTTCT
AACGCGAAGTACACGGGCTTGGTCTAATTGCTGGTTTGGCCTTGCTGCGTTAGTACAGTC
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AAGTCAACTTTACGTATCGTATTGTTCTTCGTTAACTCTGCTAGTGATTAGCTACAATGC
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GTTTCAAAGCCCTTAATTTAATATATTACATTTTCACAGTAGTGAATTTGCTTTTCTGTT
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ATTTAGCTCCGATTTGACTGCTTTGTGTGAACTGGGGATCCCACAGACAGCCGTGCTTTT
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GTGTAAATGACAGGAAAACAGAAAAATGTGAAGGCTAAAATGTGTGATCATAATGAAATG
TAGTGCAAGGTGGTTCTTGATCTGTGGTTTGTTGGTGATTTCTCAGAACTAGTGTGAAAC
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AGTAAAACGTTTGACGCAGGATTTGTCTGGATCTGTTGTGGCTGCTAAACGACAGTTTTA
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GGGTGACATCGCACCAGCTTGCCGTGGTAAATCAGAGGCGAGCCCATTTAGGAGGCACCC
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AGGTTTAGTCGTTTCATAACTGAATAAAGTCTTCATTTGCTCATGTTACTATCTCACAAC
CTGTTACTAATCTGTGTAAGCTGTCATCTTAGAAATCATCCTGTTGAATTAACTGTTATT
TTCGTCTGTCCTGAACAGGCTTTTCAAAAATACTTATCGGTGTTTAGAAGTTGTTGGCTG
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TGAAAAGACTTCCTGTTATGTTGCATGTGTATCAAATATTTGTTTGTGTTTCCTGACAGG
CTACAAACAAACGAGGGAAGGAGACGTTCTACACAGGAGCCAAGTTTGTTTTGGCTACGG
GTGAGAGGCCACGTTACCTGGGCGTTCCCGGAGACAAGGAGTACTGCATCACCAGGTGAC
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GTCACTTGCTAAGGGTGTGATCTCTGAAAACAAACCTGCCCTTTAATGATCCAGCAGGTT
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GTTGTCAGCTACTGAAATTAAGCTACACATCCTATAGCTTACGCCTGAAAACGGATAGGA
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ATAATCCAGTGTGGCTCAAGGCTTTAAATAAGGATTAGATAGCATGTCTCCACACCCTGT
GAGGTAAAAAGAAAAAATAACCTGAAGATCTAGATCAGAATCAGCAGAAGCCAGTGTCAC
ACCTGCTAAATTCTTTGTATGCAAATCTAGCTGCACAAAAACCTGCTTTAACTTCACCTT
ATTTTTGTTTGTTTTTTTTACAGTGATGACCTCTTCTCGTTGCCTTATTGCCCGGGGAAA
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GGGCTCGACGTCACCGTCATGGTACGGTCCATCCTGCTGAGGGGCTTCGACCAGGACATG
GCCAACCGCGCTGGCGAACACATGGAGGGGCACGGTGTTAAGTTCCTCCGTAAATATGTA
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AGGTCAACATTAAAAGCCTTTGATTTATAGTGAACGCAGGAGGTGATCAGTAGACTCTGA
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GGAGCTTGAAGCAGGAACTCCTGGCAGGCTGAAGGTGACAGCTAAGTCCACAGAAACCGA
CGAGATCATCGAGGGAGAGTACAACACTGTATGTATCGCTTCGGTTTTCCTTCACCCCTC
TCTCTGCTCCGTCGTCATGTATTTCCGTCACAAGAGTAATCTGTTTCTCTCTCAGCTTAT
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CGAGACGCATGCACAGACAAGCTCGGCCTGGACAAGGCAGGAGTCAAAGTCAACCCAAAG
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CTGGGGTCGAGGTCTGAGAAACTAATGATTGTGACAATCTGGTGTGTATTACCAACACAT
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TTTTTAAAAGTCTGCATCCAAATATCACGTGAGACTTGACCTCTGACCTCACATTTACAT
TTCACATCTGTCTTTCTGTCAGATACTGTAGTATAATATTTTACTGCACTGCAAACTTCT
TGAAGACCAAAGAAAACACAGTGAATATACAGAAAATACAATTAAAAGTAAACACCGCCC
AGGGTGAGCTGGCTTGATGGAGGTTTGTGCTCTCTGAGTGCTTGTACATGTGTTCCCCTG
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ATGAGAACACTGCTGTATATCACATTGGTATTAAGTGACAGAACAAAGGAAGTATCTATA
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TCCACTCTTGTGTGAATAACTGAATGGCTGAGCCTGTGTTGTGAGGCCTGCAGAGATTAA
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AGCAATTTTTAGTTGAAGCCCACCGTTAGCCAGAGGGCTTCTGTGCTCAGAGGCCTGTGG
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TGCTTTGTCACTGACACACCGCATAAACATTTGTGTGGTGCTCTTTAACCTTGTTTCCTG
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AAATGAATTTGTAATTTTCTATTATTGTTACACCCACTTAACTTTGAACTTCAACAGTCA
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CCAGCCTGAGCTCCTGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTATGCCACTCTGCAGGATC
GAGTCATCGGTTTCCACTACCTAGGACCAAATGCAGGAGAGGTGACCCAGGGCTTCGGTG
CAGCCATGAAGTGTGGTGTCACCAAGGAACAGTTGGACACCACCATCGGCATCCACCCAA
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CCCTGCCGGGTTGGCAGGTGGCCTGGACACCCAACTGGATACGAGAACAAGACGACACAG
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TTCAACCAATGAGAAGATGCCTGTGGCATTAAAGATGTTAATTATGTTCCTGTGTCCTCT
TTACCTTCTAGGTCTTTACCACTCTGGAGGTAACCAAGAGCTCTGGTGGAGACATCACAC
AGTCCGGTTGCTGAGGTTAAACCCTGCTCGTTTAGCAGGCTGCTCTCATGTTAGACTCCC
CTACTAAACCTTTTCCTCTTGACTCCCAGTCAACCTTAACTTCAGCCTCACCTCCAGCCC
CTCCCTTTACAGGGCATTTATTTCTCAGGAGCACCTGAACATGTAAAACACTCAATCTGA
CTGGGAGTTATGAGGTAAATGGAGTTGGTCAGGGCTGAAGATCTGCATGTCTTCTGCTCT
GGCTGAGGGAGTCTGATGTGAAAGCTGCCTGCTGAACAGCGGGGTTACTCTGCTGATGTT
TCTATTGGGCCCCACCAGCGTGTCACTCTCAGAGAAGCCCAAACACACACCATTCCTCAG
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GATCGATGT
Chart Advanced