SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001888_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein U1 (SelU1)
SpeciesOrnithorhynchus anatinus (Platypus)
Transcript IDSPT00001888
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001793_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00001888_2.0 # Transcript # Selenoprotein U1 (SelU1) # Platypus (Ornithorhynchus anatinus) # Full length # Forward
TCTTTCTCCCCTTTCTTTCCCCCCCGGACTTTAGGGATGCCTTTGCCCCCGGACCTGGGG
CTCTTCAACCTGGGGATGTGGTCCGTTGGGGTCGGTGCCCTGGGAGCAGCGGCGGTGGGG
CTGCTCCTGGCTAACACCGACCTTCTGCTGACGAAGCCGGAGAAGGCTACGCTGGAATAC
CTGGAAGACACAGAACTGAAAACCCTGGGAAAAGGTGAGTGCTGAACTCCTAGGCTGGCC
CGTCAAAGGGCAGGGACTGTCTCTATCTGTTGCCGATTTGTACATTCCAAGCGCTTAGTA
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AATAAGCGTATTGAGAAGCAGCGTGGCGTAATGGATAGAGCCCGGGCCTGGGAGTCAGAA
GGTCAAGCGTTCTAATCCCGGTTCTGCCACTAGTCTGCTGTATGACCTCGGGCCAGTCAC
TTAACATCGCTGGGCCTCAGTTACCTCATCCGTAAAATGGGGATTGGGACTCTGAACCCC
ATGCAGGACAGGGTCTGTATCTAACCCGATTTGCTTGTACTACCCCAGCGCTTAGTACAG
TGCCTTGCACATAGTAGGTGCTTAACAAATACCAGAATTATTATTCATTCAGTGCTTACT
CTGTGTCGAGCACTGCGGTGAGCGCTGGGAGAGAGCGACCAGGTGGGAAATAACCATGGT
CCCTGTCCTTCATGGGGCTCACAGTCTAAAAGACTGATACCAAGTTTCCATGGAAGCCTG
ATCTCTACCTCAGGGAAAAGCTCCTTCTGGGCAGGGAACGTATCTACCGACTGCTACATT
CTACTCTCCCAAGCACTCGGGACAGTGCTCTGCTCAATAAATACCATTAATTGATTGATT
GCCTTGGATTTTTTTATGGTATTTGCTAATCTGTGTATCAAGCACCGTTCTAAGTGCAAG
TTAATCGGGTCGGACACATTCCCTGCCCCATTTGGGGCTCACAGTCTAAGTAGGAGGGAG
AACAGGTATTGAGTTTCCATTTTGCAGTTGAGGAAACTGAGGCACAAAGAATTGAAGTGA
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CTCCCAGACCCATATTTTATCCACTAAACCACGCTGCTGCCCACTTAGGATTTGCTTCGG
GCTTTATTGTCCCACAGCATGTTCATGTTAACGATCTCATTTTATTTTCCCCAAATTCCT
GTGAGGGAGGGGAATGCAGTGCTGATTATCCCCATTTTACAGATGAGGATACTGAAGACC
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ACTTTTGACTCCCAAATGAAGCCTCTTTTTGGTAGGCTACGCTCCTCTGTAGTATAGATT
GAGTTTAAACCTGAATGATCAGTCTGGTGCCCAGAGTGGCACATAACGCTGAACGTGTCT
TTCTTGCCAGAATCGGAACCGAGAACGTTTAAGGCCCGAGAGCTTTGGCAGCGTAATGGG
GCCGTGATCATGGCTGTGCGGCGTCCTGGATGATTTTTGTGCAGAGAGGTAGGTGGCTTC
GGGGCTCACGTGACCCGCCGACTTGCAACGGTAACTCTTTATTTCCACTGGCAAATACAC
GGCTTGCTCAGAGCATTCGGTATTCGTTGGGTACAAATATCTTGCAGGGAGACATCCTGA
AGGTTGTGTCTCTCGAACCCCCCATGTTTATAGGGATGGGGACATGGGAGTGCATGAAAG
GGGATGACCTCGTCTACGCTGACCATCGCAAATGTGGCGAACTCTAGCCTGGAAGCTTGT
TGTGGACAGGGCTGCCAAATCTGTTATATTGTACTTTCCCAAGCGTTCAGTACAGTTCTC
CGCCTACAGTAAGCAATCAATAAATACCACTGATGATGATGATGATTCTGTGATTCCCTG
CCAAGTGGGAAGTAGAAGCCTTGCTTTCAGGTTCCAGTTGTGTGGCTTCTGCTCTTGGTT
GTGTTTCATGACAGCATGTCCATTACCCTCCTTCCTTCAAAATGGTGGTGAGATCCTCTT
AGCCACAAACCACTAATTTCTCCCAAACCGGACACCCGTGTGCAGACCAAAAGCTTTCCA
AAGCCTTTCGATCATTAAATCTTGGTTTTCATTGGTCTGTTGCTTTTTGCCCAGGCAGAG
AACGTTATGGAAACTTTTTTTCTGTTCTCCAAAGGGTGGGTGGATGGGTATGTGATTTTT
TCATTTTAATTAAATTAATTGCGGGGTGTTCTATAGGCCTGCGGGAATAAATCTATTTTT
TTTCCATTTTGCATGCATGCGTTTTAGAACTCACTCAGAGATAAAGTCGGAAGCTTTGAA
GTAGGCCTTGTAGGTCATGGCGTGGCTGGTCTCTGGTTGATGCTCAAGGTGGTCAGGTTT
ATTAGTTCAGCCAAGGCCTGGTTAAATTTTTTGTTGTTATTTTATTATTAATATTATTAT
AGTTATCCTTAAGTGCTTACTGTGTGTCGAGCGCTGTTCCAAATGCTGGGACAGATACAA
GTTAATCAGGTTGGACACAGTCCCTGTCCCATCTGGGGCTCACAGTCTAACTAGGAGGGA
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ACATGCCCTTGGTCACACGGCAAGCAATTGGCAGAACTGGGATTAGAACTCAGGTCTTCC
GACTTCCAGGCCTGTGCTCTTTCCACTAGGCCGTGCTGTTTGTAAATTTGCAGGTTACAG
GTGCACTTGCTTTATCTGGAAAAATAGTCCTTGGTGTGACCAGGAACCCGTTACCCCAAG
GCACCTCCAGCCCCATCCATCCTCTTTTCCGGTGATCAGAATCTTTGGAATTGCAACTTG
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GCTGTCTCGCGGATGTTGTCTGGTGTCCTATAGACTGAAAGCTCCTCTTAACCGTAAGCT
CCTTGTGGGCAGGGATTGCATCTATCCAAAGCTGAGAAGCGGGGCGGTTTAGTGGATAGA
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GTGTGACTTTGGAAAGTCACTTAACTTCCCTATGCATCATCTGTAAAATGGAGATTAAGA
CTGCGAGTCCCATGTGGGGCATGGACTGTGTCCAAACTGATTAGCTTGAAACTCCAGCAC
TTAGTACAGTGCTTGGCACATAGTAAGCGCTTAATAAATACCATAAAAAAACTCTGTCCA
ACTGTACTTTCCCAAACGCTTAGTACAGTGCTCTAGTTAGTTGAATGCTCAATAAATACT
ATTGGTTGAGTGGATCCCAATCGTCACCCTGGCCATTAAAATAATTTCCCTGTCGAAGTT
CCTGGGTTGGCACCTCGAAAGCCGCAGTGTTCCGGAAAGGAACACCATTCCGGAAAGGAA
CCACCCAGTTCTACGGTCCTCTCGATTTTTCTGAGAGCTAAGCCCTTCGGGTCAGTGGTC
TGGGTGTCAGACCGATTGGACGTGTGCTGGAGGTCCCTGCAGACTCGGAGTCTCTACAGG
GGCATGGATTTGCAGCCCTTCTCTGTCTCGCTGTCTTCCAGGAGGCCGCAGAGCTGTCCT
CTCTGAAACCTCAGCTTGACCGGCTGGGGGTGCCCCTCTACGCGGTGGTGAAAGAAAAGA
TCGGAACCGAAGTGGAGGATTTCCAGCCCTATTTCAAAGGAGAAATCTTTCTGGATGAAA
GGGTGAGTCTCCTTCCCCCGTCGATTGCTGTACAGAGCCAAGTTAGAAGGCTCTGTGGCG
GCGGAGGGTGCGCTGGTGGCCGAGGTGCGAAGCTCAATCGCCTTGGCCTGATGTCGGTTG
GGCGTTGGTGTGGCTTCAGCTTCGTTAATCGGGCTTAGCGTTCTATAAATGCCTCTGCTG
AGCTTTCTTGCCAGCCGAGTGGTCTTTCGGCTGCTCGATCCTGATGACATGCTCTTACAT
GACTATCTTTTTCTTGCCCCATAGCAACAGCAGTTAGATTATGAAAAGCACCTTCTTGTG
GATTGTCCAAGCCCTTCTTGAACTGTGACTCAGTGGGACGTTGCTAAAGCAAAAGTCACG
TTCTACCGGTCGTGAGGATGGATGGGAGGGAGAGCAGCTGTCGCTGCCGAGATGTTTTTG
TTTGGAGTTTTTTTTATGGTATTTGTTAAGCGCTTCCTATGTGCCAGGCATTGTTCAAAG
CGCTGGGATAGATGCAAGAAAGTCATGTTGGATTCGGTCCCTGTCCCGCATGGGCCTCAC
AGTCTTAATCCTCATTTTACGACCGAGGTAACTGAGGCACAGAGAAGTGAAGTGACTGGC
CGTGGATCACACAGCAGACAAGTGGTGGAGCTGGGATTAGACTCCAGTTCCCTCTGATTC
TCAGGCCCAGGGCTCTACCCACTAGGCCGCACTGCTTCGCCAAGATGTAAGCTCATCAGG
TTGGACGCAGTCCATCTCCCACGTGAAGCTCACAGTTCCCTTCCCTCATATACTTGCTTC
CCCCGGGGACCCACTTTCAGGTGTTCAGAGTTGTTGGGCTCCGCTCTTTCCTCTCCCACC
TTGTAAAATCGGCGATCACTAGGATCCAGTGAAATCTATTCGAATGATTTCATCCAGTTT
TCTGGGCTAACCTTGCGGAAGAATCTCTTTCCCTCCCGTCTGTTTTGCGGGGGCTTCCCT
TCCCGGCTCACAGAGGGTGTGAGTGTTTTTCTTGTTAATTTAGGCGAGAGCGTGCATTTG
GGCATTTTATAGGCATGCCATTGGTTCAGATCCTTCTGGAGCCCTTCTTGGCTTGATAGT
GGAGGGGAGTGGGTGCTTAGATAGTGGGCTCTTAGAAGGTCATGGATTATCTTTGTGTCC
TTTCAGTAAGGTGACCAGAACTTTTTGGGTTGAAAGTAGGTCAGGGGCAAAAGGGTGGAG
GTCTCAGGAGACCTGCATGTACGCGCCTGCACACGCAGACAGACACACCCACACACGCGG
CGCTCACCCAGATTCTGTTGCTGGATGCGCATTGCGGTACCTCAGGCTAGATCCTGGAGA
TTTTCTGGGTGGCTGGAAATTCTTGAACTTGCACACGAAGGAAGTTCGTGGGGCTTCAAG
GCCGTGTCGGTTAGGCATCTCACCTCCCAAATATGCGCCACGGTCACAGGCTCTCCATGC
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CTGAGGTGATGACTTATCGTACGATCGTTTGTCCTTGCAGAAAAAATTCTATGGTCCCCA
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GGCCCGAAACAGGGGCTTCTCCGGTAACCTGGAGGGAGAAGGACTGATCCTCGGAGGCGT
GTATGTCCTTGGGGCAGGCAAACAGGTATTCTGCTCTCGCTGATATTCACCATTCCCTTA
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ATCTTCCTCTTCCCAGCAAATCAACCTCCCCTGGCACCTCTGACATCCCTCCAGGGATGA
CCTGCTCCCCTTTTCTCTTGGGGACCCGGGGAGCCCCTGTAGGGCCCCGGGCCAGGACAA
CAGCCTCTCCTGGCTCTCCTGCTCCAGGTTCTTCCCTGCGTGGTTGGATTGCTCTGAGGC
AGACCTTTCATTCATTCGCTCGTGCTCATTGAGTGCTTACCTTGTGCAGACCACTGTACT
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GTGGGAAGGGGAAAGAAAGATCAGATTTATTATTCTGGTTTATTTAGGAAGCGGGGCGGG
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CCCACCGCCGCTCTGAACCTGGCTTCTGGGGATGGGGATGTTTAATCTCTTCCTCCAGTG
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AGAGGACGTGAGTTCTAATCCCGGCTCTGCCATTTGTCTGGTGTGTGACCTTGGGCAAGC
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AGGGACTCTTTTTGTCCCCTGTACTTCCATTCATTCAGTCATATTTATTGAGCGGTTACT
GTGTGCAGAGCACTGTACTAAGCGCTTGGAAGAGTACAGTATAGCAAGCAGACACAGTCC
CTGCCCACAATGGCTTAGAGTCTAGAGGGGAGACAGACATTAATATAAATGAATAAACTG
CAGATCTATGCATAGGTACCGTGGGACTGGGAGGGGGGATGAATAAAGGGAGCAAGTCAG
GGTGACGCAGAAGGAAGTGGGTGAAGAGGAGAGGAGGGCATAGTGCTTTCCTTCCCAGCG
TGATGATGGCCAACGTATATATCTGTAATTCACATTATTTCTTTACGTTAATGTCTCCCC
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AGTGCCCATGGGGCAGACGTGAATGTTCCCCTGCCTTGCCTGGCTTAGCTGGTTCACCGC
TTGCCTGGGCACCGGGGAAGGGAGAAGGGCAAGAACAGCTCCAACATGTCGTGGGGAAGA
CTGGGGGGATCCCACCGTTCCCCAAGGCGTGGCACCATCCTGCCAGCAGAGGCCAAGGTG
TGGAGCCACCATTTTGACCCTCCTTCGGTCCCATTCCAACTCAGAGGGGGTGGAGCGGGC
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AGACACGTTCCCCGCCCAACAGGAATCTACACTCTAGAGAGGGAGACAGACATTAAAATA
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GGGATTGGCTTACAGGGGGTGGCAGCATTATATCTGCAGAGCTGGGCCAACTGGAGGCAG
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GAAAAAAGCCCCAGCTGCCCCCAGGACTAGGTAGGGAGGAGGAGGAGGAAGGTCCCACCC
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TTTTGGGGGCTGGGACGAGTGGGGATAAGAGGAGCTAGCTGCCTCTGACTCGTTCCCAGA
GCCACCTACTTACCCTGGAAGCGCCCAGCGGCTTGCCAGGCTGGGCCAGGGTGACCAGCA
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ATTCTGCATTATAATTTTATGTATTTACTGCACCAAACTCCATTCACTGGGACTTTCGGA
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CAGGCACAGAGGAAGTGAAGCGACTAACCCGAGGTCACCCAGCAGGCAGGCGACGGAGCC
GGGATTGGAACCCGGGACCTCCGACTCCCAAGCCTGTGCTCTGGGCCCTCGGCCGTGCCG
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GGGATTTACCGAGTCACAGCAACGGCAGCTCTCAAAATGGGGCATTCGACTCGTCCTTGG
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CCCCTTGGGGAGAGTGGAAACCCTCACAGCCTGCTAGGTGGGGGGAGATTTTTTTTGCTC
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CTTGTTGGCAGGGATCGTGTCTATCAGGTCTATTGGATTGTACATTCCTGAAGTGGTTAG
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TGATGTCCAACTTAGCTAATACCTTTTCACGCCATAATAATAATAATAATAATGATGATG
TTGGTATTTGTTAAGCGCTTACCATGTGCCGAGCACTATTGTAAGCCCTGAGATATTATT
CTAGCTAATCAGATTAGAAACAGTGCCCTGTTCCTCAAGGGGCTCCCACTCTTAATCCCC
ATTNNNNNNNNNNCACATTTCAAGTGCTAGTACAGTGCTCTGCTCATAGTAAGCGCTCAA
TAAATATGATTGAATGAATAAATGAATTCCCTCCCAATAGAATGGTTGACCGTCGGTGAA
CTGTCATCCAGCATGGCTTAGTGGAAAGAGCAGGTCTTGGGAGTCAGAGGTCGTGGGTTC
TAATCCCGGCTCCGCCATTTATCGGCTGTGACTTTGGGCAAGTCGCTTCACTTCTCTGTG
CCTCAGTTACCTCATCTGTAAAATAGGGATTAAGATGTGAGCCCCACGTGGGACAACCTG
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CAAATACCGTCGTTATTATTCTAACACCAAATGGTGGGCACGAGTTTAAATGAAGAACAA
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AGGGATCGTGTCTATCAGGTCTATTGGATCGTACATTCCTGAAGTGTTTAGTACAGTGCT
CTTCATACAGTAAGCATTCAGTAAAACCGTGAAACTCTCTGCTCATCCTGCAAGAGCAAT
TGGCATGTTGGGGTAAATTGAGGCTTGGGGAAGGGATTTGCAGAGGTTTCTTGATGTCCA
ACTTAGCTAATACCTTTTCACGCCATAATAATAATAATAATAATGATGATGTTGGTATTT
GTTAAGCGCTTACTATGTGCCGAGCACTATTGTAAGCGCTGAGATAGATACAAGCTAATC
AGATTAGAAACAGGCCCTGTTCCACAAGGGGCTCCCACTCTTAATCCCCATTTTACAGAT
AAGGTAACAGGCTCAGAGAAGTGAAGTGACTTGTCCAAGGTCACACAGCAGGCATGTGGC
AGAGCCGGGATTAGAACCCGTATCTTTCTGACTCCTGCGCCTGTGCTCTATTCACTAAGT
CATCAGTCGCATTTATTGAGTGCTCACTGTGTGCAGAGCACTGTACTAAGCACTTGGAAA
GTACAGTTCAGCAACAGAGACAATCCCTACCGAACAACGGGCTCACAGTCTAGAAGGGGG
GAGGTAGACAACAAAGCAAAACAAGTAGACAGGCATCAATAGCATCAAAATAAATAGAAT
TCTAGATATTTACACGTTAATAGAATAAATAGAATAATCAATATGTGCAAATGTACACAA
GTGCCGTGGGGTGGAGGAGGAGGGTAGAGCAGAAGGAGGGAGTCGGAGCAATGGGGAGGG
GAGGAGGAGCAGAGGAGAAGGGGGACTCAGTCTGGGAAGGCCTCCTGGAAGAGGTGAGCT
CTCAGTAGGGCTTAGTTTGGCAGATGTGAAGAGGGAGGGCATTTCGGGACAGCGGTAGGA
CGTGGGCCAGGGGTCGACGGCGGGATCGAGGCCCAAGGAGGTTAGCGGCGGCAGAGGAAC
GGAGTGTGCGGGCTGGGCTGGGGAAGAAGAGAAGGGAGAGAAGGGAGTCACACTCCTTCA
CCAGTCCACCCATTTCTGGGACTGCAGAGGGCAAGCCCCTAGGCTTGGTGTGTGTATGCG
TGTGTGTGCACGTGTGCGGGAGGGGCAAGGTGCAGCTTCATCTCTCCATTTAGAAAGTTT
GGCCCTGCTGGGAATTTGTTTGCCTTTTGATGACTCCCTGGGTACTCACCCTTCCCAGAA
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TGCGACAGAGCAAGAATAGTTCTTTTCTTCGTTCATTCAATCGTATTTACTGTGTGCTTA
CCGTATGCACTCTGTGAAGCGCTTGGGAGAGTACAATGTAACAATAAATGGACGTATTCC
CTGCCCACAAGTTTACAGTCGAGAGGCGAGACAGACATTAATATAAATCAATTACGGATA
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GCAGAAGGGAGTGGGGGAAAAGGAGATGAGGGCTTAGGGAAGGTCTCTCGAAGGAGACGG
GCCTTCAGTAAGGCTTTGAAAGCAGGGGGAGAAATTTTCTATCATTATCATTATTATGTT
CCAGAATTGCCTCCCGGTACAAGGTTAACACTCAAGCTTTTCTTTCCCTTTGCAGGGCAT
TCTGTTGGAGCATCGCGAGAGAGAGTTCGGAGACAAAGTAAGCCCTGCGTCTGTTCTCGA
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