SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001899_2.0
Identity
TranscriptIodothyronine deiodinase 2 (DI2)
SpeciesOryctolagus cuniculus (Rabbit)
Transcript IDSPT00001899
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001804_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00001899_2.0 # Transcript # Iodothyronine deiodinase 2 (DI2) # Rabbit (Oryctolagus cuniculus) # Full length # Forward
ATGGGCATCCTCAGCGTAGACTTGCTGATCACACTGCAGATTCTGCCAGTTTTTTTCTCC
AACTGCCTCTTCCTGGCGCTCTATGACTCGGTCATTCTGCTCAAGCACGTGGTGCTGCTG
CTGAGTCGCTCCAAGTCCACTCGCGGAGAGTGGCGGCGCATGCTGACCTCAGAGGGACTC
CGCTGTGTCTGGAAGAGCTTCCTCCTTGACGCCTACAAACAGGTGAGCTGCGCTGAGCAG
TGGGTTTCCCCCTGGGGCAACAGGGGCGGGGGCAGGGACGTTGTGGGCTGGAGGCCATGG
GGAGCCTTTGGGGTGAGCATGTGCAGCCCCGTTTGGGGGCTGCCTCCTGGTTGTGGATAA
GGGAGTCTTTGTGTTTAGTTTCTACACCTGTTGCACAGGTTAGATAAGGCTTGGTGGCAT
AGTGAGCCACAATGTGTATTTCTGCATAAAGAATCTTTGTAATAAGGAATATTAATAGCT
TGCTGTGATGTTGGAGTGGAGACTGTTTGTGCCCTTAGAATAACTTCTAGAAAAATCAGA
GGTGTTGGGGGAGGGGAGACTGCTGCATGTATTCTGCTTTTGTCATAAACTGGAATTTTG
CTGTTTTGCTTATTGGGAGGCTATGTGAGGAGCATTGGGAAGGGCTGGGCATTGAAAAGC
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ATGTGACTGAGTGTCACAGTGGCTTTGTTTCTGGTAGAGGCAAGAGTTAAAGCTTCTACG
CTGATTTGGGTTTGGACCCGCTGGACAGCGTTATTAGGCTCTGCGTCCTGAGTTACTAGA
TATCAGTTTGCAAGAGGAAGACCGGTCAGAAACCCAGACTTTCTAGGGGCCACCACATTT
GCTTTGTTTCCCCAAAGTAGCCCAAGTTGTCTTTGGAAAGAGTTCATCCCTCTGCCAAAG
CTATGTAGCCTGAGACTTGGGCACTACAACAGCGCCTCCCTTACCTGCCTGTGGAAGCTG
TGCCGGTGCCACCACCCCCCGGGGATCCCACCAGGCTCCAGAAGACTGAACTCATCTGGC
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CACTGTGCCAGGGAAGGAAGGTGGAGAGGAATAGCGAAGCCAGGTGTTCAGGGCCGTTGT
GGGCTTTTGGCAAGCAAAACCAAAGAAACAGAGACCAGAAACTCAGAATACCAGAGTGGG
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GAGTTAGCTGTAGGATGTTTGCACTTTTGCCTGGACATGTGATACCAAGCAGTCTTACTA
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GAAAGGATCATTCTGTTTCAAGTGTATGCACTGAATGCGAAATTTCTCGGTTTTGTTTCA
GGGGTGGGGAATTTGAAGCCGTGTAGGGGAGTACACCAGTTTATCAAACATATTATTATT
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TTTTTCACTAATGTATCATGTTCCACTATTTGGCAATATGTTGTTTATTTCAGGAATTTA
GGAAGGATGGGTGTTTGATTTTTCTTTGCGCATAAGGTTTTTCTATTCCTCTTCTGTATT
TCTTAGTCTCTGCCAACTGATCTGATGAGTGACCAAGTTCAAGACTGATGTTCTTAATGT
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TCCAGAGACACGATTGGACTGGGTGTGTAGTCAATGGAAACATTGTGAACATAGCTTGAA
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CCGCGCCTCGGTCTTTGGGTGTGGCCATTTCTAGAGACACTGGAGGAGGCTGTGTCTGAG
AGGACGTCACAGTGTTTCACACTCCTGACTTGTATTATTTTCAGGCCGACACCTCCAGAG
GCAAAGGTTTCCAGGCGGAAGGGTGTGTCCACCTATGACAGAATTAGACATGATTCTCCT
TGTCAATGTCAGGCACTTTGGAAGATCTTTAGAGAAAGTGCGGTGGAATTTTTATTCTTG
TGATTGCTCCCACAAGAGGCAACACAGGAATAAATAAATTTAAGAATTCACATAGAACAT
AAAAAAATTGTCTTCATGGAAACGTTGAAAGGTTTTCAAATTTATAGGGGAGTTTTCAAA
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CTGACAAGCCGTTTGCCTTCTGCACGGTTAATACTGCCGAGCACAGAAAACATATTCATT
TGAACATATAATTTTGGTTTTGAAAGGGTCTCTTGACATTCCCCTCCTCCTCTTCATTCA
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AGCCCCAGAAGAACACAAAGAAGGCCACAGCCAGACCCCTTGCGCCTCTTGGATAAAACC
TTGGGAAGTGATAAAGCCGAGAGTGCTATTTTCAAGGTACAAGTCCAAAAGAGAAGAGCC
AAGAGGGAGCTGAGTTCAGAAGTAGGTAGCCTGTTCTTTGGCTCTGATTTAGTTGGCCCA
TCTGAGCGGAAATGGTTAAATCTGTTCCTAATGATTGTTTGGCCACGTTTCTAAGTTCAT
TGATGTAGCTTGGTCATTATGTCGAAGAATTTGAAACTTCCTGATAGTTAATGAAGACAT
TTCCAGGGCTTTGGGTAGCAAGAAGTATGTGTAAAACTTGGGTCACACATCCACTCCCAT
TTTTATCATTTGCTTTACTTTTTAATCATGAGCTTATGTGATAGTTTGCCCAGAAGCTTT
TTTTTCAAGCTGTGGAAAAGAAAAAAGAAAGAAAGAAAAAAAAGAAGGTTAGTAGTATAT
GCTCCATTTCCAGCTTCCACTGGATGAATGGCTCTTTTTTCCCGCTGGCCCTGCATTTCA
CAGTCCGCATGCCACAGCAGAATTATCCTTTTCTCCATGCACTGAACGCTGTCGGTGAAA
GGAATCCATCATCAAAGGAATCAAAACTTGTGTTTGCTGTGTATTCATACTATTGTTCAT
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ACATGGAAACATGGAAATCCTTTATTTACTTCCTTTATTGGTATCCTGTTGATGTTGATT
GCAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAGAAAGGACAACTGTCTAGTGCAGACGAGAGAGAG
AGAAAAGTCAGTGATGACGATACCACATTTTACGTCTGTCCTTTCTGATCCTTGCAAAAT
AAAGGGACCCTTTGGGAACATCGGAACTTCAAGACCAATTAGTGGCAATGATGCTTCTTG
TGTTTGAGCATTAAATACTGGGCAGGGTTCTCTTTAGAGCAGCTAATGCTGGCAGGGAAA
GAGGTACCGACCTAATTACTCTTCCGCAAGAGTAAAAAATGCCTTTTGAATGCCTCTTTG
GCAAATATGTCTCATTAAGGACAAAAACCAAACACAAACCCTCTAAGAAGGAGAAATTAA
GATGATAGGTAACTTGTGGCCAGGAGACTTTCTGTGCCACTGTGGGAAATTAAAACAAAG
TTTGGGAATACCAAGGGATAACTTGTTTTTGTTGAGCTTCTTTCCTGCAGCCTACATGTT
ATTATAGGACCAACTTTATTTTCTTCATCATTTTGGCTCTGGGTCAAGGAATGCTTTGCT
CCTGGGGACAGCAAAGAACCTTCCATCACTGAAGGCACTGGTGATTCTACCACTGCATCT
CAGCCGAGTGTATAACCAAGCCAACCAAAAAATTCTTGGTTTGAAACTCTACTGTAATAG
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TGTTCTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTG
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CTTCTTGGTCTCCCATGCGAGTGCAGGGCCCAAGTACTTGGGCGTTCCTTCACTGCCTTC
TCCGGCCACAGCAGAGATCTGGACTGGAAGAGGAGCAATCGGGACAGAATCCGGTGCCCT
GACCTGGACTAGAACCCAGAGTGCTGGTGCCGCAGGTGGAAGATTAGCCTAGTGAGCCAC
GGCGCTGGCCAGTAATGGTTTTTTGTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGACA
GGCAGAGTGGACAGTGAGAGAGAGAGAGACAGAGAGAAAGGTCTTCCATTGCCGTTGGTT
CACCCTCCAATGGCCGCCGCGGCCGGCGCACCGCACTGATCCAAAGGCAGGAGCCAGGTG
CTTCTCCTGGTCTCCCATGGGGTACAGGGCCCAAGTACTTGGGCCATCCTCCACTGCACT
CCCGGGCCACAGCAGAGAGCTGGCCTGGAAGGGGGGCAACTGGGACAGAATCCGGCACCC
CGACCAGGACTAGAACCCAGTGTGCTGGCGCCACAAGGCGGAGGATTAGCCTAGTGAGCC
GCGGCACCGGCCCAGTAATGGTCTTTTAAAATGTGTTTATTTATAGCTTAAAGCAAAATT
TTATTTTTTAAGTTTCCAAAGATTTTTTTTTCTCCCTCTCTTCTTCTCTCTTTCTCTCCC
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TGATTATGATGTGTATAAAAATGGACTACTGGTCTGCTCACACATGGACTTCTGGATCCT
AGATATGTGTTTTCCCTTCTTAGTTTTTTTTTTAAGATTGTATTTATTTATTTGAGATTG
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CCCAAATGGCTGTAACCGCTAGAGCTGAGCCAATCCAGAGCCAGGAGCCAGGAGCCTCCT
CCAGGTGTCCCTTGTAGGATCAGGGGCCCAAGTACTTGGGTCGTTCTCTGCTGCTGTCCC
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GCTCGTGCCACAGCTGGAGGCCGGCCCCCCTCCTTAGTTTTATTGACACTGTTAATCTTA
CCCACACATTTTCTCTTACCTGGTCATCCTCAGGCATAGTGGTATACGTTTGTGACATTC
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TATCCCTCACCCAAAAATGATGACGTTCATTGCAGGTCAAGGGTATCATGAAGTGTGAAT
TTACTCACTGACCTAGGTTTGTAAAAGCTAACGTTCATTCACTAACTCATTCAACACAAT
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TTGGTAACTGTCCTAATATTTCATTTTAGAATGATAGCATTGTATGTGTCTTCAGTTTCC
TAAGGTGGTATGGGTTTTGGAAAGAATTCAGTGCCTGAAAAATACATTGTGTGTCAGAAG
GAGGAGAGTGCCCTAACTTTCTAAGAAAATTAGCTGCAGGTAACAAGGGAGTCAGCTAGT
GACTGAAGCAGCAGATCAGCTGATTCAGTTGAATGGTCAAGAATAATGCAAGGATCAACA
GGTCTGCTTGGGTGAGGATCCGAGGTCAGAGGCCCATTTGTCAAGACCACACAGTAGCTT
ATAGGTCACAAAAAGGGCTCTGCCAGGCAGATGGCTGTTTTTACATTCTGACAAGAACTT
ACAGTTCTGTAGTTTCGAGGTGATTTTTCTTCTGTTTCCCGGTTGCTTACTTAAGAATTT
GCTGCCAGAACTCATATGACTGTACTCAGGCCCTTTTGTCGTGGTATGTTGGGGAATGTA
ACCTAGAATATTGTTAGAAGCAGCCCTCCTAGAATAATTATAACTATTTTAATTGGGAGA
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GTTAGTAGCAGATCATATGAAATAATCCAGTAAAAAATGGCTTATTAGATTTCTCCATGT
GGTGTCATTTGCAAAGTAGCCAAGAAAATTAGTAAAAATAAATAACTTTCTCTCTGGTGG
TGACTGAAAAAAAAATCATTTATTTAAATCACACCAACAGCTTCCTTTTCTAAGAAGGAA
GGTTATTATTTTAATATTTGTTTTAGAAATCAGTAATCTAGTTTCACACCTCCCTTGCTG
GGAGAAAGAGCTTTGGTTCTCTGCAGTTAAAAGACGTTCTGCGTTAACATTAGACAGCGG
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TGCGCAGGGAGCACGCGGAGGAGTTTTTGTCTACGCCTCTTCTGTCTGGATATTTTGTAA
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GAGCCAGGTGCTTATCCTGGTCTCCCATGGGGTGCAGGGCCCAAGGACTTGGGCCATCCT
CCACTGCACTCCCGGGCCACAGCAGAGAGCTGGCCTGGAAGAGGGGCAACCGGGACAGAA
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CTCAGGACCTTTTTTTAAACACAAAATTGCCCGGGGAAGAGGGCATCTTGCTTCACTTAC
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GATTGAGTTTCAACTTAATTATGAAAAGAGTTAACTTCAGTGATGAAAATAATTACTTTT
CAAGACCATAAAGAATGAAAAAGATTTTTATCCTTTTCGGAGCCTTTCTTTACATTGTCT
GCCCTGAGGGTCCTCTCCGCTCCCCCCCCCCCCCCCATCAGTATATGTTTATCCTTTGCT
TTCAGGGAAATACCGCATTCTATTAGGACCAGTTGCATTAGAGTGAATTGAAGTGGCAAC
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GCTCCGAGCGCCCACTGGTGGTCAACTTTGGCTCGGCCACTTGACCTCCTTTCACCAGCC
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GTCACCTCTTTTCTTACTGAAAATTCCTGACTGAGAAGATCCCACAAGGGAGAGGGGGAA
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CCATGAACTTTTTGAAGACTACTTGAGTATCTATACTCATTCGCAGGAGTATATATACTC
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TAGAACAAGAAAAAGTTGGTTTCAGATAATTCTGATAAGTAATTTTGGAAGCTTTGATAT
AAGGCTACCCTCAATATTATGGAATTTGGTTAAATTGAATTTCACTTGACATTTGAATTT
GGAACTGGCTCTTCCTATCATCCCATTATCTGAGGATTAGTAATCTAAGGTCATATATTA
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TGGTATCATATTTTTGTGTGTATATTGAGGATACTATCAAATTGCCATATATCATTGTAC
TTAAAGATACAAAGGTTCACATTTCCATTGTGTTAATAACTGAATCATAACATAAAACTA
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ACATTGGGAACTCGGGTGCAAGAACCAAACTTTTTAAAAAAATTAAAGCAACATATCTGT
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ATATAAGTTTTCCAAAGTTTTAAATTTTATTAAAAACAGAATTACAGTGAATTTTGAAAA
TGTAATGTTGTCTAATTGTTGGATAATGATATTGAGAATATATTATTTCATATTCCTTAA
TTGTTTACAGTCAAGACTTATCAGTGGCCACATTGATTTTTACTTTCAAAATACTGTAGA
GATTTATGTGGCCCCCTAGAGAATTAAAACGAAACATTGGCTGTAGCACACCCATGCCAT
TATCCTTCAATTTCCCCTTTTGTTATATGTGTGTGATAAAGGAACAGGATGTCAGAGAAG
CTGGTGGGGGGATGAGATTTGGCTATGGTAGTGCTAGGTTTTGTTGGGGAAAGGATGATG
GAAAAATCAGCCAGTTGTGCTCTATTTTAAAGTCAGAGAAGGTTGTGTGTGCACGCAGAG
AGTTCTCCCTGAGGGTAGTCCAGTGGAACAATGAGGCAAAGGAAGTGAACAGTTAAGGAT
CTCAGGCCGTCAGGGAGAAACACCTGTGGAACAGAACGTGGAAAAGTTACTCGAGGAAAG
ATTGTTGAAAGGACCATTGGTGAAAGTAGACTGACAAAGCCCAGGAATCCTGCAAGGTGT
AGAAAGGTTTGGTGACATCAGAGTTATGAGAAGTTTGTGATTAGCTAACATGTGTCTCAA
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GATTCAGAAGAATCAGTGATATGCTGAGAGAAACTGTCAAAATCTGCCCACCTATCATGC
CTTTTGAAAGTTTGTTACTTTGAAGAACTGTATTTCTTTCACAAGGGAAAATTTATATAA
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TTTTCCACCCATAGGTTATGTTTACATGGAACCATCAGTTTAGCCTTTTAAGGTGACTTA
GCTTGCCTATGATTGCAAGAGTTTCCAAGAAATTTTAGATATTATAGCATCTGGATTTAT
TCAAACATTTATTTTTTTGGAAGACATACATCTTGGAACTATCAACAATTTGTTTTATTA
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ACAGTGATGTAGAAGTGTTTCATACAGCTATTGAAATTAACTGACCTTCTTAGAGACTTT
TCACTGTTCTTGTTTATGAGTTTCTTTATTCCCTCTTTGGATCTCTGATCCTGTGTCATC
ACCTCATTTATAGAGTATGTATCTGATTTTTGGTAATAACAACTTCTAAATGGGTTATTG
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GGACCATATTTATAGCTTTAGGAAAATTCCCATGTGGACGCAAGATACCCTTGCAATGCC
TTATGGGGCATGTCCACAGCAAGAGAATTTACTGATTTATAGGACTTCCCATTTTGTCAG
TCATAAGAAGATGGACTGGACAAACATTTCACCTGACCTCTAACTGGCATTTTGGGGAGG
AAGTTTTGTTAGACTCAGATGGCCATTGCAAAGCAGAAAATGCAGACACCTGATTTCTGT
CCCATCGGTGGATACAGAAAACCTTTACTAGCATTTTGAGCGGTTCAGAACATGCCCAAT
GTCAAGTCTGTCAGCGTTAGAGATTGACAGTGAAGCTTTTAATTTGATGAGCTTTTCTTT
CTTTCCTTTTTTTTTTCAAGTGGTTGCCAAAAATCAGACTAATGTTTACTTGGTGATATT
TGAACTCCTTCGCCTTAAAAATGGAATTCATCCCCACACTTGAGATGTCTGTCCAGTATA
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AAAAGGCCTTCTGTGAAGGAGGGATCCCAGGCTGGGATTGCTAGGAAGTTGCTAACTGTG
AAGAATGCGACTTCGCCCCCTCACTCGGCCTGGTTTAGGAAGACCTGAAAGAAATGTCTC
ATGATTGGAGAAAGGCTGCTGAATGTCTTTGAGTGACTTTAGGATGAGCAAAACACGGGG
CCACTTCCTTAGTCCCTGTGTTCCGGATAGCACGAGAATCATGATCTCAGACTTAACAGA
CCCAGCTCTGTTTCAAGGTGAGTCTGAACCCTTAGAAAGCAAACATGTACAGATACCCAA
ACAAGACGGCTCATGCAAGTTGGGGCTTGCAGCCTGACCTAGCCAGCAACACCAGAACTC
CAGGGAGTTTCTTGAATATTTACTGAGGCTTTGGAGACGCAGCAAATGTTTAATGAAGTC
ACTATTTTGGCTCAAATCTCCCCTCCCTCCCTCCACCACTACCCCCCCCCCCAAAAAAAA
AGCCAACAGGTAAACACATAAATGAAAGAAGTCCACAGAAGGGGATGGGAAATAAATAAA
ATTCTGTCAAGATTTCTCCAGACCATGTCCCTGGTCAGTGTGGTTTTTATGTGTGTTAGG
ATTGGGGGGATGTGAAGACATAAGTATCCCGTACTTTATAACCAAAGCAATTAAAAGATA
TTGGGTAGGGAATGTTGGCCAGTTTTGTTTAGTTTTGCATCACATTGCCACCAGGCTCAC
TAGCCCGCGTAATCAGGTGCCCGAAGAGGGAGACTGGGATGTGCAGAGTTGACCAGTGTG
CAAATGATAACTGCTGACGAAAGAGTCAGTGACTCAGTCA

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