SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001972_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein I (SelI)
SpeciesOryzias latipes (Medaka)
Transcript IDSPT00001972
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001878_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00001972_2.0 # Transcript # Selenoprotein I (SelI) # Medaka (Oryzias latipes) # Full length # Reverse
CGAAGGGCTTGCTGCTTCAGAGTGAGTCCGCTCCGCTGGCGGTTTTTGAGACCCACTCTT
CATTCAAGCGCTCCACAACATTGCACACAAAACAAACAAAAACAAATAAAAAAAAGTCAT
AAAAACACCCAACATGCATAGAAAAATGCATTAAGAAACGAATCAGCGTGACACCACAAC
ACCTCAAAGGGGGGGGCAGGAGGCCAGTGCTCTGAGATAAACAGTTAGTACAGGTCCCCA
GGTTACAAGAATCCGATTGATGTAGAGTTAATTGGAAAAAAAACGGATAGTGTTCACACA
GGTAACTTAATCATAAAAAACCCCCACACACACATTGCCACTTTAAATTAGTTCATTTCA
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ATCCACCCGACGCTCCTCGAAGCACTCCAGTTCGGATAACTCAACGGAAATTTCCCAAAG
GCTTGTTCTACATTCATAATACTGTGCGCGTGCGTTCACGACCTTTCCTNNNNNNNNNNG
TGGCACTTCCTGTTTGGGAACACGAGAAAGGAGGGGTTGAGCTGTCCAGTGCTTTTACAG
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ACCACAGTTCGTTTGCTCAAGAGAGAAGGGCCAGGGGAGGGGGGAACGGATGCGGTTTCC
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TCAAGCCGATTCGCTCCTCCTCCTGTCAGTCACTGCTGGGCTTCTTAAGGGAGAAGGCAA
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AGCTACACCGTATTAAAAAATACATAAAGATAAAATGAATTCCTTTTGTAGAAAATATAA
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GAACTTTGATTTTTTTTTTTTGCGTCAATCATCAAACTTAAACTCTTTCTGTTTAAAGAC
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ATGGCAATATTTCTATATGATTTACCTATACCAGGGTGTCAGAGGCCTTATCTGCTGCTG
GTTACCTGGATCAGGTGCGTTTAGCCAATAGGGAGCTTGAATGGCAGCCCTAAATGGGGT
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CTGTTGTGACCATTAACATATCCTTAATAAAGTACTGCTAAGAATTAAAATACTAACGTT
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CACTGAGACTCCGTAGTGAACGTGCGTCAGGATGACAGCAGCCGTCCACAAATACAGCAG
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CAGCAGCAGCCAGCTCAGCGGCTGGCAGCGCGTGTTACTCATCTGACACACGATTAGCTT
ACACTACACCAAAACAAACAAACGTTGGGGTGAAGGACGGAAACTCACAGCTGCTGAATG
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TCTGATGATGGAGAACATATCTGAAAAAAAAAAAGGCATTTCTCAGTATTTCTTTGTTCA
AATCCTTGTGAAACAGGAGAAGATGAAAAAAATGCTGTTTGAAAAAGATCGTATTTGTGT
AGAAAATATGCTGGGCGGGGCCTCAAGCTCCCTGCTCCGCTCCATTCTGATGTTTCCACT
TGAACCGATCCGTGTACGCTTTTGTTTTCCACGTCTGAGCTGGAATCTGGATCCAAACTG
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TGGGGGCGTGAGGGGCTGTAAGCTAGCTGGAGAGAGTGTAAACAGAGAGTTCTCAGGAAC
GGGAAGAGTGGGTGGTGTCACTAATGCCGCACTGCAGAAACTATGTCCTAAAAAACGCTT
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AAAAAAGATCAAAACGTCAATTGGAGTGGGTCTTTAAATGTGAATTTAAAACAATTAAGT
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ACCTTTTGCCTTATAAATTTATACCTGTATTCTCATAAATCCTCAATTCATAGCTTTTGA
CATGATAGCTTTATTATCTTAAAATATTCTGATAATTTTGTGACTTTATTCTTAAAAATT
ATGACTTTTTTCTCATAATTTGATGATTTTATTTTGTAGAATTACAACTTTTTCTCATAA
TTTTAGGACTTTATTCTGGTAAATGTGTTTCTTATTAACGTCGGCCCCAACACTCCGTCC
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TAAACATGGAGGTTTTCCTGCAGCTGTTCATTCTCACAGCAGGAGAATCTCTGCTGGTGA
CAAATTCCCAAAACTTTGGGAAGAGCTTAAAAAAAAATAAAAATAAAGCAGATGGAACAG
TTTTATGGGAACTTTTGAAGACGGAGGATAAAACCTATCAAGTGATTTTAATAGCTAATT
GTGCAAGAAAAAGGAGAAAAGCATCACTGAAACATAAAATAAGCTACAGAAGAGTGAAAT
AGACTGAATGTGTGTGTTCTCGTGTGGGTCTTTACCACTTGACTGATGTCGTACCCCCAG
GGGAGGAACAAGACGCCAGTGTTGTATTTCTCCCAGTGGGAGAGGATAAAGGAGAACAGC
ACCACCCACAGGATGTAGTACAGCGTCACCACGTTCACGCCGCTCTCTCCGCGGCCAAAT
ATGGAGTACACCGTGGCCACGAAAAAGATGCACGCCCAGCTGTCCAGACCGTGGTCAAAG
AGTTCTCCTAAAGGCGTGGAGGAGTTTGTGCGGCGAGCCTGTTTACCGTCAACCCCGTCT
GTACAAAACAAAAGCCGGGACAGAGACGTTTTCACATCCCACACTCGCACGGCTGCTCCG
AGTCAGACGCATTCCTACACCCCCACCTCTAAATCTGGACTCGTTCGTTCACACAGAGAT
TTCCTCACAAGACTGTTTTCAACAGTTTCTGTCTTTCAAAAACTGATAGAGGAGCTAAAA
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TGGTGAACATATTAACAGGTCACACACACTTCTGCATCTACAGTCAGGTGCCCTCTTCTA
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CTCACCAAGTGTATACGCTAAGAAGTTGAAGATCCCAGCAGCCACCCAGACCCAGCTAGG
GACGTGCTCGTGTCCTGCAGCTGAGACACAAGTCGTGTAAGTATGCAAAACGCACAAAAA
CAATATGGGAAAAAATGACAGGGCTTCTAAAACAACCGTGGACTGTTGTGAGAACTGGAC
TGAGCGAGTACGACGCCATCCATAAACGATCCGCAGCAACTGGAGCAGGTCGGTTTCAGT
CATCGTTTCTATGGCAACCACTCTCACCAATCAGGAGTAATAAATCACAAATTTATCGTC
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GGTGAATTTAAATGTAAACATCTCAAGGCAGCTTGACATTTTTAAACATCCAGCCCCATG
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TGGTTCGAAAAAGCTCCGGTTTGTGAGTCCAGACAAAGAAATGCATTCAAATCTAAGGAA
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GCATTTCCCCAATCTATTGAATTACCTCCCATATAGACGTCTGTCATTAGCAGAATCATT
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GCGTATATATATAAATAGTTTGCTATTTAGTCAAGTTTTCCTCATTTCACACAGCCCTAG
TACACACCAAAATAAATACAGGCCACACAAAACCCATCAAACATTTTGAACGTTGGACCT
GGGGCCAGCAGGCGCCACCTACTTTTATCGAGGCATCTGATTGGCCAAAAAGAAAAATAT
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ACTCAGTCCAGTCCTCATTTGCAGTCAGTGCAAATAACTCAGCAAAAAGTGTGTTAATTA
ACAACAAAGTAAACATGGAGCAGCGTCTGGTGTTTGGTTTAGGTCATGGGGTGACGTGGC
AACGCCGATAGCTGCTTGTGTGGTTTGAGATCACTTTAAACCATAAAAAAATGGACTTTG
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GAAATGAGCAGACGTCAGTACTCCCACATGCAGGAGAACAAAGCAAATGACTCACAAGAG
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GAAAATTGTGTTTTTCTGAAGATGTGGGGTATATATAGAGAAGTTTCCAAATGTACTACA
ATGTTCTACAGAAACCATGTCCTAGAAAACAAAGGGTTCTTTGATTTTGATTAAAAAAAG
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TACTGCAGAGAAAATCAGATTTGAACATTTCTATCAGTCCCGTATTTGCTTCCTTAGAAC
GAGTACAGCCTCCGTCGCCATCCTGTCATCGTATCACAGCAGTCGGCCGGACACTCATGA
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TCCAAAAAGGGTGCATGACGTAGACGGACAGGGGATTCGTGTCCTTGGCACTGTACTGCA
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ATCACAGACATCAAAACAAACATGAGTCCAGTCACTGTAACTTAAGACAAGCATGGAAAA
GTGGAAAAAGATCCAGTGTCTCTTGTCAGATGATCTAAGAATTTCAGTGATTGGCTGCTT
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GGATCACGAATACAAAGAGTTCAATAGGAAAATACTAAAATGAACTAACAAACTGACTAA
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TGAGCTCTCATGGATCTTCCATTTTCATGCCACCATCTGTTCCTTTGCTTAGGGCACCCT
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TCTTTACAGGAAGTACCATAACCAGCCAATAAAAACATTGTAACCAGGAAACATAAAACT
GGTTTTATTGAGCTCATAGCATGGAGTAACTCAGTCATTTTTTTAAATCTTGTTTTAAAA
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ATATCTATTGAGTTTTATAGTACAACATGAGTTCCTGTAGTCACCCACTGGGTTTGCCAA
GCCTCTATCTAAATATCTGTTTTTTAAGGACACATTTATAACTGCATTCAACCAAAAAAA
CGTATTTTTAGCACAACGTAGAGATAGACTGTAGCAGCCCGAGATGCTCCTCGTCAGAGG
ATGCTGGGAAAGCTACTGCCAAACCGAACTTTCCGCTCAAAATTCGATTTTAAAATAGAC
GTATTTGACTATATCAAAACAACAGCTACAAATTCAATTTTAAAATATTGATTTTAGAAA
TTTACCGGCAGAATAATGTACTAAGCGAATCGCTTTTGTGCAAATTAGCATTATATTTAA
CTTCCGGCTTGAGTTTTCAAAATAAAGTTCCAAACTTGAAACATTTATAAGGAAAACATC
CTAAATATGATAGTTTGAATCGATTCTGATTAATGAAACTGAATGAAAAGTATGATAACA
GACTTGGATAAACTTGAAAACCATTTGCCTAAGTAAAAAACTCCCGTCATTAACGATTAT
GTAAAAGTAATTAGATTTGGAAATATGACCCGTTATTTTTCCTTCGTATTTCTTTCTTCT
TTTTTATAAGTGTTATCTGGAAAGGAATTACAAATAACTACAATACAAATAACAAATTAA
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GACAACCTTGACGTAAATCTGCTAAGGCCGACTCAACATTTATCCGAACGTCTTAACAAT
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ACGCGTTACCGGAGAAGCGCTAATGATCGTGACAGCTAGCTGCTACAGCTATTAGCCCGT
TACTCTTACCTTATATTTGTCGAAGCCGGCAAGCTGCTCCTGAGTGACATATTCGTA
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