SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001975_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein L (SelL)
SpeciesOryzias latipes (Medaka)
Transcript IDSPT00001975
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001881_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00001975_2.0 # Transcript # Selenoprotein L (SelL) # Medaka (Oryzias latipes) # Full length # Forward
GAGCACGAGACCTTAACGCGCGCGCTCAGTCTGCTGGTGAACCTGGGCCAGGTTTTGCTG
CAGAAGGCTCAGCAGGAGGCTGCAGGTATGAATAAATGTCTACCAAAATCAGACTACGGA
CGCATTGATGTCGGAGTTTGAATTTAGCGCTAAGAGGAAACCTTATAAGCCTTCACTTAG
TCCATTAGATTTTTTATTTTATTTTAAATACTTTTATTGTGACATTTCCGGCTGTTAAAA
GTTGAAAAAGCAGTGATTCATGCTTTACAGTCGAGTTGAATGTTCAATCCCATGATGTTT
TTTTGTTTTTACGTTTTGATTGTTTGTAAGGTTAACATAAATATTCTTGGTTTGTAAAAA
ATGCTGAGTCATCGTTACATGGATGTTGACTTAAGTCATTTCAACTCATTTGGAAACATA
ATTAGCACATCAATTAGTATTCAAAGCTATTTTTCTGTTGTAACTACATAGAGTTCCTTC
TTTTATATTTGTTTCTGCCAACAGCATCAGGTGGGGCCTCTTGGGAAGGGGTGTGTGTAT
GGGGGGGGTTGATGTAATCCCTGTCATGCTGGTCAGAAAAATGCTGAAATCTCCAAACAA
AGCTTCTCTGTTCTCACTCAGCCTCCCTGGAAACCTTCGTTCTGTACAAAATCACCACGA
TGTTCGGCCTGATCACCGCCGGGGCCGACTTCTACAGGAGGTGGGCTCCCATCATCAGAG
TCTGACACATTAATACCAGATCTATAATACTTTGACCTGATTCTCTGCTGTTTCTGCGCA
GCCTCGGAGTGAAGACGAAGAGTGAGGCAGAGGAGGTGTGGAAGAAGTCATACCAGTAAG
TGTTTTCAGGGCAGATGCTTCATTCAACTTTGTCCTGATCCTACGATGGAGTTTTCGAGC
AACTTTGTAAACACTTTTTTTAAATTATGACTTTAAAGTAGTAAATTTACATGAAAAATA
TGTAATAACTGTTAAATTTTGAGCATAAAGTCGTAAATTTACGATTTCTTTGTCTTGCAA
AATTACGAGTTTCTTTCTTTTAAATTTACAACATTAAATCTGTTAAATTTATGATTTTTT
TCTGGTTAAATGTACGACTTAAAATTTCATGATTTTAGTTGTTTATTTTTGGTGGCTCTA
AAACTTTTGAGTCTTTCAATCAATTTTTATTTCCAGAGAATGTTAAACTAAAGCAAAAAC
TGTAACTTAATTTTGTGAATCTACAATTTATTTTACCTATAAAAAAAATAGAAAGAGAAG
AATGAAAGTGGTGCAAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGCTCTCCTTCGGCAG
CGTGGAAGGGGCTAAGCTGTGGCTGGAGCAGACCGGATGCAGTTTCCAAATGCTTTTGGA
TCCACAGAGAAAGGTTCACGCTTTGAAACTTTTTAGTTCTGCATCAGATTGACAGACAGA
TAACTTCATTCAAGTTCAAGGGAACAGTCATTTTCTTTAAACACGGCAATAATACTTAAT
AAAAACATAAAACATGCATGAAATACTCAAAGAATAACATCAACAACAAAATAAAGCAAT
CAATGTGCTTCAAAGCGGCATTTAAGGCAGGGATTGCATTTGCGATTACTTATTAAAAAC
AGTCCTGCGCCCCCTGCTGGCCATGGATGGTGAGGGTCTGCAAAAATTCCACCAGGTGGA
GCAGGTGTACTGTTTTGCAGTTTTTCTCCATTGGTTTGGCTCATTTCTTGAAACAGAAAT
TACATTCTCAGAACTCTAAGATCATTTGGCAAAACAGTCTTACAGTTTAGCACAACACAA
TAGCTTACTTGCAAAATCTAATATATCTCCCAAAACTGTTCACTAATGCTTCAAATCTAA
ATTCCTCTCCCATGTAGAGAGTCAGTGCCACCAAAATGGCAAAGATCCTTCTCAATTGCT
TTGGCTCATTTCTTGATCAGACCGGATGTTCTCAACACTCTTGGTGCTTTTACCAAAATA
ATGTGGATGGTTCGGCAAAACGCCATGGTTCACCTGCAAAAGCTCATATCTCTCCCAAAA
TAACTCACTCATGTCAAAACTAAATTTCCATCTCATTCAAACAGTCTGTGCCCCCAAAAT
ACTTTGTCCCTGTGGCATTGTGTAAGCACTGCATGTCAAAATGATTAGATGCTTTGTCAA
CATAGCAGAGGACCATTGAAATATCCCTCATGTCCACCTTTCAGTCTTAGCTTGGTCCTT
TATTGACAAAGGTAACTGTACTGTTTTTGTATACAGTAGCTAACAAAATACAATTTTGTA
TAAAACTGGAAAAAAGAAAAAGGATTTTAGGGTTACAGTTGCCTCTTAGGTTCAACAGCA
CACTCATACTGCCAAGGAAATTGTAACCATTATCATTCACACACATTCATACATCAGAGT
AAAAAAAAATGTATACAGCATAATATACTTTATAATTTAAACACGAACAAAAAACAGTGA
CAATGATACGCAGCCTACAGTGCTGTAAATAATGCTTGAGTTTCACAACCAACAATTCTT
CACTGGTCGCTGTCCTCACCCTCCCTCTCCTGCCCATCGTCCTCACCCTGCTGGTCATCC
TCACGCTGCTGTCTGGCTACAGATTCTTGTCCACATCACAGCATACATTCTCCCTTGCGA
TGCAACGAGGGAAGAAACGGCGTGCATGTGGCAACCATCCCCTACACTGATCTCCTGTAA
TGTCCTCACACGCAGCATCCATTGCATGGAGCAGGGACTTCTGATCTTGAGCCCGATGCT
CATACACTCTCCACCTCCAAGCGGAGAAAAACTCCTCAATAGGATTGAGGAAAGGACAGT
AAGGTGGTTTGAACACTAAGAACATCCTTGGATGAGTAGTGAACCAGGTCCTGATGAGCG
GGCCACGGTGGAAATTCACATTGTCCCATACAGTAACATATAGTGGTAGGTGAGGCCCTA
CGAGACCTCTCTAGGTTTCAGGGATCAATTCAAAATAATAAATGTATCAAACGTTCCAAG
GGATTCCTATATCGTATTCATGGTATATGTTCTTGCCTAATTTTGACAATTGAACAGACT
ATTGTGCATGTGATGACTTACACAGTGAAATGATGCTGACTCATTTTGGAGCAAACAACC
ATTAGACTGAGAATCAACAATCAGTTTAGATCAACAAGATCTATTCACTTGGAAATTGTG
CTAAATGAAGGCATTGAGACATGAGACATTGAGACATGTACTAAGACATTTGCAATTGGA
TGAAACTAATGAGAAATGCCATTCTGTTGTGAACAATTGCCAAGTGGTTTGGAGGTTTGT
CCATGTTGTTTTGAGAATGTAATTTCTGTTTCAAGAAATGAGCCAAACCAATGGAGAAAA
ACTGTAACACAGTTAAAGACGGGAGTTTGTCTTTTGGACATCCTGCAGGTCCTTCTTCCC
TTTGACTCCATAGCACAACTCCTTGGTTTTGAAGATATTAAGCTTCAATGAACGCTAAGT
CAATCCATGGACCAGAGCGTGGACCTCCTGCCAGGTCCTATAACACAGATATGCTATAAA
AGCCAATCATTTTTAGGAGGGTTAATCCTTCTGTACTCCAGGAGATGTTGTTGGTGTACA
CAGAGAAAAGAACAGGTGATGCCACGCTGCCTTAAGGAAGACGGGTCTTCAAAACCATTT
GGATCAACGCAGCATTGTTTACCAGCACACGCTCTGAACTGTTGCATAAATCCACACTAT
TAGTATTTTGTGAACCAATGTGTTAATTTTAGCTGATGAAAAGTCTGTGATAGAAGCAAC
TTAGAATCTTGTAGCAACTCTGTCATCAAGCTTCATACTCACCCAGCACGTGTAGCGCGT
TTAAAAATGCACAAAAATTGTGTTCTTGAATGCACGTTTAGTCCGTGTTCACACTGGACT
AGCAGGGAGGGGCTTCTTCTTTTTTTTCATGAATTGAGTAAAGAGTAGCTTTTTCTTTAC
ACAATGCATTATTCTTTCTTGATACAGGTCTACAGGAGTTTTGGCCTGGGCTCGTCCTAC
TCGAAGGTGTTGAAGTTTGACTGCTTGCTGAAGTACTCGGAGTATCCGACGTCAAACAGA
GACTTCCCCGACATTCCCCCTCGTCTTCTGGAAGACCTTTACCAGGTGCAAAACTGACAA
CTGCTTCAAAACTGTTGTGGGATTTGAATTTAGTGTTCAGAATTTGAATTACATTTTTAT
TATTATTAGTAATTTTAAGATTTGTATCCTTTCTTGGTAACATTAGTGGTTAGCTAATGT
AGCAGCTTGTGGTAACACCCATTGACTGTACATGAGAACTGGACTAAATGAGAGTGATGT
CACCCATAGAAAATGGTTCCCCTCTGGCTCCACGAAGCCAATTCAGTCGCCATTTTATCA
GGATACGGACATTTTAAACATTATATAACACTGTTCTTCATGAACTGTTTATTCCAAAAA
GAAAAATTACACGAACACACGATCAAAAAACTATATCGCTTCAATCTTTTTTTTATTTTT
TTTTATTTTTTATTTTTTTTATTTTTAACTTGTCCTGTCCAACAGCTGGGCAGACAGACG
AGAGCTGAGGGCCTCTTGTGTTGGACATATTTTGCTTTAACAAGAGGGGTTATTAATCTT
CTGACAAACCAAAGGTATGTCTGAATAAACCCCTTTTGTAATTGAGGCCAAACTTTATTA
ATTTCAATCATGTCTGAAAATCTTTGGTGTTGGACCGGACGGAAAAGGAAAGAGGGGAAG
AAGAGAGAGGGACGCTAGAGAGAGGGGGGGGTAGGGGGTGATAATAGGAGGGGAAGGGGG
ATAAGACCATGAAGCAGCATACAGCAACAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNGCCAGGACCCCCCAAGGGAGACCCGCTCCGCGCTCCAGGCAGCCATCCG
CCCGGCCCACGGTTGGTCCGCTTCAATCTTTCTAAGGCTTCAATCAACAATGAGTCTCGC
TAACAGCATCTCTGTGACATAGCGTTATTTAATTGGAAGTTCAAACAATGATTATTTAAA
TTAACTTCCTGTCCTACTTCCTGTTTGGAACGCCAGGGGGGAGGGGTCACTCAGCCAGTG
GTCATACACAGTCAATGGTCTCAACCTTGTTATACTTAGGTTAAAGTCTTTATATAATCT
TTTTGTAATATTTACAAAAAAGTGTAAAACCAACTTTTTTTTTCAGATGGGTGGGGATTT
TTTGTTGGACGACACAGGAAAAGTGCTTCTTTCTCATCCGTCTAAAAGCCCGCTGGACAG
ACCGAGCGTGTCGGACATCCTGAAG
Chart Advanced