SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001996_2.0
Identity
TranscriptThioredoxin reductase 2 (TR2)
SpeciesOryzias latipes (Medaka)
Transcript IDSPT00001996
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001902_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00001996_2.0 # Transcript # Thioredoxin reductase 2 (TR2) # Medaka (Oryzias latipes) # Full length # Forward
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GTTGTACCTGGGCTGTCGTGGTTATGTGCTCGGTGGTGATGGATAAACGGAAATAACTGT
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CTCTTGAAAAAAGGGTGTTTTTACTTTCTTGAGGTTCAGTTTTTGCATTGTGTGTGAATT
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GGGGAAATGTTAATGGCCTGGCTCTCTGGTTGAAGAAGGGCAGAAGGGTGCAGGATGCAC
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CCATCCCCAGCTCCTGCCCCCCCCTCTGTCATCGCTCCAGCGTTGATCTGCTTCGTTTTT
GTTATTTTTTGCACTTGTAACAAAGGCAGGAATCTCCACCAGAGTCAGACTATTTTTTAT
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CTCAGACTTGATCCGCAGTGGAGTCAAAAACAAACATGGAGGAGAATCGGATTGTTGTCC
TTCTGAAATGTATGACCATTTTCTTATTTGCATTGAGAAAATAATGAAAAGATCTTCCTC
TTTACTTTTATTTTATTTTATCTTTCCCCCTCCTGGGACTAATATGGGAAGTCTAGCTGA
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GTTTACAAGCACTTTTTTGGCAGGCGTCGAGCAACAAATTGAATGCATGAATCACGTATT
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TGCTACGACTTCTCCTAAGCAACTCGTAGCACAAAAAAATGGTAGTTTTATATCATTTGT
TCTTATTTCTATCACCTTTAAAGAAAGCATTAAATTCACGCGTCACAGTTTCCTCAGCGC
CGGACTAAAATGCGACATCATTGTAAAGGCTCCATGCATGGAAGAGGCGGCTTTTTTCCC
AGACAGTTTAGTGAGAACCAGTAACAATGCGGCGCTCTGCTCTTTGATGTCTGGATGTAG
AAGTTATGAGCTACAAGGCCACTTCCCTTCACTGCCGCCCCACACGGCGGGCCAGGCAGG
GTCCCAGGCCTCTGTGGAGTTATTAAAGGCCAGAGGGGACCAGTGGACGGGATCACCACT
GTGTGCCACATCCTTCTCAATGGCTCTGCCTCCCTCCACCTTTCCCCTGCTCCTTCCTGA
AGGCCCGGCCGCTCCCCTGTCCAGGTGTGGCTGTAGGAACGGAGCAGGAAACAGAACATT
TCCAAGCTTCCTGTGTGTGTCTCTGACAGTGAGCACATCAGTCTCCATGCTCGGCTCGAG
GATGTCATTTACAGACATTTCCTCCTTTTATCAGAGGACATTTGGCGATCTGTTGAATAC
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ATTTGGGACTGGCTTCAAAAGCAAAACCTTCCAATAGACTGTACTCAGGAGATGGAATAT
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GCTGAAAGGGGCTCATCCACAGTTTAGATATGTAGATTTAATCACCAAAGAATATGATTG
GTTTGTGTCAGTAATGAGACACTTCCTGTACTGGAAAAACTTTTAGAGCAGATTTTTCTG
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TCATTGTTTTAACACAGCAAGATTCAGCGGTCAAAGTAATGGAAGCCTGTTAAGTTTGTC
TCTCTTCAGTGTTTTTGACCACATTTCCTTTGTACTGCTTTAGTTTTATTCCGCTTATAT
CCTCTTAAGCACAGAATTATTTATTTACGTGGAACCTCAAAGGTATTTCCCTAGACGCAA
CAAGAGTTTAATTCTATTTCTTTATCTCTTTTTCATCTAAAAATCTTTTTTGGCTTGAAA
CGCAACACGCCACTGTCTGGCAGAGTTTGTGATCCGTTCCCTGAAACGAAAACAAGCTTG
CGCCACATTTACTCTCCCTTTTGTCTCTGCTCATAGGTTTGATTAGATAAGCTGCCCGCT
CTTATTTCAACTTGTGGAGGTTTGTTGTGGCTGTTTAGCAAAGCATTCTGGGGGCTTCCT
CTTAATGTCACAACATGCTTTCTTCAGATTGGCTCCCTTCATCACGTCTGTGAGTGCGTC
CAGCCAAGCTTCTTATCGGCCGGCTGGCCGGCCCGCTGCCGTGTCCAAACCACACAATGG
AGCTCTGCAGCCGAGCCACAACTTCAACTGCAAACAAACCCCTTTTGTTGCTTTGGCAAG
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AGATCAACGTGGGACAAAAAAAAAACAACCATTAAAGTCCCTCTCCGATCATCTTTTGAT
CTATAGTAAAAGCAATTCCAGTGGTCTTTTCAGCAGAACTGTGTCGTTTTTAGCTAAGAT
TTTCTAGGACACGTTTTCTGTAAAGTGGCAGTTCATTAGAAATTTGCCCTTTAAGCTCTG
GACGGGACCAAAGTAAGAACCCCACTGTTTCCCATCATCAATCTGTTTATTCTCTCTCCC
GCTAGCTTACAGCCCCTTACAACCTCAGCCTAACATTACCGGTGCAACAAAGATGTCGAG
CAAAACCGGAGCTATTCAGCCACACAGTTTTGAGCCAGATGTCAGCTTGGATGAGGAAAA
TAAAGACGTGCATGGATCTAGTTATCTAGAAGTGGATGCATCAAAATGGAGCGGAGCAGG
GAGCTTGTGACCCGCCAATTGTATTTTTTTTTTACATCACAGCTCCAATCTTTTTCAAAT
GACATTTTTGTGTCAACTCCTGATTCACAACTATTTGAGTGAAGAAATACTCAAATAGTT
GTTTTATGTGTCCTCCATCATGAAAAAACAGCCACAAGAACGTGTTAAATACACCAAAAT
GGCAATGTTTATTGTAGTGGGTCTTTAAGCACGTAAACACAACCCCTATGAAAAACTGTT
TTTTACATACTAAATTAATGACTTTACCTAAATGTTCCTTTGGATTGTGTTCTACATTTA
TAAAGGTACTGAGCTGCAAACATGAATATTGAGTAAGTAACCTCTGAAAAAGATAATATG
AATATAATTGTAGTTTTTGCAAAAAAAATAAAATTTACTTATTAAAATGAAAATATTCAA
CGCTATGGATTTATTTTTGCAAATAAGATGACAATGACTTAAGAGGACAATAATAGCAGT
GATAATAATTAACAAAAGAATAGGTGTATGCAGATAAACAACAGTCATATTTCTTTAGTT
TACACAAAATAAGCTGGAGAGAAGAACATGTGCTGCAGTGTTTTGGTCTCACAAGACAGG
AAAATATTTAGACGTCCTACTTTGGGGAATTAGTCAAGGTTACCTTACTTCCCCTCGGCT
TGTTCTCCCTGCTCTGTCCCAAGCAGCCACACACACTGTGGAGAATAATACGGTGCCCTG
TGGCCCCCCCAAAAAGCCTGCAGAAAGAGGGGAGGACGTTGTTCTCCGGCTCCAGTCAGG
AAAAAGGGTCTCGGAGGTTTGTTATTTTTGCTGCCCGATAGCATCTACACGGAGTTACCT
CCATGCCGGGTGTTTATTATGCAACTCGGGCAGGTTGTACGGAGCTGTGTTGAGAATGGT
GGGGAGGGCGAAGCGTTTGCTTCAGGCTCCATCACTATGGAGGCTTGGTGTCGACAGCAT
CAGTCAGCCATTCCCCCGGAAGTGGCTGAGCGTGGAGCGCGGTGTGTCCCGTGGGCCTGC
TGGGATTCCTGTTCCCAGCTGCTCATCATCTGGTGGAGCTCTGGCCTTCAGGTGGCCACA
TGTTGTTTTTGTTGTTCACTAACCATCAGCTGGAATCCAGTGAAGACATTTCTGACAGAG
TGGCCTTCAGTAGTCACATTCGGTCAAAAATCTTTCCTGTGCTTTTGCAGAAATTAAATT
TGTTTACCTGTAAGTTTGTGTATTATTTTTTTTGTATGGATTTTAAGAAACGATTGTTAT
TTAGGAAGAGGTGATCAGATGGCAGAGTTACAGCCTGGCCTGTTTGCACTCTCTCATGTT
TTCCATCACCAATTCTTCCTGATCCTTTGTTTTTTTTTGCAGGTCGAGCTCCTGAAACTA
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CTGATGTGTTTTTGGTGTTTTTAACTGGCATTTTTCCGATGACGGAAGACATACCAGTGA
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GAGTGTATTTGTGATTGTGCATTTTGCAGTACAATAGCAAATTTGGCATTTGGGCACAAA
ATGCTTTTACTGAGGCATCATATTGGTCAGTTTAAAACTTGAACAATCTTTTTTTTCCTC
ATATGTTATCGCCCCTTTGTGATTTTTTTCCCCCTAGAGTTAGACACGTTTGCCTGTCGG
GCCGTAACACTTGCAATAAATAAAAAACATCATGAAAAAAATTAGGATTATCAAGAGCAT
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